4. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN
4.5. Sự tương ựồng về nucleotide và axit amin giữa các chủng virus PRRS
nghiên cứu
Kết quả giải trình tự ựoạn gen ORF5 của các chủng PRRSV nghiên cứu và trình tự axit amin tương ứng ựược xác ựịnh, ựược chúng tôi thu thập và sử dụng chương trình genetyx ựể so sánh tỷ lệ ựồng nhất về thành phần nucleotide và axit amin của 5 chủng PRRSV nghiên cứu và các chủng tham chiếu (chủng virus vacxin Trung Quốc và virus VR- 2332). Kết quả ựược trình bày ở bảng 4.4. Qua bảng kết quả cho thấy:
- 5 chủng PRRSV phân lập tại Việt Nam có sự tương ựồng nucleotide và axit amin ựạt tỷ lệ cao lần lượt là từ 98,02% ựến 99,86% và 97,87% ựến 100%. Như vậy, thành phần nucleotide và axit amin của các chủng này tương ựối giống nhaụ
- Sự tương ựồng về nucleotide và axit amin của các chủng PRRSV phân lập tại Việt Nam so với chủng virus vacxin Trung Quốc thấp hơn sự tương ựồng của các chủng Việt Nam với nhaụ Tuy nhiên, mức tương ựồng nucleotide và axit amin của các chủng PRRS Việt Nam so với Trung Quốc là khá cao từ 97,86% ựến 98,85% và 96,45% ựến 98,58%. điều này cho thấy sự gần gũi trong mối quan hệ di truyền của PRRSV Việt Nam và PRRSV vacxin Trung Quốc.
- Các chủng PRRSV phân lập ở Việt Nam tương ựồng thấp với các chủng virus VR-2332 mức tương ựồng về nucleotide ựạt 88,94% ựến 89,44%, tương ựồng về axit min ựạt 88,65% ựến 89,36%.
- Dễ dàng nhận thấy sự sai khác lớn trong trình tự nucleotide và axit amine của các chủng PRRSV tại Việt Nam so với các chủng Châu Âu (Lelystad), sự sai khác về nucleotide ựến 40% về axit amine là vô cùng lớn 70% (chỉ có khoảng 30% tương ựồng).
Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ 69
Bảng 4.5. Sự tương ựồng về nucleotide và axit amin giữa các chủng virus PRRS nghiên cứu (%) Sự tương ựồng về nucleotide giữa các chủng virus PRRS nghiên cứu (%)
171KTY 347KTY 352KTY CL2 HTP1 VR-2332 Vacxin TQ Lelystad
171KTY 100 98.35 98.52 98.19 98.02 88.94 98.85 62.88 347KTY 97.87 100 99.86 99.51 99.34 89.11 98.19 64.03 352KTY 98.52 99.29 100 99.67 99.51 89.27 98.35 62.71 CL2 97.87 98.57 99.29 100 99.18 89.27 98.02 62.54 HTP1 98.58 99.29 100 99.29 100 89.44 97.86 62.88 VR-2332 88.65 88.65 89.36 88.65 89.36 100 89.12 62.98 Vacxin TQ 98.58 96.45 97.16 96.45 97.16 88.65 100 62.88 Lelystad 31.92 32.86 32.86 32.86 32.86 36.23 31.92 100
Trường đại học Nông Nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ 70