giải trình tự đoạn gen quan tâm

... tế bào MARC – 145 36 2.5.4 Giải trình tự phân tích liệu trình tự gen ORF5 39 2.5.4.1 Giải trình tự DNA 39 2.5.4.2 Phân tích liệu trình tự gen ORF5 39 2.5.5 Phƣơng ... – Qiagen 2.5.4 Giải trình tự phân tích liệu trình tự gen ORF5 2.5.4.1 Giải trình tự DNA Sản phẩm DNA phản ứng RT - PCR sau tinh kit tinh gel QIAquick PCR Purification Kit - Qiagen (quy trình ... để nhân đoạn gen ORF5 kit RT - PCR one step (invitrogen), trình tự cặp mồi nhƣ bảng 2.1 Bảng 2.1 Trình tự nucleotide mồi phản ứng RT - PCR (Tony cộng sự, 2001) Tên mồi Go3F Go5R Trình tự chuỗi...

Ngày tải lên: 19/03/2016, 09:18

... EB, để yên phút, li tâm 13.000 v/p phút 2.2.9 Xác định trình tự gen máy phân tích trình tự nucleotid tự động Gen đợc xác định trình tự máy tự động ABI PRIMS đ 3100 Avant Genetic Analyzer, b»ng ... Loan 3.5 kết so sánh trình tự 3.5.1 Kết so sánh trình tự nucleotit Sử dụng chơng trình Aligment phần mềm DNAstar để so sánh trình tự gen CP mẫu nghiên cứu với với 43 trình tự gen CP TYLCV khác số ... từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trình tự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trình tự ADN + Giải mã trình tự nucleotit sang trình tự axit amin theo khung đọc mở, xác định...

Ngày tải lên: 30/10/2012, 14:53

... EB, để yên phút, li tâm 13.000 v/p phút 2.2.9 Xác định trình tự gen máy phân tích trình tự nucleotid tự động Gen đợc xác định trình tự máy tự động ABI PRIMS đ 3100 Avant Genetic Analyzer, b»ng ... Loan 3.5 kết so sánh trình tự 3.5.1 Kết so sánh trình tự nucleotit Sử dụng chơng trình Aligment phần mềm DNAstar để so sánh trình tự gen CP mẫu nghiên cứu với với 43 trình tự gen CP TYLCV khác mét ... từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trình tự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trình tự ADN + Giải mã trình tự nucleotit sang trình tự axit amin theo khung đọc mở, xác định...

Ngày tải lên: 19/03/2013, 08:21

... thấy, trình tự nucleotide chuỗi gen sau giải trình tự liên tục, rõ ràng, có chứa trình tự mồi xi (HTA6F) mồi ngược (HTA4R) phần đầu cuối chuỗi gen, với trình tự mồi thiết kế Như vậy, trình tự đoạn ... thơng thường 500-1000 nucleotide giải trình máy giải trình trình tự tự động 2.3.9 Phƣơng pháp phân tích xử lý số liệu Trình tự DNA thu nhận từ máy giải trình tự, cung cấp hai dạng: chuỗi nucleotide ... hàng gen sử dụng trình tự nucleotide gen cox1 chủng HTAQT Kết xác nhận trình tự nucleotide gen cox1 chủng HTAQT, sử dụng chương trình BLAST có Ngân hàng gen trình bày bảng 3.2 Số hóa Trung tâm...

Ngày tải lên: 16/08/2015, 17:56

Ngày tải lên: 02/12/2016, 04:11

... Blood Midi kit (QIAGEN) Chuẩn bị thư viện DNA Nextera XT (Illumina) Giải trình tự MiSeq (Illumina) với kích thước trình tự đọc 2x150 bp PHƯƠNG PHÁP (Spades) (Ragout) Chú giải gene (Res finder, ... ĐÍCH Xác định gene kháng kháng sinh cơng cụ tin sinh học từ liệu giải trình gene chủng A baumannii đa kháng phân lập lâm sàng • Lắp ráp gene phác thảo chủng A baumannii • Dò tìm gene kháng kháng ... al (2012) TỔNG QUAN Phương pháp nghiên cứu kháng thuốc PCR, điện di trường xung, whole-genome shotgun - Ít thơng tin - Nhiều bước - Tốn thời gian Whole genome sequencing (Next generation sequencing)...

Ngày tải lên: 19/04/2017, 23:15

... Ngày 18-11, hãng Roche phải giải trình trước chuyên gia FDA Cơ quan dược phẩm Liên minh châu Âu mối liên quan giữaTamiflu với trường hợp tử vong nói với 75 trường ... gia thuộc Cơ quan quản lý an toàn thực phẩm dược phẩm Mỹ (FDA) đề nghị tập đoàn Roche Thuỵ Sĩ, nơi độc quyền sản xuất thuốc chống cúm gia cầm Tamiflu, cung cấp thêm thông tin liên quan trường ... số trường hợp tử vong hậu biến chứng sau sử dụng thuốc Bộ cho biết phát 64 ca bị rối loạn tâm lý có liên quan đến thuốc Tamiflu năm qua Trưởng đại diện Tổ chức Y tế giới (WHO) Trung Quốc cho biết...

