Vì là hợp đồng không có hiệu lực pháp luật do các điều khoản trong hợp đồng không tuân thủ các quy định pháp luật, nên việc xử lý đối với hợp đồng vô hiệu được thực hiện theo phương thức sau :
Thứ nhất, hợp đồng vô hiệu không làm phát sinh, thay đổi, chấm dứt quyền, nghĩa vu của các bên từ thời điểm xác lập hợp đồng. Vì thế mà các bên không cần phải thực hiện các quyền và nghĩa vụ như đã thoả thuận cam kết trong hợp đồng trước đó.
Thứ hai, khi hợp đồng vô hiệu thì các bên phải khôi phục lại tình trạng ban đầu, hoàn trả cho nhau những gì đã nhận. Nếu không hoàn trả được bằng hiện vật thì phải hoàn trả bằng tiền, trừ trường hợp tài sản giao dịch, hoa lợi, lợi tức thu được bị tịch thu theo quy định của pháp luật.
Bên nào có lỗi ký kết hợp đồng vô hiệu mà gây thiệt hại thì bên đó phải bồi thường.
Đối với hợp đồng vô hiệu từng phần thì về nguyên tắc các bên phải sửa đổi các điều khoản, nội dung bị vô hiệu đó. Nếu đã thực hiện thì việc xử lý tài sản đối với phần đã thực hiện đó cũng được áp dụng theo quy định chung về xử lý hợp đồng vô hiệu vừa nêu trên.
Nếu hợp đồng chính vô hiệu thì sẽ làm chấm dứt hợp đồng phụ, trừ trường hợp các bên có thoả thuận hợp đồng phụ được thay thế hợp đồng chính. Nhưng quy định này không áp dụng đối với các biện pháp đảm bảo thực hiện hợp đồng mà các bên đã thoả thuận trước đó trong hợp đồng. Ngược lại, nếu hợp đồng phụ vô hiệu thì không làm chấm dứt hợp đồng chính, trừ trường hợp các bên có thoả thuận hợp đồng phụ là một phần không thể tách rời của hợp đồng chính.
Tuy chiên, cũng cần lưu ý là nếu hợp đồng vô hiệu nhưng tài sản giao dịch trong hợp đồng là động sản không phải đăng ký quyền sở hữu đã được chuyển
giao bằng một giao dịch khác cho người thứ ba thì giao dịch với người thứ ba vẫn có hiệu lực, trừ trường hợp pháp luật có quy định khác.
Trường hợp tài sản mà các bên giao dịch trong hợp đồng là bất động sản hoặc động sản phải đăng ký quyền sở hữu đã được chuyển giao bằng một giao dịch khác cho người thứ ba thì giao dịch với người thứ ba bị vô hiệu, trừ trường hợp người thứ ba nhận được tài sản này thông qua bán đấu giá hoặc giao dịch với người mà theo bản án, quyết định của cơ quan nhà nước có thẩm quyền là chủ sở hữu tài sản nhưng sau đó người này không phải là chủ sở hữu tài sản do bản án, quyết định bị huỷ, bị sửa.