Dựa trên những lí luận cơ bản về quy trình 4 bước về hoạch định chiến lược và thực trạng áp dụng doanh nghiệp đã áp dụng để đưa ra để từ đó nêu những tồn tại hạn chế.
Công ty thiếu bộ phận chuyên biệt nghiên cứu thị trường để phân tích, đưa ra các chính sách phù hợp và kịp thời với sự biến động. Tuy công ty đã thực hiện và tuân theo quy trình hoạch định nhưng đã không chú trọng đến các phương án dự phòng để đối phó với các rủi ro không lường trước xảy đến. Các chiến lược kinh doanh chủ yếu xuất phát từ kinh nghiệm và tầm nhìn của ban lãnh đạo, chưa có những chiến lược dự phòng. Các dữ liệu và phân tích thiếu sự chính xác, mang màu sắc chủ quan dẫn đến thiếu khách quan trong cung cấp các thông tin đầu vào.
Ngay từ bước 1: Doanh nghiệp chưa xác định rõ ràng về tầm nhìn, sứ mệnh và mục tiêu của doanh nghiệp. Từ đó, các hành động của công ty và chiến lược sẽ có sự sai lệch và thiếu hiệu quả.
Ở bước 2 và bước 3: Phân tích môi trường đã liệt kê đầy đủ các tác nhân ảnh hưởng tuy nhiên lại thiếu những dẫn chứng, số liệu minh họa, mức độ ảnh hưởng,
tác động của các yếu tố cụ thể tới hoạt động kinh doanh của doanh nghiệp. Một số yếu tố như: Tỉ lệ lạm phát cho thấy nền kinh tế được kiểm soát tối dù có nhiều biến động và khó khăn, báo hiệu nền kinh tế hồi phục mạnh và sẽ còn phát triển nhanh trong tương lai, ...
Ở bước 4: Khi đã áp dụng ma trận SWOT nhưng cho thấy kết quả đem lại chưa cao bởi lẽ các ma trận khi sử dụng đơn lẻ luôn tồn tại các hạn chế mang tính khái quát, khó áp dụng các trường hợp đặc biệt, kết quả phân tích không chuyên sâu và thiếu sự chính xác. Có thể thấy như trong các yếu tố cấu thành của ma trận SWOT đều ở mức độ đơn giản và chung chung:
+ Với những ưu điểm công tác hoạch định của công ty đi kèm những hạn chế như: nền kinh tế phát triển, chính trị ổn định, mức độ cạnh tranh trong ngành cao, ... Thậm chí, việc xác định các vấn đề mà doanh nghiệp phải đối mặt còn thiếu sót nhiều và chưa được đầy đủ. Qua đó, không đánh giá đúng lợi thế của doanh nghiệp khiến việc áp dụng ma trận từ lý thuyết sang thực tế còn gặp nhiều hạn chế.
Chưa có phòng ban Marketing và nhân viên quản lý vấn đề Marketing của doanh nghiệp còn nhiều bất cập và ảnh hưởng tới kết quả hoạt động kinh doanh.
Ở giai đoạn thực thi: Quá trình từ kế hoạch đến thực thi luôn xuất hiện nhiều khó khăn bởi thiếu sự linh hoạt và mang tính hạn chế. Các chiến lược còn tốn kém và chưa đem lại các hiệu quả về kinh tế. Chưa có bộ phận lên kế hoạch kinh doanh để hiện thực hóa các mục tiêu mà doanh nghiệp đề ra nhưng chưa có các giai đoạn hành động cụ thể. Thiếu những công tác đánh giá hiệu quả trước của chiến lược để kịp thời cải thiện, đưa ra các chiến lược phù hợp trong tương lai.
Qua đó, trong các bước thực hiện quy trình đều tồn tại các vấn đề để từ đó giúp doanh nghiệp tìm ra những nguyên nhân và có những giải pháp phù hợp nhằm cải thiện quy trình cũng như cách áp dụng thực tế phù hợp với doanh nghiệp.