Thông thường hàng rào thuế quan các quốc gia xây dụng được sử dụng đối với hàng nhập khẩu nhằm mục đích chính là bảo hộ nền sản xuất trong nước. Tuy nhiên điều này không có nghĩa là không có các biện pháp phi thuế quan áp dụng cho hàng xuất khẩu. Tại Việt Nam, một số mặt hàng cũng chịu sự giám sát của nhà nước thông qua các hàng rào phi thuế
2.2.1.1 Cấm xuất khẩu
Một số mặt hàng cấm xuất khẩu tại Việt Nam [16] như:
- Vũ khí, đạn dược, vật liệu nổ ( trừ vật liệu công nghiệp), trang thiết bị kỹ thuật quân sự
- Di vật, cổ vật, bảo vật quốc gia thuộc sở hữu của toàn dân, sở hữu của tổ chức chính trị, tổ chức chính trị xã hội
- Gỗ tròn, gỗ xẻ từ gỗ rừng tự nhiên trong nước.
- Động vật, thực vật nuối quý hiến và giống vật nuôi, cây trồng quý hiếm - Các loài thủy sản quý hiếm
- Các loại máy mã chuyên dụng và các chương trình phần mềm mật mã sử dụng trong phạm vi bảo vệ bí mật nhà nước
- Hóa chất độc bảng I được quy định trong Công ước cấm vũ khí hóa học
Đối với các hàng hóa loại này thì hầu hết các quốc gia đều đưa ra biện pháp để quản lý. Các biện pháp này khiến các doanh nghiệp không được phép xuất khẩu nhằm đảm bảo an ninh quốc gia, bảo vệ môi trường và hoàn toàn phù hợp với quy định của WTO. Mặc dù quy định này làm giảm khối lượng hay giá trị xuất khẩu nhưng mục đích của nó là cần thiết cho việc phát triển kinh tế theo xu hướng bền vững về cả kinh tế và chính trị. Tuy nhiên, hoạt động quản lý của các cơ quan có thực sự ngăn chăn được các hành động này từ cá nhân hay tổ chức hay vẫn có tình trạng buôn lậu các
hoàng hóa cấm xuất khẩu diễm ra vẫn là vấn đề được sự quan tâm của các cơ quan cũng như dân chúng.
2.2.1.2 Giấy phép xuất khẩu
Giấy phép xuất khẩu được quy định đối với một số mặt hàng, xin giấy phép là công đoạn trong quy trình xuất khẩu hàng hóa của doanh nghiệp kinh doanh xuất nhập khẩu. Trước đây, đó là công việc bắt buộc đối với tất cả doanh nghiệp ở Việt Nam khi muốn xuất khẩu hàng hóa ra bất cứ đất nước nào. Theo quyết định số 57/1998/NĐ/CP, tất cả doanh nghiệp thuộc mọi thành phần kinh tế đều được quyền xuất khẩu hàng hóa phù hợp với nội dung đăng ký kinh doanh nội địa của mình mà không cần đăng kí giấy phép kinh doanh xuất khẩu. Tuy nhiên, đối với một số mặt hàng cần phải quản lý thì vẫn yêu cầu có giấy phép xuất khẩu thì doanh nghiệp mới có thể xuất khẩu hàng hóa: thuốc tân dược, các loại hạt giống, mẫu khoáng sản, gỗ và các sản phẩm từ gỗ, động thực vật,...
Đây được coi là hàng rào chính trong nước đưa ra để sử dụng ngay chính cho hàng hóa trong nước nên mục đích sử dụng của nó nhằm đảm bảo quản lý các ngành hàng quan trọng mà việc xuât khẩu ồ ạt sẽ ảnh hưởng đến nền kinh tế trong nước.