* Củng cố, nâng cao hiệu quả hoạt động của các HTXNN:
- Khuyến khích và chỉ đạo các HTXNN mở rộng các hoạt động dịch vụ. Ngoài các khâu dịch vụ bắt buộc, các HTXNN phát triển thêm các dịch vụ cung ứng vật tư, điện, tiêu thụ sản phẩm, dịch vụ vốn, chế biến nông sản, các dịch vụ xã hội, các dịch vụ sản xuất (làm đất, cấy, thu hoạch, gieo hạt, bảo quản giống và nông sản…), sản xuất công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp… Chuyển dịch vụ thú y cho ban chăn nuôi thú y xã đảm nhiệm.
- Đổi mới tổ chức, cơ chế quản lý, tháo gỡ khó khăn cho HTXNN nhằm phát huy nội lực và tính tự chủ, tự chịu trách nhiệm của các HTX, bao gồm:
+ Xác định tư cách xã viên theo đúng quy định của Luật HTX năm 2003, xóa bỏ tình trạng xã viên HTXNN cũ đương nhiên đại diện hộ nông dân là xã viên của HTXNN chuyển đổi. Xã viên HTXNN phải đóng cổ phần thực tế vào HTX và phải sử dụng các
dịch vụ của HTX, có trách nhiệm tham gia vào sự phát triển của HTX;
+ Làm lành mạnh tài chính của HTXNN:
Làm rõ mối quan hệ sở hữu tài sản trong HTX: xác định tài sản thuộc sở hữu tập thể, tài sản thuộc sở hữu cá nhân xã viên, tài sản đồng sở hữu, tài sản thuộc sở hữu không chia. Trên cơ sở đó, HTX điều chỉnh lại vốn góp của xã viên từ phân bổ giá trị tài sản HTXNN cũ chuyển sang;
Xử lý dứt điểm nợ tồn đọng của HTXNN từ 1996 trở về trước, hoàn thành trong năm 2006;
+ Tạo điều kiện hỗ trợ, giúp đỡ các HTXNN trong việc: đào tạo nâng cao trình độ quản lý của cán bộ HTXNN, giải quyết chế độ bảo hiểm xã hội, vay vốn phát triển sản xuất kinh doanh, giúp đỡ phát triển các hoạt động dịch vụ, xúc tiến thương mại và các chính sách khuyến khích phát triển HTX theo Nghị định 88/NĐ-CP ngày 11 tháng 7 năm 2005 của Chính phủ.
* Đối với các HTX chưa chuyển đổi theo Luật và các HTX yếu kémkhông có khả năng củng cố, phát triển và tồn tại hình thức, giải quyết cho giải thể để tạo điều kiện hình thành các tổ hợp tác hoặc HTXNN chuyên khâu theo nhu cầu thực tế của các hộ nông dân.
* Khuyến khích và tạo điều kiện cho việc thành lập các HTXNN mới theo đúng Luật HTX năm 2003, như: HTXNN chuyên khâu, chuyên ngành sản phẩm cây con, HTX tiêu thụ sản phẩm, HTX trang trại, HTX đa ngành… nơi chưa đủ điều kiện thành lập HTX mới thì khuyến khích hình thành các tổ hợp tác trong sản xuất kinh doanh.