Những vấn đề tác động môi trường cơ bản liên quan đến việc chôn lấp các chất thải nguy hại không đúng qui cách, có liên quan đến tác động tiềm tàng đối với nước mặt và nước ngầm. Tại Việt Nam những nguồn nước này thường là nguồn cung cấp nước sinh hoạt gia đình, phục vụ nông nghiệp và nuôi trồng thuỷ sản. Do vậy, bất kỳ các tác động tiêu cực đối với các nguồn này đều có thể gây ảnh hưởng tiềm tàng về sức khoẻ đối với nhân dân hay gây ra các tác động môi trường nghiêm trọng. Có không nhiều những tài liệu về
những tai nạn do ô nhiễm gây ra do việc thực hiện tiêu huỷ chất thải nguy hại không hợp cách và có ít kết quả quan trắc để đánh giá tác động thực tế [2].
Những chuyến khảo sát điều tra về chất thải nguy hại, xem xét những tài liệu đã công bố và thảo luận vơí những cơ quan Nhà nước khác nhau đã cho thấy rằng ở Việt Nam đang có nhiều mối quan tâm về ô nhiễm nước mặt và nước ngầm do công nghiệp. Không thể phân lập chất thải nguy hại đã làm trầm trọng hơn vấn đề quản lý chất thải rắn và nước thải vốn đã khá trầm trọng, đồng thời cũng làm cho việc quản lý chất thải rắn khó khăn hơn do thiếu những hệ thống quản lý chất thải rắn đô thị [2].
Lĩnh vực quan tâm chính về chôn lấp chất thải nguy hại liên quan đến những vấn đề sau:
- Ô nhiễm nước ngầm là do việc lâu dài không được kiểm soát, chôn lấp tại chỗ, chôn lấp ở nơi chôn rác không có kĩ thuật cụ thể, hoặc sử dụng dùng để lấp các bãi đất trũng.
- Khả năng ô nhiễm nước mặt do việc thải các chất lỏng độc hại không được xử lý triệt để hoặc do hậu quả của việc làm vệ sinh công nghiệp kém và việc thải vào khí quyển những hoá chất độc hại từ quá trình cháy, đốt các vật liệu nguy hại.
- Bản chất ăn mòn tiềm tàng của các hoá chất độc hại có thể phá huỷ hệ thống cống cũng như làm ngộ độc môi trường tự nhiên [2].