Các týp gen caga, vaca và gen kháng levofloxacin của helicobacter pylori ở bệnh nhân viêm loét dạ dày tại bệnh viện chợ rẫy từ tháng 10 2015 đến 05 2016

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH .. PHẠM MINH TUẤN CÁC TÝP GEN CagA, VacA VÀ GEN KHÁNG LEVOFLOXACIN CỦA HELICOBACTER PYLORI Ở BỆNH NHÂN VIÊM LOÉT DẠ DÀY TẠI BỆNH VIỆN CHỢ RẪY TỪ THÁNG 10/2015 ĐẾN 05/2016 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - 2016 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH  PHẠM MINH TUẤN CÁC TÝP GEN CagA, VacA VÀ GEN KHÁNG LEVOFLOXACIN CỦA HELICOBACTER PYLORI Ở BỆNH NHÂN VIÊM LOÉT DẠ DÀY TẠI BỆNH VIỆN CHỢ RẪY TỪ THÁNG 10/2015 ĐẾN 05/2016 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC Chuyên ngành: VI SINH Y HỌC Mã số: 60 72 01 15 NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS.TS.BS CAO MINH NGA THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu kết luận văn trung thực chưa công bố nghiên cứu khác Tác giả luận văn Phạm Minh Tuấn LỜI CÁM ƠN Để hồn thành chương trình Cao học luận văn này, xin chân thành cảm ơn đến: Ban Giám hiệu, Phòng Sau Đại học Quý Thầy Cô Bộ môn Vi sinh Y học - Đại học Y Dược Tp HCM Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch Ban Giám đốc Trung tâm Đào tạo - Chỉ đạo tuyến bệnh viện Chợ Rẫy toàn thể bác sĩ đồng nghiệp, điều dưỡng nhân viên Khoa Nội soi Tiêu hóa Ban Giám đốc nhân viên Trung tâm Đào tạo Chẩn đoán Y Sinh học phân tử - Bệnh viện Đại học Y Dược Tp.HCM Đặc biệt, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến PGS TS BS Cao Minh Nga, người dành nhiều thời gian quý giá, tận tình giúp đỡ hướng dẫn tơi suốt q trình thực hồn thành luận văn Tôi xin cảm ơn bệnh nhân giúp đỡ tơi có số liệu nghiên cứu luận văn Tôi xin biết ơn đến người thân gia đình, tạo điều kiện tốt nhất, giúp đỡ động viên suốt trình học tập hồn thành luận văn Tp HCM, tháng năm 2016 Phạm Minh Tuấn DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT BV bệnh viện BV TƯQĐ 108 bệnh viện Trung ương Quân đội 108 CagA cytotoxin-associated gene A D91G (Asp91Gly) đột biến codon 91, aspartic acid chuyển thành glycine D91N (Asp91Asn) đột biến codon 91, aspartic acid chuyển thành asparagine D91Y (Asp91Tyr) đột biến codon 91, aspartic acid chuyển thành tyrosine DD dày DD-TT dày - tá tràng ĐHYD Đại học Y Dược N87K (Asn87Lys) đột biến codon 87, asparagine chuyển thành lysine NSAID non-steroidal anti-inflammatory drug (thuốc kháng viêm không steroid) PPI proton pump inhibitor (thuốc ức chế bơm proton) T87I (Thr87Ile) đột biến codon 87, threonine chuyển thành isoleucine Týp gen kiểu gen UTDD ung thư dày VacA vacuolating cytotoxin A YSHPT Trung tâm Đào tạo Chẩn đoán Y Sinh học phân tử ĐẶT VẤN ĐỀ Viêm loét dày bệnh phổ biến Việt Nam nước giới Bệnh tiến triển dai dẳng, gây ảnh hưởng lớn đến chất lượng sống, đồng thời tiềm ẩn nguy dẫn đến nhiều biến chứng đe dọa đến tính mạng người bệnh như: xuất huyết tiêu hóa, thủng dày, ung thư dày [10], [1], [41], [73] Bệnh nguyên viêm loét dày đa dạng Stress, thói quen sinh hoạt ăn uống, tiền sử dùng thuốc… chứng minh có liên quan đến bệnh