Trong những năm qua hoạt động kiểm toán nội bộ của NHNN Chi nhánh TP Hà Nội luôn được đánh giá là một hệ thống hoạt động có hiệu quả, góp phần cho Chi nhánh hoạt động an toàn, đúng định hướng:
Tại chi nhánh, kiểm toán nội bộ được bố trí một phòng riêng chịu sự chỉ đạo trực tiếp của Giám đốc chi nhánh, do đó tính độc lập trong hoạt động tương đối cao.
Để đáp ứng yêu cầu nâng cao chất lượng công tác kiểm toán nội bộ NHNN và để thực hiện thống nhất trong việc tổ chức, thực hiện cấu phần theo dõi thực hiện kiến nghị kiểm toán (TeamCentral) của phần mềm quản lý hoạt động kiểm toán TeamMate, kết hợp với các quy trình nghiệp vụ bám sát các văn bản pháp luật của Nhà nước theo sự hướng dẫn của Vụ Kiểm toán nội bộ, kiểm toán nội bộ chi nhánh đã coi đây như là kim chỉ nam trong hoạt động của các kiểm toán viên chi nhánh.
Chất lượng và hiệu quả của các cuộc kiểm toán ngày càng được nâng cao. Thông qua kết quả kiểm toán đã kiến nghị Giám đốc chi nhánh bổ sung, hoàn thiện các quy chế, cơ chế còn vướng mắc chưa phù hợp với thực tế; giúp cho công tác quản trị điều hành của Chi nhánh giảm thiểu rủi ro, đóng góp tích cực vào việc đảm bảo an toàn tài sản Nhà nước, đảm bảo hoạt động của chi nhánh đúng quy định pháp luật.
Các kiến nghị của kiểm toán nội bộ cũng được các phòng ban tiếp thu, chỉnh sửa, bổ sung kịp thời góp phần đảm bảo an toàn hoạt động và sự phát triển của chi nhánh trong từng thời kỳ.
Theo quy định của tiêu chuẩn TCVN ISO 9001:2008, phòng kiểm soát đã lập bảng mô tả công việc cho từng cán bộ trong phòng rõ ràng, chi tiết, phân định trách nhiệm của công việc và những nhiệm vụ cần thực hiện để có thể giảm được các sai sót và đùn đẩy trách nhiệm khi có sự cố xảy ra.