kỹ thuật giải trình tự gen sequancing
Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot
... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B trªn GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a lµ gen FliC cđa ... ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thøc víi sè truy cËp lµ AY657000 vµ AY657001 Sau ®©y xin giíi thiƯu gen FliC cđa Salmonella paratyphi B (H×nh 1) H×nh Gen FliC...
- 9
- 730
- 6
Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự chuỗi để xác định kiểu gen virus viêm gan B doc
... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác ... Việc xác định thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) Cấu tạo gen HBV HBV có gen phân tử DNA, ... biến vùng trình phát triển tự nhiên siêu vi B tác động thuốc điều trị dẫn tới vấn đề đột biến kháng thuốc Quy trình giải trình tự chuỗi: Thực PCR: Để khuếch đại gene HBV ta dùng kỹ thuật PCR...
- 6
- 548
- 2
XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VI RÚT VIÊM GAN B VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI docx
... khác 8% tồn trình tự chuỗi gen HBV, phân bố kiểu gen khác châu lục, nước khác Tuy nhiên phân loại HBV genotypes cần dựa trình tự chuỗi (sequence) đoạn gen HBV phần trình tự chuỗi gen pre-S; S ... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác ... xác định thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) 2, CẤU TẠO BỘ GEN HBV: HBV có gen phân tử...
- 22
- 655
- 6
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI ĐỂ XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA SIÊU VI VIÊM GAN B ppt
... immunoassay) Kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹ thuật giải trình tự chuỗi bên cạnh việc xác định kiểu gen HBV chúng tơi tìm đột biến kháng Lamivudine lần thực giải trình tự chuỗi Vai trò kiểu gen ... HBV dựa vào nghiên cứu gen HBV phân HBV thành loại đặt tên từ A đến H dựa vào khác 8% tồn bộ gen HBV Có nhiều kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹ thuật giải trình tự chuỗi (Sequencing), ... hay nước có kiểu gen vượt trội khác Có nhiều kỹ thuật sinh học phân tử dùng để xác định đột biến kháng thuốc HBV xác định kiểu gen HBV Chúng tơi sử dụng kỹ thuật giải trình tự chuỗi (Sequengcing)...
- 19
- 552
- 1
Xác định kiểu gen của HCV bằng kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR thu nhận được từ thử nghiệm RT real-time PCR dùng mồi và taqman probe đặc hiệu vùng 5’ NC pdf
... tính xác kết định genotype HCV phát triển khơng khác kết định genotype kỹ thuật giải trình tự Trugene đọan trình tự đích phương pháp chúng tơi đọan trình tự đích phương pháp Trugen gần phù hợp ... Sản phẩm giải trình tự làm tủa tinh phương pháp tủa với ethanol Cuối thực giải trình tự máy sequencer CEQ8000 Becman Coulter Kết giải trình tự phân tích phần mềm phân tích giải trình tự CEQ8000 ... giúp nhà lâm sàng cho định xác định genotype HCV dễ dàng hơn, việc tìm kiếm kỹ thuật xác định genotype HCV mà khơng phải sử dụng kỹ thuật giải trình tự Trugene kỹ thuật InoLIPA với giá thành thấp...
- 6
- 904
- 9
XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC CỦA SIÊU VI VIÊM GAN B BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI potx
... immunoassay) Kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹ thuật giải trình tự chuỗi bên cạnh việc xác định kiểu gen HBV chúng tơi tìm đột biến kháng Lamivudine lần thực giải trình tự chuỗi Vai trò kiểu gen ... dựa vào nghiên cứu gen HBV phân HBV thành loại đặt tên từ A đến H dựa vào khác 8% toàn bộ gen HBV4,6,8 Có nhiều kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV8,13 kỹ thuật giải trình tự chuỗi (Sequencing), ... nước có kiểu gen vượt trội khác nhau4,8 Có nhiều kỹ thuật sinh học phân tử dùng để xác định đột biến kháng thuốc HBV xác định kiểu gen HBV Chúng tơi sử dụng kỹ thuật giải trình tự chuỗi (Sequencing)...