Từ năm 1982, với phát John Robin Warren Barry James Marshall, với nhiều cơng trình nghiên cứu gần Helicobacter pylori tác động lớn đến quan điểm nguyên nhân, chế bệnh sinh phương thức điều trị bệnh viêm loét dày [10], [1], [76], [11], [24], [65] Ở vi khuẩn Helicobacter pylori, protein cagA vacA chứng minh hai yếu tố độc lực vi khuẩn Protein cagA gen cagA (cytotoxin-associated gene A) mã hóa protein VacA gen vacA (vacuolating cytotoxin A) mã hóa Các chủng Helicobacter pylori mang kiểu gene cagA vacA khác có tiềm gây bệnh khác Trong đó, chủng vi khuẩn mang tổ hợp gene cagA(+)vacAs1m1 nhiều nghiên cứu chứng minh có liên quan chặt chẽ với bệnh cảnh viêm loét dày nặng ung thư dày [11], [65], [3], [8], [18], [19] Việc điều trị tiệt trừ Helicobacter pylori gặp nhiều khó khăn vi khuẩn dần kháng lại với thuốc phác đồ truyền thống Phác đồ levofloxacin phối hợp với amoxicillin thuốc ức chế bơm proton khuyến cáo sử dụng trường hợp thất bại với phác đồ truyền thống Tuy nhiên, phác đồ trở nên hiệu Helicobacter pylori đề kháng với levofloxacin Trong vài năm gần đây, có nhiều báo cáo cho thấy vi khuẩn đề kháng lại kháng sinh với tỉ lệ cao [65], [45], [52], [59] [14], [36], [39], Có nhiều phương pháp chẩn đoán Helicobacter pylori đề xuất Tuy nhiên, đa số cho biết có diện vi khuẩn thể người bệnh, mà chưa thực cung cấp đầy đủ kiện để khẳng định chúng có thực tác nhân gây nên bệnh cảnh viêm loét dày bệnh nhân hay không [24], [11], [58] Việc ứng dụng kỹ thuật sinh học phân tử vào chẩn đoán giúp phát chủng Helicobacter pylori có tiềm gây bệnh viêm loét ung thư dày thông qua týp gen cagA vacA đặc trưng Helicobacter pylori, đồng thời giúp xác định kiểu gen kháng levofloxacin vi khuẩn thời gian ngắn, với độ nhạy độ đặc hiệu cao, giúp ích nhiều cho công tác chữa lành bệnh viêm loét dày phòng ngừa biến chứng [19], [8], [3], [77], [52] Bệnh viện Chợ Rẫy bệnh viện thuộc tuyến cuối tỉnh phía Nam, bệnh nhân đến khám bệnh khoa Tiêu hóa bệnh viện đa số xa, mang bệnh lâu điều trị bệnh nhiều nơi không hiệu quả, nên tâm lý căng thẳng lo lắng Để nhanh chóng tìm chẩn đốn phù hợp, lập kế hoạch tư vấn điều trị cho bệnh nhân, tập thể y bác sĩ phải thường xuyên cập nhật nhiều thông tin dịch tễ lâm sàng bệnh viêm loét dày, tỉ lệ phân bố chủng vi khuẩn Helicobacter pylori có độc lực cao vấn đề kháng thuốc kháng sinh vi khuẩn Nghiên cứu xác định Các týp gen cagA, vacA gen kháng levofloxacin Helicobacter pylori bệnh nhân viêm loét dày bệnh viện Chợ Rẫy từ tháng 10/2015 đến 5/2016 thực với mong muốn góp phần làm sáng tỏ số vấn đề tỉ lệ phân bố chủng Helicobacter pylori mang tổ hợp gen có độc lực cao, tình trạng kháng thuốc levofloxacin (kháng sinh chủ lực phác đồ cứu vãn nay) vi khuẩn mối liên hệ với yếu tố tuổi, giới tính, vùng dịch tễ, chẩn đốn lâm sàng hình ảnh nội soi dày bệnh nhân MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Mục tiêu tổng quát: Xác định tỉ lệ phân bố týp gen cagA, vacA gen kháng levofloxacin Helicobacter pylori bệnh nhân bị viêm loét dày đến khám bệnh viện Chợ Rẫy thời gian từ tháng 10/2015 - 05/2016 Mục tiêu chuyên