Ảnh hưởng của cấu trúc đến hoạt tính hóa học các dẫn xuất halogen trong phản ứng thế nucleophin

TRƯỜNG ĐẠI HỌC AN GIANG KHOA SƯ PHẠM ẢNH HƯỞNG CỦA CẤU TRÚC ĐẾN HOẠT TÍNH HĨA HỌC CÁC DẪN XUẤT HALOGEN TRONG PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN NGUYỄN MINH LÝ AN GIANG, 08 – 2014 TRƯỜNG ĐẠI HỌC AN GIANG KHOA SƯ PHẠM ẢNH HƯỞNG CỦA CẤU TRÚC ĐẾN HOẠT TÍNH HĨA HỌC CÁC DẪN XUẤT HALOGEN TRONG PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN NGUYỄN MINH LÝ MSSV: DHH101104 GVHD: TS PHẠM PHÁT TÂN AN GIANG, 08 – 2014 -i- Đề tài nghiên cứu khoa học “Ảnh hưởng cấu trúc đến hoạt tính hóa học dẫn xuất halogen phản ứng nucleophin”, sinh viên Nguyễn Minh Lý thực hướng dẫn TS Phạm Phát Tân Tác giả báo cáo kết nghiên cứu Hội đồng Khoa học Đào tạo Trường Đại học An Giang thông qua ngày 20/08/2014 Thƣ ký Phản biện Phản biện NGUYỄN THỊ MỸ PHƢỢNG BÙI PHƢỚC PHÚC Cán hƣớng dẫn PHẠM PHÁT TÂN Chủ tịch Hội đồng HOÀNG XUÂN QUẢNG - ii - LỜI CẢM TẠ Đề hoàn thành nghiên cứu khoa học, nhận động viên, giúp đỡ hỗ trợ nhiệt tình từ gia đình, nhà trường, thầy cô bạn bè Thông qua nghiên cứu khoa học này, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến TS Phạm Phát Tân tận tình hướng dẫn, động viên tạo điều kiện thuận lợi để tơi thực hồn thành nghiên cứu Thầy giảng dạy kiến thức cần thiết để hồn thành nghiên cứu cho tơi hội tiếp cận sâu lĩnh vực Hóa – Tin Tơi xin chân thành cảm ơn thầy cô Khoa Sư Phạm nói chung thầy giảng dạy chuyên ngành Sư Phạm Hóa nói riêng giảng dạy qua học phần, cung cấp kiến thức khoa học đại Con xin cảm ơn cha mẹ mang lại nguồn cảm hứng hi vọng cho con, đồng hành, nâng đỡ chia sẻ thất bại, thành công trình thực nghiên cứu Cuối cùng, tơi xin gửi lời chúc sức khỏe hạnh phúc đến gia đình, thầy cô bạn bè Xin chân thành cảm ơn ! An giang, ngày 01 tháng 08 năm 2014 Nguyễn Minh Lý - iii - TÓM TẮT Nghiên cứu trình bày kết khảo sát cấu trúc dẫn xuất halogen, tác nhân nucleophin ảnh hưởng cấu trúc đến hoạt tính hố học dẫn xuất phản ứng nucleophin đơn phân tử (SN1) lưỡng phân tử (SN2) Cấu trúc chất phản ứng, sản phẩm trung gian, trạng thái chuyển tiếp sản phẩm tính tốn với phương pháp ab initio áp dụng lý thuyết phiếm hàm mật độ DFT mức B3LYP/6-31G(d) chương trình Gaussian 03W B.04 biểu diển GaussView 3.0 Trong đó, việc khảo sát phản ứng yếu tố ảnh hưởng thực bước cách tối ưu hố, tính tốn tần số dao động, tính lượng obitan biên, mật độ điện tích cấu trúc; tìm trạng thái chuyển tiếp, thông số nhiệt động động học phản ứng Trạng thái chuyển tiếp xác thực thơng qua việc phân tích tần số dao động toạ độ nội phản ứng Kết thu cho thấy ảnh hưởng cấu trúc chất nền, tác nhân nucleophin đến hoạt tính hố học dẫn xuất halogen phản ứng nucleophin khảo sát phương pháp tính tốn lượng tử hố hồn tồn phù hợp với nghiên cứu thực nghiệm Từ khoá: phản ứng nucleophin, tác nhân nucleophin, dẫn xuất halogen, tính tốn lượng tử - iv - ABSTRACT This study presents the quantum calculation results of halogenated hydrocarbons, nucleophile and the influences of the structures to chemical activity in unimolecular nucleophilic substitution reaction (SN1) and bimolecular nucleophilic substitution reaction (SN2) The structures of reactant, intermediate structure, transition state and product were calculated by ab initio method applying density functional theory (DFT) with the B3LYP/6-31G(d) basis sets by Gaussian 03W program B.04 and were displayed by GaussView 3.0 software Specifically, the survey of reactions and the impact of factors on the reactions was carried out step by step such as optimization of structures; calculation of vibration frequency, frontier molecular orbital energies and charge density; searching for transition states, thermodynamic parameters and chemical kinetic parameters of reactions Accurate transition states were inspected by analysis of vibration frequency and intrinsic reaction coordinate The results shown that the influences of the structures to the chemical activity of halogenated hydrocarbons were completely suitable for experimental researches in nucleophilic substitution reactions Keywords: nucleophilic substitution reaction, nucleophile, halogenated hydrocarbon, quantum computing -v- LỜI CAM KẾT Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu nêu cơng trình nghiên cứu có xuất xứ rõ ràng Những kết luận khoa học cơng trình nghiên cứu chưa cơng bố cơng trình khác An giang, ngày 01 tháng 08 năm 2014 Nguyễn Minh Lý - vi - MỤC LỤC Trang Chƣơng 1: GIỚI THIỆU 1.1 Tính cần thiết đề tài 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Đối tƣợng nghiên cứu 1.4 Nội dung nghiên cứu 1.5 Những đóng góp đề tài Chƣơng 2: TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 2.1 Giới thiệu phản ứng nucleophin 2.1.1 Phản ứng 2.1.2 Tác nhân nucleophin 2.1.3 Phản ứng nucleophin 2.2 Phản ứng nucleophin dẫn xuất halogen 2.2.1 Phản ứng SN2 2.2.2 Phản ứng SN1 15 2.3 Khảo sát phản ứng nucleophin dẫn xuất halogen phƣơng pháp obitan biên 19 2.3.1 Giới thiệu 19 2.3.2 Các obitan biên 19 2.3.3 Một số ứng dụng phạm vi sử dụng 21 Chƣơng 3: PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 3.1 Gaussian 03 phiên B04 22 3.2 GaussView 03 22 3.3 Phần mềm hỗ trợ khác 23 3.4 Các phƣơng pháp tính tốn 23 Chƣơng 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 4.1 Khảo sát trạng thái bền dẫn xuất halogen 35 4.2 Nhận định khả phản ứng qua mật độ điện tích 36 4.3 Obitan phân tử dẫn xuất halogen tác nhân nucleophin 37 4.4 Khảo sát phản ứng SN2 38 4.4.1 Cấu trúc chất tham gia, sản phẩm phản ứng SN2 C2H5Cl tác nhân Br- 38 4.4.2 Năng lượng HOMO – LUMO 38 4.4 Hiệu ứng nhiệt biến thiên lượng tự phản ứng 39 - vii - 4.4.4 Trạng thái chuyển tiếp 40 4.4.5 Năng lượng tự hoạt hóa số tốc độ 42 4.5 Các yếu tố ảnh hƣởng phản ứng SN2 43 4.5.1 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon 43 4.5.2 Ảnh hưởng nhóm 53 4.5.3 Ảnh hưởng tác nhân nucleophin 55 4.5.4 Ảnh hưởng dung môi 56 4.6 Khảo sát phản ứng SN1 62 4.6.1 Chất tham gia, sản phẩm phản ứng SN1 C4H9Cl (tert – butyl clorua) OH- 62 4.6.2 Hiệu ứng nhiệt biến thiên lượng tự phản ứng 62 4.6.3 Trạng thái chuyển tiếp giai đoạn 63 4.6.4 Các giá trị nhiệt động giai đoạn 66 4.6.5 Khảo sát giai đoạn 68 4.7 Các yếu tố ảnh hƣởng phản ứng SN1 71 4.7.1 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon 71 4.7.2 Ảnh hưởng nhóm 79 4.7.3 Ảnh hưởng tác nhân nucleophin 81 4.7.4 Ảnh hưởng dung môi 81 4.8 So sánh phƣơng pháp tính khác cấu trúc hệ cấu trúc khảo sát 83 Chƣơng 5: KẾT LUẬN VÀ KHUYẾN NGHỊ 88 5.1 Kết luận 88 5.2 Khuyến nghị 89 TÀI LIỆU THAM KHẢO 90 PHỤ LỤC 91 - viii - DANH SÁCH BẢNG Bảng 2.1 : Một số tác nhân nucleophin sản phẩm thu Bảng 4.1 : Giá trị hệ số HOMO, LUMO Br- C2H5Cl 39 Bàng 4.2: Các giá trị nhiệt động phản ứng C2H5Cl Br- (T = 298,15K; P = 1,00 atm) 40 Bảng 4.3 : Năng lượng tự hoạt hóa số tốc độ phản ứng SN2 C2H5Cl Br- 42 Bảng 4.4 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 43 Bảng 4.5: Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng SN2 dẫn xuất khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 44 Bảng 4.6 : Năng lượng tổng cộng chất phản ứng SN2 dẫn xuất khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 44 Bảng 4.7 : Hằng số tốc độ phản ứng SN2 khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 45 Bảng 4.8 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 47 Bảng 4.9 : Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C 47 Bảng 4.10 : Năng lượng tổng cộng dẫn xuất tác nhân nucleophin phản ứng khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C 48 Bảng 4.11 : Hằng số tốc độ phản ứng khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 48 Bảng 4.12 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 49 Bảng 4.13 : Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng dẫn xuất allyl benzyl 50 Bảng 4.14 : Năng lượng tổng cộng dẫn xuất tác nhân nucleophin phản ứng khảo sát ảnh hưởng R gốc allyl, benzyl 50 Bảng 4.15 : Hằng số tốc độ phản ứng khảo sát ảnh hưởng R gốc allyl, benzyl 50 Bảng 4.16 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 51 Bảng 4.17 : Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng khảo sát ảnh hưởng R xicloankyl 52 Bảng 4.18 : Năng lượng tổng cộng dẫn xuất nucleophin phản ứng khảo sát ảnh hưởng R xicloankyl 52 Bảng 4.19 : Hằng số tốc độ phản ứng khảo sát ảnh hưởng R xicloankyl 53 Bảng 4.20 : Năng lượng tổng cộng thành phần tính lượng liên kết 54 Bảng 4.21 : Độ dài lượng liên kết C – X 54 Bảng 4.22 : Năng lượng liên kết C – X thực nghiệm 55 11 12 13 14 15 16 1 1 17 35 0.26 0.19 0.12 0.22 -0.05 -0.13 Frequencies -Red masses -Frc consts -IR Inten -Atom AN X 0.06 0.01 0.01 0.00 -0.06 0.04 0.28 0.18 -0.14 10 -0.12 11 0.14 12 0.00 13 -0.09 14 -0.20 15 17 0.00 16 35 0.00 Frequencies -Red masses -Frc consts -IR Inten -Atom AN X 0.04 0.07 0.02 -0.12 -0.07 -0.06 0.26 0.28 -0.19 10 0.16 11 -0.12 12 -0.12 13 0.07 14 0.07 15 17 0.00 16 35 0.00 Frequencies -Red masses -Frc consts -IR Inten -Atom AN X 0.07 -0.01 -0.12 -0.04 0.13 0.10 -0.27 0.26 -0.23 0.10 -0.07 0.05 -0.11 0.21 -0.09 0.05 -0.22 0.42 -0.16 -0.20 0.11 A 286.3555 1.6929 0.0818 0.2622 Y Z 0.07 0.00 -0.08 -0.01 0.14 -0.07 0.00 0.00 -0.11 0.07 0.26 -0.10 0.06 0.10 -0.22 -0.13 -0.23 0.09 0.19 -0.32 0.37 0.02 0.00 -0.01 -0.37 0.01 -0.06 0.32 -0.02 -0.02 0.01 0.01 10 A 635.9387 1.8451 0.4397 2.7720 Y Z -0.04 -0.01 0.01 0.00 0.13 0.10 0.03 0.01 -0.11 -0.09 0.21 0.03 -0.07 0.02 -0.12 -0.05 -0.15 -0.01 0.06 0.46 -0.24 -0.04 0.03 -0.01 0.27 0.04 -0.15 -0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 13 A 852.4894 2.0254 0.8673 13.6732 Y Z 0.05 0.09 0.08 0.10 0.04 -0.10 -0.05 -0.04 -0.04 -0.10 -0.27 0.28 0.05 -0.08 -0.13 -0.07 -0.15 0.30 -0.17 0.07 0.28 0.25 -0.03 0.00 X -0.02 0.01 0.02 -0.04 0.05 0.00 -0.11 0.09 -0.03 -0.01 0.10 -0.03 0.18 0.09 0.03 -0.02 X -0.08 -0.10 0.00 0.20 -0.02 -0.05 0.14 0.12 -0.19 0.13 -0.35 0.17 -0.13 0.12 0.00 0.00 X 0.01 -0.04 -0.03 0.21 -0.05 -0.03 -0.18 -0.14 -0.12 0.08 0.20 0.18 0.37 0.15 0.18 0.08 0.07 -0.02 -0.09 -0.02 -0.06 A 329.9047 1.9197 0.1231 41.3946 Y Z 0.03 0.00 0.03 0.00 0.13 -0.06 -0.11 0.06 0.12 -0.07 -0.04 0.03 0.05 0.01 0.00 0.03 0.00 0.01 0.15 -0.45 0.46 0.08 -0.09 0.06 0.44 0.05 0.10 -0.45 -0.06 0.02 -0.02 0.01 11 A 798.7920 2.3920 0.8992 18.8546 Y Z 0.01 0.09 0.04 -0.08 0.06 -0.15 -0.08 0.00 -0.02 0.14 0.16 -0.11 -0.01 0.14 -0.08 -0.07 -0.09 0.07 -0.02 0.33 -0.29 -0.23 -0.23 0.03 0.37 0.17 -0.06 -0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 14 A 885.5065 2.3990 1.1083 10.4713 Y Z 0.01 0.04 -0.01 -0.02 0.08 0.17 -0.08 -0.03 -0.02 -0.17 -0.06 0.17 0.05 0.05 0.05 -0.02 0.04 -0.20 158 -0.01 -0.02 0.01 -0.13 0.02 -0.01 X 0.10 -0.10 -0.07 0.00 0.04 0.08 0.42 -0.33 0.11 -0.18 0.11 0.02 -0.03 0.16 0.00 0.00 X -0.03 0.02 -0.03 0.03 0.00 -0.06 -0.03 0.05 0.02 0.01 -0.03 0.22 0.03 -0.01 0.00 0.00 X -0.01 0.12 -0.09 0.04 -0.04 -0.18 0.01 -0.03 0.25 -0.22 -0.02 -0.04 -0.07 0.16 -0.07 0.16 -0.15 0.02 0.09 -0.01 -0.02 A 570.0436 1.7918 0.3430 42.1756 Y Z -0.05 0.10 0.01 0.10 -0.02 -0.06 0.04 -0.07 -0.07 -0.06 0.30 -0.13 -0.03 0.31 0.22 0.30 0.26 -0.13 0.03 -0.17 0.09 -0.05 0.09 0.01 0.15 -0.06 -0.11 -0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 12 A 836.7245 1.1418 0.4710 21.0149 Y Z 0.04 0.01 0.02 -0.01 -0.04 -0.03 0.03 0.01 -0.05 0.01 0.00 0.11 0.00 -0.10 -0.03 -0.12 -0.05 0.13 -0.04 -0.10 0.05 0.02 0.88 -0.23 0.11 0.05 -0.05 -0.15 -0.02 0.01 -0.01 0.00 15 A 905.4011 1.6081 0.7767 80.4370 Y Z 0.04 0.05 0.01 -0.06 -0.08 -0.02 0.07 0.04 -0.08 -0.01 0.09 0.38 -0.04 -0.17 0.01 -0.25 0.00 0.13 10 11 12 13 14 15 16 1 1 17 35 0.11 -0.21 -0.02 0.08 -0.10 0.00 0.00 -0.06 0.11 -0.22 -0.20 0.00 0.27 -0.33 -0.17 0.03 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 16 A Frequencies -908.2093 Red masses -2.8759 Frc consts -1.3977 IR Inten -13.4931 Atom AN X Y Z 0.18 -0.10 0.17 0.12 -0.04 -0.16 -0.09 0.01 -0.06 -0.09 -0.01 -0.02 -0.08 0.15 0.08 0.19 -0.21 0.26 0.01 -0.06 0.21 0.09 0.04 -0.02 0.03 0.06 -0.50 10 0.01 -0.03 -0.01 11 -0.34 -0.03 -0.02 12 -0.06 0.19 -0.21 13 -0.28 0.10 -0.01 14 -0.17 0.17 0.16 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 19 A Frequencies 1018.0039 Red masses -1.4721 Frc consts -0.8988 IR Inten -11.8991 Atom AN X Y Z 0.07 -0.03 -0.02 -0.06 0.02 0.01 0.07 -0.04 -0.05 0.03 0.04 0.10 -0.10 0.02 -0.04 0.16 -0.16 -0.12 -0.01 -0.04 -0.06 0.02 -0.04 -0.01 -0.16 -0.03 -0.04 10 0.23 -0.09 -0.08 11 0.31 -0.09 -0.13 12 0.08 0.17 0.62 13 -0.37 0.13 -0.14 14 -0.27 0.07 -0.09 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 22 A Frequencies 1201.6635 Red masses -1.4609 Frc consts -1.2429 IR Inten -1.0364 Atom AN X Y Z 0.03 -0.04 -0.10 0.04 0.02 0.10 -0.08 -0.03 -0.02 0.07 -0.02 0.00 -0.05 0.06 0.02 -0.32 0.27 0.42 0.09 -0.05 -0.10 0.14 -0.02 0.13 -0.21 -0.25 0.25 -0.35 -0.31 0.00 0.00 0.15 0.14 0.23 0.31 0.01 -0.10 -0.14 -0.33 0.06 -0.03 -0.01 0.00 0.00 0.00 17 A 933.1126 1.5950 0.8182 37.7552 X Y Z 0.12 0.00 0.01 -0.10 0.08 0.02 0.02 -0.04 0.07 -0.01 0.00 -0.10 -0.03 -0.01 0.08 0.17 -0.29 0.13 0.00 -0.13 -0.38 -0.07 -0.11 -0.39 -0.31 -0.13 0.17 -0.08 0.01 -0.14 0.22 0.10 0.08 -0.06 -0.19 -0.32 -0.09 0.24 0.09 0.10 -0.05 -0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 A 1028.2872 1.7922 1.1165 5.5422 X Y Z -0.04 0.06 0.13 -0.09 -0.02 -0.13 0.11 -0.01 0.02 -0.04 0.02 0.02 0.07 -0.06 -0.03 -0.19 0.10 0.42 -0.19 0.11 0.20 -0.21 0.02 -0.21 -0.27 0.02 -0.44 0.15 -0.02 -0.04 0.37 -0.07 -0.08 -0.04 0.03 0.08 0.25 -0.13 0.04 0.04 -0.05 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 A 1228.0863 1.4403 1.2799 0.1118 X Y Z 0.05 0.11 -0.05 -0.02 -0.12 0.05 -0.01 0.05 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.04 -0.03 0.01 0.01 -0.10 0.22 -0.17 0.09 -0.22 -0.16 0.03 0.24 159 -0.31 -0.04 -0.05 -0.11 0.15 0.00 0.00 0.01 -0.17 0.16 0.08 -0.35 0.44 0.18 0.00 -0.14 -0.15 0.01 0.00 0.00 0.00 18 A 997.1498 1.2729 0.7457 0.3400 X Y Z -0.05 -0.06 0.02 0.00 0.08 -0.03 0.00 -0.05 0.04 -0.01 0.00 0.00 0.03 0.05 -0.04 -0.13 0.26 -0.07 0.27 -0.10 0.07 0.27 -0.08 -0.07 -0.26 -0.12 0.05 0.34 -0.16 -0.28 -0.17 0.17 0.19 0.00 0.01 0.03 -0.24 -0.05 -0.18 0.38 -0.06 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 A 1151.5953 1.2442 0.9722 129.2669 X Y Z 0.00 -0.02 0.00 0.00 -0.02 0.01 0.02 0.07 -0.02 -0.03 -0.09 0.04 0.01 0.07 -0.03 -0.14 0.12 0.18 0.22 -0.15 -0.24 -0.26 0.01 -0.24 0.15 0.02 0.13 -0.27 0.16 0.25 0.26 -0.19 -0.21 0.03 0.17 0.00 -0.26 -0.02 -0.17 0.35 -0.03 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 A 1254.2564 1.5936 1.4771 18.3384 X Y Z -0.07 0.07 0.00 0.10 0.02 0.00 -0.07 0.00 0.07 -0.02 -0.07 -0.10 0.05 -0.04 0.07 0.16 -0.12 -0.36 -0.13 0.12 0.09 0.19 0.01 0.09 10 11 12 13 14 15 16 1 1 1 17 35 -0.43 -0.07 0.22 0.08 0.27 -0.08 0.00 0.00 -0.02 -0.41 -0.03 -0.05 -0.08 -0.12 -0.03 -0.03 -0.06 0.15 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 A Frequencies 1299.7942 Red masses -1.4352 Frc consts -1.4286 IR Inten -29.8494 Atom AN X Y Z -0.06 -0.02 0.01 0.03 -0.06 0.02 -0.05 0.06 0.06 0.00 0.00 -0.10 0.09 0.02 0.06 -0.11 0.09 0.05 0.29 -0.19 -0.26 -0.33 0.03 -0.22 0.12 0.01 0.00 10 0.45 -0.12 -0.17 11 -0.02 -0.05 -0.01 12 0.02 0.02 0.24 13 -0.07 0.00 -0.02 14 -0.45 0.17 -0.18 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 28 A Frequencies 1369.0607 Red masses -1.5044 Frc consts -1.6614 IR Inten -1.8135 Atom AN X Y Z 0.00 -0.03 -0.08 0.06 0.02 0.11 0.06 -0.03 -0.07 -0.04 0.03 0.04 0.08 -0.03 0.04 -0.10 0.10 0.02 -0.20 0.16 0.31 -0.32 -0.01 -0.43 -0.24 -0.01 -0.21 10 -0.08 0.03 0.13 11 -0.31 0.15 0.10 12 -0.08 -0.04 -0.12 13 -0.39 0.10 -0.14 14 -0.11 0.02 -0.09 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 31 A Frequencies 1457.4711 Red masses -1.0786 Frc consts -1.3499 IR Inten -49.9938 Atom AN X Y Z -0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.03 -0.01 -0.03 0.00 -0.02 -0.02 0.01 -0.04 -0.04 -0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.00 0.05 0.47 -0.26 0.01 -0.18 0.50 0.00 0.00 0.07 -0.23 -0.13 -0.10 0.00 0.03 0.01 0.01 0.15 -0.02 -0.19 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 26 A 1307.8187 1.3309 1.3412 1.1849 X Y Z -0.02 0.01 0.05 0.03 0.00 0.05 0.09 -0.02 -0.02 -0.01 -0.03 -0.08 -0.08 0.04 -0.02 0.13 -0.10 -0.19 0.14 -0.10 -0.16 -0.18 0.00 -0.20 -0.17 0.00 -0.19 -0.18 0.08 0.11 -0.37 0.14 0.17 0.06 0.18 0.44 0.41 -0.12 0.18 0.16 -0.03 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 A 1372.2642 1.6323 1.8110 3.5342 X Y Z -0.07 0.05 0.10 0.07 -0.02 0.05 -0.05 -0.01 -0.04 0.03 0.05 0.13 -0.01 -0.02 -0.08 0.23 -0.17 -0.39 0.20 -0.17 -0.35 -0.11 -0.01 -0.16 -0.18 0.02 -0.34 0.10 -0.06 -0.06 0.11 -0.07 -0.12 -0.05 -0.21 -0.48 0.05 -0.06 -0.06 -0.03 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 A 1512.4807 1.0875 1.4657 3.3757 X Y Z 0.04 -0.03 0.04 -0.04 -0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.01 -0.04 0.47 -0.23 -0.44 -0.05 -0.29 160 -0.22 -0.23 0.39 0.04 -0.33 0.20 0.00 0.00 0.00 -0.36 0.06 -0.02 -0.11 -0.10 0.14 0.28 0.15 -0.07 -0.09 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 27 A 1342.4968 1.3223 1.4042 5.5870 X Y Z 0.02 -0.05 -0.02 0.05 0.02 0.02 -0.09 0.05 0.03 0.05 -0.01 -0.01 -0.09 0.01 -0.02 0.07 -0.03 -0.14 -0.22 0.17 0.46 -0.28 0.00 -0.46 0.11 -0.01 0.16 0.30 -0.09 -0.12 0.21 -0.10 -0.11 0.06 -0.01 0.00 0.25 -0.08 0.11 0.23 -0.08 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 A 1456.9021 1.0810 1.3518 4.0057 X Y Z -0.01 0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.04 -0.02 -0.04 0.00 0.00 -0.01 -0.01 0.03 0.03 0.02 -0.09 0.04 0.09 0.00 0.02 0.06 -0.04 -0.01 0.06 0.04 -0.03 0.21 -0.12 0.51 0.27 0.49 0.15 0.00 0.01 0.01 -0.07 -0.38 -0.09 0.15 -0.03 -0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 A 1523.2318 1.1035 1.5086 3.9946 X Y Z 0.04 -0.02 0.04 0.05 0.00 -0.04 -0.01 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.01 0.40 -0.21 -0.39 -0.04 -0.25 10 11 12 13 14 15 16 1 1 1 17 35 -0.02 0.00 0.14 0.19 0.00 0.11 -0.20 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.08 0.37 0.33 0.10 -0.01 0.02 0.55 0.13 