Nhằm thống nhất thủ tục hành chính trong các quy định của pháp luật thuế, Luật Quản lý thuế về hoàn thuế, ngày 14/10/2009, Tổng cục Thuế đã có Quyết định số 1485/QĐ-TCT về việc ban hành Quy trình hoàn thuế áp dụng
giải quyết đối với hoàn thuế GTGT theo quy định của Luật thuế GTGT bao gồm năm bước công việc cụ thể sau đây:
Bước 1: Tiếp nhận hồ sơ hoàn thuế
Việc tiếp nhận hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế được thực hiện theo quy định của Quy chế hướng dẫn, giải đáp vướng mắc về chính sách thuế, quản lý thuế và giải quyết các thủ tục hành chính thuế của người nộp thuế theo cơ chế "một cửa" ban hành kèm theo Quyết định số 78/2007/QĐ-BTC.
Bước 2: Phân loại hồ sơ hoàn thuế
Kiểm tra, đối chiếu với quy định hiện hành để phân loại hồ sơ hoàn thuế thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau hoặc kiểm tra trước khi hoàn thuế và các trường hợp hoàn thuế khác.
Thời gian thực hiện các công việc nêu trên chậm nhất không quá 02 (hai) ngày làm việc kể từ ngày nhận được đủ hồ sơ do bộ phận tiếp nhận hồ sơ chuyển đến.
Bước 3: Giải quyết hồ sơ hoàn thuế
Hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau (gồm có phân tích hồ sơ, đề xuất hoàn thuế). Đối với hồ sơ thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau thì chậm nhất là mười lăm ngày làm việc, kể từ ngày nhận được đủ hồ sơ hoàn thuế, cơ quan thuế phải ra quyết định hoàn thuế theo mẫu số 04/HTBT ban hành kèm theo Thông tư 60/2007/TT-BTC ngày 14/6/2007 của Bộ Tài chính hoặc thông báo bằng văn bản về việc chuyển hồ sơ sang diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau hoặc thông báo lý do không hoàn thuế.
Hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau (kiểm tra hồ sơ tại cơ quan thuế, kiểm tra hoàn thuế tại trụ sở người nộp thuế, đề xuất hoàn thuế). Đối với hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau thì chậm nhất là sáu mươi ngày, kể từ ngày nhận được đủ hồ sơ hoàn thuế, cơ quan thuế phải quyết định hoàn thuế hoặc thông báo lý do không hoàn thuế.
Thẩm định hồ sơ hoàn thuế do Chi cục Thuế (CCT) chuyển lên trình cấp có thẩm quyền quyết định.
Bước 4: Thẩm định pháp chế
Bộ phận pháp chế thực hiện thẩm định về pháp chế đối với hồ sơ hoàn thuế. Thời hạn thẩm định hồ sơ chậm nhất không quá 02 (hai) ngày làm việc kể từ ngày nhận được hồ sơ đề nghị thẩm định hoàn thuế.
Bộ phận pháp chế chuyển trả kết quả thẩm định kèm theo toàn bộ hồ sơ đến bộ phận đã đề nghị thẩm định.
Bước 5: Quyết định hoàn thuế
Gồm có phê duyệt hoàn thuế, lưu hành văn bản thuế, lập chứng từ thu chi liên quan đến hoàn thuế.
Mặc dù đã quy định rất chi tiết thời hạn giải quyết hoàn thuế đối với các trường hợp nhưng lại các văn bản trên lại không nêu rõ ràng cụ thể trường hợp nào thuộc diện "hoàn thuế trước, kiểm tra sau" hoặc "kiểm tra trước, hoàn thuế sau" gây rất nhiều lúng túng cho các đối tượng hoàn thuế.
Mặt khác, để hạn chế việc trốn thuế nên các chính sách của các cơ quan quản lý đưa ra cũng chặt chẽ hơn. Nhưng đây cũng là một trong những lý do khiến cho quy trình, thủ tục hoàn thuế cho doanh nghiệp... bị phàn nàn là rườm rà, nhiêu khê. Thậm chí khi áp dụng biện pháp "kiểm tra trước, hoàn
thuế sau", có doanh nghiệp lại cho rằng mình bị cơ quan thuế áp dụng biện
pháp không bình đẳng như dành cho "kẻ gian". Vì vậy, vô hình chung người ngay, cũng bị áp dụng các biện pháp như dành cho kẻ gian.
