Ảnh hưởng của cấu trúc đến hoạt tính hóa học các dẫn xuất halogen trong phản ứng thế nucleophin

- vi - MỤC LỤC Trang Chƣơng 1: GIỚI THIỆU 1.1 Tính cần thiết đề tài 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Đối tƣợng nghiên cứu 1.4 Nội dung nghiên cứu 1.5 Những đóng góp đề tài Chƣơng 2: TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 2.1 Giới thiệu phản ứng nucleophin 2.1.1 Phản ứng 2.1.2 Tác nhân nucleophin 2.1.3 Phản ứng nucleophin 2.2 Phản ứng nucleophin dẫn xuất halogen 2.2.1 Phản ứng SN2 2.2.2 Phản ứng SN1 15 2.3 Khảo sát phản ứng nucleophin dẫn xuất halogen phƣơng pháp obitan biên 19 2.3.1 Giới thiệu 19 2.3.2 Các obitan biên 19 2.3.3 Một số ứng dụng phạm vi sử dụng 21 Chƣơng 3: PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 3.1 Gaussian 03 phiên B04 22 3.2 GaussView 03 22 3.3 Phần mềm hỗ trợ khác 23 3.4 Các phƣơng pháp tính toán 23 Chƣơng 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 4.1 Khảo sát trạng thái bền dẫn xuất halogen 35 4.2 Nhận định khả phản ứng qua mật độ điện tích 36 4.3 Obitan phân tử dẫn xuất halogen tác nhân nucleophin 37 4.4 Khảo sát phản ứng SN2 38 4.4.1 Cấu trúc chất tham gia, sản phẩm phản ứng SN2 C2H5Cl tác nhân Br- 38 4.4.2 Năng lượng HOMO – LUMO 38 4.4 Hiệu ứng nhiệt biến thiên lượng tự phản ứng 39 - vii - 4.4.4 Trạng thái chuyển tiếp 40 4.4.5 Năng lượng tự hoạt hóa số tốc độ 42 4.5 Các yếu tố ảnh hƣởng phản ứng SN2 43 4.5.1 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon 43 4.5.2 Ảnh hưởng nhóm 53 4.5.3 Ảnh hưởng tác nhân nucleophin 55 4.5.4 Ảnh hưởng dung môi 56 4.6 Khảo sát phản ứng SN1 62 4.6.1 Chất tham gia, sản phẩm phản ứng SN1 C4H9Cl (tert – butyl clorua) OH- 62 4.6.2 Hiệu ứng nhiệt biến thiên lượng tự phản ứng 62 4.6.3 Trạng thái chuyển tiếp giai đoạn 63 4.6.4 Các giá trị nhiệt động giai đoạn 66 4.6.5 Khảo sát giai đoạn 68 4.7 Các yếu tố ảnh hƣởng phản ứng SN1 71 4.7.1 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon 71 4.7.2 Ảnh hưởng nhóm 79 4.7.3 Ảnh hưởng tác nhân nucleophin 81 4.7.4 Ảnh hưởng dung môi 81 4.8 So sánh phƣơng pháp tính khác cấu trúc hệ cấu trúc khảo sát 83 Chƣơng 5: KẾT LUẬN VÀ KHUYẾN NGHỊ 88 5.1 Kết luận 88 5.2 Khuyến nghị 89 TÀI LIỆU THAM KHẢO 90 PHỤ LỤC 91 - viii - DANH SÁCH BẢNG Bảng 2.1 : Một số tác nhân nucleophin sản phẩm thu Bảng 4.1 : Giá trị hệ số HOMO, LUMO Br- C2H5Cl 39 Bàng 4.2: Các giá trị nhiệt động phản ứng C2H5Cl Br- (T = 298,15K; P = 1,00 atm) 40 Bảng 4.3 : Năng lượng tự hoạt hóa số tốc độ phản ứng SN2 C2H5Cl Br- 42 Bảng 4.4 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 43 Bảng 4.5: Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng SN2 dẫn xuất khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 44 Bảng 4.6 : Năng lượng tổng cộng chất phản ứng SN2 dẫn xuất khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 44 Bảng 4.7 : Hằng số tốc độ phản ứng SN2 khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 45 Bảng 4.8 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 47 Bảng 4.9 : Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C 47 Bảng 4.10 : Năng lượng tổng cộng dẫn xuất tác nhân nucleophin phản ứng khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C 48 Bảng 4.11 : Hằng số tốc độ phản ứng khảo sát ảnh hưởng phân nhánh C Br- 48 Bảng 4.12 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 49 Bảng 4.13 : Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng dẫn xuất allyl benzyl 50 Bảng 4.14 : Năng lượng tổng cộng dẫn xuất tác nhân nucleophin phản ứng khảo sát ảnh hưởng R gốc allyl, benzyl 50 Bảng 4.15 : Hằng số tốc độ phản ứng khảo sát ảnh hưởng R gốc allyl, benzyl 50 Bảng 4.16 : Giá trị nhiệt động học hệ tham gia hệ sản phẩm điều kiện tiêu chuẩn (T = 298,15K ; P = 1,00 atm) 51 Bảng 4.17 : Biến thiên entanpy, entropy lượng tự phản ứng khảo sát ảnh hưởng R xicloankyl 52 Bảng 4.18 : Năng lượng tổng cộng dẫn xuất nucleophin phản ứng khảo sát ảnh hưởng R xicloankyl 52 Bảng 4.19 : Hằng số tốc độ phản ứng khảo sát ảnh hưởng R xicloankyl 53 Bảng 4.20 : Năng lượng tổng cộng thành phần tính lượng liên kết 54 Bảng 4.21 : Độ dài lượng liên kết C – X 54 Bảng 4.22 : Năng lượng liên kết C – X thực nghiệm 55 - ix - Bảng 4.23 : Năng lượng HOMO, LUMO OH-, SH- CH3CH2Cl 55 Bảng 4.24 : Năng lượng dao động điểm không dẫn xuất halogen pha khí dung môi nước với mô hình PCM 57 Bảng 4.25 : Năng lượng dao động điểm không trạng thái chuyển tiếp pha khí dung môi nước với mô hình PCM 58 Bảng 4.26 : Độ dài liên kết C – Cl dẫn xuất halogen pha khí dung môi nước với mô hình PCM 58 Bảng 4.27 : Năng lượng LUMO dẫn xuất halogen tính pha khí so sánh với tính dung môi nước mô hình PCM 59 Bảng 4.28 : Giá trị lượng tự chất ban đầu tính pha khí so sánh với tính dung môi nước mô hình PCM 60 Bảng 4.29 : Giá trị lượng tự trạng thái chuyển tiếp tính pha khí so sánh với tính dung môi nước mô hình PCM 60 Bảng 4.30 : Các giá trị nhiệt động phản ứng C4H9Cl (tert – butyl clorua) OH- (T = 298,15K; P = 1,00 atm) 62 Bảng 4.31 : Entanpy, entropy lượng tự giai đoạn 68 Bảng 4.32 : Năng lượng hoạt hóa gian đoạn 68 Bảng 4.33 : Hằng số tốc độ gian đoạn 68 Bảng 4.34 : Năng lượng HOMO – LUMO thành phần gian đoạn 70 Bảng 4.35 : Độ dài liên kết C – Cl CH3CH2CH2CH2 – Cl, CH3CH2CH(CH3) – Cl, (CH3)3C – Cl 72 Bảng 4.36 : Mật độ điện tích C trung tâm cacbocation 74 Bảng 4.37 : Năng lượng LUMO số cacbocation 74 Bảng 4.38 : Năng lượng phân li ion dẫn xuất halogen bậc tính toán dung môi nước 75 Bảng 4.39 : Năng lượng điểm cấu trúc cộng hưởng cation benzyl 78 Bảng 4.40 : Độ dài liên kết C – F, C – Cl, C – Br phân tử C4H9X 80 Bảng 4.41 : Năng lượng tổng cộng cấu trúc tính lượng liên kết 80 Bảng 4.42 : Năng lượng liên kết C – X thực nghiệm 80 Bảng 4.43 : Năng lượng dao động điểm không cacbocation pha khí dung môi nước với mô hình PCM 82 Bảng 4.44 : Mật độ điện tích C trung tâm dẫn xuất halogen tính pha khí so sánh với tính dung môi nước mô hình PCM 82 Bảng 4.45 : Năng lượng LUMO dẫn xuất halogen tính pha khí so sánh với tính dung môi nước mô hình PCM 82 Bảng 4.46 : Năng lượng dao động điểm không dẫn xuất halogen số cacbocation 83 Bảng 4.47 : Năng lượng tự dẫn xuất halogen cacbocation 84 Bảng 4.48 : Entanpy dẫn xuất halogen cacbocation 85 Bảng 4.49 : Độ dài, lượng liên kết C – X dẫn xuất C4H9X 86 -x- DANH SÁCH HÌNH Hình 2.1 : Giản đồ lượng phản ứng SN2 Hình 2.2 : Giản đồ lượng SN1 15 Hình 2.3 : Tương tác obitan xảy hai phân tử vỏ đóng tiến lại gần 20 Hình 2.4 : Tương tác ưu đãi hai obitan có sai biệt lượng thấp 21 Hình 3.1 : Mô hình Onsager (SCRF=Dipole) 26 Hình 3.2 : Mô hình PCM (SCRF=PCM) 26 Hình 3.3 : Mô hình IPCM (SCRF=IPCM) 27 Hình 3.4 : Mô hình SCI-PCM (SCRF=SCIPCM) 27 Hình 4.1 : Cấu trúc số dẫn xuất halogen 35 Hình 4.2 : Cấu trúc tối ưu hóa Br-, HO-, NH3 36 Hình 4.3 : HOMO LUMO metyl clorua isopropyl clorua 37 Hình 4.4 : HOMO hai tác nhân nucleophin HO- HS- 38 Hình 4.5 : Số thứ tự nguyên tử C2H5Cl 39 Hình 4.6 : HOMO etyl clorua tác nhân Br- 39 Hình 4.7 : Cấu trúc chất phản ứng, trạng thái chuyển tiếp sản phẩm phản ứng SN2 C2H5Cl Br- 40 Hình 4.8 : Mật độ điện tích phân tử C2H5Cl 41 Hình 4.9 : Mật độ điện tích trạng thái chuyển tiếp phản ứng SN2 C2H5Cl Br- 42 Hình 4.10 : Kết IRC trạng thái chuyển tiếp [Br….C2H5….Cl] 42 Hình 4.11 : Cấu trúc thành phần tính lượng liên kết 53 Hình 4.12 : Sự tương tác HOMO HO- HS- với LUMO C2H5Cl 56 