BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - Phạm Ngọc Sơn NGHIÊN CỨU TÍNH ĐA HÌNH VÀ TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 27 LOCUS STR TRÊN NHIỄM SẮC THỂ THƯỜNG BẰNG BỘ KIT FORENSEQ ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN HÌNH SỰ TẠI VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SĨ: SINH HỌC THỰC NGHIỆM Hà Nội - 2020 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ Phạm Ngọc Sơn NGHIÊN CỨU TÍNH ĐA HÌNH VÀ TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 27 LOCUS STR TRÊN NHIỄM SẮC THỂ THƯỜNG BẰNG BỘ KIT FORENSEQ ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN HÌNH SỰ TẠI VIỆT NAM Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 8420114 LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC THỰC NGHIỆM NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC Hướng dẫn 1: PGS TS Phí Quyết Tiến Hướng dẫn 2: PGS TS Nguyễn Văn Hà Hà Nội - 2020 i Lời cam đoan Tôi xin cam đoan nội dung viết luận văn tìm tịi, học hỏi thân với hướng dẫn tận tình PGS TS Phí Quyết Tiến, PGS TS Nguyễn Văn Hà đồng nghiệp Trung tâm Giám định sinh học, Viện Khoa học hình Viện Cơng nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam Mọi kết nghiên cứu ý tưởng tác giả khác, có trích dẫn cụ thể Đề tài luận văn chưa bảo vệ hội đồng bảo vệ luận văn thạc sĩ chưa công bố phương tiện Tôi xin chịu trách nhiệm lời cam đoan Hà Nội, ngày tháng năm 2020 Người cam đoan Phạm Ngọc Sơn ii Lời cảm ơn Để hồn thành Luận văn cao học này, tơi xin bày tỏ lời cảm ơn sâu sắc tới PGS TS Phí Quyết Tiến PGS TS Nguyễn Văn Hà trực tiếp định hướng, tận tình hướng dẫn tơi Tôi xin cảm ơn tập thể lãnh đạo Viện Khoa học hình sự, lãnh đạo cán Phịng Tham mưu Trung tâm giám định Sinh học - Viện Khoa học hình tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình học tập làm nghiên cứu đề tài Tôi xin trân trọng gửi lời cảm ơn tới ban lãnh đạo thầy cô giáo Khoa Công nghệ sinh học, Học viện Khoa học Công nghệ, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam truyền đạt kiến thức giúp đỡ tơi suốt q trình học tập thực luận văn Cuối tơi xin bày tỏ lịng biết ơn đến gia đình, người thân, bạn bè đồng nghiệp - người động viên, tạo điều kiện cho tơi hồn thành khóa học này./ Học viên Phạm Ngọc Sơn iii Danh mục ký hiệu chữ viết tắt Chữ viết tắt Nội dung ADN Axít deoxyribonucleic bp Base pair (cặp bazơ) CE Capillary Electrophoresis (Điện di mao dẫn) FSA ForenSeqTM DNA Signature Prep - Mix A (tên kít phân tích ADN hãng Illumina) FTA Tên riêng loại giấy thu mẫu máu (dạng thẻ) ID IdentifilerTM (tên kít phân tích ADN hãng Thermo Fisher) NST Nhiễm sắc thể PCR Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi polymerase) SNP Single Nucleotide Polymorphism (Đa hình đơn nucleotit) STR Short Tandem Repeat (Các trình tự lặp ngắn) VNTR Variable Number of Tandem Repeat (Các trình tự lặp trung bình) iv Danh mục bảng Bảng 1.1: Tần suất tối thiểu alen thay đổi tương ứng với số lượng mẫu khảo sát 11 Bảng 1.2: Các locus STR nhiễm sắc thể thường có kit