... TÀI LIỆU 1.1 Vikhuẩn tham gia chu trình Fe 1.2 Vikhuẩn oxy boá Fe(II) pH trung tính 1.2.1 Vikhuẩn hiếu khí oxy hoá Fe(II) 1.2.2 Vikhuẩn quang hợp kỵ khí oxy hoá Fe(II) 1.2.3 Vikhuẩn khử nitrate ... cứu đa dạngvikhuẩn ôxy hoá Fe(II) khử NO - Đây dạng môi trường vikhuẩn tham gia chu trình chuyển hoá sắt nitơ đóng vai trò quan trọng Mầu bùn đáy (dưới 10 cm bề mặt bùn) môi trường sinh thái ... Nghiên cứu vả so sánh đa dạng sinh học vikhuẩn ôxy hoá Fe2+/khử NO - số môi trường sinh thái khác - Phân lập nhóm vikhuẩn đại diện, chiếm đa số loại môi trường sinh thái nghiên cứu đặc điểm...
... polysaccharide) chọn vikhuẩn có tỉ lệ kết tụ cao / tỉnh Tổng cộng có 10 vikhuẩn kết tụ protein 10 vikhuẩn kết tụ polysaccharide chọn 2.3.4 Nhận diện, dịnh danh chủng vikhuẩn tuyển chọn *Quan sát khuẩn lạc ... chọn *Quan sát khuẩn lạc qua: màu sắc, hình dạng, độ nổi, kích thước Hình dạng, chuyển động vikhuẩn quan sát qua kính hiển vi quang học * Định danh vikhuẩn qua phân tích trình tự gen 16S rDNA ... pH tỉ lệ kết tụ nước ao chủng vikhuẩn tổ hợp vikhuẩn Khả tạo kết tụ chủng, tổ hợp vikhuẩn kiểm tra cách đo lượng TSS COD nước ao trước sau xử lý nước với vikhuẩn để thấy tỉ lệ TSS COD giảm...
... vikhuẩn nước ao cá Trà Vinh Hình 4.28.Tỉ lệ kết tụ chủng, tổ hợp vikhuẩn nước ao Cần Thơ Hình 4.29 Tỉ lệ kết tụ chủng, tổ hợp vikhuẩn nước ao Cần Thơ Hình 4.30 Tỉ lệ kết tụ chủng, tổ hợp vi ... (2011) Hình 3.1 Sơ đồ tóm tắt giai đoạn thí nghiệm Hình 3.2 Bản đồ tổng quát địa điểm thu mẫu 10 tỉnh ĐBSCL Hình 3.3 Thu mẫu ao nuôi cá Hình 3.4 Xác định mật số vikhuẩnHình 3.5 Khuẩn lạc vikhuẩn ... quan vikhuẩn tạo kết tụ polysaccharide chủng tương đồng di truyền Hình 4.18 Ảnh chủng vikhuẩn qua kính hiển vi điện tử quét Hình 4.19 Đồ thị biểu diễn tỉ lệ kết tụ vikhuẩn theo giá trị pH Hình...
... ghi nhận loại khuẩn lạc màu hồng điển hình E coli, kí hiệu HM MAC mơi trường chọn lọc cho vikhuẩn Gram âm, đặc biệt E coli Muối mật có mơi trường ức chế vikhuẩn Gram dương Khi vikhuẩn Gram âm ... chế vikhuẩn gram dương phần vikhuẩn gram âm đường ruột Sau đó, cấy chuyển vikhuẩn lên mơi trường thạch CT-SMAC với mục tiêu tăng sinh nhóm STEC, cefixime tellurite có tác dụng ức chế vikhuẩn ... CT-SMAC Vikhuẩn E coli nhóm STEC phát triển tạo khuẩn lạc khơng màu xám với tâm đục, E coli khác cho khuẩn lạc hồng giống mơi trường MAC (2) Chọn khuẩn lạc điển hình E coli - Quan sát loại khuẩn...