- 17
- 577
- 3
Kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm pcr
... tính xác kết định genotype HCV phát triển khơng khác kết định genotype kỹ thuật giải trình tự Trugene đoạn trình tự đích phương pháp chúng tơi đoạn trình tự đích phương pháp Trugen gần phù hợp ... phylogenetic Thư viện HCV thư viện xây dựng sẵn người dùng cập nhật thêm kết (thực máy giải trình tự Trugene) vào thư viện này, lấy thư viện bên ngồi khơng thể đăng nhập trình tự có từ máy giải trình ... với chiều dài mà chúng tơi dự đốn, từ 190bp đến < 200bp BÀN LUẬN Định genotype HCV kỹ thuật giải trình tự Trugene hay kỹ thuật InoLIPA lai vạch Bayer dựa đoạn nucleotide đặc hiệu vùng 5’NC Đây...
- 13
- 771
- 0
Đánh giá độ đặc hiệu và sự phù hợp của kỹ thuật PCR - RFLP xác định kiểu gen HBV so với kỹ thuật đọc trình tự gen
... 1000 trình tự Đọc trình tự phân tích lồi thực gen riêng biệt, đặc biệt gen S Phuơng pháp đọc trình tự phân tích lồi Okamoto CS sử dụng năm 1988 phân tích 18 trình tự gen HBV phát hiện kiểu gen ... Sơ đồ qui trình: Chạy PCR gắn BigDye Tinh BigDye Biến tính HiDi Giải trình ọc trình tự genegen Phân tích trình tự genegen Thứ tự bước thực bao gồm: 50 * Chạy phản ứng PCR gắn BigDye: Thành phần ... pháp đánh giá phù hợp kỹ thuật PCR - RFLP so với đọc trình tự gen Tiến hành đánh giá 30 mẫu HBV - DNA (+) xác định kiểu gen đồng thời hai kỹ thuật PCR - RFLP đọc trình tự gen Sau tính hệ số phù...
- 107
- 2,164
- 5
Nhân gene và kỹ thuật giải trình tự ADN ppt
... nhỏ ADN virus hệ gene người có kích thước gấp 100 000 lần Mặt khác dùng kỹ thuật miễn dịch với kháng thể phải cần tới ngày có đáp ứng miễn dịch máu, với kỹ thuật PCR tồn quy trình phát vài (đối ... Có thể nhận tính đặc hiệu độ nhạy cao sử dụng kỹ thuật RFLP với sản phẩm PCR lai với mẫu dò đặc hiệu Tuy nhiên, thông tin đầy đủ kết xác định trình tự ADN sản phẩm PCR Ngay từ giới thiệu PCR xem ... hay phi phóng xạ tiến hành phản ứng khuyếch đại Mẫu dò đánh dấu với kỹ thuật PCR có ưu phương pháp đánh dấu truyền thống kỹ thuật tổng hợp mạch đứt gãy (nick translation) hay đánh dấu với mồi...
- 7
- 465
- 1
Một số phương pháp cụ thể thường được dùng cho kỹ thuật giải trình tự ADN - Phương pháp 1 ppsx
... ADN dùng cột Qiagene: Các cột Qiagene chuẩn bị dễ dàng nhanh để tinh ADN không cần dùng gradient CsCl ADN chuẩn bị theo phương pháp đạt kết tốt cho việc biến nạp giải trình tự gene Có hai ý quan ... tích đệm thích hợp (25ml) Chú ý trường hợp mẫu dùng cho giải trình tự ADN tự động huỳnh quang hồ tan mẫu nước Nói chung sử dụng cột Qiagene thu 90% ADN thường dùng cho tinh Plasmid cosmit (kích ... Ly tâm lại bước lần để loại phần cặn có Cân đệm cho cột Qiagene-tip 20 với 1ml QBT đệm chảy hết tự Đưa phần dịch thu bước lên cột để tự chảy qua cột 7 Rửa cột lần, lần ml đệm QC Thu ADN với 0.8...
- 6
- 543
- 3
Một số phương pháp cụ thể thường được dùng cho kỹ thuật giải trình tự ADN - Phương pháp 2 potx
... b Kỹ thuật giải trình tự ADN thiết bị giải trình tự ADN tự động: Hình 1.12 Thiết bị giải trình tự ADN tự độngg (3100-Avant Genetic Analyzer) Trong phần chúng tơi đề cập phản ứng giải trình tự ... tủa ADN bắt cặp với ADN mồi dùng để giải trình tự Phương pháp giải trình tự ADN với sợi đôi cần lượng ADN mồi cao gấp 10-20 lần so với sợi đơn Việc giải trình tự gồm hai phản ứng: phản ứng đánh ... việc giải trình tự ADN plasmid nên tái tinh với Genee-Clean sắc ký trao đổi ion Hình 1.11 Tra mẫu thiết bị chạy gel Các phần đề cập đến số vấn đề nảy sinh cách giải tiến hành giải trình tự ADN...
