Ngoài các hoạt động chính trên, NHTM có thể tham gia vào các hoạt động phụ trợ khác:
Lu ký chứng khoán là việc lu giữ, bảo quản chứng khoán của khách hàng và giúp khách hàng thực hiện các quyền của mình đối với chứng khoán lu ký. Đây là quy định bắt buộc trong giao dịch chứng khoán, bởi vì giao dịch chứng khoán trên thị trờng tập trung là hình thức giao dịch ghi sổ, khách hàng phải mở tài khoản lu ký chứng khoán tại các công ty chứng khoán ( nếu chứng khoán phát hành dới hình thức ghi sổ ) hoặc ký gửi chứng khoán ( nếu chứng khoán phát hành dới dạng chứng chỉ vật chất ). Khi thực hiện dịch vụ lu ký chứng khoán cho khách hàng, NHTM sẽ nhận đợc các khoản thu phí lu ký chứng khoán, phí gửi, phí rút và phí chuyển nhợng chứng khoán.
Quản lý thu nhập của khách hàng: xuất phát từ việc lu ký chứng khoán cho khách hàng, ngân hàng sẽ theo dõi tình hình thu lãi, cổ tức của chứng khoán và đứng ra làm dịch vụ thu nhận và chi trả cổ tức cho khách hàng thông qua tài khoản của khách hàng.
Nghiệp vụ tín dụng: đối với các nớc có TTCK phát triên, bên cạnh nghiệp vụ môi giới chứng khoán cho khách hàng để hởng hoa hồng, ngân hàng có thể cho vay chứng khoán để khách hàng thực hiện các giao dịch bán khống (short sale ) hoặc cho khách hàng vay tiền để thực hiện việc ký quỹ chứng khoán ( margin purchase ).
Cho vay ký quỹ là hình thức cấp tín dụng của ngân hàng cho khách hàng của mình để họ mua chứng khoán và sử dụng các chứng khoán đó làm vật thế chấp cho các khoản vay đó. Khách hàng chỉ cần ký quỹ một phần, số còn lại sẽ do ngân hàng ứng trớc tiền thanh toán. Đến kỳ hạn thanh toán, khách hàng phải hoàn trả đủ số gốc và lãi cho ngân hàng. Trờng hợp khách hàng không trả đợc nợ, ngân hàng sẽ phát mãi số chứng khoán đã mua để thu hồi nợ.
Nghiệp vụ quản lý quỹ đầu t : ở một số TTCK, pháp luật còn cho phép các NHTM đợc thực hiện nghiệp vụ quản lý quỹ đầu t. Theo đó, NHTM cử đại diện của mình để quản lý quỹ, sử dụng vốn và tài sản của quỹ để đầu t vào chứng khoán.