1. Đặc điểm kinh tế xã hội tỉnh Hà Tĩnh và các DNNQD
2.2.1.Quản lý công tác đăng ký và cấp mã số thuế cho các DNNQD
Theo điều 11 luật thuế GTGT quy định: Tất cả các cơ sở kinh doanh thuộc đối tượng nộp thuế GTGT theo quy định của Luật thuế GTGT kể cả các đơn vị chi nhánh trực thuộc cơ sở kinh doanh chính đều phải đăng ký với cơ quan thuế. Theo số liệu tại sở kế hoạch và đầu tư, hiện nay Hà Tĩnh có 375 doanh nghiệp ngoài quốc doanh được cấp giấy phép nhưng trong số 375 doanh nghiệp đó Cục thuế Hà Tĩnh mới đăng ký và cấp mã số thuế cho 345 DNNQD trong đó văn phòng Cục trực tiếp quản lý 128 DNNQD, 217 doanh nghiệp trực tiếp do các chi cục quản lý. Số doanh nghiệp còn lại chưa đưa vào quản lý được. Nguyên nhân của tình trạng này là do sự phối hợp giữa cơ quan cấp giấy phép kinh doanh và cơ quan quản lý chưa được chặt chẽ, ngành thuế không thường xuyên phối hợp với cơ quan cấp giấy phép kinh doanh để thông báo thuế cho các doanh nghiệp đến để đăng ký thuế; một số doanh nghiệp đã đăng ký kinh doanh nhưng Chi cục vẫn quan niệm thu thuế như hộ cá thể. Trước thực tế đó đòi hỏi các cấp nghành phải phối hợp chặt chẽ hơn nữa để đưa loại hình doanh nghiệp này vào quản lý 100%.
Trước năm 1999, khi chưa có sự ra đời 2 luật thuế mới, các DNNQD được quản lý bởi các chi cục thuế. Sau năm 1999 vì áp dụng hai luật thuế mới nên các doanh nghiệp này chuyển về Cục thuế quản lý nhưng việc quản lý theo trên đã không đạt được hiệu quả, năm 2000 do có chủ trương của cục thuế, những doanh nghiệp mới thành lập chưa có bộ máy hoàn chỉnh thì giao cho các chi cục quản lý. Đến thời điểm hiện tại, việc phân cấp quản lý đối với các DNNQD đã được thống nhất, nhất quán.
Nhìn chung, DNNQD đã thực hiện nghiêm thúc các thủ tục để được đăng ký và cấp mã số thuế.
Về phía cục thuế, do được trang bị hệ thống máy tính trong quản lý, các chương trình quản lý về thuế, quản lý ấn chỉ, tổ chức cán bộ đã được thực hiện có hiệu quả trên máy tính; Nâng cấp, chuyển đổi kịp thời chương trình quản lý thuế các doanh nghiệp. Do vậy, việc đăng ký và cấp mã số thuế đã được quan tâm và phối hợp tương đối chặt chẽ với các phòng, các chi cục nên sau khi có thủ tục kê khai đăng ký thuế các doanh nghiệp đều đã được cấp mã số kịp thời.