Hình 4.13 : Trạng thái chuyển tiếp phản ứng SN2 CH3Cl Br- dung môi nước pha khí 57 Hình 4.14 : Đường phản ứng metyl clorua Br- pha khí 61 Hình 4.15 : Đường phản ứng metyl clorua Br- dung môi nước 61 Hình 4.16 : Cấu trúc chất phản ứng, trạng thái chuyển tiếp cấu trúc trung gian giai đoạn phản ứng SN1 tert – butyl clorua OH- 63 Hình 4.17 : Mật độ điện tích phân tử tert – butyl clorua 64 Hình 4.18 : Khảo sát trạng thái chuyển tiếp TS (1) 64 Hình 4.19 : Khảo sát trạng thái chuyển tiếp TS (2) 64 Hình 4.20 : Khảo sát trạng thái chuyển tiếp TS (3) 65 Hình 4.21 : Mật độ điện tích cacbocation tert – butyl 66 Hình 4.22 : Giản đồ mô tả tiên đề Hammond 67 Hình 4.23 : Hai hướng công OH- vào cacbocation 69 Hình 4.24 : Thứ tự nguyên tử cacbocation 70 Hình 4.25 : Hướng công Br- vào LUMO cacbocation sec – butyl tert – butyl 75 Hình 4.26 : Các dạng tồn cation C3H5+ 77 Hình 4.27 : HOMO HO-, HS- LUMO C4H9+ 81 - xi - DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT o o A Angstrom Đơn vị đo chiều dài (1 A = 10-10m) DFT Density Functional Theory Lý thuyết phiếm hàm mật độ HF Hartree – Fock Phương pháp Hartree – Fock HOMO Highest Occupied Molecular Orbital Obitan phân tử đầy có mức lượng cao Tọa độ phản ứng nội IRC Intrinsic Reaction Coordinate LUMO Lowest Unoccupied Molecular Orbital Obitan phân tử trống có mức lượng thấp MO Molecular Orbital Obitan phân tử (Obitan phân tử) Nu Nucleophin Tác nhân thân hạch PCM Polarizable Continuum Models Mô hình liên tục phân cực SCRF Seft – Consident Reaction Field Trường phản ứng tự hợp TS Transition State Trạng thái chuyển tiếp IS Intermidiate Structure Cấu trúc trung gian GTO Gaussian Type Orbitals Bộ hàm kiểu Gauss STO Slater Type Orbitals Bộ hàm kiểu Slater ZPE Zero Point Energy Năng lượng điểm không Hal Halogen Nhóm halogen CHƢƠNG GIỚI THIỆU 1.1 TÍNH CẦN THIẾT CỦA ĐỀ TÀI Cơ chế phản ứng SN1 SN2 nghiên cứu nhiều trước Đồng thời, có số công trình nghiên cứu nước vấn đề Hơn nữa, phát triển mạnh mẽ khoa học hóa học việc áp dụng công nghệ thông tin nghiên cứu khoa học tính đa dạng phần mềm phục vụ việc tính toán hóa học lượng tử Gaussian, HyperChem, Mopac,….đã ảnh hưởng không nhỏ đến công trình nghiên cứu Với mong muốn hiểu biết sâu Hóa học Hữu nói chung chế phản ứng nucleophin dẫn xuất halogen nói riêng, nghiên cứu thực tính toán cần thiết với hỗ trợ Gaussian GaussView để mô tả, giải thích chứng minh kết phù hợp với thực nghiệm đề tài mang tên: “ẢNH HƢỞNG CỦA CẤU TRÚC ĐẾN HOẠT TÍNH HÓA HỌC CÁC DẪN XUẤT HALOGEN TRONG PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN” 1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Khảo sát ảnh hưởng cấu trúc chất tác nhân nucleophin, dung môi đến hoạt tính hóa học dẫn xuất halogen phản ứng nucleophin SN1 SN2 Dựa sở lượng tử hóa phần mềm chuyên dụng Phần mềm GaussView 03 để xây dựng cấu trúc ban đầu, cacbocation, tác nhân nucleophin phần mềm Gaussian 03W để tính toán xử lí số liệu thu Lập bảng so sánh, thống kê độ dài, lượng liên kết, mật độ điện tích, thông số nhiệt động,… để mô tả, giải thích chứng minh thực nghiệm 1.3 ĐỐI TƢỢNG NGHIÊN Nghiên cứu thực phản ứng nucleophin dẫn xuất halogen Trong bao gồm: - Việc mô cấu trúc phân tử phần mềm GaussView thực tính toán thông qua Gaussian - Nghiên cứu cấu trúc chất dẫn xuất halogen - Các gốc hiđrocacbon no, không no dẫn xuất halogen có vòng thơm - Tác nhân nucleophin (HO-, Br-), dung môi (H2O) 1.4 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU Khảo sát yếu tố ảnh hưởng đến hoạt tính phân tử halogen phản ứng nucleophin, gồm: - Cấu trúc chất dẫn xuất halogen - Cấu trúc tác nhân nucleophin (OH-, H2O, Br-) - Các yếu tố nhiệt động lượng hoạt hóa, biến thiên entanpy, biến thiên lượng tự do) - Xác định lượng HOMO, LUMO - Tính mật độ điện tích trung tâm phản ứng Xây dựng mô hình cấu trúc phân tử, ion, tối ưu hóa cấu trúc, tính toán xử lí kết phần mềm GaussView 03 Gaussian 03 1.5 NHỮNG ĐÓNG GÓP CỦA ĐỀ TÀI Đề tài ứng dụng việc rèn luyện nâng kiến thức chế phản ứng hóa học hữu số kiến thức có liên quan Ứng dụng vào việc nghiên cứu kiến thức hóa học hữu sở lượng tử hóa, cách nhìn đại hóa học Đồng thời phát huy khả tự học khả sử dụng công nghệ thông tin sinh viên việc học chuyên ngành Hóa trường đại học Nghiên cứu cung cấp hệ thống kiến thức nâng cao chế nucleophin cho sinh viên ngành Hóa nói chung sư phạm Hóa nói riêng, nhằm nâng cao chất lượng học tập nghiên cứu sinh viên thông qua việc tiếp cận với kiến thức hóa học cách đại Kết đề tài cung cấp sở kiến thức giúp cho giáo viên việc bồi dưỡng học sinh giỏi - CHƢƠNG TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 2.1 GIỚI THIỆU VỀ PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN 2.1.1 PHẢN ỨNG THẾ Phản ứng (Substitution Reaction) phản ứng mà có hay nhóm nguyên tử phân tử thay hay nhóm nguyên tử khác (Nguyễn Hữu Đỉnh & Đỗ Đình Rãng, 2009) Có loại phản ứng sau: - Phản ứng theo chế gốc (SR) - Phản ứng electrophin (SE) - Phản ứng nucleophin (SN) 2.1.2 TÁC NHÂN NUCLEOPHIN Các anion halogen, cacbanion,…và phân tử trung hòa có electron π anken, aren…hoặc có cặp electron tự như: NH3, H2O, RNH2,…luôn có lực cao với điện tích dương nên gọi chất nucleophin Khi chất nucleophin đóng vai trò tác nhân phản ứng gọi tác nhân nucleophin (Nguyễn Hữu Đỉnh & Đỗ Đình Rãng, 2009) Bảng 2.1 : Một số tác nhân nucleophin sản phẩm thu đƣợc (Thái Doãn Tĩnh, 2001) Loại tác nhân nucleophin Nu- Nu: H – Nu Tác nhân nucleophin Sản phẩm HOROHSRSRCOOCNHC≡CNH2N3NO2NO3SCN Cl , Br-, I(CH3)3N: (CH3)3P: H2O RCOOH Ancol ROH Ete ROR Thioancol RSH Thioete RSR Este RCOOR Nitrin RCN Ankylaxetilen RC≡CH Amin RNH2 Ankyl axit RN3 Nitroankan RNO2 Ankyl nitrat RNO3 Ankyl thioxyanat RSCN Ankyl halogenua (CH3)3N+RXRP+(CH3)3XAncol ROH Este RCOOR ROH NH3 Ete ROR Amin RNH2 2.1.3 PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN Phản ứng nucleophin SN xảy công tác nhân nucleophin (Nu) vào trung tâm thiếu electron chất phân cắt nhóm cặp electron liên kết (Thái Doãn Tĩnh, 2008) Dựa vào chế phản ứng, trường hợp giới hạn định nghĩa Hughes Ingold có hai loại phản ứng nucleophin đơn phân tử (SN1, Unimolecular Nucleophilic Substitution) phản ứng nucleophin lưỡng phân tử (SN2, Bimolecular Nucleophilic Substitution) (Francis, k.n) Dựa vào mối quan hệ chất phản ứng sản phẩm phản ứng nucleophin, có loại phản ứng nucleophin sau: Chất ban đầu Tác nhân Nucleophin Sản phẩm Nu R – Nu+ XNu: R – Nu++ XR–X H – Nu R – Nu+ HX Nu R – Nu + X: R – X+ Nu: R – Nu++ X: Theo định nghĩa trên, phản ứng nguyên tử halogen dẫn xuất halogen nhóm khác phản ứng nucleophin SN Phản ứng nguyên tử halogen dẫn xuất halogen xảy theo chế nucleophin đơn phân tử (SN1) hay lưỡng phân tử (SN2), phụ thuộc vào cấu tạo gốc hiđrocacbon, tác nhân nucleophin, dung môi, nhiệt độ… 2.2 PHẢN ÚNG THẾ NUCLEOPHIN ĐỐI VỚI DẪN XUẤT HALOGEN 2.2.1 PHẢN ỨNG THẾ SN2 Cơ chế phản ứng Cơ chế phản ứng SN2 trình đồng bộ, nhóm Hal tác nhân nucleophin vào đồng thời tạo nên phức hoạt hóa lưỡng phân tử (Thái Doãn Tĩnh, 2001) Nu- + C X Nu C X Nu C + X- Trong tiến trình phản ứng, Nu công vào RHal tạo nên trạng thái chuyển tiếp liên kết C – Hal bắt đầu dài C trung tâm bắt đầu chuyển từ dạng lai hóa sp3 sang sp2 (từ dạng tứ diện chuyển sang dạng tam giác phẳng) Như vậy, trạng thái chuyển tiếp, nguyên tử cacbon trung tâm trạng thái lai hóa sp có obitan p tự do, liên kết C – Nu hình