Quy trình hoàn thuế GTGT cho hàng hóa thực xuất khẩu có những đặc thù nhất định:
Đối với doanh nghiệp xuất khẩu, vướng mắc lớn thường gặp khi hoàn thuế là trong thủ tục thanh toán tiền của bên nhập khẩu phía nước ngoài chưa phù hợp với nội dung hợp đồng xuất khẩu đã ký theo qui định. Do đó, trong
quá trình giải quyết hoàn thuế GTGT cho các đối tượng hoàn thuế, cơ quan thuế phải mất nhiều thời gian chỉ dẫn và yêu cầu các đối tượng xin hoàn thuế bổ sung hồ sơ, thực hiện đúng quy định, quy trình hoàn thuế. Do vậy, ngày 30/6/2010, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư số 94/2010/TT-BTC hướng dẫn về hoàn thuế GTGT đầu vào cho hàng hóa thực xuất khẩu. Thông tư 94/2010/TT-BTC có hiệu lực vào ngày 14/08/2010 thay thế Thông tư số 04/2009/TT-BTC và hướng dẫn thêm quy trình hoàn thuế cho một số trường hợp cụ thể nhằm khắc phục những hạn chế của quy định cũ như sau:
Được hoàn 100% số thuế GTGT đầu vào trong trường hợp hàng hóa xuất khẩu thanh toán theo phương thức trả chậm, được ghi rõ trong hợp đồng xuất khẩu mà vẫn chưa đến hạn thanh toán;
Được hoàn 90% số thuế GTGT đầu vào nếu chưa có chứng từ thanh toán qua ngân hàng trong các trường hợp sau:
- Trường hợp xuất khẩu ủy thác và khoản thanh toán của bên nhận ủy thác cho bên ủy thác phải thực hiện thanh toán qua ngân hàng;
- Trường hợp điều chỉnh giá bán hàng hóa đã xuất khẩu và thỏa mãn các điều kiện sau: (a) có phụ lục điều chỉnh giá bán; (b) có hóa đơn GTGT điều chỉnh theo giá bán mới. (c) thỏa mãn các điều kiện về khấu trừ đối với hàng xuất khẩu;
- Trường hợp thay đổi doanh thu xuất khẩu và giá trị thanh toán qua ngân hàng vì hàng hóa xuất khẩu tăng/giảm trọng lượng, thể tích tự nhiên trong quá trình vận chuyển do tính chất lý hóa của hàng hóa;
Không được hoàn thuế GTGT đầu vào hoặc bị thu hồi nếu đã được hoàn trong trường hợp hàng hóa xuất khẩu bị khách hàng nước ngoài trả lại.
Trường hợp hai bên mua bán điều chỉnh thời hạn thanh toán, thì phải cung cấp ngay văn bản thỏa thuận điều chỉnh thời hạn thanh toán cho cơ quan thuế trong thời hạn 03 (ba) ngày, kể từ ngày ký.
Trường hợp đến thời hạn thanh toán theo hợp đồng xuất khẩu, nếu người nộp thuế chưa xuất trình được chứng từ thanh toán qua ngân hàng thì ngoài việc bị thu hồi số tiền thuế đã tạm hoàn tương ứng, còn bị xử phạt về hành vi khai sai dẫn tới tăng số tiền thuế được hoàn. (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
Trường hợp hợp đồng xuất khẩu không ghi rõ thời hạn thanh toán thì sau 30 (ba mươi) ngày, kể từ ngày được tạm hoàn 90% số thuế GTGT đầu vào, nếu người nộp thuế không có giải trình phù hợp thì cơ quan thuế thực hiện kiểm tra sau hoàn thuế, làm rõ lý do chậm xuất trình chứng từ thanh toán qua ngân hàng. Trường hợp xác định doanh nghiệp có sai phạm không đáp ứng điều kiện hoàn thuế đối với hàng hóa xuất khẩu thì thu hồi tiền thuế GTGT đã tạm hoàn và xử phạt vi phạm về thuế theo pháp luật.
Trong khi số lượng hồ sơ hoàn thuế theo hướng ngày càng nhiều lên, mà lực lượng cán bộ thuế làm về công tác giải quyết hồ sơ hoàn thuế ở các tỉnh, thành phố vẫn còn hạn chế… Hệ thống cơ sở vật chất, máy móc, thiết bị mà cụ thể là hệ thống máy tính lưu trữ, tác nghiệp về thuế chưa được kết nối trong phạm vi cả nước đã ảnh hưởng không nhỏ trong công tác kiểm tra, xác minh hóa đơn, chứng từ trong bộ hồ sơ xin hoàn thuế của cán bộ làm công tác giải quyết các thủ tục về hoàn thuế GTGT… Chính những vướng mắc, tồn tại kể trên đã gây ảnh hưởng không nhỏ trong việc giải quyết hoàn thuế của các cơ quan chức năng.
Theo ông Huỳnh Minh Trí, Phó Cục trưởng Cục thuế tỉnh Bình Dương nhận xét "Việc kiểm tra, xác minh hóa đơn rất khó, có khi chúng tôi gửi đi xác
minh nhưng rất lâu mới được phúc đáp. Thậm chí 70 - 80% hóa đơn, chứng từ gửi đi mà không có hồi âm… Trong khi đó, việc kiểm tra sau hoàn thuế cũng chỉ chủ yếu dựa trên hồ sơ mà thôi…" 30. Nhận xét trên đây của ông
Trí thực ra cũng thể hiện tình hình chung của các Cục thuế các tỉnh, thành phố trên phạm vi toàn quốc trong việc hoàn thuế GTGT.