trình tự gen rpob và rpoc1
Nghiên cứu sự đa dạng di truyền của nấm Metarhizium anisopliae dựa vào trình tự gen Pr1 và vùng rDNA-ITS
... đọc trình tự nhận thấy có mẫu: BXDTG, RBCQ9 và BDBD7 trình tự có nhiều sai sót quá trình đọc nên không đạt độ tin cậy Do loại bỏ mẫu Trình tự mẫu lại đƣợc sử dụng những nghiên cứu Trình tự ... sánh trình tự các dòng nƣớc với những trình tự thu thập đƣợc genbank NCBI Những dòng nấm đƣợc sử dụng so sánh đƣợc trình bày bảng 4.1 30 Bảng 4.1: Các nguồn nấm Metarhizum anisopliae genbank ... ABI PRISM 3100 3.8 Phƣơng pháp phân tích trình tự Hình 3.3: Sơ đồ những phƣơng pháp đƣợc sử dụng phân tích trình tự 25 Trình tự Sắp gióng cột chƣơng trình ClustalX Gói phần mềm Phylip Seqboot...
Ngày tải lên: 17/11/2012, 09:44
xác định trình tự gen e6 và l1 của hpv và gen ebna-1 của ebv để ứng dụng trong chuẩn đoán ung thư cổ tử cung và vòm mũi họng
... VECTOR pCR2.1 TOPO) VÀ THU NHẬN DNA SẢN PHẨM DÒNG HOÁ GIẢI TRÌNH TỰ XỬ LÝ VÀ THU NHẬN CHUỖI GEN EBNA1 VÀ E6, L1 (Thành phần trình tự Nucleotide) SO SÁNH PHÂN TÍCH CHUỖI GEN EBV VÀ HPV-16/ HPV-18 ... điện di gen EBNA-1 61 Hình 3.11 Hình ảnh giản đồ (chromatogram) phần trình tự gen EBNA-1 63 Hình 3.12 Kết chuỗi gen EBNA-1 EB17 thu nhận sau giải trình tự 63 Hình 3.13 So sánh phần trình tự acid ... phát có mặt mRNA gen E6, E7 sau hoà nhập vào hệ gen tế bào chủ Thực chất phương pháp dựa sở gen E6, E7 có khả đột nhập vào hệ gen tế bào chủ trở thành thành phần hệ gen tế bào chủ Gen E6, E7 HPV...
Ngày tải lên: 05/10/2014, 06:35
Xác định trình tự gen E6 và L1 của HPV và gen EBNA-1 của EBV để ứng dụng trong chuẩn đoán ung thư cổ tử cung và vòm mũi họn
... điện di gen EBNA-1 61 Hình 3.11 Hình ảnh giản đồ (chromatogram) phần trình tự gen EBNA-1 63 Hình 3.12 Kết chuỗi gen EBNA-1 EB17 thu nhận sau giải trình tự 63 Hình 3.13 So sánh phần trình tự acid ... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trình trình tự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trình trình tự xác định gen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... dòng giải trình tự sản phẩm HPV-16 HPV-18 từ mẫu kiểm tra 53 3.1.4 Kết giải trình tự thu nhận chuỗi gen E6 HPV-16 chuỗi gen L1 HPV-18 54 3.1.5 Kết truy cập Ngân hàng gen xác định...
Ngày tải lên: 16/04/2017, 19:57
Tách dòng, xác định và so sánh trình tự gen mã hoá Nuclear Inclusion Body protein (NIb) của một số dòng virus gây bệnh đốm vòng trên cây đu đủ (Papaya Ringspot virus-PRSV) ở Việt Nam
... sánh trình tự gen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trình tự gen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trình tự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trình tự ... đoạn gen 16 trình tự gen Nib đợc khai thác NCBI Các trình tự đợc so sánh với nhờ chơng trình phần mềm DNAstar Với mục đích sử dụng cặp mồi nhân đợc nhiều dòng virus khác nhau, chọn vùng trình tự ... nối plasmit (phản ứng tự đóng vòng) 4) Biến nạp plasmit vào tế bào E.coli DH5 5) Tách dòng xác định trình tự 2.2.10 Phơng pháp xử lý trình tự gen thu đợc 23 Sử dụng chơng trình phần mềm DNAstar...