0.06 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 34 A Frequencies 3057.7815 Red masses -1.0664 Frc consts -5.8746 IR Inten -25.2137 Atom AN X Y Z 0.00 0.01 -0.01 -0.05 -0.03 0.04 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.02 0.00 -0.01 -0.03 -0.17 0.06 0.37 0.75 -0.30 0.18 -0.32 -0.15 10 -0.04 -0.11 0.00 11 0.00 -0.01 0.02 12 0.00 0.00 0.00 13 0.00 0.00 -0.01 14 0.01 0.03 0.00 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 37 A Frequencies 3075.9766 Red masses -1.0655 Frc consts -5.9397 IR Inten -22.8122 Atom AN X Y Z 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.03 -0.06 -0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.01 0.09 -0.15 -0.08 10 0.31 0.85 0.02 11 0.07 -0.17 0.31 12 -0.01 0.00 0.00 13 0.00 0.00 0.01 14 -0.01 -0.02 0.00 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 40 A Frequencies 3130.4935 Red masses -1.0972 Frc consts -6.3353 IR Inten -20.9808 Atom AN X Y Z 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 -0.01 0.06 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.04 -0.02 -0.02 0.29 0.29 0.02 0.01 0.00 0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.28 -0.24 0.30 -0.20 -0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 A 3062.1688 1.0677 5.8989 1.1384 X Y Z -0.01 0.03 -0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.06 -0.02 0.14 0.06 0.06 -0.08 -0.40 0.15 -0.03 -0.06 0.02 -0.05 0.08 0.04 0.01 0.03 0.00 0.00 -0.01 0.02 0.00 0.00 0.00 -0.10 -0.05 0.20 0.25 0.81 -0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 A 3109.1121 1.0988 6.2581 20.2591 X Y Z 0.04 0.03 0.01 0.02 -0.07 -0.02 -0.01 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.41 -0.15 -0.19 -0.03 -0.16 0.06 0.13 0.25 -0.11 -0.38 0.61 0.30 0.04 0.10 0.00 0.04 -0.07 0.14 -0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 -0.04 -0.02 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 A 3136.6066 1.0952 6.3484 21.4996 X Y Z 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.03 -0.07 -0.07 -0.03 -0.03 161 -0.33 -0.30 0.03 0.04 0.00 -0.01 0.03 0.00 0.00 0.31 0.28 -0.35 0.24 -0.02 0.07 0.07 0.01 0.00 0.00 -0.07 -0.01 -0.01 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 36 A 3066.7135 1.0609 5.8787 40.3246 X Y Z 0.03 -0.04 0.04 -0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 -0.01 -0.46 -0.18 -0.20 0.13 0.64 -0.23 0.02 0.05 -0.02 0.07 -0.11 -0.05 -0.01 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.07 -0.04 0.16 0.13 0.41 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 A 3118.1669 1.1041 6.3249 37.8676 X Y Z -0.06 -0.06 -0.01 0.01 -0.05 0.00 0.00 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.58 0.22 0.26 0.08 0.46 -0.17 0.13 0.24 -0.10 -0.19 0.30 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 -0.08 0.16 0.00 0.00 0.00 -0.06 -0.03 0.14 0.02 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 A 3303.4204 1.0925 7.0239 1.3482 X Y Z 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.09 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 11 12 13 14 15 16 1 1 1 1 17 35 -0.01 -0.06 0.06 -0.13 0.19 -0.01 0.04 0.00 0.00 0.00 -0.04 -0.12 -0.10 -0.35 -0.39 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.02 0.05 -0.05 -0.02 0.78 0.00 -0.08 0.00 0.00 0.00 -0.02 -0.02 0.02 -0.02 0.01 0.02 -0.38 -0.08 0.00 0.00 -0.11 -0.03 -0.03 -0.04 -0.02 -0.01 -0.17 -0.27 0.00 0.00 0.04 0.01 -0.02 0.00 0.05 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.04 -0.02 0.00 0.00 0.00 - Thermochemistry Temperature 298.150 Kelvin Pressure 1.00000 Atm Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom 10 has atomic number and mass 1.00783 Atom 11 has atomic number and mass 1.00783 Atom 12 has atomic number and mass 1.00783 Atom 13 has atomic number and mass 1.00783 Atom 14 has atomic number and mass 1.00783 Atom 15 has atomic number 17 and mass 34.96885 Atom 16 has atomic number 35 and mass 78.91834 Molecular mass: 182.95761 amu Principal axes and moments of inertia in atomic units: EIGENVALUES -986.959622871.072263385.85669 X 0.37097 0.91744 0.14384 Y 0.81977 -0.39630 0.41342 Z -0.43629 0.03545 0.89911 This molecule is an asymmetric top Rotational symmetry number Warning assumption of classical behavior for rotation may cause significant error Rotational temperatures (Kelvin) 0.08776 0.03017 0.02558 Rotational constants (GHZ): 1.82859 0.62859 0.53302 imaginary frequencies ignored Zero-point vibrational energy 341499.5 (Joules/Mol) 81.62034 (Kcal/Mol) Warning explicit consideration of degrees of freedom as vibrations may cause significant error Vibrational temperatures: 91.10 114.24 151.10 211.80 252.97 (Kelvin) 412.00 474.66 820.16 914.97 1149.28 1203.86 1226.54 1274.04 1302.67 1306.71 1342.54 1434.67 1464.68 1479.47 1656.89 1728.92 1766.94 1804.59 1870.11 1881.66 1931.55 1969.77 1974.38 2096.15 2096.97 2176.12 2191.59 4399.46 4405.77 4412.31 4425.64 4473.31 4486.34 4504.08 4512.87 4752.88 Zero-point correction= Thermal correction to Energy= Thermal correction to Enthalpy= Thermal correction to Gibbs Free Energy= Sum of electronic and zero-point Energies= Sum of electronic and thermal Energies= Sum of electronic and thermal Enthalpies= Sum of electronic and thermal Free Energies= 162 0.130070 (Hartree/Particle) 0.138259 0.139203 0.094446 -3227.886203 -3227.878015 -3227.877071 -3227.921828 E (Thermal) CV S KCal/Mol Cal/Mol-Kelvin Cal/Mol-Kelvin Total 86.759 27.616 94.199 Electronic 0.000 0.000 0.000 Translational 0.889 2.981 41.519 Rotational 0.889 2.981 30.640 Vibrational 84.981 21.654 22.040 Vibration 0.597 1.972 4.351 Vibration 0.600 1.963 3.906 Vibration 0.605 1.945 3.359 Vibration 0.617 1.906 2.708 Vibration 0.628 1.872 2.372 Vibration 0.684 1.699 1.495 Vibration 0.713 1.616 1.261 Vibration 0.926 1.096 0.504 Q Log10(Q) Ln(Q) Total Bot 0.361434D-43 -43.441971 -100.028834 Total V=0 0.243267D+17 16.386084 37.730352 Vib (Bot) 0.335117D-57 -57.474804 -132.340627 Vib (Bot) 0.326000D+01 0.513217 1.181726 Vib (Bot) 0.259393D+01 0.413958 0.953173 