Đầu tư xây dựng cơ sở hạ tầng là yếu tố quan trọng để nâng cao năng lực cạnh tranh và Nhà nước có vai trò cực kỳ quan trọng trong công tác này. Hệ thống cơ sở hạ tầng bao gồm hệ thống các cầu đường, bến cảng đường sông, đường biển, đường hàng không, kho tàng, hệ thống điện, hệ thống cấp thoát nước, dịch vụ bưu chính viễn thông, internet... có ảnh hưởng rất lớn đến giá thành của các doanh nghiệp sản xuất và kinh doanh hàng thủy sản Việt
Nam. Hệ thống cơ sở hạ tầng phát triển có vai trò hết sức quan trọng trong việc thúc đẩy hoạt động xuất khẩu, tăng nhanh kim ngạch xuất khẩu và góp phần nâng cao năng lực cạnh tranh của hàng hóa.
Tuy đã được đầu tư và có cải thiện đáng kể trong những năm vừa qua nhưng hệ thống cơ sở hạ tầng của nước ta vẫn còn nhiều lạc hậu so với khu vực. Tỷ trọng chi phí về kết cấu hạ tầng trong một sản phẩm ở nước ta cao hơn so với các nước trong khu vực, làm giảm các lợi thế cạnh tranh khác như lao động, sự ổn định chính trị xã hội v.v... Tuy giá điện không quá cao nhưng chất lượng cung ứng điện, bao gồm điện áp thiếu ổn định và cắt điện bất thường làm cho chi phí về điện của các doanh nghiệp tăng thêm từ 8-12%. Doanh nghiệp công nghệ cao chưa dám đầu tư vào nước ta trong đó có lý do về kết cấu hạ tầng thấp, đặc biệt là về điện. Giá dịch vụ viễn thông quốc tế, phí internet cao nhất khu vực với tốc độ truyền dẫn chậm, dịch vụ không ổn định là những cản trở quan trọng trong việc hạ giá thành sản phẩm. Chi phí bốc xếp ở bến cảng, phí lưu kho đều cao, cộng với thủ tục tại bến cảng quá rườm rà làm cho chi phí quá cao về tiền bạc và thời gian. Những tồn tại này làm giảm hiệu quả hoạt động sản xuất kinh doanh của các doanh nghiệp sản xuất và kinh doanh thủy sản và đồng thời làm giảm sức cạnh tranh của hàng thủy sản xuất khẩu Việt Nam trên thị trường thế giới nói chung, thị trường Mỹ nói riêng.
Để nâng cao năng lực cạnh tranh của nền kinh tế nói chung, của hàng thủy sản xuất khẩu nước ta nói riêng, Nhà nước cần tập trung đầu tư xây dựng hệ thống cơ sở hạ tầng. Khoảng cách địa lý xa giữa Việt Nam và Mỹ sẽ không còn gây khó khăn lớn cho hàng thủy sản xuất khẩu của Việt Nam khi hệ thống đường giao thông phát triển và nhiều cảng nước sâu của Việt Nam đi vào hoạt động. Chất lượng của các ngành dịch vụ khác như điện, nước, bưu chính viễn thông được cải thiện và phát triển là yếu tố quan trọng giúp hàng thủy sản Việt Nam nâng cao sức cạnh tranh trên thị trường Mỹ. Nhà nước cần quan
tâm tới việc đầu tư đồng bộ hệ thống cơ sở hạ tầng nghề cá như các cơ sở hạ tầng phục vụ nuôi trồng thủy sản, cảng cá, bến cá, hiện đại hóa hệ thống thông tin nghề cá… nhằm hạn chế tác động của môi trường, giảm rủi ro cho nông ngư dân và đảm bảo cung cấp đủ nguyên liệu cho chế biến xuất khẩu một cách bền vững. Nhà nước cần khuyến khích các thành phần kinh tế tham gia đầu tư để huy động tối đa nguồn vốn đầu tư cho sản xuất, cho xây dựng cơ sở hạ tầng. Cần tăng cường công tác nghiên cứu, thẩm định và kiểm tra, giám sát chặt chẽ việc thực hiện các dự án đầu tư của các doanh nghiệp thủy sản nhằm đảm bảo dự án được thực hiện đúng mục tiêu, không gây thất thoát vốn đầu tư.