- 25
- 474
- 0
Định enotyp và phát hiện đột biến YMDD kháng lamivudine của HBV bằng kỹ thuật giải trình tự vùng gene rt của HBV pot
... biến Để định genotype HBV, đăng nhập trình tự giải lên local blast phần mềm miễn phí Bio-edit chúng tơi có cài thư viện genotype HBV, sau truy cập dể so sánh trình tự giải với trình tự thư viện, ... heterozygote Sau dùng chức investigator CEQ8000 để thực đối chiếu so sánh trình tự giải với trình tự tham chiếu thành lập từ trình tự gene polymerase HBV dòng khơng đột biến để phát vị trí đột biến, đặc ... trạng kháng lamivudine Cơng trình nghiên cứu chúng tơi nhằm mục đích dùng kỹ thuật giải trình tự vùng rt HBV để định genotype HBV đồng thời tìm hiểu đột biến giới ghi nhận gene polymerase virus có...
- 7
- 783
- 4
xây dựng quy trình cải tiến kỹ thuật giải trình tự dna phù hợp việc tiến hành tự động và phân tích bằng phần mềm từ phương pháp sanger kinh điển
... để giải trình tự lượng DNA tương đương [Hall N., 2007] Kỹ thuật giải trình tự DNA tự động dựa phương pháp giải trình tự Sanger kinh điển Sự đời phương pháp giải trình tự Sanger kỹ thuật giải trình ... hầu hết phòng thí nghiệm giải trình tự gen phương pháp enzyme máy tự động Thay việc phải đánh dấu trình tự ống giải trình tự xạ ký tự ghi, phương pháp giải trình tự gen tự động đánh dấu dideoxynucleotide ... tích thành trình tự đoạn DNA Hình 10: Cấu tạo máy giải trình tự DNA tự động 33 4.2 Kỹ thuật giải trình tự DNA tự động (Dye termination sequencing) 4.2.1 Chuẩn bị DNA cần giải trình tự * DNA khn...
- 48
- 483
- 0
nhân gene và kỹ thuật giải trình tự adn
... sequenase) 28/31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN Kỹ thuật giải trình tự ADN thiết bị giải trình tự ADN tự động: Hình 1.12 Thiết bị giải trình tự ADN tự độngg (3100-Avant Genetic Analyzer) Trong ... Bảng 1.7 Một số ví dụ ứng dụng kỹ thuật PCR xác định vi sinh vât 2/31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN 3/31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN Sau nét chung kỹ thuật PCR: Nguyên tắc PCR: Khái ... Phương pháp Chuẩn bị gel cho giải trình tự ADN Giới thiệu chung: 17/31 Nhân gene kỹ thuật giải trình tự ADN Phương pháp giới thiệu cách đổ gel, lên mẫu chạy gel giải trình tự ADN Có nhiều cách đổ...
- 31
- 535
- 0
xây dựng và ứng dụng kỹ thuật giải trình tự để xác định kiểu gene virút viêm gan siêu vi c
... nhận với với kết đònh kiểu gene HCV kỹ thuật HCV-LIPA và/hay kỹ thuật giải trình tự TRUGENE Bayer Sản phẩm qui trình hoàn chỉnh đònh kiểu gene HCV băng kỹ thuật giải trình tự Thực phòng nghiên cứu ... gian: Xây dưng kỹ thuật giải trình tự sản phẩm PCR nội dung máy giải trình tự CEQ 8000 trang bò công ty Nam Khoa Là mồi đặc hiệu cho phản ứng giải trình tự qui trình giải trình tự Thực phòng nghiên ... kỹ thuật RT-PCR phát HCV dựa vùng 5’-NC có trình tự đặc hiệu cho kiểu gene tương tự trình tự mà Trugene LIPA nghiên cứu Nội dung 2: Xây dưng kỹ thuật giải trình tự sản phẩm PCR nội dung máy giải...