Vib (Bot) 0.195225D+01 0.290535 0.668982 Vib (Bot) 0.137851D+01 0.139411 0.321006 Vib (Bot) 0.114395D+01 0.058409 0.134491 Vib (Bot) 0.669138D+00 -0.174484 -0.401764 Vib (Bot) 0.566398D+00 -0.246879 -0.568459 Vib (Bot) 0.269977D+00 -0.568673 -1.309418 Vib (V=0) 0.225554D+03 2.353250 5.418559 Vib (V=0) 0.379812D+01 0.579568 1.334505 Vib (V=0) 0.314168D+01 0.497162 1.144757 Vib (V=0) 0.251526D+01 0.400583 0.922376 Vib (V=0) 0.196639D+01 0.293670 0.676200 Vib (V=0) 0.174845D+01 0.242654 0.558731 Vib (V=0) 0.133531D+01 0.125583 0.289165 Vib (V=0) 0.125552D+01 0.098823 0.227548 Vib (V=0) 0.106823D+01 0.028666 0.066005 Electronic 0.100000D+01 0.000000 0.000000 Translational 0.972704D+08 7.987981 18.393006 Rotational 0.110880D+07 6.044852 13.918787 Center Atomic Forces (Hartrees/Bohr) Number Number X Y Z 0.000008362 0.000003310 -0.000010244 -0.000009540 -0.000000870 -0.000009272 -0.000019617 0.000017546 0.000007691 0.000039868 -0.000008076 -0.000010718 0.000007899 -0.000002522 -0.000005470 0.000014805 0.000006670 -0.000020934 0.000015815 0.000003877 -0.000007452 -0.000012091 0.000003292 -0.000017284 -0.000008850 -0.000000214 -0.000016408 10 -0.000011131 -0.000008071 0.000008983 11 -0.000023548 -0.000003896 0.000004156 12 -0.000004577 -0.000002808 0.000021608 13 0.000020759 0.000002117 0.000006345 14 0.000007664 0.000005946 -0.000002359 15 17 -0.000019218 -0.000002122 0.000005960 16 35 -0.000006600 -0.000014178 0.000045398 Cartesian Forces: Max 0.000045398 RMS 0.000014033 -Internal Coordinate Forces (Hartree/Bohr or radian) Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J -1 C C 0.000039( 1) C 0.000009( 2) 0.000754( 16) 163 C -0.000016( 3) 0.000379( 17) -0.000005( 30) C -0.000022( 4) 0.000108( 18) 0.000052( 31) H -0.000007( 5) 0.000053( 19) 0.000002( 32) H 0.000009( 6) 0.000010( 20) 0.000029( 33) H -0.000003( 7) -0.000036( 21) -0.000024( 34) H -0.000002( 8) -0.000035( 22) 0.000014( 35) 10 H -0.000011( 9) -0.000010( 23) 0.000021( 36) 11 H 0.000000( 10) -0.000050( 24) -0.000002( 37) 12 H -0.000005( 11) -0.000036( 25) 0.000021( 38) 13 H 0.000003( 12) -0.000044( 26) 0.000006( 39) 14 H -0.000008( 13) -0.000004( 27) -0.000011( 40) 15 Cl 0.000004( 14) -0.000063( 28) 0.000075( 41) 16 Br -0.000033( 15) -0.000139( 29) 0.000116( 42) -Internal Forces: Max 0.000754424 RMS 0.000136922 4.3 IRC 4.3.1 TS phản ứng SN2 etyl clorua + Br- : [Br- - - C2H5 - - - Cl] Summary of reaction path following: (Int Coord: Angstroms, and Degrees) Energy reported as Energy + 3111 a.u -ENERGY RX.COORD B1 B2 B3 -0.30183 -2.99464 1.09446 1.09446 1.09211 -0.30121 -2.89467 1.09437 1.09442 1.09213 -0.30055 -2.79468 1.09429 1.09437 1.09213 -0.29985 -2.69469 1.09421 1.09432 1.09217 -0.29912 -2.59472 1.09415 1.09427 1.09214 -0.29838 -2.49475 1.09405 1.09422 1.09221 -0.29760 -2.39475 1.09398 1.09418 1.09222 -0.29682 -2.29476 1.09389 1.09412 1.09230 -0.29604 -2.19479 1.09385 1.09410 1.09220 10 -0.29524 -2.09484 1.09375 1.09403 1.09232 11 -0.29446 -1.99484 1.09368 1.09400 1.09231 12 -0.29367 -1.89485 1.09359 1.09394 1.09242 13 -0.29289 -1.79487 1.09354 1.09391 1.09236 14 -0.29213 -1.69487 1.09347 1.09387 1.09241 15 -0.29139 -1.59487 1.09342 1.09384 1.09235 16 -0.29067 -1.49489 1.09332 1.09377 1.09252 17 -0.28997 -1.39492 1.09329 1.09376 1.09241 18 -0.28930 -1.29492 1.09322 1.09372 1.09246 19 -0.28867 -1.19493 1.09319 1.09370 1.09239 20 -0.28805 -1.09494 1.09310 1.09363 1.09255 21 -0.28749 -0.99500 1.09312 1.09365 1.09228 22 -0.28696 -0.89513 1.09297 1.09353 1.09279 23 -0.28649 -0.79538 1.09300 1.09356 1.09249 24 -0.28605 -0.69538 1.09295 1.09352 1.09258 25 -0.28565 -0.59539 1.09293 1.09351 1.09252 26 -0.28531 -0.49541 1.09288 1.09348 1.09267 27 -0.28501 -0.39544 1.09288 1.09348 1.09258 28 -0.28478 -0.29554 1.09282 1.09344 1.09279 29 -0.28460 -0.19694 1.09284 1.09344 1.09269 30 -0.28446 -0.09858 1.09281 1.09342 1.09283 31 -0.28435 0.00000 1.09279 1.09341 1.09296 32 -0.28446 0.09861 1.09278 1.09338 1.09307 33 -0.28458 0.19734 1.09277 1.09332 1.09318 34 -0.28476 0.29643 1.09280 1.09342 1.09312 35 -0.28499 0.39630 1.09278 1.09329 1.09329 36 -0.28527 0.49624 1.09281 1.09338 1.09325 37 -0.28560 0.59622 1.09280 1.09328 1.09339 38 -0.28597 0.69620 1.09284 1.09333 1.09337 39 -0.28639 0.79619 1.09285 1.09327 1.09346 40 -0.28685 0.89619 1.09288 1.09329 1.09346 41 -0.28734 0.99598 1.09286 1.09310 1.09364 42 -0.28787 1.09583 1.09295 1.09330 1.09344 43 -0.28844 1.19579 1.09295 1.09314 1.09359 44 -0.28904 1.29578 1.09299 1.09318 1.09354 45 -0.28964 1.39577 1.09302 1.09311 1.09359 164 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 -0.29030 -0.29097 -0.29167 -0.29238 -0.29310 -0.29385 -0.29459 -0.29533 -0.29606 -0.29680 -0.29754 -0.29827 -0.29899 -0.29970 -0.30039 -0.30107 B4 1.51844 1.51804 1.51751 1.51691 1.51623 1.51553 1.51475 1.51396 1.51311 1.51227 1.51140 1.51055 1.50966 1.50881 1.50796 1.50717 1.50634 1.50558 1.50484 1.50415 1.50346 1.50293 1.50232 1.50181 1.50136 1.50096 1.50068 1.50028 1.50041 1.50005 1.49990 1.50006 1.50052 1.50036 1.50079 1.50110 1.50151 1.50198 1.50249 1.50306 1.50365 1.50431 1.50496 1.50570 1.50643 1.50722 1.50795 1.50877 1.50958 1.51041 1.51121 1.49564 1.59558 1.69556 1.79555 1.89555 1.99552 2.09551 2.19551 2.29543 2.39539 2.49538 2.59538 2.69533 2.79530 2.89529 2.99528 B5 1.08560 1.08537 1.08507 1.08482 1.08448 1.08423 1.08391 1.08363 1.08333 1.08303 1.08273 1.08241 1.08215 1.08184 1.08161 1.08121 1.08104 1.08074 1.08056 1.08017 1.08016 1.07956 1.07961 1.07936 1.07924 1.07898 1.07889 1.07838 1.07884 1.07852 1.07831 1.07836 1.07854 1.07818 1.07856 1.07847 1.07875 1.07872 1.07897 1.07904 1.07965 1.07913 1.07976 1.07975 1.08009 1.07985 1.08071 1.08064 1.08106 1.08124 1.08171 165 1.09311 1.09308 1.09315 1.09318 1.09323 1.09326 1.09332 1.09337 1.09344 1.09348 1.09354 1.09359 1.09367 1.09371 1.09378 1.09384 B6 1.08376 1.08329 1.08308 1.08258 1.08268 1.08207 1.08186 1.08127 1.08152 1.08077 1.08058 1.07994 1.07986 1.07945 1.07932 1.07863 1.07862 1.07823 1.07810 1.07754 