Ngày tải lên: 30/10/2012, 15:03
nghiên cứu giải trình tự gen kháng nguyên GP5 của virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp lợn việt nam và so sánh với một số chủng của thế giới
... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... c m t s nucleotide, th m chí m t gen hay nhi u gen - ð t bi n thêm vào (insertion) thêm m t ho c m t s nucleotide vào phân t DNA, th m chí m t gen hay nhi u gen - ð t bi n ñ o ño n (inversion) ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen...
Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10
Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot
... đa ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu ... paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a gen FliC Salmonella ... loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella...
Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20
TẠO DÒNG VÀ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN SERINE PROTEASE THỦY PHÂN FIBRIN TỪ GIUN QUẾ (Perionyx excavatus) pot
... quế gen mã hóa lumbrokinase tiến hành phân tích trình tự nucleotide gen 3.2 Phân tích trình tự gen lumbrokinase Gen mã hóa lumbrokinase plasmid tái tổ hợp phân tích trình tự máy ABI-3130 Trình tự ... nucleotide gen mã hóa lumbrokinase trình bày hình so sánh với số trình tự gen mã hóa lumbrokinase từ loài giun khác công bố GenBank chương trình BioEdit TRẦN QUỐC DUNG, ĐẶNG PHƯỚC HẢI 33 Trình tự nucletotide ... dựa vào trình tự gen mã hóa lumbrokinase từ L bimastus Như trình tự gen mã hóa lumbrokiase giun đất E fetida có độ tương đồng cao với L rubellus Guo cộng (2004) thiết kế cặp primer dựa vào trình...
Ngày tải lên: 11/03/2014, 06:21
Đánh giá độ đặc hiệu và sự phù hợp của kỹ thuật PCR - RFLP xác định kiểu gen HBV so với kỹ thuật đọc trình tự gen
... kiu gen A l kiu gen c in v cỏc kiu gen khỏc cũn li cú hn 8% nucleotide (Nu.) khỏc so vi kiu gen A Nh vy, kiu gen B s cú hn 8% Nu khỏc bit so vi kiu gen A; kiu gen C cú hn 8% Nu khỏc so vi kiu gen ... DpnII cho phộp xỏc nh cỏc kiu gen t A - F trờn 99 mu lõm sng thỡ 95 mu xỏc nh c kiu gen ú kiu gen A: 23, kiu gen B: 20, kiu gen C: 20, kiu gen D: 22 v kiu gen E: 3, kiu gen F l Khi so sỏnh vi c trỡnh ... tng ng v trớ ct trờn b gen HBV ca enzyme EcoRI (Hỡnh 1.2) Chiu di ca b gen thay i tựy theo tng kiu gen khỏc nhau, [11], [23] 12 Hỡnh 1.2 S cu trỳc cỏc genb gen ca HBV B gen ca HBV c t chc thnh...
Ngày tải lên: 28/07/2014, 15:26
Phát hiện đột biến gen COL1A1 trên bệnh nhân tạo xương bất toàn bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen
... ảnh minh họa kỹ thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn hợp phản ... (thymine) Các nucleotid liên kết với theo thứ tự xác định Giải trình tự gen tức phát thứ tự xếp nucleotid phân tử DNA Vào thập kỷ 70, có hai quy trình giải trình tự sau đưa gần lúc: - Phương pháp Maxam ... nucleotid Sản phẩm PCR giải trình tự điện di đọc kết máy Bước 2: Đọc trình tự máy tự động Để thực đọc trình tự máy tự động mạch DNA đơn sản sinh ống phản ứng giải trình phải đánh dấu huỳnh quang...
Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31
nghiên cứu tách dòng và đọc trình tự gen cry1ab, cry1ac mã hóa protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ các chủng bacillus thuringiensis phân lập từ một số mẫu đất thuộc tỉnh thái nguyên
... cú ti hn 300 gen ó c tỏch dũng v ng kớ trờn ngõn hng d liu gen (Gene Database) [7] 1.2.6.4 c im riờng ca mt s nhúm gen v c t ca chỳng Nhúm gen cry1: gm trờn 130 gen thuc cỏc nhúm gen cry1A-cry1L ... cỏc bn ca gen hoc trỡnh t DNA cn thit Tỏch dũng gen cũn c gi l phõn lp gen, cú nhiu phng phỏp tỏch dũng gen khỏc Tỏch dũng invitro (in vitro gene cloning), tỏch dũng silico (in silico gene cloning) ... tng hp Gen ny khụng xp vo h gen cry vỡ khụng sinh tinh th S húa bi Trung tõm Hc liu i hc Thỏi Nguyờn http://www.lrc-tnu.edu.vn 16 1.2.6.5 c im v gen cry1Ab, cry1Ac Gen cry1Ab kớch thc gen 3468...
Ngày tải lên: 07/10/2014, 09:14
Nghiên cứu một số đặc điểm sinh học và trình tự gen TrnH psbA của loài sao mặt quỷ (Hopea Mollissima C.Y.Wu, 1957) ở Việt Nam
Ngày tải lên: 08/10/2014, 02:25
đánh giá đặc điểm nông sinh học và so sánh trình tự gen ltp của một số dòng đậu xanh có nguồn gốc từ mô sẹo chịu mất nước
... giống gốc 34 Bảng 3.4 Trình tự mồi nhân gen LTP 36 Bảng 3.5 Vị trí sai khác trình tự nucleotide gen LTP VC1973A D15 42 Bảng 3.6 Vị trí sai khác trình tự nuclotide gen LTP hai mẫu đậu xanh ... Sơ đồ hình mối quan hệ trình tự gen LTP 44 Hình 3.13 So sánh trình tự amino acid gen LTP hai mẫu đậu xanh VC1973A D15 45 Hình 3.14 So sánh trình tự amino acid gen LTP hai mẫu đậu xanh ... Nhân gen LTP kỹ thuật PCR từ dòng đậu xanh có nguồn gốc từ mô sẹo chịu nước - Tách dòng xác định trình tự gen LTP từ dòng đậu xanh có nguồn gốc từ mô sẹo chịu nước - So sánh trình tự gen, trình tự...
Ngày tải lên: 14/11/2014, 22:42
Tuyển chọn, tách dòng và xác định trình tự gen cry1c mã hóa Protein tinh thể diệt côn trùng bộ cánh vảy từ vi khuẩn Bacillus thuringiensis subsp. aizawai phân lập từ một số mẫu đất tỉnh Thái Nguyên
... tăng độ phân giải gen Dùng tia laze quét để phát dideoxynucleotid đánh dấu Xử lý kết phần mềm PC/gene, sau tiến hành so sánh trình tự gen tách dòng với trình tự công bố ngân hàng gen quốc tế 2.4 ... cao - Phát gen cry1C từ chủng Bta có hoạt tính diệt sâu xanh (Spodoptera exigua) sâu tơ (Plutella xylostella) - Tách dòng, đọc trình tự gen cry1C so sánh với trình tự công bố ngân hàng gen quốc ... biến đổi gen có mang gen Bacillus thuringiensis, nhiều loại thương mại hóa rộng rãi giới Năm 1985 gen cry1Ab gen cry1Ac chuyển thành công vào ngô Năm 1995, chuyển gen thương phẩm đưa vào sản xuất...
Ngày tải lên: 15/11/2014, 22:24
nghiên cứu trình tự gen 5’ – utr và ứng dụng trong chẩn đoán sớm csfv (classical swine fever virus) gây bệnh dịch tả heo
... cách lặp lại vò trí (trình tự) xác đònh Mỗi RE nhận biết trình tự nucleotide đặc trưng Các trình tự thường bao gồm 4-8 nucleotide Các RE khác có trình tự nhận biết số RE, trình tự nhận biết tính ... thay đổi nhiệt độ khoảng thời gian nhanh b) Trình tự nồng độ mồi Trình tự mồi Trình tự mồi đònh tính chuyên biệt phản ứng PCR Việc lựa chọn trình tự mồi chuyên biệt nồng độ mồi tối ưu cho phản ... Thu nhận đoạn gen 5'UTR từ virus CSFV - Tạo dòng gen 5'UTR E coli - Giải trình tự gen 5'UTR, so sánh với trình tự công bố giới - Thiết kế mồi để phát CSFV RT-PCR - Xây dựng quy trình chẩn đoán...