... TS : Khuẩn lạc trắng môi trường SMAC UV : Ultra violet VT : Verotoxin VTEC : Verotoxigenic E coli ix DANH SÁCH CÁC HÌNH, SƠ ĐỒ, BIỂU ĐỒ HÌNH TRANG Hình 2.1 Nguyên lý phản ứng PCR 13 Hình ... lục vi Danh sách chữ vi t tắt viii Danh sách hình x Danh sách bảng xi ĐẶT VẤN ĐỀ TỔNG QUAN .3 2.1 Vikhuẩn E coli ... stb, vt2e vikhuẩn E coli phân lập từ 27 mẫu phân tiêu chảy bò, heo, bê mẫu bề mặt thịt bò kỹ thuật multiplex – PCR Ghi nhận khuẩn lạc hồng môi trường MAC; SMAC có loại: khuẩn lạc hồng khuẩn lạc...
... DANH MỤC CÁC CHỮ VI T TẮT VKL Vikhuẩnlam VKL CĐN Vikhuẩnlam cố định đạm Lô 100% nước cất ( Đối chứng) Lô 100% dung dịch BG 11 không đạm ( Đối chứng) Lô 1A – 1B 25% dịch vẩn vikhuẩnlam + 75% ... + 75% nước cất Lô 2A – 2B 50% dịch vẩn vikhuẩnlam + 50% nước cất Lô 3A – 3B 75% dịch vẩn vikhuẩnlam + 25% nước cất Lô 4A - 4B 100% dịch vẩn vikhuẩnlam Chủng A Nostoc calcicola Breb.ex Born.et ... điển hình (Procaryota) Xét cấu trúc hình thái, thể tảo lam thường gặp mức độ sau: đơn bào, tập đoàn (kiểu palmelloid), dạng sợi dị sợi Tế bào thể đơn bào thường có dạnghình cầu, hình trụ hình...
... newly discovered verotoxin variant, VT2g, produced by bovine verocytotoxigenic Escherichia coli Appl Environ Microbiol 69: 7549-7553 35 Levine M M., Xu J., Kapper J B., Lior H., Prado V., Tall ... 40:3613-3619 51 Wieler L H., Vieler E., Erpenstein C., Schlapp T., Steinruck H., Bauerfeind R., Byomi A., and Baljer G., 1996 Shiga toxin-producing Escherichia coli strains from bovines: Association of ... M., 1998 Vero cytotoxin-producing strains of Escherichia coli J Med Microbiol 26:77-85 47 Timisjarvi A T., Alatossava T., 2004 Rapid DNA preparation from milk and dairy process samples for the detection...
... 4, 6, Ở mẫu phân có loại khuẩn lạc HS HM Cả hai loại khuẩn lạc mang gen stx1 Ở mẫu phân có hai loại khuẩn lạc HS HM Cả hai loại khuẩn lạc mang gen stx1, eae, hly Vi c phát nhiều gen độc lực ... loại khuẩn lạc hồng (HM), môi trường thạch SMAC xuất loại khuẩn lạc trắng (TS) hồng (HS), môi trường thạch CT-SMAC xuất loại khuẩn lạc trắng (6) Nhóm khuẩn lạc có mang gen độc lực chưa khuẩn ... phân lập từ phân bê tiêu chảy Bảng 4.5 Kết phát gen độc lực nhóm khuẩn lạc đại diện cho E coli phân bê tiêu chảy Mẫu Gen độc lực Loại khuẩn lạc Thứ tự stx1 stx2 eae hly lt sta stb vt2e - - - - -...