ForenSeq DNA Signature Prep - Mix A [25] 14 Bảng 3.1 Kết định lượng ADN phương pháp Realtime PCR 35 Bảng 3.2 So sánh tần suất alen (%) locus D8S1179 43 Bảng 3.3 So sánh tần suất alen (%) locus D21S11 44 Bảng 3.4 So sánh tần suất alen (%) locus D7S820 45 Bảng 3.5 So sánh tần suất alen (%) locus CSF1PO 45 Bảng 3.6 So sánh tần suất alen (%) locus D3S1358 46 Bảng 3.7 So sánh tần suất alen (%) locus TH01 47 Bảng 3.8 So sánh tần suất alen (%) locus D13S317 47 Bảng 3.9 So sánh tần suất alen (%) locus D16S539 48 Bảng 3.10 So sánh tần suất alen (%) locus D2S1338 49 Bảng 3.11 So sánh tần suất alen (%) locus D19S433 50 Bảng 3.12 So sánh tần suất alen (%) locus vWA 50 Bảng 3.13 So sánh tần suất alen (%) locus TPOX 51 Bảng 3.14 So sánh tần suất alen (%) locus D18S51 52 Bảng 3.15 So sánh tần suất alen (%) locus D5S818 53 Bảng 3.16 So sánh tần suất alen (%) locus FGA 54 Bảng 3.17 So sánh tần suất alen (%) locus D1S1656 56 Bảng 3.18 So sánh tần suất alen (%) locus D2S411 57 Bảng 3.19 So sánh tần suất alen (%) locus D4S2408 57 Bảng 3.20 So sánh tần suất alen (%) locus D6S1043 58 v Bảng 3.21 So sánh tần suất alen (%) locus D9S1122 59 Bảng 3.22 So sánh tần suất alen (%) locus D10S1248 59 Bảng 3.23 So sánh tần suất alen (%) locus D12S391 60 Bảng 3.24 So sánh tần suất alen (%) locus PentaE 61 Bảng 3.25 So sánh tần suất alen (%) locus D17S1301 62 Bảng 3.26 So sánh tần suất alen (%) locus D20S482 63 Bảng 3.27 So sánh tần suất alen (%) locus PentaD 64 Bảng 3.28 So sánh tần suất alen (%) locus D22S1045 65 Bảng 3.29 Tổng hợp so sánh số đánh giá bảng tần suất 71 vi Danh mục hình ảnh Hình 1.1 Vị trí số locus nhiễm sắc thể sử dụng giám định ADN số kít phổ biến Hình 1.2 Hình ảnh máy điện di mao quản ABI 3130xl 16 Hình 1.3 Quy trình giải trình tự hệ Illumina 17 Hình 1.4 Hình ảnh máy giải trình tự hệ MiSeq FGxTM 24 Hình 2.1 Sơ đồ nghiên cứu 26 Hình 2.2 Thẻ FTA dùng để thu mẫu máu 27 Hình 2.3 Danh ghi thơng tin cá nhân 28 Hình 2.4 Hình ảnh mơ tả q trình chuẩn bị thư viện mẫu 31 Hình 3.1 Mẫu máu thu vào giấy FTA thông tin cá nhân 36 Hình 3.2 Hình ảnh báo cáo kết phân tích mẫu đối chứng dương 37 Hình 3.3 Hình ảnh báo cáo kết phân tích mẫu M001 38 Hình 3.4 Hình ảnh báo cáo chi tiết kiểu gen mẫu đối chứng dương 39 Hình 3.5 Hình ảnh báo cáo chi tiết kiểu gen mẫu M001 40 Hình 3.6 Biểu đồ so sánh số PD 66 Hình 3.7 Biểu đồ so sánh số PE 67 Hình 3.8 Biểu đồ so sánh số PI 68 Hình 3.9 Biểu đồ so sánh số PIC 69 vii MỤC LỤC Trang Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Danh mục ký hiệu chữ viết tắt iii Danh mục bảng iv Danh mục hình ảnh vi MỞ ĐẦU CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 KHÁI NIỆM VỀ CÁC LOCUS TRÌNH TỰ LẶP LẠI NGẮN (SORT TANDEM REPEAT - STR) 1.1.1 Khái niệm 1.1.2 Danh pháp quốc tế locus STR 1.2 CƠ SỞ DỮ LIỆU TẦN SUẤT CÁC ALEN 1.2.1 Khái niệm sở liệu tần suất alen 1.2.2 Tần suất alen 1.2.2.1 Alen có tần suất thấp 1.2.2.2 Alen có tần suất cao - Alen phổ biến 1.2.3 Ý nghĩa sở liệu tần suất alen 1.2.4 Cơ sở khoa học để xác định số lượng cá thể khảo