thành liên kết C – Hal từ từ đứt ra, hai liên kết hai liên kết dở dang yếu Sau đó, phức hoạt hóa dần chuyển thành sản phẩm, liên kết C – Nu hình thành bền vững, liên kết C – Hal bị phá vỡ, C trung tâm trở lại trạng thái lai hóa sp3 Sự biến thiên lượng trình phản ứng thể hình 2.1: 11 12 13 14 15 16 1 1 17 35 0.26 0.19 0.12 0.22 -0.05 -0.13 Frequencies -Red masses -Frc consts -IR Inten -Atom AN X 0.06 0.01 0.01 0.00 -0.06 0.04 0.28 0.18 -0.14 10 -0.12 11 0.14 12 0.00 13 -0.09 14 -0.20 15 17 0.00 16 35 0.00 Frequencies -Red masses -Frc consts -IR Inten -Atom AN X 0.04 0.07 0.02 -0.12 -0.07 -0.06 0.26 0.28 -0.19 10 0.16 11 -0.12 12 -0.12 13 0.07 14 0.07 15 17 0.00 16 35 0.00 Frequencies -Red masses -Frc consts -IR Inten -Atom AN X 0.07 -0.01 -0.12 -0.04 0.13 0.10 -0.27 0.26 -0.23 0.10 -0.07 0.05 -0.11 0.21 -0.09 0.05 -0.22 0.42 -0.16 -0.20 0.11 A 286.3555 1.6929 0.0818 0.2622 Y Z 0.07 0.00 -0.08 -0.01 0.14 -0.07 0.00 0.00 -0.11 0.07 0.26 -0.10 0.06 0.10 -0.22 -0.13 -0.23 0.09 0.19 -0.32 0.37 0.02 0.00 -0.01 -0.37 0.01 -0.06 0.32 -0.02 -0.02 0.01 0.01 10 A 635.9387 1.8451 0.4397 2.7720 Y Z -0.04 -0.01 0.01 0.00 0.13 0.10 0.03 0.01 -0.11 -0.09 0.21 0.03 -0.07 0.02 -0.12 -0.05 -0.15 -0.01 0.06 0.46 -0.24 -0.04 0.03 -0.01 0.27 0.04 -0.15 -0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 13 A 852.4894 2.0254 0.8673 13.6732 Y Z 0.05 0.09 0.08 0.10 0.04 -0.10 -0.05 -0.04 -0.04 -0.10 -0.27 0.28 0.05 -0.08 -0.13 -0.07 -0.15 0.30 -0.17 0.07 0.28 0.25 -0.03 0.00 X -0.02 0.01 0.02 -0.04 0.05 0.00 -0.11 0.09 -0.03 -0.01 0.10 -0.03 0.18 0.09 0.03 -0.02 X -0.08 -0.10 0.00 0.20 -0.02 -0.05 0.14 0.12 -0.19 0.13 -0.35 0.17 -0.13 0.12 0.00 0.00 X 0.01 -0.04 -0.03 0.21 -0.05 -0.03 -0.18 -0.14 -0.12 0.08 0.20 0.18 0.37 0.15 0.18 0.08 0.07 -0.02 -0.09 -0.02 -0.06 A 329.9047 1.9197 0.1231 41.3946 Y Z 0.03 0.00 0.03 0.00 0.13 -0.06 -0.11 0.06 0.12 -0.07 -0.04 0.03 0.05 0.01 0.00 0.03 0.00 0.01 0.15 -0.45 0.46 0.08 -0.09 0.06 0.44 0.05 0.10 -0.45 -0.06 0.02 -0.02 0.01 11 A 798.7920 2.3920 0.8992 18.8546 Y Z 0.01 0.09 0.04 -0.08 0.06 -0.15 -0.08 0.00 -0.02 0.14 0.16 -0.11 -0.01 0.14 -0.08 -0.07 -0.09 0.07 -0.02 0.33 -0.29 -0.23 -0.23 0.03 0.37 0.17 -0.06 -0.24 0.00 0.00 0.00 0.00 14 A 885.5065 2.3990 1.1083 10.4713 Y Z 0.01 0.04 -0.01 -0.02 0.08 0.17 -0.08 -0.03 -0.02 -0.17 -0.06 0.17 0.05 0.05 0.05 -0.02 0.04 -0.20 158 -0.01 -0.02 0.01 -0.13 0.02 -0.01 X 0.10 -0.10 -0.07 0.00 0.04 0.08 0.42 -0.33 0.11 -0.18 0.11 0.02 -0.03 0.16 0.00 0.00 X -0.03 0.02 -0.03 0.03 0.00 -0.06 -0.03 0.05 0.02 0.01 -0.03 0.22 0.03 -0.01 0.00 0.00 X -0.01 0.12 -0.09 0.04 -0.04 -0.18 0.01 -0.03 0.25 -0.22 -0.02 -0.04 -0.07 0.16 -0.07 0.16 -0.15 0.02 0.09 -0.01 -0.02 A 570.0436 1.7918 0.3430 42.1756 Y Z -0.05 0.10 0.01 0.10 -0.02 -0.06 0.04 -0.07 -0.07 -0.06 0.30 -0.13 -0.03 0.31 0.22 0.30 0.26 -0.13 0.03 -0.17 0.09 -0.05 0.09 0.01 0.15 -0.06 -0.11 -0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 12 A 836.7245 1.1418 0.4710 21.0149 Y Z 0.04 0.01 0.02 -0.01 -0.04 -0.03 0.03 0.01 -0.05 0.01 0.00 0.11 0.00 -0.10 -0.03 -0.12 -0.05 0.13 -0.04 -0.10 0.05 0.02 0.88 -0.23 0.11 0.05 -0.05 -0.15 -0.02 0.01 -0.01 0.00 15 A 905.4011 1.6081 0.7767 80.4370 Y Z 0.04 0.05 0.01 -0.06 -0.08 -0.02 0.07 0.04 -0.08 -0.01 0.09 0.38 -0.04 -0.17 0.01 -0.25 0.00 0.13 10 11 12 13 14 15 16 1 1 17 35 0.11 -0.21 -0.02 0.08 -0.10 0.00 0.00 -0.06 0.11 -0.22 -0.20 0.00 0.27 -0.33 -0.17 0.03 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 16 A Frequencies -908.2093 Red masses -2.8759 Frc consts -1.3977 IR Inten -13.4931 Atom AN X Y Z 0.18 -0.10 0.17 0.12 -0.04 -0.16 -0.09 0.01 -0.06 -0.09 -0.01 -0.02 -0.08 0.15 0.08 0.19 -0.21 0.26 0.01 -0.06 0.21 0.09 0.04 -0.02 0.03 0.06 -0.50 10 0.01 -0.03 -0.01 11 -0.34 -0.03 -0.02 12 -0.06 0.19 -0.21 13 -0.28 0.10 -0.01 14 -0.17 0.17 0.16 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 19 A Frequencies 1018.0039 Red masses -1.4721 Frc consts -0.8988 IR Inten -11.8991 Atom AN X Y Z 0.07 -0.03 -0.02 -0.06 0.02 0.01 0.07 -0.04 -0.05 0.03 0.04 0.10 -0.10 0.02 -0.04 0.16 -0.16 -0.12 -0.01 -0.04 -0.06 0.02 -0.04 -0.01 -0.16 -0.03 -0.04 10 0.23 -0.09 -0.08 11 0.31 -0.09 -0.13 12 0.08 0.17 0.62 13 -0.37 0.13 -0.14 14 -0.27 0.07 -0.09 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 22 A Frequencies 1201.6635 Red masses -1.4609 Frc consts -1.2429 IR Inten -1.0364 Atom AN X Y Z 0.03 -0.04 -0.10 0.04 0.02 0.10 -0.08 -0.03 -0.02 0.07 -0.02 0.00 -0.05 0.06 0.02 -0.32 0.27 0.42 0.09 -0.05 -0.10 0.14 -0.02 0.13 -0.21 -0.25 0.25 -0.35 -0.31 0.00 0.00 0.15 0.14 0.23 0.31 0.01 -0.10 -0.14 -0.33 0.06 -0.03 -0.01 0.00 0.00 0.00 17 A 933.1126 1.5950 0.8182 37.7552 X Y Z 0.12 0.00 0.01 -0.10 0.08 0.02 0.02 -0.04 0.07 -0.01 0.00 -0.10 -0.03 -0.01 0.08 0.17 -0.29 0.13 0.00 -0.13 -0.38 -0.07 -0.11 -0.39 -0.31 -0.13 0.17 -0.08 0.01 -0.14 0.22 0.10 0.08 -0.06 -0.19 -0.32 -0.09 0.24 0.09 0.10 -0.05 -0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 A 1028.2872 1.7922 1.1165 5.5422 X Y Z -0.04 0.06 0.13 -0.09 -0.02 -0.13 0.11 -0.01 0.02 -0.04 0.02 0.02 0.07 -0.06 -0.03 -0.19 0.10 0.42 -0.19 0.11 0.20 -0.21 0.02 -0.21 -0.27 0.02 -0.44 0.15 -0.02 -0.04 0.37 -0.07 -0.08 -0.04 0.03 0.08 0.25 -0.13 0.04 0.04 -0.05 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 A 1228.0863 1.4403 1.2799 0.1118 X Y Z 0.05 0.11 -0.05 -0.02 -0.12 0.05 -0.01 0.05 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.04 -0.03 0.01 0.01 -0.10 0.22 -0.17 0.09 -0.22 -0.16 0.03 0.24 159 -0.31 -0.04 -0.05 -0.11 0.15 0.00 0.00 0.01 -0.17 0.16 0.08 -0.35 0.44 0.18 0.00 -0.14 -0.15 0.01 0.00 0.00 0.00 18 A 997.1498 1.2729 0.7457 0.3400 X Y Z -0.05 -0.06 0.02 0.00 0.08 -0.03 0.00 -0.05 0.04 -0.01 0.00 0.00 0.03 0.05 -0.04 -0.13 0.26 -0.07 0.27 -0.10 0.07 0.27 -0.08 -0.07 -0.26 -0.12 0.05 0.34 -0.16 -0.28 -0.17 0.17 0.19 0.00 0.01 0.03 -0.24 -0.05 -0.18 0.38 -0.06 0.29 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 A 1151.5953 1.2442 0.9722 129.2669 X Y Z 0.00 -0.02 0.00 0.00 -0.02 0.01 0.02 0.07 -0.02 -0.03 -0.09 0.04 0.01 0.07 -0.03 -0.14 0.12 0.18 0.22 -0.15 -0.24 -0.26 0.01 -0.24 0.15 0.02 0.13 -0.27 0.16 0.25 0.26 -0.19 -0.21 0.03 0.17 0.00 -0.26 -0.02 -0.17 0.35 -0.03 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 A 1254.2564 1.5936 1.4771 18.3384 X Y Z -0.07 0.07 0.00 0.10 0.02 0.00 -0.07 0.00 0.07 -0.02 -0.07 -0.10 0.05 -0.04 0.07 0.16 -0.12 -0.36 -0.13 0.12 0.09 0.19 0.01 0.09 10 11 12 13 14 15 16 1 1 1 17 35 -0.43 -0.07 0.22 0.08 0.27 -0.08 0.00 0.00 -0.02 -0.41 -0.03 -0.05 -0.08 -0.12 -0.03 -0.03 -0.06 0.15 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 A Frequencies 1299.7942 Red masses -1.4352 Frc consts -1.4286 IR Inten -29.8494 Atom AN X Y Z -0.06 -0.02 0.01 0.03 -0.06 0.02 -0.05 0.06 0.06 0.00 0.00 -0.10 0.09 0.02 0.06 -0.11 0.09 0.05 0.29 -0.19 -0.26 -0.33 0.03 -0.22 0.12 0.01 0.00 10 0.45 -0.12 -0.17 11 -0.02 -0.05 -0.01 12 0.02 0.02 0.24 13 -0.07 0.00 -0.02 14 -0.45 0.17 -0.18 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 28 A Frequencies 1369.0607 Red masses -1.5044 Frc consts -1.6614 IR Inten -1.8135 Atom AN X Y Z 0.00 -0.03 -0.08 0.06 0.02 0.11 0.06 -0.03 -0.07 -0.04 0.03 0.04 0.08 -0.03 0.04 -0.10 0.10 0.02 -0.20 0.16 0.31 -0.32 -0.01 -0.43 -0.24 -0.01 -0.21 10 -0.08 0.03 0.13 11 -0.31 0.15 0.10 12 -0.08 -0.04 -0.12 13 -0.39 0.10 -0.14 14 -0.11 0.02 -0.09 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 31 A Frequencies 1457.4711 Red masses -1.0786 Frc consts -1.3499 IR Inten -49.9938 Atom AN X Y Z -0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.03 -0.01 -0.03 0.00 -0.02 -0.02 0.01 -0.04 -0.04 -0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.00 0.05 0.47 -0.26 0.01 -0.18 0.50 0.00 0.00 0.07 -0.23 -0.13 -0.10 0.00 0.03 0.01 0.01 0.15 -0.02 -0.19 0.11 0.00 0.00 0.00 0.00 26 A 1307.8187 1.3309 1.3412 1.1849 X Y Z -0.02 0.01 0.05 0.03 0.00 0.05 0.09 -0.02 -0.02 -0.01 -0.03 -0.08 -0.08 0.04 -0.02 0.13 -0.10 -0.19 0.14 -0.10 -0.16 -0.18 0.00 -0.20 -0.17 0.00 -0.19 -0.18 0.08 0.11 -0.37 0.14 0.17 0.06 0.18 0.44 0.41 -0.12 0.18 0.16 -0.03 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 A 1372.2642 1.6323 1.8110 3.5342 X Y Z -0.07 0.05 0.10 0.07 -0.02 0.05 -0.05 -0.01 -0.04 0.03 0.05 0.13 -0.01 -0.02 -0.08 0.23 -0.17 -0.39 0.20 -0.17 -0.35 -0.11 -0.01 -0.16 -0.18 0.02 -0.34 0.10 -0.06 -0.06 0.11 -0.07 -0.12 -0.05 -0.21 -0.48 0.05 -0.06 -0.06 -0.03 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 A 1512.4807 1.0875 1.4657 3.3757 X Y Z 0.04 -0.03 0.04 -0.04 -0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.01 -0.04 0.47 -0.23 -0.44 -0.05 -0.29 160 -0.22 -0.23 0.39 0.04 -0.33 0.20 0.00 0.00 0.00 -0.36 0.06 -0.02 -0.11 -0.10 0.14 0.28 0.15 -0.07 -0.09 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 27 A 1342.4968 1.3223 1.4042 5.5870 X Y Z 0.02 -0.05 -0.02 0.05 0.02 0.02 -0.09 0.05 0.03 0.05 -0.01 -0.01 -0.09 0.01 -0.02 0.07 -0.03 -0.14 -0.22 0.17 0.46 -0.28 0.00 -0.46 0.11 -0.01 0.16 0.30 -0.09 -0.12 0.21 -0.10 -0.11 0.06 -0.01 0.00 0.25 -0.08 0.11 0.23 -0.08 0.07 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 A 1456.9021 1.0810 1.3518 4.0057 X Y Z -0.01 0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.04 -0.02 -0.04 0.00 0.00 -0.01 -0.01 0.03 0.03 0.02 -0.09 0.04 0.09 0.00 0.02 0.06 -0.04 -0.01 0.06 0.04 -0.03 0.21 -0.12 0.51 0.27 0.49 0.15 0.00 0.01 0.01 -0.07 -0.38 -0.09 0.15 -0.03 -0.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 A 1523.2318 1.1035 1.5086 3.9946 X Y Z 0.04 -0.02 0.04 0.05 0.00 -0.04 -0.01 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.01 0.40 -0.21 -0.39 -0.04 -0.25 10 11 12 13 14 15 16 1 1 1 17 35 -0.02 0.00 0.14 0.19 0.00 0.11 -0.20 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.08 0.37 0.33 0.10 -0.01 0.02 0.55 0.13 0.06 0.54 0.00 0.00 0.00 0.00 34 A Frequencies 3057.7815 Red masses -1.0664 Frc consts -5.8746 IR Inten -25.2137 Atom AN X Y Z 0.00 0.01 -0.01 -0.05 -0.03 0.04 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.02 0.00 -0.01 -0.03 -0.17 0.06 0.37 0.75 -0.30 0.18 -0.32 -0.15 10 -0.04 -0.11 0.00 11 0.00 -0.01 0.02 12 0.00 0.00 0.00 13 0.00 0.00 -0.01 14 0.01 0.03 0.00 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 37 A Frequencies 3075.9766 Red masses -1.0655 Frc consts -5.9397 IR Inten -22.8122 Atom AN X Y Z 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.03 -0.06 -0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.01 0.09 -0.15 -0.08 10 0.31 0.85 0.02 11 0.07 -0.17 0.31 12 -0.01 0.00 0.00 13 0.00 0.00 0.01 14 -0.01 -0.02 0.00 15 17 0.00 0.00 0.00 16 35 0.00 0.00 0.00 40 A Frequencies 3130.4935 Red masses -1.0972 Frc consts -6.3353 IR Inten -20.9808 Atom AN X Y Z 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 -0.01 0.06 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.04 -0.02 -0.02 0.29 0.29 0.02 0.01 0.00 0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.28 -0.24 0.30 -0.20 -0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 35 A 3062.1688 1.0677 5.8989 1.1384 X Y Z -0.01 0.03 -0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.06 -0.02 0.14 0.06 0.06 -0.08 -0.40 0.15 -0.03 -0.06 0.02 -0.05 0.08 0.04 0.01 0.03 0.00 0.00 -0.01 0.02 0.00 0.00 0.00 -0.10 -0.05 0.20 0.25 0.81 -0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 A 3109.1121 1.0988 6.2581 20.2591 X Y Z 0.04 0.03 0.01 0.02 -0.07 -0.02 -0.01 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.41 -0.15 -0.19 -0.03 -0.16 0.06 0.13 0.25 -0.11 -0.38 0.61 0.30 0.04 0.10 0.00 0.04 -0.07 0.14 -0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 -0.04 -0.02 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 A 3136.6066 1.0952 6.3484 21.4996 X Y Z 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.03 -0.07 -0.07 -0.03 -0.03 161 -0.33 -0.30 0.03 0.04 0.00 -0.01 0.03 0.00 0.00 0.31 0.28 -0.35 0.24 -0.02 0.07 0.07 0.01 0.00 0.00 -0.07 -0.01 -0.01 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 36 A 3066.7135 1.0609 5.8787 40.3246 X Y Z 0.03 -0.04 0.04 -0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 -0.01 -0.46 -0.18 -0.20 0.13 0.64 -0.23 0.02 0.05 -0.02 0.07 -0.11 -0.05 -0.01 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.07 -0.04 0.16 0.13 0.41 -0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 A 3118.1669 1.1041 6.3249 37.8676 X Y Z -0.06 -0.06 -0.01 0.01 -0.05 0.00 0.00 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.58 0.22 0.26 0.08 0.46 -0.17 0.13 0.24 -0.10 -0.19 0.30 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 -0.08 0.16 0.00 0.00 0.00 -0.06 -0.03 0.14 0.02 0.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 A 3303.4204 1.0925 7.0239 1.3482 X Y Z 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.09 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 11 12 13 14 15 16 1 1 1 1 17 35 -0.01 -0.06 0.06 -0.13 0.19 -0.01 0.04 0.00 0.00 0.00 -0.04 -0.12 -0.10 -0.35 -0.39 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.02 0.05 -0.05 -0.02 0.78 0.00 -0.08 0.00 0.00 0.00 -0.02 -0.02 0.02 -0.02 0.01 0.02 -0.38 -0.08 0.00 0.00 -0.11 -0.03 -0.03 -0.04 -0.02 -0.01 -0.17 -0.27 0.00 0.00 0.04 0.01 -0.02 0.00 0.05 0.00 0.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.04 -0.02 0.00 0.00 0.00 - Thermochemistry Temperature 298.150 Kelvin Pressure 1.00000 Atm Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 12.00000 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom has atomic number and mass 1.00783 Atom 10 has atomic number and mass 1.00783 Atom 11 has atomic number and mass 1.00783 Atom 12 has atomic number and mass 1.00783 Atom 13 has atomic number and mass 1.00783 Atom 14 has atomic number and mass 1.00783 Atom 15 has atomic number 17 and mass 34.96885 Atom 16 has atomic number 35 and mass 78.91834 Molecular mass: 182.95761 amu Principal axes and moments of inertia in atomic units: EIGENVALUES -986.959622871.072263385.85669 X 0.37097 0.91744 0.14384 Y 0.81977 -0.39630 0.41342 Z -0.43629 0.03545 0.89911 This molecule is an asymmetric top Rotational symmetry number Warning assumption of classical behavior for rotation may cause significant error Rotational temperatures (Kelvin) 0.08776 0.03017 0.02558 Rotational constants (GHZ): 1.82859 0.62859 0.53302 imaginary frequencies ignored Zero-point vibrational energy 341499.5 (Joules/Mol) 81.62034 (Kcal/Mol) Warning explicit consideration of degrees of freedom as vibrations may cause significant error Vibrational temperatures: 91.10 114.24 151.10 211.80 252.97 (Kelvin) 412.00 474.66 820.16 914.97 1149.28 1203.86 1226.54 1274.04 1302.67 1306.71 1342.54 1434.67 1464.68 1479.47 1656.89 1728.92 1766.94 1804.59 1870.11 1881.66 1931.55 1969.77 1974.38 