Tất cả các mẫu ADN tổng số sau khi tách chiết sẽ được kiểm tra chất lượng bằng phương pháp điện di trên gel agarose với nồng độ 0.8%. Phân tử ADN sau tách chiết thường có kích thước và trọng lượng lớn nên sẽ di chuyển chậm khi tiến hành điện di. Do đó, sau điện di các phân tử ADN trong mẫu sẽ chiếm vị trí cao trên bản gel. Băng ADN sẽ được hiển thị bằng phương pháp nhuộm EtBr. Phân tử EtBr sẽ bám vào khe giữa mạch đôi ADN trong quá trình nhuộm. Hơn nữa, phân tử này có khả năng phát sáng dưới tia tử ngoại, do đó ta có thể phát hiện được các băng ADN khi để bản gel dưới đèn UV.
Hình 3.1: Điện di kiểm tra ADN tổng số trên gel agarose 0.8%.
Kết quả điện di được thể hiện ở ảnh bên trên cho thấy hầu hết các dải băng đều sắc nét và vùng sáng tập trung chủ yếu ở vùng 20 kb. Điều này có nghĩa rằng sản phẩm ADN tổng số sau tách chiết không bị đứt gãy nhiều, có độ tinh khiết cao nhằm đảm bảo cho các bước thí nghiệm tiếp theo.
Ngoài kiểm tra chất lượng bằng phương pháp điện di, chúng tôi còn thực hiện đo nồng độ ADN tổng số sau tách chiết. Sử dụng máy Qubit Fluorometer và bộ kít theo hướng dẫn sử dụng của hãng nồng độ ADN trong các mẫu được xác định nằm trong khoảng 20.8 – 63.7 ng/ml. Các thông số đo chi tiết cho mỗi mẫu được thể hiện trong bảng sau.
39
Bảng 3.2: Nồng độ ADN tổng số được xác định bằng kit Qubit® dsDNA BR
STT Mã Mẫu Nồng độ ADN (ng/µl) 1 TMM.001 63.7 2 TMM.002 32.1 3 TMM.003 33.6 4 TMM.004 32.5 5 TMM.005 20.8 6 TMM.007 38.8 7 TMM.008 35.9 8 TMM.009 34.3 9 TMM.010 35.7 10 TMM.011 28.2 11 TMM.012 55.9 12 TMM.013 35.1 13 TMM.014 44.3 14 TMM.015 33.9