biệt: Xác định tỉ lệ phân bố týp gen cagA, vacA đột biến gen kháng levofloxacin Helicobacter pylori mẫu sinh thiết dày có thử nghiệm urease dương tính bệnh nhân bị viêm loét dày Khảo sát mối liên quan nhóm tuổi, giới tính, vùng dịch tễ, chẩn đốn lâm sàng hình ảnh nội soi người bệnh với tỉ lệ phân bố tổ hợp gen cagA(+/-)vacAs1/s2m1/m2 Khảo sát mối liên quan nhóm tuổi, giới tính vùng dịch tễ người bệnh với khả xuất kiểu đột biến gen kháng levofloxacin (đột biến điểm vùng xác định tính kháng với quinolone gen gyrA) chủng Helicobacter pylori mang tổ hợp gen cagA(+)vacAs1m1 CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ - LÂM SÀNG CỦA VIÊM LOÉT DẠ DÀY 1.1.1 Định nghĩa Viêm dày (gastritis) thuật ngữ dùng để tất tổn thương viêm niêm mạc dày, thể đáp ứng niêm mạc dày với yếu tố công [45] Loét dày (gastric ulcer) hệ cuối trình viêm cân yếu tố công yếu tố bảo vệ niêm mạc dày Loét dày chẩn đoán tổn thương niêm mạc ≥ mm với độ sâu đáng kể phát qua nội soi hay có chứng mô học cho thấy tổn thương lan đến lớp niêm mạc [30], [73], [45] 1.1.2 Đặc điểm dịch tễ - lâm sàng Viêm loét dày bệnh lý nhóm bệnh viêm loét đường tiêu hóa Bệnh gặp quốc gia hầu hết lứa tuổi, chiếm khoảng 35% bệnh lý đường tiêu hóa [10] Biểu bệnh đa dạng, khoảng 50% bệnh nhân có triệu chứng điển hình, 40 - 45% có triện chứng mơ hồ - 10% hồn tồn khơng có triệu chứng Nếu không phát chữa trị hợp lý, bệnh đưa đến nhiều biến chứng nguy hiểm xuất huyết tiêu hóa (15 - 20%), thủng dày (5 - 10%), hẹp môn vị (5 - 10%) thối hóa đưa đến ung thư dày, trường hợp viêm loét dày có Helicobacter pylori [10], [1], [73], [41], [72] 1.1.3 Chỉ định nội soi dày Nội soi dày giới thiệu từ năm 1881 tác giả Johann von Mikulicz cộng Nhưng thực phải đến năm 1958, đời nguồn sáng lạnh, kỹ thuật ghi hình đại với ống nội soi mềm có tích hợp kênh hút rửa, sinh thiết , định nội soi dần trở nên quen thuộc thiếu chẩn đoán điều trị nhiều bệnh lý đường tiêu hóa nói chung dày nói riêng [55] Nội soi dày phần nội soi đường tiêu hóa trên, thường định trường hợp nghi ngờ bệnh thực quản, dày tá tràng, nghi ngờ có xuất huyết tiêu hóa trên, có dị vật thực quản, dày Trong q trình nội soi, kết hợp sinh thiết mô để tiến hành thêm xét nghiệm bổ sung cho chẩn đốn, cầm máu có xuất huyết tiêu hóa, cắt polyp, lấy dị vật cần thiết Ngồi ra, nội soi tiêu hóa cịn giúp theo dõi xử lý trường hợp dãn tĩnh mạch thực quản bệnh nhân xơ gan, truy tìm ngun nhân người lớn tuổi sụt cân khơng rõ nguyên nhân Cũng kỹ thuật xâm nhập khác, trước định nội soi tiêu hóa trên, bệnh nhân cần phải bác sĩ thăm khám cẩn thận để đảm bảo bệnh nhân không nằm nhóm chống định nội soi Các chống định nội soi tiêu hóa thường gặp là: bệnh nhân rối loạn tâm thần, bệnh nhân không hợp tác, bệnh nhân bị hôn mê, động kinh, nhồi máu tim, nghi ngờ thủng dày hay tá tràng, bệnh nhân mổ dày, tá tràng hay tụy khoảng tuần, hay bệnh nhân mổ vùng hầu họng (nguy chảy máu) đặc biệt trường hợp bệnh nhân không đồng ý nội soi [55], [66], [65] 1.1.4 Phân loại theo hình ảnh tổn thương đại thể qua nội soi Có nhiều cách phân loại, cách phân loại Hội nghị tiêu