Ngày tải lên: 10/02/2015, 01:10
nghiên cứu rối loạn enzyme α–galactosidase a và phân tích trình tự gen GLA trên bệnh nhân phì đại cơ tim
... 2.4.2.5 Giải trình tự gen GLA Trình tự gen GLA xử lý cách sử dụng kít giải trình tự chu kỳ BigDye Terminator v3.1 (Applied Biosystems) máy giải trình tự ABI Prism 3730 Hệ thống giải trình tự hoạt ... ký tự ghi, từ vạch giải trình tự đoạn ADN Ngày nay, phương pháp xác định trình tự gen chủ yếu thực máy giải trình tự tự động Nguyên tắc ban đầu hai phương pháp hoá học enzyme cải tiến đưa vào ... [1] 1.6.2.3 Phương pháp xác định trình tự gen [3] Kỹ thuật giải trình tự gen phương pháp xác định xếp loại nucleotide phân tử ADN Có hai phương pháp xác định trình tự phương pháp hoá học Maxam –...
Ngày tải lên: 18/05/2015, 23:29
Nghiên cứu một số đặc điểm sinh học và trình tự gen trnh psba của loài sao mặt quỷ (hopea mollissima c y wu, 1957) ở việt nam
... ƣơn p áp đọc trình t gen Để xác định trình tự gen trnH-psbA, sử dụng phương pháp giải trình tự trực tiếp từ sản phẩm PCR theo nguyên lý Sanger et al, 1977 [16], thực máy đọc trình tự ABI 3100 ... Tạ Thị Nhung Trường ĐHSP HN 21 3.2 Trình t gen trnH-psbA c a loài Sao mặt quỷ Sau trình tiến hành tách chiết ADN, chạy PCR, đọc trình tự gen phân tích trình tự gen trnH-psbA loài Sao mặt quỷ thu ... Hình 3.9 Sơ đồ peaks trình tự gen trnH-psbA loài Sao mặt quỷ So sánh trình tự gen trnH-psbA Blast-NCBI chứng tỏ đoạn gen thu gen trnH-psbA loài Sao mặt quỷ 3.2.4 So sánh trình t nucleotide mẫu...
Ngày tải lên: 30/11/2015, 06:43
Giải trình tự gen thế hệ mới và ứng dụng chuẩn đoán bệnh
... Biotech, 2008 Giải trình tự gene hay gen cho nghiên cứu có liên quan Phát đột biến gene (liên quan đến ung thư, kháng thuốc), SNP (trong cá nhân hóa liệu pháp điều trị), kiểu gene (genotype virus ... 16-R chứa trình tự đặt hiệu loài vi khuẩn (527bp) PCR – điện di – tinh => giải trình tự NCBI Định danh vi nấm Vi nấm viêm xoang Mẫu bệnh phẩm DNA toàn phần Primer 28-F 28-R chứa trình tự đặt hiệu ... Neanderthal (106 bp ) Trở ngại: nhiễm DNA người đại bacteria Ưu điểm Giải trình tự gene, chí 24h cho gene người Lôi ánh sáng trình tự nucleic acid tác nhân có mặt mẫu thử lấy từ vật chủ hay bệnh nhân...
Ngày tải lên: 29/02/2016, 09:36
SÀNG lọc và GIẢI TRÌNH tự GEN mã hóa ENDO 1,4 β GLUCANASE từ nấm mốc CHỊU NHIỆT thielavia spp
... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629 ... So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm có trình tự khác biệt lớn với trình tự ThCEL 72629 (khoảng 5%) đặc biệt 21 axit amin cuối từ axit amin 370 đến 391 Nguyên nhân trình tự Thite_72629 ... phân tích trình tự gen Cel1 chủng LPH 195 phần mềm NetAspGene 1.0 3.6.2 Xác định trình tự peptide tín hiệu Enzyme endo-1,4-β-glucanase mà nghiên cứu enzyme ngoại bào nên gen bao gồm trình tự mã hóa...
Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02