... ghi nhận loại khuẩn lạc màu hồng điển hình E coli, kí hiệu HM MAC môi trường chọn lọc cho vikhuẩn Gram âm, đặc biệt E coli Muối mật có môi trường ức chế vikhuẩn Gram dương Khi vikhuẩn Gram âm ... chế vikhuẩn gram dương phần vikhuẩn gram âm đường ruột Sau đó, cấy chuyển vikhuẩn lên môi trường thạch CT-SMAC với mục tiêu tăng sinh nhóm STEC, cefixime tellurite có tác dụng ức chế vikhuẩn ... trường đỏ khuẩn lạc có màu đỏ (Koneman, 1983) Mẫu phân tiêu chảy nuôi cấy thạch SMAC, ta quan sát loại khuẩn lạc: khuẩn lạc hồng (HS) khuẩn lạc trắng (TS) Vikhuẩn không sử dụng sorbitol cho khuẩn...
... CT-SMAC Vikhuẩn E coli nhóm STEC phát triển tạo khuẩn lạc không màu xám với tâm đục, E coli khác cho khuẩn lạc hồng giống môi trường MAC (2) Chọn khuẩn lạc điển hình E coli - Quan sát loại khuẩn ... Mỗi nhóm khuẩn lạc chọn – 10 khuẩn lạc rời rạc đại diện E coli mẫu khảo sát Các nhóm khuẩn lạc sau: – 10 khuẩn lạc hồng MAC (Ký hiệu HM) – 10 khuẩn lạc trắng SMAC (Ký hiệu TS) – 10 khuẩn lạc ... nhóm khuẩn lạc (DNA tổng) (4) Thử sinh hóa - Sau nuôi cấy, khuẩn lạc rời rạc thử phản ứng IMViC để xác định E coli 3.2.2.3 Ly trích DNA khuẩn lạc Sau thu nhóm khuẩn lạc ống eppendorf giữ gốc khuẩn...
... vào lơng bề mặt vi khuẩn, gọi yếu tố định vị (CF hay CFA - Colonization factor antigens) CFA phân loại dựa đặc tính hìnhthái Có loại gồm loại lơng hình que cứng, lơng hình que mềm dạng bó, lơng ... tác nhân gây bệnh Ví dụ: Khuếch đại DNA vi khuẩn, virus mẫu bệnh phẩm trước triệu chứng bệnh bắt đầu xuất nhiều ngày, nhiều tuần, chí nhiều tháng Từ ta đề cách chữa trị thích hợp ngăn chặn thiệt ... nhầy khác cá thể nhiễm ETEC, (2) người nhiễm khơng có biểu triệu chứng thải lượng lớn vikhuẩn qua phân, (3) vi c nhiễm đạt liều gây nhiễm cao Ba đặc tính tạo nên tình trạng nhiễm ETEC 22 mơi trường...
... kết Hơn nữa, E coli vikhuẩn bình thường đường ruột thường có 13 mặt thực phẩm nên vi c phân lập vikhuẩn E coli phân để tìm nguyên nhân gây bệnh hay xác định số lượng vikhuẩn thực phẩm hoàn ... 2.1 Vikhuẩn E coli 2.1.1 Định nghĩa - Vikhuẩn Escherichia coli tên đặt theo tên nhà bác sĩ nhi khoa người Đức Theodor Escherich (1857-1911), ông người phân lập mô tả vikhuẩn vào năm 1885 - Vi ... cho khuẩn lạc điển hình màu trắng, nhầy, nhóm E coli lên men sorbitol cho khuẩn lạc màu hồng (FDA, 2002) 15 - E coli mọc tốt môi trường thạch dinh dưỡng (NA: nutrient agar), sau 24 hình thành khuẩn...
... Mục lục vi Danh sách chữ vi t tắt viii Danh sách hình x Danh sách bảng xi ĐẶT VẤN ĐỀ TỔNG QUAN 2.1 Vikhuẩn E coli ... trắng; khuẩn lạc trắng CT-SMAC Mỗi nhóm chọn khoảng – 10 khuẩn lạc riêng lẻ Ly trích DNA theo nhóm khuẩn lạc khuẩn lạc riêng lẻ theo phương pháp nhiệt Kết multiplex - PCR ghi nhận sau: (1) Nhóm khuẩn ... stb, vt2e vikhuẩn E coli phân lập từ 27 mẫu phân tiêu chảy bò, heo, bê mẫu bề mặt thịt bò kỹ thuật multiplex – PCR Ghi nhận khuẩn lạc hồng môi trường MAC; SMAC có loại: khuẩn lạc hồng khuẩn lạc...