hóa Thế giới năm 1990 Sydney - Australia có bổ sung năm 1994, nhiều tác giả cơng nhận sử dụng [55], [66], [65] Theo cách phân loại này, hình ảnh tổn thương viêm dày nội soi chia thành dạng: - Viêm dày xung huyết (phù nề, ban đỏ giả mạc): niêm mạc nhẵn bóng, nhạt màu, có vùng phù nề xung huyết - Viêm dày trợt phẳng (viêm sướt phẳng): niêm mạc có vết trợt nhỏ, có giả mạc bám rìa có viền đỏ bao quanh không bao quanh, trợt nông chạy dài nếp niêm mạc thân vị Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 10 Trần Kiều Miên (2012), Viêm loét dày - tá tràng: nguyên nhân, điều trị phịng ngừa, Bệnh tiêu hóa gan mật - trĩ, Nguyễn Đình Hối, ed, Nhà xuất Y học, tr 17-28 11 Cao Minh Nga (2014), Vi khuẩn Helicobacter pylori, Vi khuẩn Y học, Cao Minh Nga cộng sự., ed, Bộ môn Vi sinh - Đại học Y dược Tp.HCM, Tp.HCM, Việt Nam, tr 181-186 12 Lê Quang Nghĩa (2012), Điều trị loét dày - tá tràng Helicobacter pylori., Hội Y học Tp.HCM, truy cập ngày 20 - 02 - 2016, trang web http://hoiyhoctphcm.org.vn/Data/picture/file/tintuc/HoithaoGialai2012/Dieutriloetdadaytatrang.pdf 13 Lê Đình Minh Nhân Võ Thị Chi Mai (2006), "Tính Đề Kháng Kháng Sinh Của Helicobacter pylori Trong Bệnh Viêm Loét Dạ Dày tá Tràng", Y học Thành phố Hồ Chí Minh 10, tr 73-75 14 Hồng Trọng Thảng Bùi Quang Di (2015), Cập nhật điều trị Helicobacter pylori - Bộ môn Nội, Trường Đại học Y Huế., truy cập ngày 18/11/2015, trang web http://bomonnoiydhue.edu.vn/upload/file/dieutrihp.pdf 15 Lê Trung Thọ, Trần Văn Hợp Phạm Bình Nguyên (2007), "Nghiên Cứu Mô Bệnh Học Và Tỷ Lệ Nhiễm Helicobacter pylori Ở Bệnh Nhân Viêm Dạ Dày Mạn Tính", Y học Thành phố Hồ Chí Minh 11, tr 68-74 16 Trần Thiện Trung cộng (2014), "Nghiên Cứu Bước Đầu Các Đột Biến Kháng Thuốc Clarithromycin Và Levofloxacin Của Vi Khuẩn Helicobacter pylori Bằng Giải Trình Tự Gen", Tạp Chí Khoa Học Tiêu Hóa Việt Nam 9, tr 2367-2375 17 Trần Thiện Trung cộng (2013), "Giá trị chẩn đoán Helicobacter pylori phương pháp multiplex PCR so với Clotest huyết thanh", Y học Thành phố Hồ Chí Minh 17(4), tr 4-10 18 Trần Thiện Trung cộng (2013), "Kết nghiên cứu gen cagA gen vacA H pylori bệnh nhân viêm dày phương pháp multiplex PCR", Y học Thành phố Hồ Chí Minh 17(4), tr 11-17 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 19 Trần Thiện Trung cộng (2011), "Phân tích týp gen cagA vagA Helicobacter pylori ung thư dày", Y học Tp.HCM 15(1), tr 43-51 20 Trần Thiện Trung cộng (2009), "Hiệu phác đồ EAL EBMT tiệt trừ Helicobacter pylori sau điều trị thất bại lần đầu.", Y học Thành phố Hồ Chí Minh 13(1), tr 21 Bùi Hữu Hồng (2009), "Cập nhật thơng tin Helicobacter pylori", Y học Thành phố Hồ Chí Minh 13(1), tr 1-4 Tiếng Anh: 22 Angelo Zullo cộng (2014), "First-and second-line H pylori eradication with modified sequential therapy and modified levofloxacinamoxicillin-based triple therapy", Annals of Gastroenterology 27(4), tr 23 Ragnar K Breckan cộng (2016), "The All-Age Prevalence of Helicobacter pylori Infection and Potential Transmission Routes A Population-Based Study", Helicobacter 2016, tr 1-10 24 Geo F Brooks cộng (2013), Helicobacter pylori, Jawetz, Melnick & Adelberg's Medical Microbiology., Geo F Brooks cộng sự., ed, Vol 26th Edition 25 Fusun Can cộng (2008), "Urease activity and urea gene sequencing of coccoid forms of H pylori induced by different factors", Current Microbiology 56(2), tr 150-155 26 John J Carothers cộng (2007), "The Relationship between Previous Fluoroquinolone Use and Levofloxacin Resistance in Helicobacter pylori Infection", Clinical Infectious Diseases 44, tr 27 Laura Lúcia Cogo cộng (2011), "Characterization of virulence genes cagA and vacA in H pylori and their prevalence in gastrointestinal disorders", Brazilian Journal of Microbiology, tr 1289-1295 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 28 Maria Celeste C Cortes cộng (2010), "Diversity of the cagA gene of Helicobacter pylori strains from patients with gastroduodenal diseases in the Philippines", FEMS Immunol Med Microbiol 60, tr 90-97 29 Débora Menezes da Costa, Eliane dos Santos Pereira Silvia Helena Barem Rabenhorst (2015), "What exists beyond cagA and vacA? Helicobacter pylori genes in gastric diseases", World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology 21(37), tr 10563-10572 30 Francis K.L Chan James Y.W Lau (2016), Peptic Ulcer Disease, 10th, Sleisenger and Fordtran's Gastrointestinal and Liver Disease 10th edition, Lawrence S Friedman Mark Feldman, and Lawrence J Brandt, ed, Elsevier Saunders, tr 884-900 31 William D Chey Benjamin C.Y Wong (2007), "American College of Gastroenterology Guideline on the Management of Helicobacter pylori Infection", American Journal of Gastroenterology, tr 1808-1825 32 Norma Urtiz Estrada cộng (2013), "Prevalence of Helicobacter pylori cagA and vacA genotypes in a population from Northeastern Mexico with chronic gastritis and intestinal metaplasia", Academic Journals 7(15), tr 1409-1414 33 Leonardo H Eusebi, Rocco M Zagari Franco Bazzoli (2014), "Epidemiology of Helicobacter pylori Infection", Gastroenterology and Endoscopy - University of Bologna 19(Suppl 1), tr 1-5 34 James G Fox Francis Megraud (2007), Helicobacter, 9th, Manual of Clinical Microbiology, Patrik R Murray, ed, Vol 1, ASM Press American Society for Microbiology, Washington, tr 947-962 35 Vincenzo De Francesco cộng (2010), "Worldwide H pylori Antibiotic Resistance: a Systematic Review", J Gastrointestin Liver Dis 19(4), tr 409-414 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 36 Vincenzo De Francesco cộng (2011), "Mechanisms of Helicobacter pylori antibiotic resistance: An updated appraisal", World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology, tr 35-41 37 Robert W Frenck cộng (2006), "Sensitivity and Specificity of Various Tests for the Diagnosis of Helicobacter pylori in Egyptian Children", Pediatrics 118(4), tr 1195-1202 38 Magali Garcia cộng (2012), "Distribution of Spontaneous gyrA Mutations in 97 Fluoroquinolone Resistant H pylori Isolates Collected in France", Antimicrobial Agents and Chemotherapy 56(1), tr 550-551 39 J P Gisbert F De La Morena (2006), "Systematic review and metaanalysis: