nguyên lý giải trình tự gen

... dụng kỹ thuật giải trình tự gen hệ nghiên cứu nguồn lây truyền vi khuẩn bệnh viện 23 1.4.1 Đại cương kỹ thuật giải trình tự gen hệ 23 1.4.2 Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gen hệ xác định ... xác định trình tự gen vi khuẩn: - Sau hệ thống Miseq hoàn thành chương trình chạy giải trình tự, số lần chạy cần lưu ý để đánh giá thành cơng lần chạy Với hóa chất giải trình tự Miseq reagent kit ... CLC genomics Workbench (Qiagen) Đối với chế độ “Resequencing”- giải trình tự lại, đoạn đọc (sequencing reads) phần mềm Miseq reporter tự động trình tự so sánh với trình tự tham khảo (reference sequence)

Ngày tải lên: 26/01/2022, 15:08

... High-incomecountry Chuỗiđalocus MRSA : Methicillin-resistantS t TụcầukhángMethicil NGS : NextGenerationSeq uGiảitrìnhtựgenthếh NKBV : Nhiễmkhuẩnbệnhviệ NKQ : Nộikhíquản PDR : Pandrugresistanc eToànkhángthuốc ... N TRUYỀN CỦACÁCVI K THUỐC GÂY VIÊM PHỔTHỞMÁY BẰNGKỸTH TỰGENTHẾ LUẬNÁNTIẾNSỸ HÀNỘI-20 TRUYỀN CỦACÁCVI K THUỐC GÂY VIÊM PHỔTHỞMÁY BẰNGKỸTH TỰGENTHẾ Chuyênngành:Truyền Mãsố: 627201 LUẬNÁNTIẾNSỸYH ... Pulsedfieldgelelectro Điệndixungđiệntrườ SBS : SequencingbySynthe Sắpxếptheotổnghợp SMRT : SinglemoleculerealtiGiảitrìnhtựgentứcth SNVs : Singlenucleotidevaria

Ngày tải lên: 13/11/2022, 18:57

... dụng kỹ thuật giải trình tự gen hệ nghiên cứu nguồn lây truyền vi khuẩn bệnh viện 23 1.4.1 Đại cương kỹ thuật giải trình tự gen hệ 23 1.4.2 Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gen hệ xác định ... xác định trình tự gen vi khuẩn: - Sau hệ thống Miseq hoàn thành chương trình chạy giải trình tự, số lần chạy cần lưu ý để đánh giá thành cơng lần chạy Với hóa chất giải trình tự Miseq reagent kit ... CLC genomics Workbench (Qiagen) Đối với chế độ “Resequencing”- giải trình tự lại, đoạn đọc (sequencing reads) phần mềm Miseq reporter tự động trình tự so sánh với trình tự tham khảo (reference sequence)

Ngày tải lên: 17/07/2023, 16:11

... thuật giải trình tự gen hệ trongnghiên cứunguồnlây truyền vi khuẩntrongbệnhviện 1.4.1 Đạicươngvềkỹthuậtgiảitrìnhtựgenthếhệmới Giải trình tự gen (giải trình tự DNA) trình xác địnhtrình tự bazơ ... theo trình tự hệ sửdụng rộng rãi toàn giới, tạo 90% liệu trình tựcủa thếgiới 1.4.2 Ứngdụngkỹthuậtgiảitrìnhtựgenthếhệmớitrongxácđịnhsựlâ ytruyềncủavikhuẩntrongbệnhviện Nhiễmkhuẩnbệnhviệnl? ?nguyên ... nằmviệntươngđốidài,trungbìnhlà 28,0 ±18,0ngày ĐâylànghiêncứuđầutiêntạiViệtNamthựchiệngiảitrìnhtự tồn bộ genbằngcơngnghệgiảitrìnhtựgenthếhệmớicho 2000 chủng vi khuẩn đa kháng thuốc loàiA.baumannii,K pneumoniaevàE

Ngày tải lên: 28/08/2023, 05:17

... giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự một DNA có thể chia làm 2 bước lớn: PCR giải trình tự và đọc trình tự trên máy tự động Bước 1: PCR giải ... sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm 3 bước: - Thực hiện phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sạch sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực tiếp trên ... nucleotid Sản phẩm PCR giải trình tự sẽ được điện di và đọc kết quả trên máy Bước 2: Đọc trình tự trên máy tự động Để thực hiện đọc trình tự bằng máy tự. .. deoxyribose),

Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31

... nấm mốc tự nhiên, từ tìm enzyme tốt để tiến hành nhân dòng gen mã hóa sinh tổng hợp cellulase tái tổ hợp hệ biểu thích hợp Vì lý trên, tiến hành thực đề tài: “Sàng lọc giải trình tự gen mã hóa ... HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC BÙI NGỌC ANH BÙI NGỌC ANH SÀNG LỌC VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN MÃ HÓA ENDO1,4-β-GLUCANASE ... ENDOSÀNG LỌC VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GENCHỊU NHIỆT Thielavia spp 1,4-β-GLUCANASE TỪ NẤM MỐC CHỊU NHIỆT Thielavia spp Khóa luận tốt nghiệp đại học hệ quy Ngành Công nghệ sinh học (Chương trình đào tạo

Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02

... băng để giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1 Xử lý trình tự chuỗi nucleotid phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03, AsemblyLIGNv1.9c hệ chương trình MacVector8.2 ... ADN tinh vào ống để đưa Một số sản phẩm PCR giải trình tự giải trình tự Sau giải trình tự, chuỗi cho chuỗi nucleotid lồng nhau, không nucleotid xử lý phân tích phần thể phân tích để thu chuỗi ... phân biệt để thu clon riêng giải sách mẫu, kết PCR, chuỗi gen giải trình tự trình tự, kết truy cập Ngân hàng Gen Kết truy cập Ngân hàng Gen chủ yếu liệt kê xác định loài số 51 mẫu truy cập, kết

Ngày tải lên: 11/10/2016, 23:49

... 3.6 So sánh trình tự amino acid protrein BCET vói trình tự BAA041341 ngân hàng gen quốc tế 44 Hình 3.7 So sánh trình tự amino acid protrein NHE vói trình tự DQ153257.1 ngân hàng gen quốc tế ... tra xác gen tách dòng gen bceT, nhe hblA hay không, tiến hành đọc trình tự đoạn gen so sánh với trình tự gen đăng ký Ngân hàng Gen Quốc tế phần mềm chuyên dụng 43 3.3.2 Đọc trình tự gen má ... triǹ h tự Trình tự nucleotid gen bcet chủng HN 7.9 có 51 vị trí thay đổi so với 44 trình tự công bố ngân hàng gen quốc tế (Mã số DQ153257.1) có độ tương đồ ng 93% Trình tự dịch mã lý thuyết

Ngày tải lên: 13/09/2017, 14:52

... Kết giải trình tự gen S chủng PEDV phân lập Mẫu VNLd01 72 Mẫu VNLd02 73 Mẫu VNLd03 74 Mẫu VNLd04 Mẫu VNLd05 75 Mẫu VNLr06 76 Mẫu VNLb07 Mẫu VNLb08 77 Phụ lục 2: Thành phần nucleotide trình tự ... VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP HỒ CHÍ MINH *** TRỊNH THỊ THANH HUYỀN PHÁT HIỆN VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN S CỦA CORONAVIRUS GÂY BỆNH TIÊU CHẢY CẤP TRÊN HEO Ở MỘT SỐ TỈNH MIỀN ĐƠNG NAM BỘ Chun ... học: TS NGUYỄN TẤT TỒN TS NGUYỄN ĐÌNH QT Thành phố Hồ chí minh Tháng 08/2011 PHÁT HIỆN VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN S CỦA CORONAVIRUS GÂY BỆNH TIÊU CHẢY CẤP TRÊN HEO Ở MỘT SỐ TỈNH MIỀN ĐÔNG NAM BỘ TRỊNH

Ngày tải lên: 14/03/2019, 10:38

... dễ bị nhiễm nhiều kiểu gen HCV Đây vấn đề mà phương pháp Sanger giải Trong năm gần đây, số phương pháp giải trình tự gen đời, gọi phương pháp giải trình tự gen hệ (Next Generation Sequencing – ... Realtime PCR (Realtime Primer Chain Reaction) 12 1.4.3 Giải trình tự gen phương pháp Sanger 12 1.4.4 Giải trình tự gen hệ NGS (Next Generation Sequencing) .14 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG ... thuật giải trình tự gen hệ xác định kiểu gen số chủng virus viêm gan C Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương năm 2015” với mục tiêu: Xác định tỷ lệ genotype subtype HCV dựa phương pháp giải trình tự