2096.15 2096.97 2176.12 2191.59 4399.46 4405.77 4412.31 4425.64 4473.31 4486.34 4504.08 4512.87 4752.88 Zero-point correction= Thermal correction to Energy= Thermal correction to Enthalpy= Thermal correction to Gibbs Free Energy= Sum of electronic and zero-point Energies= Sum of electronic and thermal Energies= Sum of electronic and thermal Enthalpies= Sum of electronic and thermal Free Energies= 162 0.130070 (Hartree/Particle) 0.138259 0.139203 0.094446 -3227.886203 -3227.878015 -3227.877071 -3227.921828 E (Thermal) CV S KCal/Mol Cal/Mol-Kelvin Cal/Mol-Kelvin Total 86.759 27.616 94.199 Electronic 0.000 0.000 0.000 Translational 0.889 2.981 41.519 Rotational 0.889 2.981 30.640 Vibrational 84.981 21.654 22.040 Vibration 0.597 1.972 4.351 Vibration 0.600 1.963 3.906 Vibration 0.605 1.945 3.359 Vibration 0.617 1.906 2.708 Vibration 0.628 1.872 2.372 Vibration 0.684 1.699 1.495 Vibration 0.713 1.616 1.261 Vibration 0.926 1.096 0.504 Q Log10(Q) Ln(Q) Total Bot 0.361434D-43 -43.441971 -100.028834 Total V=0 0.243267D+17 16.386084 37.730352 Vib (Bot) 0.335117D-57 -57.474804 -132.340627 Vib (Bot) 0.326000D+01 0.513217 1.181726 Vib (Bot) 0.259393D+01 0.413958 0.953173 Vib (Bot) 0.195225D+01 0.290535 0.668982 Vib (Bot) 0.137851D+01 0.139411 0.321006 Vib (Bot) 0.114395D+01 0.058409 0.134491 Vib (Bot) 0.669138D+00 -0.174484 -0.401764 Vib (Bot) 0.566398D+00 -0.246879 -0.568459 Vib (Bot) 0.269977D+00 -0.568673 -1.309418 Vib (V=0) 0.225554D+03 2.353250 5.418559 Vib (V=0) 0.379812D+01 0.579568 1.334505 Vib (V=0) 0.314168D+01 0.497162 1.144757 Vib (V=0) 0.251526D+01 0.400583 0.922376 Vib (V=0) 0.196639D+01 0.293670 0.676200 Vib (V=0) 0.174845D+01 0.242654 0.558731 Vib (V=0) 0.133531D+01 0.125583 0.289165 Vib (V=0) 0.125552D+01 0.098823 0.227548 Vib (V=0) 0.106823D+01 0.028666 0.066005 Electronic 0.100000D+01 0.000000 0.000000 Translational 0.972704D+08 7.987981 18.393006 Rotational 0.110880D+07 6.044852 13.918787 Center Atomic Forces (Hartrees/Bohr) Number Number X Y Z 0.000008362 0.000003310 -0.000010244 -0.000009540 -0.000000870 -0.000009272 -0.000019617 0.000017546 0.000007691 0.000039868 -0.000008076 -0.000010718 0.000007899 -0.000002522 -0.000005470 0.000014805 0.000006670 -0.000020934 0.000015815 0.000003877 -0.000007452 -0.000012091 0.000003292 -0.000017284 -0.000008850 -0.000000214 -0.000016408 10 -0.000011131 -0.000008071 0.000008983 11 -0.000023548 -0.000003896 0.000004156 12 -0.000004577 -0.000002808 0.000021608 13 0.000020759 0.000002117 0.000006345 14 0.000007664 0.000005946 -0.000002359 15 17 -0.000019218 -0.000002122 0.000005960 16 35 -0.000006600 -0.000014178 0.000045398 Cartesian Forces: Max 0.000045398 RMS 0.000014033 -Internal Coordinate Forces (Hartree/Bohr or radian) Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J -1 C C 0.000039( 1) C 0.000009( 2) 0.000754( 16) 163 C -0.000016( 3) 0.000379( 17) -0.000005( 30) C -0.000022( 4) 0.000108( 18) 0.000052( 31) H -0.000007( 5) 0.000053( 19) 0.000002( 32) H 0.000009( 6) 0.000010( 20) 0.000029( 33) H -0.000003( 7) -0.000036( 21) -0.000024( 34) H -0.000002( 8) -0.000035( 22) 0.000014( 35) 10 H -0.000011( 9) -0.000010( 23) 0.000021( 36) 11 H 0.000000( 10) -0.000050( 24) -0.000002( 37) 12 H -0.000005( 11) -0.000036( 25) 0.000021( 38) 13 H 0.000003( 12) -0.000044( 26) 0.000006( 39) 14 H -0.000008( 13) -0.000004( 27) -0.000011( 40) 15 Cl 0.000004( 14) -0.000063( 28) 0.000075( 41) 16 Br -0.000033( 15) -0.000139( 29) 0.000116( 42) -Internal Forces: Max 0.000754424 RMS 0.000136922 4.3 IRC 4.3.1 TS phản ứng SN2 etyl clorua + Br- : [Br- - - C2H5 - - - Cl] Summary of reaction path following: (Int Coord: Angstroms, and Degrees) Energy reported as Energy + 3111 a.u -ENERGY RX.COORD B1 B2 B3 -0.30183 -2.99464 1.09446 1.09446 1.09211 -0.30121 -2.89467 1.09437 1.09442 1.09213 -0.30055 -2.79468 1.09429 1.09437 1.09213 -0.29985 -2.69469 1.09421 1.09432 1.09217 -0.29912 -2.59472 1.09415 1.09427 1.09214 -0.29838 -2.49475 1.09405 1.09422 1.09221 -0.29760 -2.39475 1.09398 1.09418 1.09222 -0.29682 -2.29476 1.09389 1.09412 1.09230 -0.29604 -2.19479 1.09385 1.09410 1.09220 10 -0.29524 -2.09484 1.09375 1.09403 1.09232 11 -0.29446 -1.99484 1.09368 1.09400 1.09231 12 -0.29367 -1.89485 1.09359 1.09394 1.09242 13 -0.29289 -1.79487 1.09354 1.09391 1.09236 14 -0.29213 -1.69487 1.09347 1.09387 1.09241 15 -0.29139 -1.59487 1.09342 1.09384 1.09235 16 -0.29067 -1.49489 1.09332 1.09377 1.09252 17 -0.28997 -1.39492 1.09329 1.09376 1.09241 18 -0.28930 -1.29492 1.09322 1.09372 1.09246 19 -0.28867 -1.19493 1.09319 1.09370 1.09239 20 -0.28805 -1.09494 1.09310 1.09363 1.09255 21 -0.28749 -0.99500 1.09312 1.09365 1.09228 22 -0.28696 -0.89513 1.09297 1.09353 1.09279 23 -0.28649 -0.79538 1.09300 1.09356 1.09249 24 -0.28605 -0.69538 1.09295 1.09352 1.09258 25 -0.28565 -0.59539 1.09293 1.09351 1.09252 26 -0.28531 -0.49541 1.09288 1.09348 1.09267 27 -0.28501 -0.39544 1.09288 1.09348 1.09258 28 -0.28478 -0.29554 1.09282 1.09344 1.09279 29 -0.28460 -0.19694 1.09284 1.09344 1.09269 30 -0.28446 -0.09858 1.09281 1.09342 1.09283 31 -0.28435 0.00000 1.09279 1.09341 1.09296 32 -0.28446 0.09861 1.09278 1.09338 1.09307 33 -0.28458 0.19734 1.09277 1.09332 1.09318 34 -0.28476 0.29643 1.09280 1.09342 1.09312 35 -0.28499 0.39630 1.09278 1.09329 1.09329 36 -0.28527 0.49624 1.09281 1.09338 1.09325 37 -0.28560 0.59622 1.09280 1.09328 1.09339 38 -0.28597 0.69620 1.09284 1.09333 1.09337 39 -0.28639 0.79619 1.09285 1.09327 1.09346 40 -0.28685 0.89619 1.09288 1.09329 1.09346 41 -0.28734 0.99598 1.09286 1.09310 1.09364 42 -0.28787 1.09583 1.09295 1.09330 1.09344 43 -0.28844 1.19579 1.09295 1.09314 1.09359 44 -0.28904 1.29578 1.09299 1.09318 1.09354 45 -0.28964 1.39577 1.09302 1.09311 1.09359 164 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 -0.29030 -0.29097 -0.29167 -0.29238 -0.29310 -0.29385 -0.29459 -0.29533 -0.29606 -0.29680 -0.29754 -0.29827 -0.29899 -0.29970 -0.30039 -0.30107 B4 1.51844 1.51804 1.51751 1.51691 1.51623 1.51553 1.51475 1.51396 1.51311 1.51227 1.51140 1.51055 1.50966 1.50881 1.50796 1.50717 1.50634 1.50558 1.50484 1.50415 1.50346 1.50293 1.50232 1.50181 1.50136 1.50096 1.50068 1.50028 1.50041 1.50005 1.49990 1.50006 1.50052 1.50036 1.50079 1.50110 1.50151 1.50198 1.50249 1.50306 1.50365 1.50431 1.50496 1.50570 1.50643 1.50722 1.50795 1.50877 1.50958 1.51041 1.51121 1.49564 1.59558 1.69556 1.79555 1.89555 1.99552 2.09551 2.19551 2.29543 2.39539 2.49538 2.59538 2.69533 2.79530 2.89529 2.99528 B5 1.08560 1.08537 1.08507 1.08482 1.08448 1.08423 1.08391 1.08363 1.08333 1.08303 1.08273 1.08241 1.08215 1.08184 1.08161 1.08121 1.08104 1.08074 1.08056 1.08017 1.08016 1.07956 1.07961 1.07936 1.07924 1.07898 1.07889 1.07838 1.07884 1.07852 1.07831 1.07836 1.07854 1.07818 1.07856 1.07847 1.07875 1.07872 1.07897 1.07904 1.07965 1.07913 1.07976 1.07975 1.08009 1.07985 1.08071 1.08064 1.08106 1.08124 1.08171 165 1.09311 1.09308 1.09315 1.09318 1.09323 1.09326 1.09332 1.09337 1.09344 1.09348 1.09354 1.09359 1.09367 1.09371 1.09378 1.09384 B6 1.08376 1.08329 1.08308 1.08258 1.08268 1.08207 1.08186 1.08127 1.08152 1.08077 1.08058 1.07994 1.07986 1.07945 1.07932 1.07863 1.07862 1.07823 1.07810 1.07754 1.07771 1.07678 1.07701 1.07670 1.07660 1.07627 1.07624 1.07576 1.07608 1.07582 1.07566 1.07566 1.07575 1.07559 1.07584 1.07578 1.07603 