Bệnh cúm gia cầm H9N2 được phát hiện lần đầu tiên trên thế giới vào năm 1966 (Yun Zhu et al., 2014). Từ đó đến nay đã có nhiều nghiên cứu về virus và bệnh cúm gia cầm độc lực thấp này bao gồm nghiên cứu dịch tễ bệnh, khảo sát sự lưu hành của virus, điều tra mức độ nhiễm bệnh, giám định phân tửvà phân nhóm hệ phả virus gây bệnh, nghiên cứu sản xuất và thử nghiệm vacxin.
Nghiên cứu về di truyền đã được các nhà khoa học Trung Quốc thực hiện ngay khi dịch cúm gia cầm H9N2 nổ ra vào năm 1994 đã xác định có 3 dòng cúm gia cầm độc lực thấp H9N2 lưu hành trên đàn gia cầm gây nên thiệt hại nặng nề về kinh tế là: Ck/Beijing/1/94 (BJ/94), Qa/HK/G1/97 (giống G1) và Dk/HK/Y439/97(tương tự như chủng virus được các nhà khoa học Hàn Quốc công bố). Sun và cộng sự (2010) đã phân tích sự tiến triển của virut cúm H9N2 ở Trung Quốc từ năm 1994 đến năm 2008 và chứng minh rằng các virus H9N2 ở Trung Quốc đã trải qua quá trình sắp xếp lại rộng rãi, và các kiểu gen mới vẫn tiếp tục xuất hiện. Các nhà khoa học Hồng Kông cũng phát hiện các chủng virus cúm H9N2 lưu hành tại Hồng Kông có nguồn gốc bắt nguồn từ Trung Quốc là Dk/HK/Y280/97, Qa/HK/G1/97 và Ck/Kor/006/96 trong đó các virus H9N2 thuộc dòng giống Y280 này liên quan mật thiết đến Dk/HK/G9/97 (H9N2)-chủng virus tại Trung Quốc. Các nhà khoa học người Hồng Kông, Hàn Quốc cũng chứng minh được virus cúm H9N2 có thể gây bệnh trên gà, vịt, ngỗng, chim bồ câu và gà tơ đồng thời lây truyền sang các động vật có vú (Butt et al., 2005).
Các nhà khoa học Pakistan và Ai Cập nghiên cứu cho thấy tỷ lệ tử vong do virus cúm gia cầm H9N2 gây ra chủ yếu dao động từ 10% đến 15% với các triệu chứng hô hấp là chủ yếu (Abdel-Moneim et al., 2012). Việc điều tra huyết thanh học được các nhà khoa học Hàn Quốc thực hiện cho thấy tỷ lệ lưu hành virus cúm gia cầm H9N2 trên đàn gia cầm là rất cao trên 50%. Đây là nguy cơ đe dọa lớn đến ngành công nghiệp chăn nuôi gia cầm vì không chỉ giết chết cá thể mà còn làm giảm sản lượng trứng rất lớn gây thiệt hại về kinh tế.
Việc nghiên cứu về đặc điểm di truyền khả năng lây nhiễm, khả năng đồng nhiễm của virus cúm gia cầm H9N2 đã được các nhà khoa học Hồng Kông và Pakistan công bố là virus cúm H9N2 có thể đồng nhiễm với virus Newcastle cũng như virus cúm khác như H7N3. Những thử nghiệm nghiên cứu của các nhà khoa học Nhật Bản cho thấy gà nhiễm đồng thời với virus H9N2 và với Staphylococcus aureus hoặc Haemophilus paragallinarum cho thấy những dấu hiệu lâm sàng nghiêm trọng hơn những con gà chỉ bị nhiễm S. aureus hoặc H. paragallinarum.
Việc phát triển nghiên cứu và sử dụng vacxin cúm gia cầm H9N2 được rất nhiều quốc gia quan tâm và thực hiện. Nhiều nhà khoa học Trung Quốc và Hàn Quốc đã nghiên cứu và đưa vào sử dụng một số vacxin chống lại virus cúm H9N2 để ngăn chặn và kiểm soát dịch bệnh cúm H9N2 bùng nổ. Tại Trung Quốc các nhà khoa học đã nghiên cứu và đưa vào sử dụng vacxin nhũ dầu được vô hiệu hóa bằng formalin được lấy từ các chủng đầu tiên A/ ck/Sơn Đông/6/96 (A/CK/SD/6/96) và đã được sử dụng trên các trang trại gà giống kể từ năm 1998 để kiểm soát tình hình nhiễm cúm H9N2. Tại Hàn Quốc các nhà khoa học cũng chế tạo thành công loại vacxin bổ trợ nhũ dầu và đưa vào sử dụng để khống chế dịch bệnh cúm H9N2 vào năm 2004.