Ngày tải lên: 24/07/2019, 11:56

... THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỂ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ LẶP CGG CỦA GEN FMR1 Hồn chỉnh quy trình kỹ thuật giải trình tự gen đến phân tích trình tự lặp CGG gen FMR1: vai trị trình tự lặp CGG lên đột biến gen ... tự gen để phân tích trình tự lặp CGG gen FMR1” Nghiên cứu nhằm hai mục tiêu sau: Khuyếch đại phân tích trình tự lặp CGG gen FMR1 kỹ thuật PCR đặc hiệu giải trình tự gen Mơ tả đặc điểm trình tự ... Phân tích trình tự lặp ba nucleotid CGG gen FMR1 kỹ thuật giải trình tự gen - Hình ảnh giải trình tự gen - Cơng thức để tính số lặp CGG xác định 3.1.2 Kết phân tích kích thước đoạn gen FMR1 thu

Ngày tải lên: 24/07/2019, 11:57

... Kết chất lượng giải trình tự 99 4.2.3 Kết giải trình tự chung 103 4.3 Xác định tỷ lệ lệch bội NST 21, 18, 13, X, Y phương pháp giải trình tự gen hệ sử dụng DNA thai tự máu mẹ 111 ... Kết chất lượng giải trình tự 67 3.2.3 Kết giải trình tự 69 3.3 Xác định tỷ lệ lệch bội NST 21, 18, 13, X, Y phương pháp giải trình tự gen hệ phân tích DNA thai tự máu mẹ .74 3.3.1 ... huyết tương mẹ .25 1.4 Giải trình tự gen hệ (Next-Generation Sequencing- NGS) xét nghiệm NIPS 28 1.4.1 Nguyên lý 28 1.4.2 Một số hệ thống máy giải trình tự hệ phổ biến giới 29

Ngày tải lên: 23/08/2019, 11:40

... Prenatal-BoBs .30 Giải trình tự hệ 30 3.1 Các cơng nghệ giải trình tự NGS 32 3.2 Cơng nghệ giải trình tự hệ phát lệch bội NST thai .36 Sàng lọc trước sinh DNA thai tự 39 4.1 Lịch ... dựa kiểu gen cha mẹ liệu giải trình tự huyết tương mẹ 44 4.4.3 Phương pháp dựa liệu giải trình tự high-depth DNA huyết tương mẹ 44 4.4.4 Phương pháp dựa liệu giải trình tự shallow-depth ... PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN THẾ HỆ MỚI PHÁT HIỆN LỆCH BỘI NHIỄM SẮC THỂ THAI BẰNG DNA THAI TỰ DO TRONG MÁU MẸ Người hướng dẫn khoa học: TS Trần Huy Thịnh Cho đề tài: Nghiên cứu giá trị phương pháp giải

Ngày tải lên: 25/11/2019, 21:12

... PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN THẾ HỆ MỚI PHÁT HIỆN LỆCH BỘI NHIỄM SẮC THỂ THAI BẰNG DNA THAI TỰ DO TRONG MÁU MẸ Người hướng dẫn khoa học: TS Trần Huy Thịnh Cho đề tài: Nghiên cứu giá trị phương pháp giải ... Y HÀ NỘI BỘ Y TẾ HOÀNG HẢI YẾN GIÁ TRỊ CỦA PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN THẾ HỆ MỚI PHÁT HIỆN LỆCH BỘI NHIỄM SẮC THỂ THAI BẰNG DNA THAI TỰ DO TRONG MÁU MẸ TIỂU LUẬN TỔNG QUAN HÀ NỘI - 2017 BỘ ... huyết mẹ, đặc biệt đời sàng lọc trước sinh khơng xâm lấn (NIPS) phân tích trình tự cffDNA máu mẹ sử dụng cơng nghệ giải trình tự hệ (NGS) NIPS thể tiến lớn lĩnh vực sàng lọc trước sinh, khơng có độ

Ngày tải lên: 05/01/2020, 15:23

... Mỗi chip giải trình tự tối đa 14 mẫu/lần, tổ hợp hỗn hợp thư viện đồng 14 mẫu để có hỗn hợp thư viện ≥ 25µL 2.5 Chuẩn bị mẫu giải trình tự giải trình tự 2.5.1 Chuẩn bị mẫu giải trình tự (Ion Chef) ... giá trị phương pháp giải trình tự gen hệ mới, giúp thầy thuốc lâm sàng có thêm phương pháp sàng lọc lệch bội NST thai, đề tài “Nghiên cứu giá trị phương pháp giải trình tự gen hệ phát lệch bội ... thống Ion Torrent (Ion Torrent Server) Dữ liệu phân tích tự động máy chủ - 12 2.5.3 Phân tích kết giải trình tự Sau trình giải trình tự, liệu chuyển sang hệ thống Ion Torrent Server Dữ liệu thơ

