Nền kinh tế Việt Nam nói chung và nền kinh tế Nghệ An nói riêng đang chịu tác động của cuộc khủng hoảng tài chính và suy thoái kinh tế toàn cầu, lạm phát trong nƣớc làm ảnh hƣởng trực tiếp đến hoạt động kinh doanh của ngân hàng.
Agribank Nghệ An phải chịu sự cạnh tranh của các NHTM khác trên địa bàn, cạnh tranh về việc làm chủ công nghệ mới và đƣa sản phẩm dịch vụ mới ra thị trƣờng là một đặc trƣng của NHĐT. Trong hoạt động Ngân hàng truyền thống, việc triển khai ứng dụng Ngân hàng mới thƣờng đƣợc tiến hành thử nghiệm và hoàn thiện trong một thời gian dài trƣớc khi đƣa ra thị trƣờng. Với Ngân hàng điện tử, do
chịu sức ép cạnh tranh, các ứng dụng sản phẩm mới đƣợc Ngân hàng chấp nhận với thời gian thử nghiệm ngắn hơn. Vì vậy, đối với việc phát triển ứng dụng mới trong NHĐT phải xây dựng chiến lƣợc phát triển hợp lý, phân tích rủi ro và đánh giá an ninh bảo mật đang là những thách thức lớn trong hoạt động Ngân hàng.
Sự phụ thuộc công nghệ, giao dịch NHĐT đƣợc tích hợp ngày càng nhiều trên các hệ thống máy tính, trang thiết bị công nghệ thông tin và mạng Internet đã cho phép xử lý hiệu quả các giao dịch điện tử trực tuyến. Với đặc điểm giao dịch trong môi trƣờng công nghệ sẽ làm tăng sự phụ thuộc vào thiết kế, cấu trúc, liên kết và quy mô hoạt động của các hệ thống công nghệ. Mặc dù đội ngũ nhân viên khá đông nhƣng số lƣợng nhân viên hiểu rõ về dịch vụ NHĐT thì còn hạn chế.
Sự phụ thuộc vào đối tác thứ ba, ứng dụng công nghệ thông tin làm tăng tính phức tạp kỹ thuật trong quá trình vận hành, bảo đảm an ninh bảo mật, mở rộng quan hệ, liên kết với các nhà cung cấp dịch vụ Internet, công ty truyền thông và các đối tác công nghệ khác (đối tác thứ ba), mà trong số đó nhiều sản phẩm dịch vụ nằm ngoài sự kiểm soát của Ngân hàng.
Tội phạm mạng, tội phạm công nghệ cao, đánh cắp thông tin tài khoản, thông tin cá nhân trên mạng ngày càng tăng. Điều đó khiến Agribank Nghệ An phải chú trọng nhiều đến công tác kiểm soát an ninh bảo mật, chứng thực khách hàng, bảo vệ dữ liệu, các thủ tục kiểm toán theo vết, bảo đảm tính riêng tƣ của khách hàng.
Ngân hàng đã triển khai nhiều chính sách khuyến mãi, chính sách khách hàng nhƣng chƣa thực sự chuyên nghiệp, chƣa thu hút đƣợc sự chú ý của khách hàng, khách hàng chƣa quan tâm đến dịch vụ NHĐT, đây là một vấn đề quan trọng trong việc phát triển dịch vụ NHĐT.
Hiện nay việc thanh toán bằng tiền mặt đã trở thành thói quen của ngƣời dân. Vì vậy, việc thay đổi thói quen này để dần đƣa dịch vụ NHĐT vào cuộc sống cũng là một thách thức đối với các ngân hàng nói chung và Agribank Nghệ An nói riêng.