- 32
- 429
- 0
NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ MẪU PHÂN LẬP NẤM Botryodiplodia theobromae Pat TRÊN CÂY CAO SU BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG rDNA ITS VÀ CHỈ THỊ PHÂN TỬ ISSR
... hóa lồi (Guarro, 1999) Các trình tự gen rDNA đƣợc thu thập cách phân lập giải trình tự gen dòng vơ tính riêng Trực tiếp giải trình tự rDNA đƣợc thực để thu đƣợc trình tự nhanh chóng Tuy nhiên, ... chuỗi đƣợc giải trình tự Việc thực phản ứng PCR giải trình tự DNA trực tiếp cho vài thuận lợi so với việc tạo dòng (cloning) giải trình tự DNA trực tiếp Phƣơng pháp dùng DNA tổng số từ gen với lƣợng ... ứng khuếch đại); hai mạch đơn gen đƣợc dùng để giải trình tự nhằm hạn chế bớt sai sót; phƣơng pháp thích hợp với thiết bị giải trình tự DNA tự động sử dụng trình tự mồi có đánh dấu huỳnh quang...
- 77
- 277
- 0
Phát hiện đột biến gen COL1A1 trên bệnh nhân tạo xương bất toàn bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen
... Hình ảnh minh họa kỹ thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn ... nhân đoạn gen đặc hiệu với OI - Chạy điện di kiểm tra sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm bước: - Thực phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực ... biểu protein collagen týp I (da, xương) Như để phát đột biến gen COL1A1 cần ý tới kỹ thuật là: PCR, RT-PCR giải trình tự gen 1.4.1 Kỹ thuật Polymerase Chain Reaction (PCR): PCR kỹ thuật nhân DNA...
- 68
- 571
- 0
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỊNH DANH NẤM ĐƯỜNG SINH SẢN Ở PHỤ NỮ TRONG ĐỘ TUỔI SINH ĐẺ (18 - 49 TUỔI) ĐÃ CÓ CHỒNG TẠI THỊ XÃ QUẢNG YÊN TỈNH QUẢNG NINH (2013 - 2014)
... băng để giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1 Xử lý trình tự chuỗi nucleotid phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03, AsemblyLIGNv1.9c hệ chương trình MacVector8.2 ... băng thu phân tích giám định loài ADN tinh vào ống để đưa Một số sản phẩm PCR giải trình tự giải trình tự Sau giải trình tự, chuỗi cho chuỗi nucleotid lồng nhau, không nucleotid xử lý phân tích phần ... phân biệt để thu clon riêng giải sách mẫu, kết PCR, chuỗi gen giải trình tự trình tự, kết truy cập Ngân hàng Gen Kết truy cập Ngân hàng Gen chủ yếu liệt kê xác định loài số 51 mẫu truy cập, kết...
- 11
- 426
- 0
Giải trình tự gen HP1125 mã hóa cho protein màng ngoài của helicobacter
... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự tồn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... đại gen HP1125 phương pháp PCR M Thang chuẩn ADN 100 cặp bazơ Sản phẩm PCR có kích thướckhoảng 540 cặp bazo kiểm tra phương pháp điện di Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực...
- 7
- 616
- 4
Tìm thêm: xác định các mục tiêu của chương trình xác định các nguyên tắc biên soạn khảo sát các chuẩn giảng dạy tiếng nhật từ góc độ lí thuyết và thực tiễn khảo sát chương trình đào tạo của các đơn vị đào tạo tại nhật bản khảo sát chương trình đào tạo gắn với các giáo trình cụ thể xác định thời lượng học về mặt lí thuyết và thực tế điều tra đối với đối tượng giảng viên và đối tượng quản lí điều tra với đối tượng sinh viên học tiếng nhật không chuyên ngữ1 khảo sát thực tế giảng dạy tiếng nhật không chuyên ngữ tại việt nam khảo sát các chương trình đào tạo theo những bộ giáo trình tiêu biểu phát huy những thành tựu công nghệ mới nhất được áp dụng vào công tác dạy và học ngoại ngữ mở máy động cơ rôto dây quấn các đặc tính của động cơ điện không đồng bộ đặc tuyến hiệu suất h fi p2 đặc tuyến mômen quay m fi p2 đặc tuyến dòng điện stato i1 fi p2 động cơ điện không đồng bộ một pha sự cần thiết phải đầu tư xây dựng nhà máy thông tin liên lạc và các dịch vụ từ bảng 3 1 ta thấy ngoài hai thành phần chủ yếu và chiếm tỷ lệ cao nhất là tinh bột và cacbonhydrat trong hạt gạo tẻ còn chứa đường cellulose hemicellulose