levofloxacin-based rescue regimens after Helicobacter pylori treatment failure", Alimentary Pharmacology & Therapeutics, tr 35-44 40 Ikuya Miki Hideyuki Miyachi, and et al (2006), "Primary Levofloxacin Resistance and gyrA/B Mutations Among Helicobacter pylori in Japan", Blackwell Publishing Ltd, Helicobacter 11, tr 243-249 41 Del Valle J (2013), Peptic Ulcer and Related Disorders 18th, Harrison's manual of medicine 18th Edition, Dan L Longo cộng sự., ed, Vol 18th Edition, The McGrow-Hill Companies, tr 1005-1011 42 Sushil Kumar, Ashok Kumar Vinod Kumar Dixit (2008), "Direct detection and analysis of vacA genotypes and cagA gene of Helicobacter pylori from gastric biopsies by a novel multiplex polymerase chain reaction assay", Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 62, tr 366-373 43 Chao Hung Kuo cộng (2014), "Helicobacter pylori and Systemic Disease", Gastroenterology Research and Practice 2014, tr 1-3 44 Jung W Lee cộng (2011), "Mutations of Helicobacter pylori Associated with Fluoroquinolone Resistance in Korea", Blackwell Publishing Ltd 16, tr 301-310 45 Mark Feldman and Edward L Lee (2016), gastritis, 10th, Sleisenger and Fordtran's gastrointestinal and liver disease 10th edition, Lawrence S Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Friedman Mark Feldman, and Lawrence J Brandt, ed, Elsevier Saunders, tr 868-883 46 S Maeda cộng (2015), "Major virulence factors, VacA and CagA, are commonly positive in Helicobacter pylori isolates in Japan", Gut 42, tr 338-343 47 Mahsa Molaei cộng (2010), "CagA status and VacA subtypes of H pylori in relation to histopathologic findings in Iranian population", Indian Journal of Pathology and Microbiology 53(1), tr 24-27 48 P Malfertheiner cộng (2007), "Current concepts in the management of Helicobacter pylori infection: the Maastricht III Consensus Report", Gut, tr 772-781 49 P Malfertheiner cộng (2007), "Current concepts in the management of Helicobacter pylori infection: the Maastricht III Consensus Report", Gut 56, tr 772-781 50 Peter Malfertheiner cộng (2012), "Management of Helicobacter pylori infectiond - the Maastricht IV/ Florence Consensus Report", Gut 61, tr 646-664 51 Juntaro Matsuzaki cộng (2010), "Homology model of the DNA gyrase enzyme of Helicobacter pylori, a target of quinolone-based eradication therapy", Journal of Gastroenterology and Hepatology 25(Supplement s1), tr S7-S10 52 Hideyuki Miyachi cộng (2006), "Primary Levofloxacin Resistance and gyrA/B Mutations Among Helicobacter pylori in Japan", Journal compilation, tr 243-249 53 Douglas R Morgan Shella E Crowe (2016), Helicobacter pylori Infection, 10th, Sleisenger and Fordtran's gastrointestinal and liver disease 10th edition, Lawrence S Friedman Mark Feldman, and Lawrence J Brandt, ed, Elsevier Saunders, tr 856-867 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 54 Toshihiro Nishizawa Hidekazu Suzuki (2014), "Mechanisms of Helicobacter pylori antibiotic resistance and molecular testing", Frontiers in molecular biosciences 1, tr 1-7 55 H Niwa cộng (2008), New Challenges