sát 11 1.3 KHÁI QUÁT VỀ BỘ KÍT FORENSEQ DNA SIGNATURE PREP MIX A 12 1.3.1 Bộ kít ForenSeqTM DNA Signature Prep 12 1.3.2 Các locus STR nhiễm sắc thể thường kít ForenSeqTM DNA Signature Prep-Mix A 13 viii 1.4 CƠNG NGHỆ GIẢI TRÌNH TỰ ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN15 1.4.1 Công nghệ điện di mao quản (Capillary electrophoresis - CE) 15 1.4.2 Hệ thống giải trình tự hệ MiSeq FGxTM hãng Illumina Hoa Kỳ 16 1.5 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU VỀ TẦN SUẤT ALEN CÁC LOCUS STR TRÊN THẾ GIỚI VÀ TRONG NƯỚC 19 1.5.1 Tình hình nghiên cứu giới 19 1.5.2 Tình hình nghiên cứu nước 22 CHƯƠNG VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 2.1 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 25 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 25 2.1.2 Hóa chất, thiết bị dụng cụ nghiên cứu 25 2.1.2.1 Hóa chất 25 2.1.2.2 Máy móc, thiết bị dụng cụ 25 2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 2.2.1 Phương pháp thu thập mẫu máu 27 2.2.2 Phương pháp tách chiết ADN 28 2.2.3 Tinh ADN 29 2.2.4 Định lượng ADN 29 2.2.5 Chuẩn bị thư viện mẫu giải trình tự ADN 30 2.2.6 Các phương pháp thu thập xử lý số liệu thống kê 31 2.2.6.1 Xác định tính tần suất alen 32 2.2.6.2 Phương pháp kiểm định giả thiết Khi bình phương ( χ2) 32 Ký AMEL hiệu M091 X,X M092 X,X M093 X,X M094 X,X M095 X,Y M096 X,X M097 X,Y M098 X,Y M099 X,X M100 X,Y M101 X,X M102 X,Y M103 X,Y M104 X,Y M105 X,Y M106 X,Y M107 X,Y M108 X,Y M109 X,Y M110 X,Y M111 X,Y M112 X,Y M113 X,Y M114 X,Y M115 X,Y M116 X,X M117 X,X M118 X,Y M119 X,X M120 X,Y M121 X,Y M122 X,X D8 S1179 13,14 14,15 12,16 10,16 11,13 14,14 11,13 10,14 13,14 11,13 13,14 10,15 10,13 12,12 10,13 15,16 10,13 10,10 12,12 13,16 12,15 12,15 10,12 12,15 10,11 11,12 10,18 10,14 11,14 12,13 8,12 14,16 D21 S11 30,31.2 32.2,33.2 31,31.2 29,31 29,33.2 31,31 29,33.2 30,31.2 31.2,31.2 29,33.2 29,33.2 29,30 30,30 30,31 29,32.2 29,30 28,29 29,32.2 29,32.2 29,31.2 31,33.2 29,31.2 31.2,31.2 29,32.2 29,32.2 31.2,33.2 30,30.2 30.2,32.2 29,29 31.2,32.2 29,31 30,32.2 D7 S820 8,12 7,9 9,10 10,11 8,11 8,12 8,13 10,12 10,13 8,11 11,11 8,11 11,11 10,11 11,12 10,12 8,10 8,11 10,12 8,11 10.1,11 11,11 8,12 12,12 12,12 9,14 10,12 12,12 8,12 8,10 8,11 9,10 CSF 1PO 9,11 10,12 11,12 11,12 11,12 11,14 11,12 12,12 11,12 11,12 11,13 12,12 9,11 12,12 12,13 11,12 12,13 12,12 10,12 12,12 12,12 9,10 12,12 7,11 10,12 10,11 10,11 11,12 10,12 10,11 10,12 9,10 D3 S1358 15,16 15,15 15,17 14,15 17,17 15,17 16,17 16,17 17,17 17,17 15,16 15,16 15,18 16,17 15,15 13,15 15,15 16,17 14,16 17,17 16,16 15,16 16,17 16,18 15,17 15,16 14,16 16,17 15,17 17,18 15,15 16,16 TH01 9,10 6,9.3 6,9 7,7 7,10 8,9 7,10 7,7 7,9.3 7,10 6,9 8,9 7,9 8,9 7,9 6,7 6,6 9,9.3 7,9 7,9 7,7 9,9.3 6,9 7,9 9,9.3 9,10 6,6 7,9 8,9 8,9 6,7 7,7 D13 S317 8,8 10,11 8,12 9,10 8,11 12,12 8,11 9,11 8,12 8,11 8,9 10,11 12,13 8,8 11,11 9,11 9,12 8,11 8,9 8,11 11,11 10,12 10,11 8,8 11,11 9,12 12,13 9,10 8,13 8,8 8,9 9,10 D16 S539 9,12 11,11 8,13 12,13 10,12 9,11 10,12 9,12 