Các nghiên cứu về sinh học phân tử của virus cúm gia cầm H9N2 đã được rất nhiều nhà khoa học thực hiện. Iqbal và cộng sự (Iqbal et al., 2009) đã điều tra các đặc tính phân tử và mối quan hệ di truyền của virus H9N2 phổ biến ở Pakistan. Phân tích trình tự gen của tất cả tám phân đoạn ARN từ 12 virus bị cô lập giữa năm 2005 và 2008 đã được thực hiện. Các chuỗi HA của tất cả các phân lập có liên quan chặt chẽ đến các virus H9N2 được phân lập từ Iran từ năm 2004 đến năm 2007. Các gen HA, NA, NP và M cho thấy có đặc điểm gần giống với LPAI H9N2 phân lập trong năm 1999 ở Pakistan và là một phần của cùng nhóm với nhóm A/Qa/HK/G1/97. Ngược lại, các gen
polymerase gắn liền với LPAI H9N2 từ Ấn Độ, Iran và Dubai. Đoạn gen NS cho thấy sự đa dạng di truyền lớn hơn và chia sẻ mức độ tương tự cao với gen NS từ các phân nhóm H5 hoặc H7 hơn là các dòng dõi H9N2 Âu Á được thành lập. Các tác giả đã chỉ ra rằng, trong những năm gần đây, virus H9N2 đã được tái tổ hợp di truyền rộng rãi, dẫn đến việc tạo ra các virus H9N2 với các genotype mới ở tiểu lục địa Ấn Độ (Abdel-Moneim et al., 2012) đã phân tích sự tiến triển của LPAI H9 phân lập từ trang trại gà Hàn Quốc từ năm 2002 đến năm 2004. LPAI HAI của Hàn Quốc đã hình thành hai nhóm kháng nguyên khác biệt: nhóm kháng nguyên phân lập từ năm 1996 đến giữa năm 2003 và từ cuối năm 2003 đến năm 2004. Tiết lộ ba kiểu gen của LPAI H9N2 và cho thấy tái tổ hợp đã xảy ra. Một chủng phân lập, Ck/Kor/164/04, thuộc loại phụ H9N8, trong đó gen HA và PB1 của nó tương tự như gen của LPAI H9N2, nhưng các gen khác có liên quan chặt chẽ hơn với virus H3N8. Họ báo cáo rằng tính gây bệnh của các phân lập sớm thay đổi do trôi dạt kháng nguyên và sắp xếp lại, làm cho LPAI H9 ở Hàn Quốc có khả năng mở rộng phạm vi tiếp nhận của chúng tới động vật có vú.
Các nhà khoa học Ấn Độ nghiên cứu phân tích chuỗi nucleotide của gen HA cho thấy các virus cúm H9N2 phân lập từ Ấn Độ có liên quan chặt chẽ với các dòng H9N2 phân lập từ các khu vực của Đức và châu Á hơn là từ Trung Quốc. Phân tích loài cho biết chúng chia sẻ một tổ tiên chung - Qa/HK/G1/97 - đã góp phần vào các gen nội tại của virus H5N1 lưu hành tại Việt Nam vào thời điểm đó. Trình tự axit amin cho thấy các virus H9N2 phân lập ở Ấn Độ có thể có khả năng lây nhiễm cho người. Để hiểu các mối liên hệ di truyền giữa các virus cúm tại Ấn Độ, Tosh et al. (Tosh et al., 2008) xác định trình tự nucleotide của virus H9N2. Các chuỗi axit amin tiết lộ rằng bốn virus phân lập đã chia sẻ một mẫu R-S-S-R/G tại vị trí phân cắt của HA, trong khi một virus chứa một mẫu R-S-N-R/G ở cùng vị trí. Phân tích loài cho thấy 50% gen (HA, NA, NP và M) tương tự như các virus giống G1. Những điều này cung cấp bằng chứng về một kiểu gen tái tổ họp H9N2 mới của các virus giống G1 lưu hành ở Ấn Độ.
Karthik và cộng sự (Karthik et al., 2014) đã xác định trình tự di truyền của 37 virus H9N2 ở Bangladesh được phân lập trong giai đoạn 2011-2013 và điều tra sự đa dạng di truyền giữa các virus và trong nội bộ của chúng bằng cách truy tìm nguồn gốc của các virus này trong mối quan hệ với các
virus H9N2 khác biệt phân lập từ các nước láng giềng. Các chủng này đều đồng nhất với một số điểm đặc trưng của động vật có vú và tạo ra một tiểu dòng H9N2 mới, trong đó gen haemagglutinin (HA) bắt nguồn từ dòng H9N2 Iran (Mideast_B Iran), gen neuraminidase (NA) và polymerase cơ bản 2 (PB2) từ H9N2 Dubai (Mideast_C Dubai) và các protein không cấu trúc (NS), nucleoprotein (NP), protein M (MP), polymerase acidic (PA) và polymerase cơ bản 1 (PB1) là từ HP H7N3 có nguồn gốc từ Pakistan. Các phân tích loài và phân tích phân tử cho thấy kiểu gen hiện tại ban đầu xuất phát từ dòng H9N2 nguyên mẫu (G1).
2.3. DỊCH BỆNH CÚM GIA CẦM A/H9N2 VÀ TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU CÚM GIA CẦM A/H9N2 TẠI VIỆT NAM