Ngân hàng được thành lập theo Nghị định số 53/HĐBT ngày 26/3/1988 của Hội đồng Bộ trưởng (nay là Chính phủ), tên gọi đầu tiên thành lập là Ngân hàng Phát Triển Nông Nghiệp huyện Châu Thành.
Ngày 14/11/1990, Chủ tịch Hội đồng Bộ trưởng (nay là Thủ tướng Chính phủ) ký Quyết định số 400/CT đổi tên Ngân hàng Phát Triển Nông Nghiệp huyện Châu Thành thành Ngân hàng Nông Nghiệp huyện Châu Thành.
Đến 15/11/1996 đổi tên thành ngân hàng Nông Nghiệp và Phát Triển Nông Thôn huyện Châu Thành, đặt tại chợ Cái Tắc, huyện Châu Thành, tỉnh Cần Thơ.
Sau khi tỉnh Cần Thơ được công nhận là Thành phố trực thuộc trung ương. Do yêu cầu phát triển chung của Thành phố Cần Thơ, địa giới Châu Thành được chia tách ra thành Quận Cái Răng (thuộc Thành phố Cần Thơ) và huyện Châu Thành (thuộc tỉnh Hậu Giang). Chính vì vậy, ngày 25/3/2004 Ngân hàng đổi tên thành NHNo & PTNT Cần Thơ chi nhánh Quận Cái Răng, có trụ sở đặt tại số 106/4 đường Võ Tánh, Phường Lê Bình, Quận Cái Răng, Thành phố Cần Thơ. NHNo & PTNT chi nhánh Quận Cái Răng cho tới nay là một trong 9 chi nhánh NHNo & PTNT Thành phố Cần Thơ gồm: NHNo & PTNT Quận Ninh Kiều, Quận Ô Môn, Quận Bình Thủy, Quận Thốt Nốt, huyện Phong Điền, huyện Vĩnh Thạnh, huyện Cờ Đỏ, huyện Thới Lai.
Với phương châm tiếp tục xây dựng và hoàn thiện nguồn lực với 3 nội dung chính là nhân lực, công nghệ và tài chính. Từ khi chia tách đến nay, mặc dù có nhiều thay đổi về nhân sự và địa bàn hoạt động nhưng Ngân hàng không ngừng phát triển và đạt nhiều thành tựu đáng kể, giữ vững danh hiệu tiên tiến trong thời kỳ mới, góp phần giúp tình hình kinh tế của Quận ngày càng phát triển.
16