1.07771 1.07678 1.07701 1.07670 1.07660 1.07627 1.07624 1.07576 1.07608 1.07582 1.07566 1.07566 1.07575 1.07559 1.07584 1.07578 1.07603 1.07605 1.07629 1.07640 1.07690 1.07661 1.07713 1.07720 1.07753 1.07743 1.07815 1.07817 1.07856 1.07878 1.07922 1.09321 1.09299 1.09302 1.09294 1.09291 1.09283 1.09284 1.09278 1.09281 1.09269 1.09269 1.09265 1.09265 1.09261 1.09262 1.09262 B7 1.94661 1.96089 1.97566 1.99068 2.00590 2.02123 2.03675 2.05239 2.06811 2.08389 2.09976 2.11570 2.13165 2.14767 2.16371 2.17978 2.19585 2.21195 2.22807 2.24419 2.26030 2.27639 2.29245 2.30856 2.32465 2.34072 2.35677 2.37281 2.38849 2.40400 2.43635 2.46868 2.48417 2.49982 2.51558 2.53136 2.54709 2.56278 2.57843 2.59404 2.60953 2.62499 2.64044 2.65584 2.67119 2.68641 2.70164 2.71681 2.73194 2.74700 2.76196 1.09346 1.09366 1.09359 1.09364 1.09364 1.09369 1.09367 1.09370 1.09366 1.09376 1.09377 1.09381 1.09382 1.09390 1.09393 1.09398 B8 3.02260 3.00978 2.99680 2.98372 2.97059 2.95742 2.94416 2.93083 2.91748 2.90408 2.89061 2.87707 2.86353 2.84990 2.83622 2.82248 2.80874 2.79491 2.78105 2.76713 2.75319 2.73918 2.72521 2.71112 2.69700 2.68286 2.66867 2.65448 2.64043 2.62658 2.59784 2.56893 2.55460 2.54044 2.52597 2.51150 2.49700 2.48249 2.46798 2.45346 2.43899 2.42451 2.41002 2.39554 2.38108 2.36670 2.35231 2.33794 2.32360 2.30931 2.29512 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 1.51202 1.51280 1.51362 1.51436 1.51512 1.51582 1.51651 1.51710 1.51768 1.51819 A1 108.71041 108.71651 108.72425 108.73309 108.74231 108.75207 108.76272 108.77409 108.78433 108.79608 108.80730 108.81895 108.82982 108.84094 108.85113 108.86145 108.87178 108.88014 108.88713 108.89503 108.90042 108.90758 108.91102 108.91442 108.91470 108.91402 108.90980 108.91467 108.90732 108.89859 108.88291 108.87030 108.86430 108.84878 108.84137 108.82783 108.81596 108.80200 108.78706 108.77079 108.75407 108.73515 108.71760 108.69822 108.67743 108.65287 108.63393 108.61320 108.59303 108.57194 108.55002 108.52747 108.50480 108.48124 108.45859 108.43520 108.41178 1.08166 1.08205 1.08187 1.08266 1.08267 1.08303 1.08292 1.08359 1.08361 1.08394 A2 108.51259 108.52219 108.53273 108.54406 108.55574 108.56844 108.58084 108.59312 108.60614 108.61927 108.63271 108.64550 108.65952 108.67318 108.68691 108.69974 108.71410 108.72809 108.74142 108.75304 108.76518 108.77319 108.78423 108.79163 108.79841 108.80304 108.81043 108.80088 108.82170 108.80992 108.80212 108.79966 108.79355 108.79262 108.78388 108.77866 108.77175 108.76511 108.75943 108.75423 108.74758 108.74402 108.73832 108.73429 108.73059 108.72802 108.72326 108.71931 108.71445 108.70975 108.70527 108.70222 108.69793 108.69305 108.68800 108.68311 108.67781 166 1.07927 1.07965 1.07963 1.08027 1.08038 1.08073 1.08078 1.08132 1.08145 1.08176 A3 111.51366 111.49740 111.48299 111.46899 111.45757 111.44352 111.43234 111.42187 111.41404 111.40431 111.39719 111.39058 111.38460 111.37985 111.37575 111.37217 111.36991 111.36744 111.36573 111.36555 111.36479 111.36579 111.36505 111.36570 111.36620 111.36792 111.36854 111.37320 111.38972 111.36850 111.36419 111.38088 111.40347 111.39145 111.39533 111.39972 111.40352 111.40775 111.41280 111.41848 111.42318 111.42880 111.43407 111.44047 111.44723 111.45356 111.46033 111.46738 111.47471 111.48284 111.49154 111.50052 111.50898 111.51727 111.52431 111.53272 111.54107 2.77689 2.79175 2.80646 2.82117 2.83578 2.85033 2.86472 2.87909 2.89334 2.90748 A4 113.96912 114.22488 114.49161 114.76144 115.03595 115.31617 115.59928 115.87992 116.15978 116.44193 116.71997 116.98861 117.26437 117.52938 117.78721 118.03121 118.28222 118.51673 118.74208 118.95683 119.16194 119.34161 119.52867 119.69296 119.84146 119.97645 120.07992 120.21468 120.21165 120.34201 120.42658 120.42217 120.31465 120.37315 120.26617 120.20171 120.10135 119.98885 119.86222 119.72070 119.55702 119.39751 119.21802 119.02798 118.82864 118.61344 118.40349 118.18385 117.95659 117.72296 117.48275 117.24918 117.00864 116.76098 116.51899 116.27808 116.03527 2.28098 2.26691 2.25298 2.23909 2.22530 2.21164 2.19818 2.18481 2.17161 2.15863 A5 114.68953 114.99451 115.30479 115.61771 115.92915 116.25149 116.57230 116.89194 117.20486 117.52749 117.84112 118.14771 118.45738 118.75709 119.04870 119.32838 119.60912 119.87451 120.12860 120.37129 120.60157 120.80712 121.01964 121.20587 121.37600 121.53383 121.65706 121.82078 121.82893 121.96393 122.05928 122.08047 122.00536 122.05579 121.94274 121.87686 121.77168 121.65105 121.51186 121.35437 121.17484 120.99630 120.79745 120.58330 120.35747 120.11428 119.87635 119.62653 119.36856 119.10229 118.82743 118.55817 118.28279 117.99926 117.72485 117.44843 117.17073 58 59 60 61 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 108.39014 108.36784 108.34644 108.32597 A6 111.42402 111.16494 110.87759 110.57333 110.25698 109.93445 109.59723 109.24987 108.89713 108.53916 108.17213 107.79694 107.42206 107.03808 106.65025 106.25529 105.86119 105.46063 105.05719 104.64856 104.24040 103.82372 103.41229 102.99454 102.57693 102.15726 101.73580 101.31443 100.89194 100.47996 99.63627 98.78380 98.35147 97.94453 97.51787 97.09771 96.67734 96.25905 95.84389 95.43190 95.02565 94.62230 94.22057 93.82337 93.43140 93.04884 92.66642 92.28894 91.91630 91.55014 91.19482 90.84461 90.50267 90.17413 89.84916 89.53390 89.22901 88.94096 88.65930 88.39070 88.13786 D4 -39.91882 108.67193 111.54930 108.66636 111.55788 108.65970 111.56676 108.65357 111.57471 A7 D1 88.62069 118.52911 88.86944 118.48871 89.14672 118.44506 89.44070 118.39956 89.74820 118.35283 90.06209 118.30616 90.39205 118.25866 90.73191 118.21035 91.07896 118.16375 91.43071 118.11583 91.79301 118.07039 92.16262 118.02589 92.53433 117.98219 92.91506 117.93964 93.30075 117.89925 93.69201 117.85987 94.08461 117.82105 94.48381 117.78436 94.88734 117.74957 95.29609 117.71359 95.70713 117.68068 96.12215 117.64575 96.53696 117.61318 96.95732 117.58001 97.37871 117.54813 97.80266 117.51345 98.22858 117.48921 