1.07605 1.07629 1.07640 1.07690 1.07661 1.07713 1.07720 1.07753 1.07743 1.07815 1.07817 1.07856 1.07878 1.07922 1.09321 1.09299 1.09302 1.09294 1.09291 1.09283 1.09284 1.09278 1.09281 1.09269 1.09269 1.09265 1.09265 1.09261 1.09262 1.09262 B7 1.94661 1.96089 1.97566 1.99068 2.00590 2.02123 2.03675 2.05239 2.06811 2.08389 2.09976 2.11570 2.13165 2.14767 2.16371 2.17978 2.19585 2.21195 2.22807 2.24419 2.26030 2.27639 2.29245 2.30856 2.32465 2.34072 2.35677 2.37281 2.38849 2.40400 2.43635 2.46868 2.48417 2.49982 2.51558 2.53136 2.54709 2.56278 2.57843 2.59404 2.60953 2.62499 2.64044 2.65584 2.67119 2.68641 2.70164 2.71681 2.73194 2.74700 2.76196 1.09346 1.09366 1.09359 1.09364 1.09364 1.09369 1.09367 1.09370 1.09366 1.09376 1.09377 1.09381 1.09382 1.09390 1.09393 1.09398 B8 3.02260 3.00978 2.99680 2.98372 2.97059 2.95742 2.94416 2.93083 2.91748 2.90408 2.89061 2.87707 2.86353 2.84990 2.83622 2.82248 2.80874 2.79491 2.78105 2.76713 2.75319 2.73918 2.72521 2.71112 2.69700 2.68286 2.66867 2.65448 2.64043 2.62658 2.59784 2.56893 2.55460 2.54044 2.52597 2.51150 2.49700 2.48249 2.46798 2.45346 2.43899 2.42451 2.41002 2.39554 2.38108 2.36670 2.35231 2.33794 2.32360 2.30931 2.29512 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 1.51202 1.51280 1.51362 1.51436 1.51512 1.51582 1.51651 1.51710 1.51768 1.51819 A1 108.71041 108.71651 108.72425 108.73309 108.74231 108.75207 108.76272 108.77409 108.78433 108.79608 108.80730 108.81895 108.82982 108.84094 108.85113 108.86145 108.87178 108.88014 108.88713 108.89503 108.90042 108.90758 108.91102 108.91442 108.91470 108.91402 108.90980 108.91467 108.90732 108.89859 108.88291 108.87030 108.86430 108.84878 108.84137 108.82783 108.81596 108.80200 108.78706 108.77079 108.75407 108.73515 108.71760 108.69822 108.67743 108.65287 108.63393 108.61320 108.59303 108.57194 108.55002 108.52747 108.50480 108.48124 108.45859 108.43520 108.41178 1.08166 1.08205 1.08187 1.08266 1.08267 1.08303 1.08292 1.08359 1.08361 1.08394 A2 108.51259 108.52219 108.53273 108.54406 108.55574 108.56844 108.58084 108.59312 108.60614 108.61927 108.63271 108.64550 108.65952 108.67318 108.68691 108.69974 108.71410 108.72809 108.74142 108.75304 108.76518 108.77319 108.78423 108.79163 108.79841 108.80304 108.81043 108.80088 108.82170 108.80992 108.80212 108.79966 108.79355 108.79262 108.78388 108.77866 108.77175 108.76511 108.75943 108.75423 108.74758 108.74402 108.73832 108.73429 108.73059 108.72802 108.72326 108.71931 108.71445 108.70975 108.70527 108.70222 108.69793 108.69305 108.68800 108.68311 108.67781 166 1.07927 1.07965 1.07963 1.08027 1.08038 1.08073 1.08078 1.08132 1.08145 1.08176 A3 111.51366 111.49740 111.48299 111.46899 111.45757 111.44352 111.43234 111.42187 111.41404 111.40431 111.39719 111.39058 111.38460 111.37985 111.37575 111.37217 111.36991 111.36744 111.36573 111.36555 111.36479 111.36579 111.36505 111.36570 111.36620 111.36792 111.36854 111.37320 111.38972 111.36850 111.36419 111.38088 111.40347 111.39145 111.39533 111.39972 111.40352 111.40775 111.41280 111.41848 111.42318 111.42880 111.43407 111.44047 111.44723 111.45356 111.46033 111.46738 111.47471 111.48284 111.49154 111.50052 111.50898 111.51727 111.52431 111.53272 111.54107 2.77689 2.79175 2.80646 2.82117 2.83578 2.85033 2.86472 2.87909 2.89334 2.90748 A4 113.96912 114.22488 114.49161 114.76144 115.03595 115.31617 115.59928 115.87992 116.15978 116.44193 116.71997 116.98861 117.26437 117.52938 117.78721 118.03121 118.28222 118.51673 118.74208 118.95683 119.16194 119.34161 119.52867 119.69296 119.84146 119.97645 120.07992 120.21468 120.21165 120.34201 120.42658 120.42217 120.31465 120.37315 120.26617 120.20171 120.10135 119.98885 119.86222 119.72070 119.55702 119.39751 119.21802 119.02798 118.82864 118.61344 118.40349 118.18385 117.95659 117.72296 117.48275 117.24918 117.00864 116.76098 116.51899 116.27808 116.03527 2.28098 2.26691 2.25298 2.23909 2.22530 2.21164 2.19818 2.18481 2.17161 2.15863 A5 114.68953 114.99451 115.30479 115.61771 115.92915 116.25149 116.57230 116.89194 117.20486 117.52749 117.84112 118.14771 118.45738 118.75709 119.04870 119.32838 119.60912 119.87451 120.12860 120.37129 120.60157 120.80712 121.01964 121.20587 121.37600 121.53383 121.65706 121.82078 121.82893 121.96393 122.05928 122.08047 122.00536 122.05579 121.94274 121.87686 121.77168 121.65105 121.51186 121.35437 121.17484 120.99630 120.79745 120.58330 120.35747 120.11428 119.87635 119.62653 119.36856 119.10229 118.82743 118.55817 118.28279 117.99926 117.72485 117.44843 117.17073 58 59 60 61 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 108.39014 108.36784 108.34644 108.32597 A6 111.42402 111.16494 110.87759 110.57333 110.25698 109.93445 109.59723 109.24987 108.89713 108.53916 108.17213 107.79694 107.42206 107.03808 106.65025 106.25529 105.86119 105.46063 105.05719 104.64856 104.24040 103.82372 103.41229 102.99454 102.57693 102.15726 101.73580 101.31443 100.89194 100.47996 99.63627 98.78380 98.35147 97.94453 97.51787 97.09771 96.67734 96.25905 95.84389 95.43190 95.02565 94.62230 94.22057 93.82337 93.43140 93.04884 92.66642 92.28894 91.91630 91.55014 91.19482 90.84461 90.50267 90.17413 89.84916 89.53390 89.22901 88.94096 88.65930 88.39070 88.13786 D4 -39.91882 108.67193 111.54930 108.66636 111.55788 108.65970 111.56676 108.65357 111.57471 A7 D1 88.62069 118.52911 88.86944 118.48871 89.14672 118.44506 89.44070 118.39956 89.74820 118.35283 90.06209 118.30616 90.39205 118.25866 90.73191 118.21035 91.07896 118.16375 91.43071 118.11583 91.79301 118.07039 92.16262 118.02589 92.53433 117.98219 92.91506 117.93964 93.30075 117.89925 93.69201 117.85987 94.08461 117.82105 94.48381 117.78436 94.88734 117.74957 95.29609 117.71359 95.70713 117.68068 96.12215 117.64575 96.53696 117.61318 96.95732 117.58001 97.37871 117.54813 97.80266 117.51345 98.22858 117.48921 98.66141 117.43229 99.08284 117.45778 99.51385 117.39282 100.36906 117.33648 101.21845 117.31134 101.63302 117.31219 102.04966 117.27978 102.47039 117.28490 102.89128 117.27427 103.31133 117.27498 103.72887 117.27604 104.14398 117.28074 104.55526 117.28747 104.96252 117.29920 105.36434 117.31093 105.76708 117.32853 106.16323 117.34815 106.55537 117.37125 106.93610 117.39812 107.32055 117.42367 107.69655 117.45172 108.06918 117.48149 108.43465 117.51138 108.79065 117.54198 109.14116 117.57272 109.48491 117.60553 109.81318 117.64134 110.14083 117.67648 110.45643 117.71121 110.76271 117.74530 111.05106 117.77978 111.33654 117.81029 111.60599 117.83852 111.86129 117.86543 D5 D6 76.27665-100.54536 167 115.79116 115.55898 115.32565 115.09523 D2 118.60361 118.73707 118.86780 118.99534 119.12051 119.24505 119.36369 119.47710 119.58807 119.69678 119.79898 119.89423 119.99131 120.08111 120.16746 120.24742 120.32861 120.40583 120.48113 120.55235 120.62371 120.68773 120.75679 120.82197 120.88891 120.95661 121.02148 121.09151 121.09973 121.21619 121.34228 121.42719 121.45800 121.53204 121.56350 121.61399 121.65482 121.69785 121.74029 121.78367 121.82346 121.87034 121.91120 121.95759 122.00587 122.06148 122.10974 122.16333 122.21697 122.27519 122.33843 122.40501 122.47346 122.54718 122.61808 122.69357 122.77026 122.84776 122.92470 123.00274 123.08046 116.89019 116.62210 116.35230 116.08830 D3 191.50251 191.45885 191.32980 191.14805 