Ngày tải lên: 18/04/2020, 11:48

... 1.4 Giải trình tự gen hệ ứng dụng xét nghiệm NIPS 24 1.4.1 Nguyên lý giải trình tự hệ 24 1.4.2 Ứng dụng phương pháp giải trình tự gen hệ xét nghiệm NIPS 26 1.4.3 Nghiên cứu DNA thai tự Việt ... Mỗi chip giải trình tự tối đa 14 mẫu/lần, tổ hợp hỗn hợp thư viện đồng 14 mẫu để có hỗn hợp thư viện ≥ 25µL 2.5 Chuẩn bị mẫu giải trình tự giải trình tự 2.5.1 Chuẩn bị mẫu giải trình tự (Ion ... Gynecology giới ISUOG Hệ gen người MPSS Massively Parallel Shotgun Sequencing Giải trình tự đồng thời số lượng lớn ngẫu nhiên NGS Next Generation Sequencing Giải trình tự gen hệ NIPS Noninvasive

Ngày tải lên: 11/05/2020, 20:34

... huyết tương thai phụ 22 1.4 Giải trình tự gen hệ ứng dụng xét nghiệm NIPS 24 1.4.1 Nguyên lý giải trình tự hệ 24 1.4.2 Ứng dụng phương pháp giải trình tự gen hệ xét nghiệm NIPS ... Mỗi chip giải trình tự tối đa 14 mẫu/lần, tổ hợp hỗn hợp thư viện đồng 14 mẫu để có hỗn hợp thư viện ≥ 25µL 2.5 Chuẩn bị mẫu giải trình tự giải trình tự 2.5.1 Chuẩn bị mẫu giải trình tự (Ion ... Ứng dụng phương pháp giải trình tự gen hệ phát lệch bội NST 21, 18, 13, X, Y DNA tự máu thai phụ 58 3.2.1 Chỉ định thai phụ làm xét nghiệm NIPS 58 3.2.2 Kết giải trình tự 59 3.3

Ngày tải lên: 13/05/2020, 10:57

... NST thai 1.4 Giải trình tự gen hệ ứng dụng phân tích cffDNA 1.4.1 Nguyên lý giải trình tự hệ Phương pháp giải trình tự gen hệ hoạt động dựa nguyên lý tổng hợp tương tự giải trình tự DNA theo phương ... thuận nghịch để đọc nhận biết trình tự cách trực tiếp + Nguyên lý giải trình tự Ion Torrent hay giải trình tự bán dẫn (Ion semiconductor sequencing): Xác định trình tự nucleotide DNA thơng qua ... gắn vào đầu 3’ chuỗi DNA tổng hợp theo nguyên tắc bổ sung Tuy nhiên, giải trình tự hệ mới, thay giải trình tự đoạn đơn lẻ, kỹ thuật cho phép giải trình tự với lượng lớn đoạn DNA khác song song

Ngày tải lên: 13/05/2020, 10:57

... huyết tương thai phụ 22 1.4 Giải trình tự gen hệ ứng dụng xét nghiệm NIPS 24 1.4.1 Nguyên lý giải trình tự hệ 24 1.4.2 Ứng dụng phương pháp giải trình tự gen hệ xét nghiệm NIPS ... Mỗi chip giải trình tự tối đa 14 mẫu/lần, tổ hợp hỗn hợp thư viện đồng 14 mẫu để có hỗn hợp thư viện ≥ 25µL 2.5 Chuẩn bị mẫu giải trình tự giải trình tự 2.5.1 Chuẩn bị mẫu giải trình tự (Ion ... Gynecology giới ISUOG Hệ gen người MPSS Massively Parallel Shotgun Sequencing Giải trình tự đồng thời số lượng lớn ngẫu nhiên NGS Next Generation Sequencing Giải trình tự gen hệ NIPS Noninvasive

Ngày tải lên: 14/05/2020, 14:27

... giải trình tự đoạn gen virus đậu dê từ chủng virus phân lập được, chúng tơi tiến hành phân tích kết giải trình tự gen thu tín hiệu giải trình tự gen, trình bày hình Hình Tín hiệu giải trình tự ... hành giải trình tự gen chúng Kết phân tích mức độ tương đồng trình tự nucleotide amino acid chủng nghiên cứu cho thấy mức tương đồng trình tự nucleotide đạt 90,1% - 98,38% mức tương đồng trình tự ... XXV SỐ - 2018 Trình tự mồi cho giải trình tự: Mồi xi: GTP VF1: AGA AAC GAG GTC TCC AAG CA Mồi ngược: GTP VR1: GGA GGT TGC TGG AAA TGT GT Bảng Thành phần phản ứng PCR giải trình tự Thành phần

Ngày tải lên: 15/05/2020, 13:42