in Gastrointestinal Endoscopy, Springer, Japan, 3-66, tr 163-242 56 Tung L Nguyen cộng (2010), "Helicobacter pylori infection and gastroduodenal diseases in Vietnam: A cross-sectional, hospital-based study.", BMC Gastroenterology 114(10), tr 1-7 57 Laura Llorca Otero Guillermo I Perez Perez (2014), "Helicobacter pylori: the balance between a role as colonizer and pathogen", Best Practice & Research Clinical Gastroenterology 28, tr 1017-1029 58 Laura Llorca Otero, Victoria E Ruiz Guillermo I Perez Perez (2014), Helicobacter pylori: The balance between a role as colonizer and pathogen., Best Practice and Research in Clinical Gastroenterology 59 Vasilios Papastergiou, Sotirios D Georgopoulos Stylianos Karatapanis (2014), "Treatment of Helicobacter pylori infection: Past, present and future", World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology, tr 392-399 60 Ines Pinto-Ribeiro cộng (2016), "Helicobacter pylori vacA Genotypes in Chronic Gastritis and Gastric Carcinoma Patients from Macau, China", Toxins 2016 8(142), tr 1-10 61 Trung Nam Phan cộng (2014), "High rate of levofloxacin resistance in a background of clarithromycin and metronidazole resistant Helicobacter pylori in Vietnam", International Journal of Antimicrobial Agents 45, tr 244-248 62 Trung Nam Phan cộng (2015), "Antimicrobial resistance in Helicobacter pylori: current situation and management strategy in Vietnam ", J Infect Dev Ctries 2015 9(6), tr 609-613 63 Emiko Rimbara cộng (2012), "Fluoroquinolone Resistance in Helicobacter pylori: Role of Mutations at Position 87 and 91 of GyrA on Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM the Level of Resistance and Identification of a Resistance Conferring Mutation in GyrB", Helicobacter 17(1), tr 36-42 64 Yasunori Sawayama cộng (2008), "Chronic Helicobacter pylori infection is associated with peripheral arterial disease", Journal of Infection and Chemotherapy 14(3), tr 250-254 65 Yoshie Senda cộng (2016), CagA - Helicobacter pylori VacA Exhibits Pleiotropic Actions in Host Cells - Endoscopic Findings of H pylori Infection, Helicobacter pylori, Hidekazu Suzuki, Robin Warren Barry Marshall, ed, Springer Japan 2016, 33-72; 157-168 66 Louis Michel Wong Kee Song Mark Topazian (2015), Gastrointestinal Endoscopy, Harrisons Principles of Internal Medicine 19th Edition, stephen L Hauser dennis L Kasper, J Larry Jameson, Anthony s fauci, dan L Longo, and Joseph Loscalzo, ed, McGraw-Hill, tr 1880-1900 67 Hidekazu Suzuki, Toshihiro Nishizawa Toshifumi Hibi (2010), "Helicobacter pylori eradication therapy", Future Microbiol 5(4), tr 639648 68 Tran Thi Huyen Trang cộng (2015), "The Prevalence of Helicobacter pylori Virulence Factors in Bhutan, Vietnam, and Myanmar Is Related to Gastric Cancer Incidence", BioMed Research International 2015, tr 1-8 69 Alba A Trespalacios-Rangél cộng (2016), "Surveillance of Levofloxacin Resistance in Helicobacter pylori Isolates in BogotáColombia (2009-2014)", PLoS ONE 11(7), tr 1-10 70 Hasan Umit cộng (2009), "The Relationship Between Virulence Factors of Helicobacter