190.92132 190.68533 190.39188 190.06156 189.70111 189.33305 188.92041 188.47527 188.02826 187.54167 187.03042 186.49277 185.95415 185.38242 184.79063 184.17857 183.54813 182.89492 182.24222 181.56499 180.87131 180.16847 179.45195 178.73237 178.01240 177.39273 175.87636 174.30094 173.53495 172.79653 172.03833 171.30469 170.58866 169.88384 169.19754 168.52879 167.89272 167.25820 166.64946 166.06210 165.49965 164.97588 164.46213 163.97025 163.50731 163.07569 162.69138 162.31259 161.97254 161.68736 161.41397 161.16983 160.96544 160.82644 160.69401 160.60882 160.57102 -39.07491 76.66830-100.19902 -38.21847 77.01466 -99.88895 -37.35344 77.33659 -99.60030 -36.47538 77.63490 -99.32869 -35.61280 77.92428 -99.06789 -34.72351 78.19096 -98.82396 -33.81642 78.44663 -98.59003 -32.89288 78.68781 -98.36509 10 -31.97420 78.92703 -98.14546 11 -31.02302 79.15298 -97.93391 12 -30.04601 79.37478 -97.72643 13 -29.07466 79.59004 -97.52273 14 -28.06806 79.80004 -97.32326 15 -27.03954 80.00534 -97.12687 16 -25.98473 80.20954 -96.93174 17 -24.93271 80.40874 -96.73850 18 -23.84816 80.60472 -96.54822 19 -22.74258 80.79782 -96.35934 20 -21.61309 80.99151 -96.16998 21 -20.46658 81.18142 -95.98336 22 -19.28850 81.37571 -95.79379 23 -18.11954 81.56372 -95.60889 24 -16.91351 81.75528 -95.42052 25 -15.69056 81.94585 -95.23317 26 -14.45202 82.13921 -95.04386 27 -13.19480 82.33229 -94.85448 28 -11.90264 82.54193 -94.65047 29 -10.60978 82.74936 -94.44742 30 -9.34005 83.00250 -94.21697 31 -6.75639 83.36288 -93.86289 32 -4.18026 83.67532 -93.53332 33 -2.93057 83.80165 -93.36998 34 -1.70310 83.94752 -93.20858 35 -0.39975 84.11582 -93.02600 36 0.88007 84.28344 -92.84581 37 2.15508 84.45718 -92.66006 38 3.42324 84.63220 -92.47282 39 4.67625 84.80900 -92.28328 40 5.91228 84.98723 -92.09160 41 7.11971 85.17077 -91.89602 42 8.32003 85.35181 -91.70232 43 9.50293 85.53980 -91.50316 44 10.65832 85.72810 -91.30244 45 11.78612 85.91891 -91.09878 46 12.86815 86.11118 -90.89270 47 13.95819 86.31212 -90.67853 48 15.02570 86.51504 -90.46116 49 16.07226 86.72431 -90.23732 50 17.09330 86.93809 -90.00744 51 18.08070 87.16052 -89.76711 52 19.06875 87.38601 -89.52263 53 20.03455 87.62079 -89.26785 54 20.96932 87.86858 -88.99706 55 21.91223 88.12555 -88.71801 56 22.84508 88.39236 -88.42566 57 23.76393 88.67257 -88.11805 58 24.66017 88.97439 -87.78357 59 25.57110 89.28569 -87.43877 60 26.47021 89.61424 -87.07208 61 27.36134 89.96231 -86.68342 -Total number of gradient calculations: 106 Total number of points: 60 Average number of gradient calculations: 1.76667 -IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC 4.3.2 TS1 phản ứng SN1 tert - butyl clorua + OH- : [C4H9 - - - Cl] 168 RADIUS OF CURVATURE = 0.37657 NET REACTION COORDINATE UP TO THIS POINT = 12.40612 # OF POINTS ALONG THE PATH =127 # OF STEPS = Calculating another point on the path Stepping into the G*F direction IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC -Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J -1 C 2 C 1.548578( 1) 3 H 1.087106( 2) 110.533( 14) 4 H 1.086531( 3) 110.502( 15) 120.316( 26) 5 H 1.083816( 4) 109.195( 16) -120.029( 27) 6 C 1.550790( 5) 111.040( 17) -178.824( 28) 7 H 1.085126( 6) 109.114( 18) 62.849( 29) 8 H 1.072150( 7) 110.548( 19) -177.450( 30) 9 H 1.086241( 8) 110.525( 20) -56.656( 31) 10 10 C 1.549597( 9) 111.073( 21) 124.036( 32) 11 11 H 10 1.085270( 10) 110.562( 22) 58.540( 33) 12 12 H 10 1.086934( 11) 110.588( 23) 179.319( 34) 13 13 H 10 1.086032( 12) 109.174( 24) -61.072( 35) 14 14 Cl 1.814506( 13) 107.969( 25) -117.908( 36) -Z-Matrix orientation: Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.548578 1.018042 0.000000 1.929877 -0.513705 0.878543 1.929129 -0.512230 -0.886168 1.904926 6 0.704811 -1.264205 -0.556757 0.151248 -2.144832 -0.247626 0.739512 -1.234734 -1.627940 1.717918 -1.336193 -0.171593 10 -1.440688 0.123400 -0.557172 11 -1.911091 1.033626 -0.199372 12 -1.430520 0.134676 -1.644000 13 -2.026687 -0.727489 -0.222420 14 17 0.938824 1.448339 -0.559783 Distance matrix (angstroms): C 0.000000 C 1.548578 0.000000 H 2.181934 1.087106 0.000000 H 2.181116 1.086531 1.765811 0.000000 H 2.162502 1.083816 1.768516 1.764877 0.000000 C 1.550790 2.554879 2.807076 3.500825 2.772000 H 2.164370 2.801701 3.176973 3.784339 2.580294 H 2.172933 3.487365 3.776269 4.323105 3.764240 H 2.183139 2.774102 2.586777 3.781300 3.080262 10 C 1.549597 2.554406 3.499428 2.758846 2.818366 11 H 2.181834 2.788544 3.765887 2.550932 3.173404 12 H 2.183406 3.501011 4.334304 3.763129 3.805293 13 H 2.164756 2.788033 3.798946 3.081819 2.616172 14 Cl 1.814506 2.724749 2.881382 2.937548 3.691919 10 C 0.000000 H 1.085126 0.000000 H 1.072150 1.754879 0.000000 H 1.086241 1.764690 1.757418 0.000000 10 C 2.555115 2.788361 2.782867 3.500839 0.000000 169 11 12 13 14 H H H Cl 11 12 13 14 H H H Cl 3.500099 2.774635 2.803734 2.722621 11 0.000000 1.768053 1.765055 2.902395 3.789217 3.106124 2.598633 3.691692 12 3.769875 2.566044 3.143985 2.894748 13 4.334341 3.774135 3.794096 2.917412 14 1.085270 1.086934 1.086032 2.723517 0.000000 1.766249 0.000000 2.918052 3.693547 0.000000 Interatomic angles: C1-C2-H3=110.533 C1-C2-H4=110.5022 H3-C2-H4=108.6575 C1-C2-H5=109.1954 H3-C2-H5=109.1031 H4-C2-H5=108.815 C2-C1-C6=111.0397 C1-C6-H7=109.1137 C1-C6-H8=110.5481 H7-C6-H8=108.8712 C1-C6-H9=110.5246 H7-C6-H9=108.723 H8-C6-H9=109.0201 C2-C1-C10=111.0731 C6-C1-C10=111.0003 C1-C10-H11=110.5624 C1-C10-H12=110.5884 H11-C10-H12=108.9662 C1-C10-H13=109.1738 H11-C10-H13=108.7608 H12-C10-H13=108.7464 C2-C1-Cl14=107.9691 C6-C1-Cl14=107.7452 C10-C1-Cl14=107.8512 Symmetry turned off by external request Stoichiometry C4H9Cl Framework group C1[X(C4H9Cl)] Deg of freedom 36 Full point group C1 NOp Rotational constants (GHZ): 4.4408185 2.9841831 2.9831583 Standard basis: STO-3G* (5D, 7F) Integral buffers will be 262144 words long Raffenetti integral format Two-electron integral symmetry is turned off 43 basis functions, 120 primitive gaussians, 44 cartesian basis functions 25 alpha electrons 25 beta electrons nuclear repulsion energy 239.9103786468 Hartrees NAtoms= 14 NActive= 14 NUniq= 14 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 Big=F United Atom Topological Model (UA0 parameters set) Nord Group Hybr Charge Alpha Radius Bonded to C * 0.00 1.00 1.925 C2 [s] C6 [s] C10 [s] Cl14 [s] CH3 * 0.00 1.00 2.525 C1 [s] CH3 * 0.00 1.00 2.525 C1 [s] 10 CH3 * 0.00 1.00 2.525 C1 [s] 14 Cl * 0.00 1.00 1.973 C1 [s] Polarizable Continuum Model (PCM) ================================= Model : PCM Atomic radii : UA0 (Simple United Atom Topological Model) Polarization charges : Total charges Charge compensation : None Solution method : Matrix inversion Cavity : GePol (RMin=0.200 OFac=0.890) Default sphere list used, NSphG= Tesserae with average area of 0.200 Ang**2 1st derivatives : Analytical V*U(x)*V algorithm (CHGder, D1EAlg=0) Cavity 1st derivative terms included Solvent : Water, Eps= 78.390000 One-electron integrals computed using PRISM NBasis= 43 RedAO= T NBF= 43 NBsUse= 43 1.00D-06 NBFU= 43 Initial guess read from the read-write file: Harris functional with IExCor= 205 diagonalized for initial guess ExpMin= 1.69D-01 ExpMax= 6.01D+02 ExpMxC= 6.01D+02 IAcc=1 IRadAn= AccDes= 1.00D-06 HarFok: IExCor= 205 AccDes= 1.00D-06 IRadAn= IDoV=1 170 