Có nhiều quan điểm khác nhau về kiểm tra thuế. Theo Học viện tài chính (2006), “Kiểm tra thuế là hoạt động của cơ quan thuế trong việc xem xét tình hình thực tế của đối tượng kiểm tra, từ đó đối chiếu với chức năng, nhiệm vụ yêu cầu đặt ra đối với đối tượng kiểm tra để có những nhận xét, đánh giá.”
Theo giáo sư Michel Bouvier, trong tác phẩm “Nhập môn về luật thuế đại cương và lý thuyết thuế”, kiểm tra thuế được định nghĩa là hoạt động nhằm xem xét tính trung thực, tính chính xác của cơ sở tính thuế mà NNT đã kê khai.
Như vậy, tổng hợp các quan niệm trên có thể hiểu kiểm tra thuế là hoạt động xem xét, đánh giá của cơ quan nhà nước có thẩm quyền đối với các cơ quan, tổ chức và cá nhân chịu sự quản lý trong việc thực hiện pháp luật về thuế, phí và lệ phí (gọi chung là thuế).
Quy trình kiểm tra thuế ban hành kèm theo Quyết định số 746/QĐ-TCT ngày 20 tháng 4 năm 2015 của Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế. Nội dung chính quy định về việc thực hiện các công việc:
a. Kiểm tra hồ sơ khai thuế tại trụ sở cơ quan thuế
* Bước 1: Cập nhật dữ liệu, thông tin vào các phần mềm, ứng dụng công nghệ thông tin cho công tác kiểm tra.
* Bước 2: Kiểm tra hồ sơ khai thuế.
* Bước 3: Xử lý kết quả kiểm tra hồ sơ khai thuế.
Việc kiểm tra thực hiện theo nguyên tắc kiểm tra tại trụ sở của NNT Quy trình thực hiện theo các bước sau:
* Bước 1: Lập kế hoạch kiểm tra và chuyên đề kiểm tra. * Bước 2: Chuẩn bị kiểm tra tại trụ sở NNT.
* Bước 3: Thực hiện kiểm tra tại trụ sở NNT trong thời gian 05 ngày làm việc. * Bước 4: Lập biên bản kiểm tra .
* Bước 5: Xử lý kết quả kiểm tra tại trụ sở của NNT. * Bước 6: Giám sát kết quả sau kiểm tra.
* Bước 7: Tổng hợp báo cáo và lưu giữ tài liệu kiểm tra thuế: Nhập dữ liệu vào hệ thống; Gửi báo cáo theo thời hạn quy định; Lưu trữ hồ sơ kiểm tra.