Qua phân tích hiệu quả hoạt động kinh doanh của công ty Cổ phần Nông sản Thực phẩm Xuất khẩu Cần Thơ trong giai đoạn 2011-2013 và 6 tháng đầu năm 2013 - 2014, ta thấy tình hình hoạt động của công ty đang có xu hướng không tốt, nhưng Công ty đã cố gắng thực hiện nhiệm vụ trong lĩnh vực kinh doanh, biểu hiện là doanh thu năm 2012 và năm 2013 cao hơn nhiều so với năm 2011. Trong mối quan hệ doanh thu-chi phí-lợi nhuận, muốn đạt được lợi nhuận cao thì ngoài việc nâng cao doanh thu, công tác phải làm song song là giảm chi phí, và đây là nguyên nhân chủ yếu làm cho lợi nhuận của công ty giảm, năm 2013 chi phí giá vốn tăng trong khi doanh thu bán hàng giảm do công tác dự báo giá của công ty còn kém làm cho giá nguyên liệu đầu vào tăng ảnh hưởng đến lợi nhuận của công ty. Bên cạnh đó chi phí bán hàng tăng liên tục, chi phí quản lý doanh nghiệp tăng giảm qua các năm cho thấy việc quản lý chi phí của công ty chưa tốt, vì vậy công ty cần kiểm soát các chi phí như: chi phí giá vốn hàng bán, chi phí bán hàng, chi phí quản lý doanh nghiệp, hạn chế sự gia tăng và có thể giảm các chi phí này đến mức thấp nhất, đồng nghĩa với việc làm tăng lợi nhuận, và nâng cao hiệu quả hoạt động của công ty.
Bên cạnh doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ thì doanh thu hoạt động tài chính và thu nhập khác của công ty cũng góp phần làm tăng lợi nhuận của công qua các năm. Doanh thu hoạt động tài chính của công ty chủ yếu là do lãi tiền gửi và lợi nhuận từ việc góp vốn liên doanh, tuy biến động tăng giảm qua các năm nhưng nói chung luôn mang lại hiệu quả, việc góp vốn liên doanh cho thấy công ty đã đa dạng hóa ngành nghề và tối thiểu hóa rủi ro trong kinh doanh.
Nhìn chung tình hình hàng bán ra của công ty tương đối tốt biểu hiện là vòng quay hàng tồn kho tăng ở năm 2013 giúp công ty giảm bớt nguy cơ để hàng dự trữ trở thành hàng ứ đọng, giảm chi phí cho việc tồn trữ. Kỳ thu tiền bình quân của công ty tương đối thấp điều này cho thấy vốn của Công ty không bị chiếm dụng, hiệu quả sử dụng tài sản lưu động của công ty tốt. Bên cạnh những mặt tốt thì công ty cũng gặp phải không ít vấn đề cần khắc phục như hiệu quả sử dụng tài sản cố định, Công ty có đầu tư thêm TSCĐ nhằm đem lại hiệu quả cao hơn trong sản xuất kinh doanh, tuy nhiên hiệu quả sử dụng TSCĐ của công ty chưa tốt.
Về tỷ số khả năng sinh lời ROA, ROS, ROE của công ty giảm liên tục qua các năm cho thấy khả năng sinh lợi của tài sản, của vốn chủ sở hữu, của doanh thu là đang giảm, phản ánh khả năng sinh lợi của công ty đang giảm. Bên cạnh đó tỷ lệ lãi gộp cũng đang giảm, Công ty cần có những biện pháp tăng lợi nhuận giảm chi phí để tăng các tỷ số này trong thời gian tới.
Do đặc điểm ngành nghề kinh doanh chủ yếu là xuất khẩu gạo nên doanh thu công ty chịu ảnh hưởng nhiều của quy luật cung cầu và sự biến động về giá trên thị trường lúa gạo thế giới cũng như trong nước, công ty chưa có bộ phận chuyên phân tích và dự báo về những biến động của giá gạo trong và ngoài nước nên trước sự biến động của thị trường đã làm lợi nhuận gộp của công ty giảm xuống.