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06 Requested convergence on energy=1.00D-06 No special actions if energy rises Keep R1 integrals in memory in canonical form, NReq= 2089358 Error on total polarization charges = 0.00276 SCF Done: E(RHF) = -609.492276368 A.U after cycles Convg = 0.6937D-08 -V/T = 2.0157 S**2 = 0.0000 -Variational PCM results ======================= (a.u.) = -609.489010 (a.u.) = -609.492276 Total free energy in solution: with all non electrostatic terms (a.u.) = -609.479727 -(Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -2.05 -Cavitation energy (kcal/mol) = 17.55 Dispersion energy (kcal/mol) = -10.17 Repulsion energy (kcal/mol) = 0.50 Total non electrostatic (kcal/mol) = 7.88 -Partition over spheres: Sphere on Atom Surface Charge GEl GCav GDR C1 0.00 0.000 0.00 0.00 0.00 C2 39.96 -0.044 -0.20 4.87 -2.53 C6 39.96 -0.043 -0.19 4.87 -2.53 C10 39.96 -0.043 -0.20 4.87 -2.53 Cl14 18.95 0.087 -0.92 2.93 -2.08 Added spheres: 17.83 0.040 -0.54 0.00 0.00 -D1PCM: PCM CHGder 1st derivatives, ID1Alg=0 FixD1E=F DoIter=F I1PDM=0 Center Atomic Forces (Hartrees/Bohr) Number Number X Y Z 0.000697952 -0.000509181 -0.001421987 0.002155211 0.004139759 0.000688440 -0.001414969 -0.001121895 -0.000511932 0.000224556 -0.000735081 -0.000423028 -0.000993431 -0.002089681 0.001114695 6 0.000693717 0.000978714 0.012743793 -0.000613413 -0.001124325 0.000344095 0.000307773 0.000359880 -0.012503430 -0.000728662 0.000184763 -0.000255512 10 0.000094139 0.000064335 -0.001573563 11 -0.000007516 0.000178140 0.000123030 12 0.000129969 0.000060571 0.001310144 13 -0.000348127 -0.000532738 0.000172009 14 17 -0.000197199 0.000146738 0.000193247 Cartesian Forces: Max 0.012743793 RMS 0.002941945 -Internal Coordinate Forces (Hartree/Bohr or radian) Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J -1 C C 0.000868( 1) H -0.001505( 2) 0.000035( 14) H -0.000849( 3) -0.000276( 15) 0.001814( 26) H 0.002545( 4) 0.000603( 16) 0.000359( 27) C -0.000598( 5) -0.000267( 17) -0.001473( 28) H 0.001323( 6) 0.000176( 18) -0.000019( 29) H 0.012512( 7) -0.000122( 19) -0.000148( 30) H -0.000782( 8) -0.000254( 20) -0.000103( 31) 171 10 C 0.000093( 9) -0.000013( 21) -0.000539( 32) 11 H 10 0.000193( 10) -0.000199( 22) -0.000024( 33) 12 H 10 -0.001308( 11) -0.000279( 23) -0.000164( 34) 13 H 10 0.000658( 12) 0.000007( 24) -0.000069( 35) 14 Cl -0.000045( 13) -0.000647( 25) -0.000800( 36) -Internal Forces: Max 0.012512006 RMS 0.002232482 IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC-IRC 172 [...]... phẩm anken Ảnh hưởng của cấu trúc đến hoạt tính hóa học dẫn xuất halogen trong phản ứng thế SN1 Ảnh hưởng của gốc hiđrocacbon Cấu tạo gốc hiđrocacbon có ảnh hưởng quan trọng nhất đến cơ chế phản ứng thế nucleophin Bậc của gốc R trong RX càng cao, khả năng phản ứng SN1 càng tăng Dẫn xuất RX 30 20 10 CH3X SN1 tăng Entanpy phân li ion của R – X để hình thành cacbocation giảm khi chuyển từ dẫn xuất bậc nhất... tác nhân nucleophin càng khó tấn công để liên kết được với cacbon Vì vậy, ưu đãi về mặt cấu trúc không gian của các dẫn xuất halogen rất quan trọng trong phản ứng thế SN2 Sự phân nhánh ở Cα Phản ứng thế SN2 rất nhạy cảm với chướng ngại không gian xung quanh C trung tâm Do đó, sẽ dẫn đến sự ảnh hưởng của phân nhánh ở C – α đối với phản ứng Khi RX là dẫn xuất halogen (Ankyl Halogenua), phản ứng SN2 sẽ... tác nhân nucleophin vào ở cùng 1 vị trí cacbon Ảnh hưởng của cấu trúc đến hoạt tính hóa học của các dẫn xuất halogen trong phản ứng thế SN2 7 Ảnh hưởng của gốc hiđrocacbon Trong cơ chế SN2, tác nhân nucleophin tấn công vào cacbon no có nhóm halogen và đẩy Hal ra đi Ở trạng thái chuyển tiếp, nguyên tử cacbon liên kết với 5 nhóm nguyên tử Trạng thái đó không thuận lợi về mặt không gian Nếu như các nhóm... nhân nucleophin và sản phẩm Các phản ứng trong nghiên cứu được thực hiện trong dung môi nước và một số dung môi khác Vì vậy, để biết được hình dạng chính xác của phân tử, ion, trong dung 27 môi, ta cần thực hiện tối ưu hóa các cấu trúc Việc tối ưu hóa được thực hiện với từ khóa Opt với hệ hàm cơ sở 6-31G(d) Việc tính toán tối ưu hóa cấu trúc sẽ tạo ra cấu trúc tối ưu hóa chứa trong file dữ liệu xuất của. .. của phản ứng thế nucleophin Xác định trạng thái chuyển tiếp (TS) và đường phản ứng Khả năng tối ưu hóa có thể được dùng để xác định các cấu trúc chuyển tiếp cũng như cấu trúc của các trạng thái cơ bản vì cả hai tương ứng với các điểm dừng trên mặt thế năng Tuy nhiên, việc tìm trực tiếp một cấu trúc chuyển tiếp như mong muốn bằng việc dự đoán một cách hợp lý cấu hình của nó có thể là sự thách thức trong. .. 10-4 Khả năng phản ứng tƣơng đối của các halogenua[24] Ảnh hưởng của tác nhân nucleophin Phản ứng nucleophin lưỡng phân tử SN2 xảy ra với một giai đoạn qua trạng thái chuyển tiếp Tốc độ phản ứng phụ thuộc nồng độ của dẫn xuất halogen và tác nhân nucleophin Do đó, tác nhân nucleophin mạnh sẽ thuận lợi cho cơ chế SN2 Tính nucleophin là khả năng cho cặp electron tham gia vào liên kết Tác nhân nucleophin. .. dụ: Thủy phân CH3I trong nước – Phản ứng dung môi phân v CH3I H2O 5 CH3OH HI H H O H +H H H C I O H H C I - I- H + O C H H H H H H OH2 H H O C H + H3O+ H Phản ứng loại này thường gọi là phản ứng giả bậc nhất Hóa học lập thể Trong phản ứng SN2 của dẫn xuất halogen, khuynh hướng ra đi của Hal xảy ra cùng lúc với việc đến của tác nhân nucleophin Cacbon trung tâm lai hóa sp3, mỗi AO lai hóa sp3 có 2 đầu... xét các trung tâm phản ứng trên phân tử dẫn xuất halogen, ta cần tính toán mức năng lượng của các obitan phân tử Từ khóa Pop=Full trong Route Section yêu cầu Gaussian cho ra các dữ liệu về obitan phân tử tại file dữ liệu xuất Chúng xuất hiện tại phần đầu của mục “Population analysis” Sau khi tính toán với từ khóa Pop=Full, trong file dữ liệu xuất sẽ thu được các thông số về các obitan bị chiếm O và các. .. với các bazơ có trong hỗn hợp phản ứng Ở đây phản ứng xảy ra theo tính bazơ của nucleophin có trong dung dịch (Thái Doãn Tĩnh, 2001) Xét phản ứng giữa tert – butyl bromua và etanol 80% ở 250C: cacbocation có thể tương tác với các nucleophin trong dung dịch: C2H5OH, H2O Ngoài ra, còn có xu hướng xày ra phản ứng tách HX tạo anken (Thái Doãn Tĩnh, 2001) Ảnh hưởng của dung môi Phản ứng của SN1 có hình... càng cao - Nhóm ra đi có tính bazơ mạnh nhất sẽ là nhóm ra đi khó nhất - Ngược lại, nhóm ra đi có tính bazơ yếu sẽ là nhóm ra đi dễ Đối với các dẫn xuất halogen: - Các ankyl clorua, bromua, iodua đều dễ phản ứng SN2 - Dẫn xuất florua thực tế không tham gia phản ứng SN2 Nguyên nhân là do tính axit HF < HCl < HBr < HI nên tính bazơ I-< Br-< Cl-< F- làm khả năng phản ứng của các dẫn xuất giảm dần từ RI > ... ẢNH HƢỞNG CỦA CẤU TRÚC ĐẾN HOẠT TÍNH HÓA HỌC CÁC DẪN XUẤT HALOGEN TRONG PHẢN ỨNG THẾ NUCLEOPHIN 1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Khảo sát ảnh hưởng cấu trúc chất tác nhân nucleophin, dung môi đến hoạt. .. Do phản ứng SN1 kèm theo lượng sản phẩm anken Ảnh hưởng cấu trúc đến hoạt tính hóa học dẫn xuất halogen phản ứng SN1 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon Cấu tạo gốc hiđrocacbon có ảnh hưởng quan trọng đến. .. vào vị trí cacbon Ảnh hưởng cấu trúc đến hoạt tính hóa học dẫn xuất halogen phản ứng SN2 Ảnh hưởng gốc hiđrocacbon Trong chế SN2, tác nhân nucleophin công vào cacbon no có nhóm halogen đẩy Hal