Tiến trình đổi mới đã đạt đợc những thành tựu to lớn. Song bên cạnh đó Kỳ Anh cũng đang còn nhiều tồn tại và khuyết điểm.
1. Chuyển dịch cơ cấu cây trồng vật nuôi, ứng dụng các tiến bộ khoa học kỹ thuật vào sản xuất thiếu đồng bộ, đầu t thâm canh cha đều, thị trờng tiêu thụ sản phẩm còn khó khăn. Chuyển đổi ruộng đất nông nghiệp gắn với cải tạo đồng ruộng triển khai còn chậm. Trong cải tạo vờn tạp cha đợc quan tâm đúng mức, việc đầu t để mở rộng diện tích trồng dứa mặc dầu đã đợc tập trung chỉ đạo nhng quá trình thực hiện vẫn còn thiếu nhiều yếu tố, cha thực hiện đợc chỉ tiêu mà Nghị quyết Đại hội Đảng bộ huyện đề ra.
Sản xuất công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp cha có giải pháp tốt để khuyến khích các thành phần kinh tế đầu t, cha tích cực để phát triển ngành nghề tiểu thủ công nghiệp, các chính sách về vốn, thị trờng cha đợc quan tâm. Việc cũng cố thành lập các hợp tác xã, cũng cố các doanh nghiệp trên địa bàn thực hiện còn chậm. Tình trạng chen lấn chiếm đất đai, chặt phá rừng, buôn bán gỗ trái phép tuy đã tập trung chỉ đạo nhng cha đợc ngăn chặn triệt để. Một số dự án phát huy hiệu quả cha cao nh dự án đánh bắt hải sản xa bờ, dự án ch- ơng trình nớc sạch nông thôn.
Công tác quản lý, điều hành, tổ chức thực hiện của các cấp chính quyền, một số mặt còn hạn chế. Trong quản lý nhà nớc về hành chính kinh tế còn nhiều sơ hở, nhất là quản lý ngân sách, đất đai và vốn đầu t của các dự án. Việc xây dựng các mô hình điển hình trên các lĩnh vực và tổ chức tổng kết rút kinh nghiệm cha đợc chú trọng.
Trong phong trào xây dựng làng, xã văn hoá, cơ quan công sở văn minh tuy đã đạt đợc những kết quả bớc đầu, nhng một số địa phơng thực hiện chỉ thị 27 của Bộ chính trị về việc cới, việc tang, lễ hội cha nghiêm túc, việc khiếu kiện vợt cấp còn để xẩy ra cha có biện pháp tốt để khắc phục.
Trong giáo dục, chất lợng cha đồng đều ở các vùng, công tác giáo dục ở vùng trong và vùng trên còn nhiều khó khăn, cha đầu t đúng mức về xây dựng cơ sở vật chất cho trờng học mầm non.
Công tác khám chữa bệnh còn nhiều bất cập, đội ngũ y bác sỹ ở tuyến xã, cơ sở còn yếu và thiếu, cha đáp ứng đợc yêu cầu. Tỷ lệ sinh con thứ 3 còn cao nhất là dân c vùng biển, vùng thiên chúa giáo. Tuy đã có biện pháp tích cực để ngăn chặn các tệ nạn xã hội nhng vẫn còn có chiều hớng gia tăng. Tình trạng lợi dụng tự do tín ngỡng, lợi dụng tôn giáo để gây mất trật tự xẩy ra ở một số địa bàn, ý thức chấp hành pháp luật của một bộ phận nhân dân cha nghiêm túc.
Việc triển khai học tập các Chỉ thị, Nghị quyết của Đảng cha thật sâu rộng, còn chậm. Một số cán bộ đảng viên thiếu năng động, sáng tạo, năng lực quản lý điều hành còn nhiều yếu kém, t tởng bảo thủ, trì trệ, trông chờ, ỷ lại, vẫn còn phổ biến ở một số ngời.
3. Công tác an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội ở một số địa bàn cha đợc quan tâm đúng mức, hoạt động của các tổ chức tự quản hiệu quả cha cao, còn có những tiềm ẩn mất ổn định ở một số cơ sở. Công tác tuyên truyền giáo dục pháp luật cha đợc làm thờng xuyên, một bộ phận nhân dân còn cố tình gây khó khăn cản trở trong đền bù giải phóng mặt bằng.
Công tác thanh tra, kiểm tra, xét xử tuy có chuyển biến tích cực, nhng vẫn còn một số vụ việc chậm đợc xử lý dứt điểm, cha đáp ứng yêu cầu, nhiệm vụ đặt ra. Quy chế dân chủ ở cơ sở cha đợc quán triệt và triển khai thực hiẹn một cách nghiêm túc đồng bộ.
Chất lợng hoạt động của lực lợng dân quân tự vệ ở một số nơi còn yếu, năng lực đội ngũ cán bộ phụ trách quân sự ở cơ sở cha thực sự vững mạnh, cha có chiều sâu.