Bên cạnh những kết quả đạt được thì trong quan hệ tín dụng giữa NHNo&PTNT Tp.Ninh Bình với các DNVVN vẫn còn tồn tại một số hạn chế cần khắc phục đó là :
Thứ nhất, công tác kế hoạch vẫn còn nhiều hạn chế, kết quả kinh doanh của chi
nhánh còn bị ảnh hưởng bởi biến động của các yếu tố khách quan từ thị trường, mà cụ thể ở đây là tình hình kinh tế suy thoái, lạm phát cao và sự biến động của lãi suất.
Thứ hai, thủ tục tín dụng của chi nhánh vẫn còn bị đánh giá là rườm rà, nhiều
giấy tờ và tốn nhiều thời gian. Điều này không chỉ gây phiền toái cho khách hàng mà còn làm ngân hàng tốn kém nhiều chi phí quản lý hơn cho ngân hàng.
Thứ ba, các sản phẩm tín dụng cho DNVVN chưa thực sự đa dạng để đáp ứng
được nhu cầu ngày càng cao của khách hàng. Các DNVVN vẫn chỉ sử dụng một số sản phẩm quen thuộc mà chưa được tiếp xúc với nhiều sản phẩm mới, tiện ích hơn.
Thứ tư, doanh số cho vay và dư nợ đối với DNVVN không ổn định qua các
năm, trong đó năm 2011 cả hai chỉ tiêu này đều giảm sút. Đến năm 2012 mặc dù cả doanh số cho vay và dư nợ đối với DNVVN đã tăng trở lại nhưng mức tăng không nhiều. Chi nhánh cần tăng cường các biện pháp nhằm thu hút, hỗ trợ các DN tới vay vốn để và giúp cho hoạt động cho vay DNVVN ổn định và tăng trưởng tốt hơn
Thứ năm, tỷ lệ nợ quá hạn và nợ xấu ở mức cao, đặc biệt là năm 2011, dẫn đến
vòng quay vốn tín dụng thấp và có xu hướng giảm, thể hiện công tác kiểm tra, giám sát việc sử dụng vốn vay và đôn đốc thu hồi nợ của chi nhánh chưa thực sự hiệu quả. Chi nhánh cần quan tâm thực hiện công tác này một cách chặt chẽ, nghiêm túc hơn để tránh tình trạng tồn đọng nhiều nợ quá hạn, nợ xấu, không thu hồi được vốn cho ngân hàng.