... nâu (Dioscoreaceae) - Thân củ: thân phình to chứa chất dinh dưỡng (Su hào, Khoai tây) - Thân hành: loại chồi ngầm đất, rút ngắn thường có dạng tròn, trứng, hình cầu dẹp Loại thân thường gặp họ ... rễ: loại thân ngầm đất mà bề trông giống rễ chứa chất dự trữ; thân rễ khác với rễ chỗ chóp rễ có dạng vảy, nách vảy có chồi mấu chồi mọc rễ phụ: thân Cỏ tranh, Gừng, Chuối 64 - Thân mọng nước:...
... men đƣờng chủng vikhuẩn Vibrio 51 Bảng 3.4 Khả sử dụng lysin chủng vikhuẩn 52 vi DANH MỤC HÌNHHình 1.1 Cấu tạo Vibrio dƣới kính hiển vi điện tử Hình 2.1 Sơ đồ cách tiếp cận nội ... nghiên cứu 27 2.3.1 Phân lập vikhuẩn 27 2.3.2 Xác định đặc điểm hìnhtháivikhuẩn Vibrio 30 2.3.3 Xác định số đặc tính sinh hóa chủng Vibrio 31 2.3.4 Bảo quản chủng vikhuẩn 33 2.3.5 Tách chiết ... 37oC 48 Hình 3.3 Tế bào chủng vikhuẩn Vibrio T11 sau nhuộm Gram 49 Hình 3.4 Thí nghiệm lên men đƣờng chủng vikhuẩn T5 51 Hình 3.5 Thí nghiệm sử dụng lysin chủng Vibrio 52 Hình 3.6 DNA...
... tiêm canh khuẩn vào xoang phúc mạc 34 Hình 3.2 Phương pháp tiêm độc tố vào tĩnh mạch đuôi chuột 35 Hình 4.1 .Hình tháivi khuẩn, trực khuẩn Gram dương 38 Hình 4.2 Hìnhtháivi khuẩn, ... dương Hình 3.2 Hìnhtháivi khuẩn, phương pháp soi tươi Hình 3.3 Dung huyết β môi trường thạnh máu Hình 3.4 Hìnhtháikhuẩn lạc môi trường thạch SPS Hình 3.5 Trên môi trường Egg yolk Hình 3.6 Trên ... perfringens vikhuẩn dinh dưỡng hữu yếm khí Vikhuẩn phát triển tốt nhiệt độ từ 200C - 500C, nhiệt độ tối thích 450C sau vikhuẩn mọc [9] 9 Vikhuẩn có khả hình thành nha bào, nha bào hình ovan...
... cho vikhuẩn sinh trưởng từ 26 - 300C, nhiệt độ tối thiểu - 50C, tối đa 400C cao 530C làmvikhuẩn chết Vikhuẩn sống phạm vi pH rộng từ 5,7 8,5 thích hợp pH 6,8 - 7,2 Hình 2.3 Ảnh hiển vi điện ... x 0,5-0,9 µm Trên môi trường nhân tạo khuẩn lạc cầu vikhuẩn có dạnghình tròn, màu vàng sáp, rìa nhẵn, bề mặt khuẩn lạc ướt, háo khí, nhuộm Gram âm Vikhuẩn khả phân giải nitrat, không dịch ... chịu trách nhiệm tổng hợp cấu tử 16S 23S ribosome vikhuẩn bạc lúa 1.1.6 Đặc điểm hìnhthái cấu trúc Vikhuẩn Xoo thuộc họ Pseudomonadaceae, có dạnghình gậy hai đầu tròn, có lông roi đầu, kích thước...