98.66141 117.43229 99.08284 117.45778 99.51385 117.39282 100.36906 117.33648 101.21845 117.31134 101.63302 117.31219 102.04966 117.27978 102.47039 117.28490 102.89128 117.27427 103.31133 117.27498 103.72887 117.27604 104.14398 117.28074 104.55526 117.28747 104.96252 117.29920 105.36434 117.31093 105.76708 117.32853 106.16323 117.34815 106.55537 117.37125 106.93610 117.39812 107.32055 117.42367 107.69655 117.45172 108.06918 117.48149 108.43465 117.51138 108.79065 117.54198 109.14116 117.57272 109.48491 117.60553 109.81318 117.64134 110.14083 117.67648 110.45643 117.71121 110.76271 117.74530 111.05106 117.77978 111.33654 117.81029 111.60599 117.83852 111.86129 117.86543 D5 D6 76.27665-100.54536 167 115.79116 115.55898 115.32565 115.09523 D2 118.60361 118.73707 118.86780 118.99534 119.12051 119.24505 119.36369 119.47710 119.58807 119.69678 119.79898 119.89423 119.99131 120.08111 120.16746 120.24742 120.32861 120.40583 120.48113 120.55235 120.62371 120.68773 120.75679 120.82197 120.88891 120.95661 121.02148 121.09151 121.09973 121.21619 121.34228 121.42719 121.45800 121.53204 121.56350 121.61399 121.65482 121.69785 121.74029 121.78367 121.82346 121.87034 121.91120 121.95759 122.00587 122.06148 122.10974 122.16333 122.21697 122.27519 122.33843 122.40501 122.47346 122.54718 122.61808 122.69357 122.77026 122.84776 122.92470 123.00274 123.08046 116.89019 116.62210 116.35230 116.08830 D3 191.50251 191.45885 191.32980 191.14805 190.92132 190.68533 190.39188 190.06156 189.70111 189.33305 188.92041 188.47527 188.02826 187.54167 187.03042 186.49277 185.95415 185.38242 184.79063 184.17857 183.54813 182.89492 182.24222 181.56499 180.87131 180.16847 179.45195 178.73237 178.01240 177.39273 175.87636 174.30094 173.53495 172.79653 172.03833 171.30469 170.58866 169.88384 169.19754 168.52879 167.89272 167.25820 166.64946 166.06210 165.49965 164.97588 164.46213 163.97025 163.50731 163.07569 162.69138 162.31259 161.97254 161.68736 161.41397 161.16983 160.96544 160.82644 160.69401 160.60882 160.57102 -39.07491 76.66830-100.19902 -38.21847 77.01466 -99.88895 -37.35344 77.33659 -99.60030 -36.47538 77.63490 -99.32869 -35.61280 77.92428 -99.06789 -34.72351 78.19096 -98.82396 -33.81642 78.44663 -98.59003 -32.89288 78.68781 -98.36509 10 -31.97420 78.92703 -98.14546 11 -31.02302 79.15298 -97.93391 12 -30.04601 79.37478 -97.72643 13 -29.07466 79.59004 -97.52273 14 -28.06806 79.80004 -97.32326 15 -27.03954 80.00534 -97.12687 16 -25.98473 80.20954 -96.93174 17 -24.93271 80.40874 -96.73850 18 -23.84816 80.60472 -96.54822 19 -22.74258 80.79782 -96.35934 20 -21.61309 80.99151 -96.16998 21 -20.46658 81.18142 -95.98336 22 -19.28850 81.37571 -95.79379 23 -18.11954 81.56372 -95.60889 24 -16.91351 81.75528 -95.42052 25 -15.69056 81.94585 -95.23317 26 -14.45202 82.13921 -95.04386 27 -13.19480 82.33229 -94.85448 28 -11.90264 82.54193 -94.65047 29 -10.60978 82.74936 -94.44742 30 -9.34005 83.00250 -94.21697 31 -6.75639 83.36288 -93.86289 32 -4.18026 83.67532 -93.53332 33 -2.93057 83.80165 -93.36998 34 -1.70310 83.94752 -93.20858 35 -0.39975 84.11582 -93.02600 36 0.88007 84.28344 -92.84581 37 2.15508 84.45718 -92.66006 38 3.42324 84.63220 -92.47282 39 4.67625 84.80900 -92.28328 40 5.91228 84.98723 -92.09160 41 7.11971 85.17077 -91.89602 42 8.32003 85.35181 -91.70232 43 9.50293 85.53980 -91.50316 44 10.65832 85.72810 -91.30244 45 11.78612 85.91891 -91.09878 46 12.86815 86.11118 -90.89270 47 13.95819 86.31212 -90.67853 48 15.02570 86.51504 -90.46116 49 16.07226 86.72431 -90.23732 50 17.09330 86.93809 -90.00744 51 18.08070 87.16052 -89.76711 52 19.06875 87.38601 -89.52263 53 20.03455 87.62079 -89.26785 54 20.96932 87.86858 -88.99706 55 21.91223 88.12555 -88.71801 56 22.84508 88.39236 -88.42566 57 23.76393 88.67257 -88.11805 58 24.66017 88.97439 -87.78357 59 25.57110 89.28569 -87.43877 60 26.47021 89.61424 -87.07208 61 27.36134 89.96231 -86.68342 -Total number of gradient calculations: 106 Total number of points: 60 Average number of gradient calculations: 1.76667 -IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC 4.3.2 TS1 phản ứng SN1 tert - butyl clorua + OH- : [C4H9 - - - Cl] 168 RADIUS OF CURVATURE = 0.37657 NET REACTION COORDINATE UP TO THIS POINT = 12.40612 # OF POINTS ALONG THE PATH =127 # OF STEPS = Calculating another point on the path Stepping into the G*F direction IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC -Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J -1 C 2 C 1.548578( 1) 3 H 1.087106( 2) 110.533( 14) 4 H 1.086531( 3) 110.502( 15) 120.316( 26) 5 H 1.083816( 4) 109.195( 16) -120.029( 27) 6 C 1.550790( 5) 111.040( 17) -178.824( 28) 7 H 1.085126( 6) 109.114( 18) 62.849( 29) 8 H 1.072150( 7) 110.548( 19) -177.450( 30) 9 H 1.086241( 8) 110.525( 20) -56.656( 31) 10 10 C 1.549597( 9) 111.073( 21) 124.036( 32) 11 11 H 10 1.085270( 10) 110.562( 22) 58.540( 33) 12 12 H 10 1.086934( 11) 110.588( 23) 179.319( 34) 13 13 H 10 1.086032( 12) 109.174( 24) -61.072( 35) 14 14 Cl 1.814506( 13) 107.969( 25) -117.908( 36) -Z-Matrix orientation: Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.548578 1.018042 0.000000 1.929877 -0.513705 0.878543 1.929129 -0.512230 -0.886168 1.904926 6 0.704811 -1.264205 -0.556757 0.151248 -2.144832 -0.247626 0.739512 -1.234734 -1.627940 1.717918 -1.336193 -0.171593 10 -1.440688 0.123400 -0.557172 11 -1.911091 1.033626 -0.199372 12 -1.430520 0.134676 -1.644000 13 -2.026687 -0.727489 -0.222420 14 17 0.938824 1.448339 -0.559783 Distance matrix (angstroms): C 0.000000 C 1.548578 0.000000 H 2.181934 1.087106 0.000000 H 2.181116 1.086531 1.765811 0.000000 H 2.162502 1.083816 1.768516 1.764877 0.000000 C 1.550790 2.554879 2.807076 3.500825 2.772000 H 2.164370 2.801701 3.176973 3.784339 2.580294 H 2.172933 3.487365 3.776269 4.323105 3.764240 H 2.183139 2.774102 2.586777 3.781300 3.080262 10 C 1.549597 2.554406 3.499428 2.758846 2.818366 11 H 2.181834 2.788544 3.765887 2.550932 3.173404 12 H 2.183406 3.501011 4.334304 3.763129 3.805293 13 H 