Thường xuyên phối hợp đối chiếu, xác minh về doanh nghiệp được cấp đăng ký kinh doanh, mã số thuế để quản lý chặt chẽ đối tượng nộp thuế; giám sát sự biến động của doanh nghiệp thông qua việc nắm bắt các đối tượng ngừng, nghỉ, bỏ kinh doanh, giải thể, phá sản... để khai thác nguồn thu trên địa bàn.
Kiểm tra, già soát các doanh nghiệp có giao dịch liên kết để theo dõi và đôn đốc kê khai theo mẫu GCN-01/QLT. Xử lý nghiêm minh đối với các doanh nghiệp không thực hiện nghĩa vụ kê khai của mình.
Tăng cường đôn đốc, hướng dẫn kê khai thuế kịp thời, đúng quy định; hàng tháng, quý tổng hợp đánh giá chất lượng công tác kê khai phấn đấu tối thiểu 95% trường hợp kê khai đúng hạn, không sai sót.
phổ biến việc doanh nghiệp được cấp giấy phép kinh doanh không thực hiện việc kê khai thuế thì cơ quan thuế thực hiện ngay việc đóng mã số thuế mà không cần kiểm tra tình trạng tồn tại của doanh nghiệp. Nếu sau đó doanh nghiệp đến kê khai thuế thì phải thực hiện xử phạt vi phạm hành chính theo quy định.
Triển khai kết nối mạng thông tin giữa các cơ quan có liên quan nhằm khai thác thông tin về các trường hợp thành lập doanh nghiệp mới, các biến động của doanh nghiệp đang hoạt động như chia, tách, giải thể, phá sản, điều chỉnh ngành nghề kinh doanh...một cách kịp thời, chính xác.
Đẩy mạnh việc ứng dụng công nghệ thông tin trong công tác kê khai thuế qua mạng nhằm tạo điều kiện tốt nhất cho doanh nghiệp. Tạo điều kiện thuận lợi và hỗ trợ tối đa cho doanh nghiệp tư nhân khi nộp hồ sơ khai thuế qua mạng (có thể hỗ trợ tại cơ quan thuế hoặc hỗ trợ trực tiếp nếu doanh nghiệp có yêu cầu). Đặc biệt hỗ trợ 100% DN áp dụng mã vạch hai chiều trong kê khai thuế nhất là đối với doanh nghiệp mới thành lập. Trong giai đoạn hiện nay, với sự phát triển mạnh mẽ của Internet được thực hiện một cách rất đơn giản và đem lại hiệu quả rất thiết thực cho doanh nghiệp nên tạo điều kiện cho doanh nghiệp kê khai không giới hạn số lần gửi 1 tờ khai nếu khai sai có thể khai lại trước 24h ngày cuối cùng nộp tờ khai vẫn không bị tính nộp chậm và có thể gửi tờ khai vào tất cả các ngày trong tuần kể cả ngày lễ vào bất cứ thời gian nào trong ngày.
Trong quá trình đăng ký thuế, Chi cục thuế cần phải bố trí xử lý hồ sơ cho phù hợp khoa học để việc cấp mã số thuế nhanh gọn nhất. Sau khi tiếp nhận tờ khai cần kiểm tra và xử lý ngay nhằm phát hiện những sai sót và thông báo sớm cho doanh nghiệp điều chỉnh. Việc phân loại đối tượng đăng ký thuế cần nắm rõ đặc thù, loại hình, cơ cấu tổ chức và tính pháp nhân của từng doanh nghiệp để xác định chính xác trường hợp đăng ký bảo đảm thống nhất để quản lý thuế đúng trong suốt quá trình tồn tại hoạt động của doanh nghiệp.