Mặc dù cá tra chịu rất tốt trong điều kiện nuôi mật độ cao và nƣớc ao ít thay đổi, nhƣng phải chú ý định kỳ thay bỏ nƣớc cũ và cấp nƣớc mới để môi trƣờng ao luôn sạch, phòng cho cá không bị nhiễm bệnh.
Trong quá trình nuôi cần thực hiện chế độ thay nƣớc nhƣ sau:
- Nƣớc cấp vào ao nên đƣợc lọc qua túi lƣới ngăn chặn địch hại vào ao nuôi. - Trong 1 tháng đầu thay nƣớc 1 tuần/lần sau đó tăng dần lịch thay nƣớc mỗi tuần 2 - 3 lần, lƣợng nƣớc thay là 30% lƣợng nƣớc trong ao. Sau 3 tháng đến cuối kỳ nuôi ao rất bẩn, do vậy cần thay nƣớc mỗi ngày, lƣợng nƣớc thay 40 - 50% để tạo môi trƣờng ao nuôi nƣớc luôn sạch, hạn chế ô nhiễm.
- Theo qui phạm thực hành quản lý tốt hơn (BMP) cho nuôi cá tra thƣơng phẩm: tháng nuôi thứ nhất thay nƣớc 2 tuần một lần, các tháng tiếp theo thay hàng ngày tùy vào khô hay mùa mƣa mà thực hiện nhƣ sau:
+ Mùa khô thì nƣớc thải nên đƣa vào vƣờn cây ăn trái hoặc ao chứa trƣớc khi thải ra sông rạch.
+ Mùa mƣa do mực nƣớc sông rạch cao nên có thể xả một phần nƣớc thải trực tiếp ra môi trƣờng bên ngoài.
- Khi trong vùng nuôi có dịch bệnh thì hạn chế hoặc ngừng thay nƣớc.
Lƣu ý:
Cần phối hợp lên lịch thay nước cho tất cả các trại, ao nuôi có sử dụng chung nguồn nước của đoạn sông khoảng 2km.
Trao đổi thông tin về lịch thay nước (cấp và thải) giữa các trại nuôi với nhau qua phương pháp truyền thông đơn giản (như nhắn tin).
Các trại cố gắng có ao, mương lắng nước thải trước khi thải ra ngoài.