Bên cạnh những kết quả đạt được, hoạt động logistics của Delta còn bộc lộ nhiều hạn chế cần phải khắc phục:
- Các sản phẩm dịch vụ của công ty vẫn chỉ dừng lại ở các dịch vụ truyền thống, chưa mang tính chuyên nghiệp của một doanh nghiệp cung cấp dịch vụ logistics, chưa mang lại giá trị gia tăng cao, chưa đưa ra được những gói dịch vụ theo nhu cầu của khách hàng, chưa mang tính định hướng đến khách hàng.
- Việc cung cấp dịch vụ còn rời rạc, chưa tích hợp chúng thành quá trình và kết nối được các khâu trong chuỗi dịch vụ. Chưa khai thác thêm được nhiều các dịch vụ mới để phát triển công ty do đó khó có thể thỏa mãn khách hàng về mặt giảm chi phí cũng như tính đáp ứng nhanh (quick responsiveness).
- Cơ sở vật chất phục vụ cho việc kinh doanh của công ty còn thiếu dẫn đến sự khó khăn rất lớn trong việc đáp ứng nhu cầu ngày càng cao của khách hàng.
- Việc quảng bá thương hiệu công ty, dự báo nhu cầu thị trường còn mang tính chất thụ động, chưa được quan tâm, chú trọng đầu tư.
- Khả năng ứng dụng công nghệ thông tin vào hoạt động kinh doanh của công ty còn nhiều hạn chế .Chỉ xét về khía cạnh xây dựng website cũng có thể thấy. Hiện tại doanh nghiệp chỉ đơn thuần giới thiệu về mình, về dịch vụ của mình, thiếu hẳn các tiện ích và tương tác mà khách hàng rất cần như công cụ theo dõi đơn hàng, theo dõi lịch trình tàu, theo dõi chứng từ… Đây là những yếu tố được các chủ hàng đánh giá rất cao khi lựa chọn nhà cung cấp dịch vụ logistics cho mình.
- Chi phí cho phát triển dịch vụ Logistic của công ty còn ở mức cao, gây nhiều vướng mắc như: Chi phí vận tải, chi phí cơ hội vốn – suất sinh lời tối thiểu, chi phí bảo quản hàng hóa
- Mặt khác, phương tiện vận tải còn lạc hậu, cũ kỹ, trình độ cơ giới hóa trong bốc dỡ hàng hóa vẫn còn yếu kém, lao động thủ công vẫn phổ biến. Công tác lưu kho còn khá lạc hậu, chưa áp dụng phổ biến tin học trong quản trị kho như mã vạch, chương trình phần mềm quản trị kho.
- Thời gian vận chuyển, giao hàng tới khách hàng đôi khi còn chậm trễ gây ảnh hưởng tới sự hài lòng và đánh giá của khách hàng đối với dịch vụ và uy tín của công ty.
- Việc liên kết, liên doanh với các công ty cung cấp dịch vụ logistics trong và ngoài nước để chia sẻ và phát huy thế mạnh về kinh nghiệm và lợi thế của nhau, cung cấp cho khách hàng những dịch vụ logistics tổng thể, hoàn hảo sử dụng công nghệ thông tin hiện đại đối với công ty cũng còn ở mức hạn chế.
- Tiềm lực tài chính của công ty vẫn ở mức doanh nghiệp vừa, khả năng cạnh tranh với các DN Logistic nước ngoài và các DN Logistic trong nước có vốn đầu tư nước ngoài với tiềm lực tài chính mạnh là vấn đề đáng quan tâm, ảnh hưởng không nhỏ đến khả năng mở rộng và phát triển dịch vụ Logistic tại công ty
- Lực lượng lao động của công ty vẫn là đội ngũ trẻ, chưa có nhiều kinh nghiệm trong xử lý các vấn đề phát sinh liên quan đến dịch vụ.