Hoạt động thanh tra trực tiếp và hệ thống các biện pháp xử lý sau thanh tra đã góp phần nâng cao ý thức chấp hành pháp luật của các TCTD; hạn chế và giảm thiểu những sai phạm nghiêm trọng trong hoạt động quản trị điều hành và hoạt động tác nghiệp tại các TCTD.
Cùng với việc phát hiện và xử lý vi phạm, hoạt động thanh tra tại chỗ đã phát hiện những bất cập, thiếu sót trong cơ chế, chính sách có liên quan để trình cấp có thẩm quyền xem xét điều chỉnh; bước đầu định hướng cho quá trình hoàn thiện chính sách của NHNN (bao gồm các quy chế, chính sách điều chỉnh hoạt động của các TCTD và các chính sách nhằm nâng cao hiệu quả hoạt động của Thanh tra ngân hàng).
Việc Cơ quan TTGSNH thực hiện kết hợp thanh tra chấp hành chính sách, pháp luật và thanh tra rủi ro trong tổ chức và hoạt động đối với các TCTD nước ngoài theo đúng quy định pháp luật đã đem lại những kết quả đáng ghi nhận. Chẳng hạn như, với nội dung kiểm tra an toàn hoạt động của TCTD, những cuộc thanh tra/kiểm tra gần đây không chỉ chú ý việc tuân thủ của TCTD đối với các tỷ lệ đảm bảo an toàn trong hoạt động ngân hàng mà còn tập trung đánh giá việc thực hiện các quy định của Nhà nước, của NHNN về hệ thống kiểm tra, kiểm soát nội bộ; kiểm tra hệ thống kiểm tra, kiểm soát nội bộ của TCTD về rủi ro tài chính. Qua nghiên cứu các quy định (quy trình) nội bộ về quản lý rủi ro tài chính (quản lý rủi ro tín dụng, quản lý rủi ro thanh khoản, quản lý rủi ro lãi suất, quản lý rủi ro tỷ giá), quy định cung cấp thông tin nội bộ phục vụ công tác quản lý rủi ro tài chính, các quy định nội bộ về chính sách kế toán, cho vay, cam kết ngoại bảng; quy trình cấp tín dụng đối với từng loại sản phẩm tín dụng; quy định nội bộ về chức năng, nhiệm vụ và quy trình thực hiện của kiểm tra, kiểm toán nội bộ..., các Đoàn thanh tra/kiểm tra đã có cái nhìn toàn diện và sâu sát hơn về công tác quản trị rủi ro của TCTD, phát hiện được rủi ro tiềm ẩn.
Ngoài ra, thanh tra, giám sát trên cơ sở rủi ro còn làm thay đổi nhận thức của đối tượng thanh tra về hoạt động thanh tra của NHNN, thể hiện việc chấp nhận các đánh giá mức độ rủi ro, miễn nhiệm các chức danh quản lý, các kiến nghị cảnh báo, kiến nghị về cơ chế chính sách... Việc thực hiện các kiến nghị sau thanh tra và không có khiếu nại về xử lý và kiến nghị của CQTTGSNH. Đồng thời trình độ của cán bộ thanh tra được nâng lên rõ rệt do thường xuyên phải học tập, nghiên cứu và trao đổi về kiến thức quản trị rủi ro, thanh tra, đánh giá rủi ro trong hoạt động ngân hàng.