Một trong những khó khăn lừn nhất của NYK Line tại thị trường Việt Nam là cạnh tranh v ề giá cưừc v ừ i các hãng tàu khác. Hiện nay, mặc dù dịch vụ được đánh giá là tốt nhất trên thị trường nhưng cưừc phí của N Y K Line
cũng thuộc hàng cao nhất. vấn đề này càng khó khăn hơn khi các hãng tàu giá rẻ của Trung Quốc thâm nhập vào thị trường Việt Nam như SYMS, China Shipping, Wanhai...
K h ó khăn t h ứ hai là tốc độ làm hàng ờ càng Cái Lân giảm do hai cần cẩu chuyên dụng dùng để x ế p d ỡ container bị hỏng vào cuối tháng 11 năm 2006
và đến thời điểm hiện tại vẫn chưa có cần cẩu m ớ i thay thế. Hiện nay, m ỗ i g i ờ cảng Cái Lân chỉ x ế p d ỡ được 13 container nên N Y K Line phải hạn chế lượng hàng xuất đi t ừ cảng Cái Lân, làm giảm ưu thế của N Y K Line so v ớ i các hãng tàu khác.
K h ó khăn nậa N Y K Line đang gặp phải là cơ sở hạ tầng của các cảng biên V i ệ t Nam còn lạc hậu so v ớ i sự phát t r i ế n cùa các cảng trên thê giới. Phương tiện x ế p d ỡ chuyên dụng cho container còn t h i ế u rất nhiều. H ơ n nậa, các cảng của V i ệ t N a m phần lớn là các cảng sông, m ó n nước nông, các tàu có tải trọng l ớ n không vào được nên để vận c h u y ế n hàng đi các t u y ế n như Mỹ, châu  u , N Y K Line đều phải dùng "tàu cho ăn" (feeder) chờ tới các cảng lớn trong khu vực để lên tàu lớn hơn có khả năng vượt đại dương làm tăng chi phí hoạt động vận tải. Đây cũng là khó khăn chung của các doanh nghiệp vận tải tại Việt Nam.
C H Ư Ơ N G HI. BÀI HỌC KINH NGHIỆMVÀ MỘT SÒ KIÊN NGHỊ V À GIẢI PHÁP CHO C Á C DOANH NGHIỆP