Khi thực hiện quyết toán thuế TNDN, Chi cục Thuế huyện Nhơn Trạch cần phải tăng cường kiểm tra các khoản chi phí để loại trừ các khoản chi phí không hợp lệ, chi phí không được phép tính trừ theo quy định. Việc kiểm tra này tương đối phức tạp vì bắt buộc phải kiểm tra từ chứng từ gốc, do đó đòi hỏi cán bộ thuế phải kiểm tra chứng từ gốc một cách chính xác và tỷ mỷ mới đảm bảo khắc phục được tình trạng doanh nghiệp hợp pháp hoá các khoản chi phí đầu vào và các khoản chi phí không được phép tính vào chi phí.
Cán bộ thuế cần kiểm tra tổng thể và chi tiết báo cáo tài chính, bảng cân đối kế toán để phát hiện các khoản thu nhập khác ngoài thu nhập từ hoạt động sản xuất kinh doanh chính của doanh nghiệp. Việc kiểm tra này dựa trên cơ sở phân tích các tài khoản có liên quan đến các khoản thu của doanh nghiệp nhằm phát hiện các khoản thu nhập chịu thuế khác phát sinh trong kỳ của doanh nghiệp để tính thu nhập chịu thuế.
Cán bộ thuế cần kiểm tra, đối chiếu các doanh nghiệp có kê khai sữa chữa lớn tài sản nhằm khắc phục hiện tượng các doanh nghiệp kê khai sữa chữa lớn tài sản nhưng không thực hiện sữa chữa nhằm trốn thuế TNDN.
Cán bộ thuế cần đẩy mạnh và tăng cường đôn đốc các doanh nghiệp đăng ký phương pháp trích khấu hao và tỷ lệ trích khấu hao tài sản cố định trước khi hoạt động hoặc trước khi bắt đầu SXKD.
Cán bộ thuế yêu cầu doanh nghiệp đăng ký định mức tiêu hao hợp lý nguyên, nhiên vật liệu, hàng hoá. Việc kê khai đăng ký định mức tiêu hao do doanh nghiệp tự xây dựng và đăng ký, thông qua việc đăng ký định mức tiêu hao này, cơ quan thuế sẽ quản lý được các khoản chi phí của doanh nghiệp khi thực hiện kê khai và nộp thuế TNDN.
Quyết toán thuế là khâu quan trọng, có vai trò xác định đúng số thuế doanh nghiệp phải nộp vào ngân sách và giúp cơ quan quản lý xác định được số thuế thu được vào ngân sách vì vậy cán bộ thuế cần cần phải:
- Cần đôn đốc các doanh nghiệp nộp quyết toán thuế đúng thời gian quy định. Cần bổ sung chế tài xử phạt khi doanh nghiệp nộp chậm quyết toán thuế. Đồng thời cơ quan thuế cũng phải tăng cường bố trí cán bộ thực hiện nhiệm vụ này một cách phù hợp.
- Quá trình quyết toán thuế cần đi sâu phân tích đến từng chi tiết các chỉ tiêu trong báo cáo quyết toán nhằm phát hiện ra những bất hợp lý, chống thất thu, đảm bảo thu nộp đúng chế độ.
- Có kế hoạch kiểm tra tình hình thực hiện quyết toán thuế tại Doanh nghiệp theo kỳ hạch toán của doanh nghiệp (theo quý) tạo cơ sở cho công tác quyết toán thuế hàng năm được nhanh chóng, kịp thời và chính xác.