pylori and Severity of Gastritis in Infected Patients", Dig Dis Sci 54, tr 103-110 71 Jamshid Vafaeimanesh cộng (2014), "Association of Helicobacter pylori Infection with Coronary Artery Disease: Is H pylori a Risk Factor?", The Scientific World Journal 2014, tr 1-6 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM 72 Ratha-Korn Vilaichone, Varocha Mahachai David Y Graham (2006), "Helicobacter pylori Diagnosis and Management", Gastroenterology Clinics North America 35, tr 229-247 73 Wadie I Najm (2011), "Peptic Ulcer Disease", Primary Care: Clinics in Office Practice - Gastroenterology 38(3), tr 383-394 74 Yunsheng Yang WenmingWu, and Gang Sun (2012), "Recent Insights into Antibiotic Resistance in Helicobacter pylori Eradication", Gastroenterology Research and Practice 2012, tr 75 Mohammad Yawar Yakoob Akbar Shah Hussainy (2010), "Chronic Gastritis and Helicobacter pylori: A Histopathological Study of Gastric Mucosal Biopsies", Journal of the College of Physicians and Surgeons Pakistan 20(11), tr 773-775 76 Juan Carlos Zapata-Colindres cộng (2006), "The association of Helicobacter pylori infection and nonsteroidal anti-inflammatory drugs in peptic ulcer disease", Can J Gastroenterol 20(4), tr 277-280 77 Yan Zhang cộng (2012), "H pylori Infection and Colorectal Cancer Risk: Evidence From a Large Population-based Case-Control Study in Germany", American Journal of Epidemiology 175(5), tr 441-450 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM PHỤ LỤC Quyết định công nhận người hướng dẫn tên đề tài Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Giấy chấp thuận Hội đồng Đạo đức nghiên cứu Y Sinh học Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Giấy chấp thuận Trung tâm Đào tạo - Chỉ đạo tuyến, bệnh viện Chợ Rẫy Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Mẫu thông tin dành cho đối tượng nghiên cứu chấp thuận tham gia nghiên cứu Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Một số hình ảnh khoa Nội soi - bệnh viện Chợ Rẫy Bên bên khoa Nội soi - bệnh viện Chợ Rẫy Nội soi sinh thiết dày Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Nghiên cứu viên tư vấn cho bệnh nhân Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Kết nội soi sinh thiết dày với urease N.S test dương tính Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM Hình ảnh đọc kết điện di sản phẩm multiplex PCR để xác định týp gen cagA vacA đèn cực tím Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn ... vi khuẩn Nghiên cứu xác định ? ?Các týp gen cagA, vacA gen kháng levofloxacin Helicobacter pylori bệnh nhân viêm loét dày bệnh viện Chợ Rẫy từ tháng 10/ 2015 đến 5 /2016? ?? thực với mong muốn góp phần... DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH  PHẠM MINH TUẤN CÁC TÝP GEN CagA, VacA VÀ GEN KHÁNG LEVOFLOXACIN CỦA HELICOBACTER PYLORI Ở BỆNH NHÂN VIÊM LOÉT DẠ. .. bệnh nhân 3 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Mục tiêu tổng quát: Xác định tỉ lệ phân bố týp gen cagA, vacA gen kháng levofloxacin Helicobacter pylori bệnh nhân bị viêm loét dày đến khám bệnh viện Chợ Rẫy