Vốn điều chuyển là nguồn vốn mà chi nhánh điều chuyển từ hội sở hay các chi nhánh khác trong cùng hệ thống khi nguồn vốn huy động không đủ để đáp ứng cho nhu cầu kinh doanh hay đảm bảo khả năng thanh toán của NH. Tuy nhiên khi NH sử dụng nguồn vốn điều chuyển sẽ gặp một số hạn chế: thứ nhất vốn điều chuyển có chi phí cao hơn nguồn vốn huy động, dẫn tới chi phí của nguồn vốn kinh doanh tăng, vì thế lợi nhuận của NH giảm. Thứ hai, vốn điều chuyển nhiều làm cho NH khó chủ động về nguồn tài chính của mình để đầu tư hoặc cho vay
Từ số liệu trong bảng 4.1 ta thấy vốn điều chuyển không theo xu hướng tăng hay giảm mà nó biến động qua các năm. chẳng hạn năm 2011 vốn điều chuyển là 654.873 triệu đồng chiếm 44,49%, sang năm 2012 giảm mạnh xuốn còn 581.892 triệu đồng chiếm 38,49% giảm 72.981 triệu đồng tương ứng giảm 11,14% so với năm 2011. Do trong năm 2012, PVcomBank Cần Thơ có những chính sách đúng đắn và hợp lý dẫn đến việc hạn chế sử dung vốn điều chuyển, cho thấy đây là dấu hiệu tốt của ngân hàng. Đến năm 2013 thì tăng nhẹ trở lại là 598.865 triệu đồng chiếm 35,09% tăng 16.973 triệu đồng tức tăng 2,92% so với năm 2012. Nguyên nhân trong năm 2013, nền kinh tế bắt đầu đã ổn định, chi nhánh cần mở rộng hoạt động kinh doanh với nhiều dự án tiềm năng nên nguồn VHĐ dù khá tăng nhưng vẫn chưa đủ.
Tình hình vốn điều chuyển của ngân hàng qua 6 tháng đầu năm 2013- 2014 như sau: 6 tháng đầu năm 2013 vốn điều chuyển đạt 534.991 triệu đồng, sang cùng kỳ năm 2014 giảm xuống còn 508.241 triệu đồng tương ứng giảm 26.750 triệu đồng tức giảm 5,00% so với cùng kỳ năm 2013. Như đã biết nếu NH sử vốn điều chuyển nhiều thì phải trả chi phí cao, và cao hơn chi phí huy động vốn. Do đò NH đã đẩy mạnh công tác huy động vốn và song song đó NH cũng cố gắn giảm vốn điều chuyển để tăng lợi nhuân cho NH.