2.164756 2.788033 3.798946 3.081819 2.616172 14 Cl 1.814506 2.724749 2.881382 2.937548 3.691919 10 C 0.000000 H 1.085126 0.000000 H 1.072150 1.754879 0.000000 H 1.086241 1.764690 1.757418 0.000000 10 C 2.555115 2.788361 2.782867 3.500839 0.000000 169 11 12 13 14 H H H Cl 11 12 13 14 H H H Cl 3.500099 2.774635 2.803734 2.722621 11 0.000000 1.768053 1.765055 2.902395 3.789217 3.106124 2.598633 3.691692 12 3.769875 2.566044 3.143985 2.894748 13 4.334341 3.774135 3.794096 2.917412 14 1.085270 1.086934 1.086032 2.723517 0.000000 1.766249 0.000000 2.918052 3.693547 0.000000 Interatomic angles: C1-C2-H3=110.533 C1-C2-H4=110.5022 H3-C2-H4=108.6575 C1-C2-H5=109.1954 H3-C2-H5=109.1031 H4-C2-H5=108.815 C2-C1-C6=111.0397 C1-C6-H7=109.1137 C1-C6-H8=110.5481 H7-C6-H8=108.8712 C1-C6-H9=110.5246 H7-C6-H9=108.723 H8-C6-H9=109.0201 C2-C1-C10=111.0731 C6-C1-C10=111.0003 C1-C10-H11=110.5624 C1-C10-H12=110.5884 H11-C10-H12=108.9662 C1-C10-H13=109.1738 H11-C10-H13=108.7608 H12-C10-H13=108.7464 C2-C1-Cl14=107.9691 C6-C1-Cl14=107.7452 C10-C1-Cl14=107.8512 Symmetry turned off by external request Stoichiometry C4H9Cl Framework group C1[X(C4H9Cl)] Deg of freedom 36 Full point group C1 NOp Rotational constants (GHZ): 4.4408185 2.9841831 2.9831583 Standard basis: STO-3G* (5D, 7F) Integral buffers will be 262144 words long Raffenetti integral format Two-electron integral symmetry is turned off 43 basis functions, 120 primitive gaussians, 44 cartesian basis functions 25 alpha electrons 25 beta electrons nuclear repulsion energy 239.9103786468 Hartrees NAtoms= 14 NActive= 14 NUniq= 14 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 Big=F United Atom Topological Model (UA0 parameters set) Nord Group Hybr Charge Alpha Radius Bonded to C * 0.00 1.00 1.925 C2 [s] C6 [s] C10 [s] Cl14 [s] CH3 * 0.00 1.00 2.525 C1 [s] CH3 * 0.00 1.00 2.525 C1 [s] 10 CH3 * 0.00 1.00 2.525 C1 [s] 14 Cl * 0.00 1.00 1.973 C1 [s] Polarizable Continuum Model (PCM) ================================= Model : PCM Atomic radii : UA0 (Simple United Atom Topological Model) Polarization charges : Total charges Charge compensation : None Solution method : Matrix inversion Cavity : GePol (RMin=0.200 OFac=0.890) Default sphere list used, NSphG= Tesserae with average area of 0.200 Ang**2 1st derivatives : Analytical V*U(x)*V algorithm (CHGder, D1EAlg=0) Cavity 1st derivative terms included Solvent : Water, Eps= 78.390000 One-electron integrals computed using PRISM NBasis= 43 RedAO= T NBF= 43 NBsUse= 43 1.00D-06 NBFU= 43 Initial guess read from the read-write file: Harris functional with IExCor= 205 diagonalized for initial guess ExpMin= 1.69D-01 ExpMax= 6.01D+02 ExpMxC= 6.01D+02 IAcc=1 IRadAn= AccDes= 1.00D-06 HarFok: IExCor= 205 AccDes= 1.00D-06 IRadAn= IDoV=1 170 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06 Requested convergence on energy=1.00D-06 No special actions if energy rises Keep R1 integrals in memory in canonical form, NReq= 2089358 Error on total polarization charges = 0.00276 SCF Done: E(RHF) = -609.492276368 A.U after cycles Convg = 0.6937D-08 -V/T = 2.0157 S**2 = 0.0000 -Variational PCM results ======================= (a.u.) = -609.489010 (a.u.) = -609.492276 Total free energy in solution: with all non electrostatic terms (a.u.) = -609.479727 -(Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -2.05 -Cavitation energy (kcal/mol) = 17.55 Dispersion energy (kcal/mol) = -10.17 Repulsion energy (kcal/mol) = 0.50 Total non electrostatic (kcal/mol) = 7.88 -Partition over spheres: Sphere on Atom Surface Charge GEl GCav GDR C1 0.00 0.000 0.00 0.00 0.00 C2 39.96 -0.044 -0.20 4.87 -2.53 C6 39.96 -0.043 -0.19 4.87 -2.53 C10 39.96 -0.043 -0.20 4.87 -2.53 Cl14 18.95 0.087 -0.92 2.93 -2.08 Added spheres: 17.83 0.040 -0.54 0.00 0.00 -D1PCM: PCM CHGder 1st derivatives, ID1Alg=0 FixD1E=F DoIter=F I1PDM=0 Center Atomic Forces (Hartrees/Bohr) Number Number X Y Z 0.000697952 -0.000509181 -0.001421987 0.002155211 0.004139759 0.000688440 -0.001414969 -0.001121895 -0.000511932 0.000224556 -0.000735081 -0.000423028 -0.000993431 -0.002089681 0.001114695 6 0.000693717 0.000978714 0.012743793 -0.000613413 -0.001124325 0.000344095 0.000307773 0.000359880 -0.012503430 -0.000728662 0.000184763 -0.000255512 10 0.000094139 0.000064335 -0.001573563 11 -0.000007516 0.000178140 0.000123030 12 0.000129969 0.000060571 0.001310144 13 -0.000348127 -0.000532738 0.000172009 14 17 -0.000197199 0.000146738 0.000193247 Cartesian Forces: Max 0.012743793 RMS 0.002941945 -Internal Coordinate Forces (Hartree/Bohr or radian) Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J -1 C C 0.000868( 1) H -0.001505( 2) 0.000035( 14) H -0.000849( 3) -0.000276( 15) 0.001814( 26) H 0.002545( 4) 0.000603( 16) 0.000359( 27) C -0.000598( 5) -0.000267( 17) -0.001473( 28) H 0.001323( 6) 0.000176( 18) -0.000019( 29) H 0.012512( 7) -0.000122( 19) -0.000148( 30) H -0.000782( 8) -0.000254( 20) -0.000103( 31) 171 10 C 0.000093( 9) -0.000013( 21) -0.000539( 32) 11 H 10 0.000193( 10) -0.000199( 22) -0.000024( 33) 12 H 10 -0.001308( 11) -0.000279( 23) -0.000164( 34) 13 H 10 0.000658( 12) 0.000007( 24) -0.000069( 35) 14 Cl -0.000045( 13) -0.000647( 25) -0.000800( 36) -Internal Forces: Max 0.012512006 RMS 0.002232482 IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC 172 ... ? ?ẢNH HƢỞNG CỦA CẤU TRÚC ĐẾN HOẠT TÍNH HĨA HỌC CÁC DẪN XUẤT HALOGEN TRONG PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN? ?? 1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Khảo sát ảnh hưởng cấu trúc chất tác nhân nucleophin, dung môi đến hoạt. .. khảo sát cấu trúc dẫn xuất halogen, tác nhân nucleophin ảnh hưởng cấu trúc đến hoạt tính hoá học dẫn xuất phản ứng nucleophin đơn phân tử (SN1) lưỡng phân tử (SN2) Cấu trúc chất phản ứng, sản... Do phản ứng SN1 kèm theo lượng sản phẩm anken Ảnh hưởng cấu trúc đến hoạt tính hóa học dẫn xuất halogen phản ứng SN1 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon Cấu tạo gốc hiđrocacbon có ảnh hưởng quan trọng đến