Ngày tải lên: 19/03/2014, 15:20

... trình tự nucleotide đoạn mã hóa gen GmEXP1 3.2.4 Kết xác định so sánh trình tự nucleotide gen GmEXP1 Xác định trình tự nucleotide đoạn mã hóa gen GmEXP1 tách dòng.chúng tơi tiến hành đọc trình tự ... nucleotid đoạn mã hóa gen GmEXP1 trình tự acid amin protein EXP1 Trình tự nucleotid đoạn mã hóa gen GmEXP1 đậu tƣơng đƣợc xác định có kích thƣớc 768 bp Chúng tơi tiến hành so sánh trình tự với trình tự ... sánh sai khác trình tự nucleotide đoạn mã hóa thuộc gen GmEXP1 trình tự acid amine suy diễn hai giống đậu tƣơng SL2 SL4 với trình tự cơng bố Ngân hàng gen quốc tế Số hóa trung tâm học liệu www:...

Ngày tải lên: 19/11/2014, 19:56

... Biotech, 2008 Giải trình tự gene hay gen cho nghiên cứu có liên quan Phát đột biến gene (liên quan đến ung thư, kháng thuốc), SNP (trong cá nhân hóa liệu pháp điều trị), kiểu gene (genotype virus ... 2010 Giải trình tự DNA  Mục đích: Xác định thứ tự nucleotide (A,C,G T) mạch DNA gen  Ứng dụng cơng nghệ sinh học: nghiên cứu, khám phá, chuẩn đốn điều tra  Vấn đề  Phương pháp giải trình tự ... ddNTP blocker Cắt periodate oligo Giải trình tự sinh tổng hợp Polony PCR Solid sequencing Tiến trình: Chuẩn bị thư viện DNA Emulsion/Wildfire PCR Giải trình tự ligation Wildfire PCR Sequencing:...

Ngày tải lên: 29/02/2016, 09:36

... điều trị Trung Tâm Y Khoa MEDIC giải trình tự đoạn gen 5’NC NS5B - Tìm hiểu tần suất kiểu gen khác thực giải trình tự đoạn gen NS5B trường hợp xác định kiểu gen giải trình tự đoạn gen 5’NC 2, Vật ... Core) giải trình tự đoạn NS5B: Kết cho thấy LiPA hệ với giải trình tự đoạn NS5B có ưu điểm định kiểu gen, kiểu gen xác K Sandres – Sauné cộng nghiên cứu so sánh định kiểu gen đoạn 5’NC (TRUGENE) đoạn ... gen giải trình tự đoạn 5’NC thực lại việc xác định kiểu gen với kỹ thuật giải trình tự đoạn gen NS5B, kết kiểu gen chiếm 78,22% với kiểu gen 1a 36,63%, 1b 41,59%; có 19,8% xác định lại kiểu gen...

Ngày tải lên: 12/10/2016, 00:10

... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự tồn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... trình tự trực tiếp khơng qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự tồn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... trình tự trực tiếp khơng qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen ... Nam th gi i cung c p chu i gen GP5 đ phân tích so sánh thành ph n gen m i quan h ngu n g c ph h K t qu truy c p Ngân hàng gen qu c t , s d ng chu i nucleotide c a gen GP5 c a ch ng TXMT1...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... Nghiệp K13 Viện Đại Học Mở Hà Nội 3.1.3 Kết xác định trình tự đoạn gen NovS Đoạn gen novS plasmid pGEM -3Z đuợc giải trình tự Kết giải trình tự gen novS sau: ATTGGAGCTCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAG ... pGEM -3Z mang gen novS 2.2.7 Giải trình tự gen Để giải trình tự gen ta tiến hành tách plasmid tái tổ hợp pGEMnovS tế bào vi khuẩn E.coli XL1 Blue biến nạp trên, sau gửi giải trình tự 2.2.8 Tạo ... 12: 10a So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAF67512.1 10b So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAN65241.1 10c So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAG29801.1...

Ngày tải lên: 25/12/2013, 12:42

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phát huỳnh quang màu khác Ưu điểm phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng ... polyacrylamide, quan sát đựơc đoạn có gắn P32 Đoạn DNA ngắn có đánh dấu phóng xạ chạy nhanh tác dụng điện trường Căn vào vị trí vạch quan sát gel mà xác định trình tự nucleotide MAXAM-GILBERT CHEMICAL...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... quỳnh quang, enzyme, mồi…) Bước 2: Nhân DNA PCR Bước 3: Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình tự gen Bước 4: Phân tích kết từ liệu máy tính cung cấp 2.3 Phương pháp giải trình ... ngân hàng gen xác định đoạn ADN sinh vật Biết trình tự xếp nucleotit đoạn ADN suy trình tự axit amin tương ứng mạch polypeptide đoạn ADN mã hóa Ứng dụng Xác định đột biến, sai khác trình tự nucleotit...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B trªn GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a lµ gen FliC cđa ... ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thøc víi sè truy cËp lµ AY657000 vµ AY657001 Sau ®©y xin giíi thiƯu gen FliC cđa Salmonella paratyphi B (H×nh 1) H×nh Gen FliC...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

Ngày tải lên: 11/03/2014, 08:20

... cá thể Để giải trình tự hệ gen người, nhiều DNA phân thành nhiều đoạn ngắn sau giải trình tự đoạn Nhiều DNA nghĩa đoạn DNA phân bố cách ngẫu nhiên hệ gen Các đoạn sau so sánh với trình tự tham ... bị giải trình tự hệ Roche 01 máy khối phổ để phân tích cấu trúc chức protein Thiết bị giải trình tự Roche giải trình tự đoạn DNA có kích thước đến 800 nucleotide Ngồi mục tiêu giải trình tự phân ... gen (1X) nhiều đoạn trình tự bị bỏ qua, số vùng trình tự hệ gen bao phủ số đoạn số vùng khác khơng Mức độ phủ trình tự cao hệ gen bao phủ đoạn Ngồi ra, người dạng lưỡng bội; trình tự bao phủ cao...

Ngày tải lên: 20/04/2014, 13:32