10,13 10,12 11,11 9,9 12,12 9,12 10,11 10,12 9,10 12,13 10,12 9,10 11,12 10,12 10,12 11,12 9,12 11,12 10,11 9,12 11,13 11,12 11,11 12,13 83 D2 S1338 19,24 19,20 17,19 18,19 20,23 23,25 20,23 17,17 18,20 20,23 19,24 19,24 17,23 18,20 16,24 23,25 16,22 18,18 18,20 21,21 19,23 20,20 20,23 18,22 17,21 19,23 23,24 19,22 19,21 24,25 18,25 23,24 D19 S433 14,14.2 13.2,15.2 12,13 13,14 14,15.2 13,14 14,15.2 13,13 13,13.2 14,15.2 13,14 13,14 13,14.2 14,14 12,14.2 13,13 14,14.2 14,15 13.2,14 14,14.2 15,15.2 13,14.2 13,15.2 14.2,14.2 12,12 14,15.2 13,14 13,14 12.2,13.2 14,15.2 15.2,15.2 13,15 vWA TPOX 17,19 14,19 16,20 17,17 16,18 17,19 17,18 14,18 15,16 17,18 19,19 18,18 14,18 14,19 17,17 16,20 14,16 14,19 14,16 14,17 14,17 14,18 14,18 14,18 14,19 14,21 16,18 14,14 17,18 18,18 17,18 14,14 8,11 8,11 8,8 11,11 8,8 8,11 8,8 9,11 8,10 8,8 8,8 8,11 8,8 11,11 8,11 8,11 8,8 8,11 8,8 8,8 8,11 8,11 8,9 8,11 11,11 8,11 8,8 8,12 8,11 9,11 8,11 8,9 D18 S51 13,15 13,13 17,20 14,17 13,14 12,18 13,16 16,17 12,15 13,16 14,16 14,19 14,17 12,14 15,16 15,17 16,19 14,14 15,15 15,16 14,20 13,17 13,16 12,15 18,18 14,17 16,18 14,17 17,18 13,16 15,16 12,14 D5 S818 10,10 9,10 13,13 11,13 12,13 10,13 12,13 12,14 10,12 12,13 10,12 9,11 10,12 10,11 10,11 10,12 10,13 10,12 13,13 12,13 9,10 10,13 7,11 11,13 11,12 10,11 7,10 11,12 11,12 7,12 10,13 11,12 FGA 22,22 22,27 19,22 22,22 22,22 25,26 22,22 23,23 20,23 22,22 24,25 23,24 22,22 22,24 21,24 23,24 23,23 19,21.2 22.2,24 18,19 18,26 22,23 22,23 23,25 19,23 23,24 21,22 19,21 23,24 19,21 19,25 21,22 Ký AMEL hiệu M123 X,Y M124 X,Y M125 X,X M126 X,Y M127 X,Y M128 X,Y M129 X,Y M130 X,X M131 X,X M132 X,Y M133 X,Y M134 X,X M135 X,Y M136 X,Y M137 X,Y M138 X,Y M139 X,Y M140 X,Y M141 X,Y M142 X,Y M143 X,Y M144 X,Y M145 X,X M146 X,Y M147 X,Y M148 X,Y M149 X,Y M150 X,Y M151 X,Y M152 X,Y M153 X,Y M154 X,Y D8 S1179 13,16 11,11 11,14 10,12 10,11 11,14 12,15 14,17 12,14 10,15 13,13 10,14 10,10 12,13 11,14 11,14 12,16 10,15 10,15 11,15 11,15 11,11 11,13 14,15 11,14 10,15 10,10 13,15 11,15 11,12 10,12 12,13 D21 S11 29,30 31.2,33.2 32.2,34 30,30 32.2,32.2 28,28 33.2,33.2 31.2,33.2 33.2,33.2 29,32.2 29,30 29,31 31.2,31.2 29,31.2 32.2,33.2 29,33.2 30,31 28,31.2 28,31.2 29,33.2 29,33.2 29,30 29,31 27,31.2 29,31.2 28,31.2 28,32.2 30,32 30,30 29,32.2 29,29 32.2,33.2 D7 S820 11,11 11,12 10,11 11,11 10,11 11,12 10,11 10,11 10,11 11,11 10,11 9,11 10,11 10,11 11,13 8,11 8,9 8,13 8,13 11,11 11,11 10,10 8,10 8,10 10,11 8,13 11,11 11,12 10,11 11,11 9,10 8,11 CSF 1PO 10,12 12,13 10,12 11,12 10,12 10,13 10,12 12,12 10,12 10,11 11,12 11,12 10,12 11,12 10,11 11,13 10,13 10,12 10,13 11,11 11,11 11,12 11,12 12,12 11,12 10,12 10,12 10,13 12,12 11,12 10,12 10,12 D3 S1358 14,17 16,16 15,19 17,18 16,16 16,17 15,15 16,18 15,16 16,16 15,18 17,18 14,15 15,17 15,16 15,17 15,17 16,16 16,16 15,16 15,16 16,18 17,18 17,18 16,17 16,16 16,17 14,16 15,19 16,16 15,15 15,16 TH01 7,7 6,6 7,7 9,9 7,9.3 6,9 6,7 7,8 6,7 7,9 7,9 9,10 7,7 9,9.3 7,7 7,8 7,9 9,10 9,10 9,10 9,10 7,7 7,9 6,9 7,9 9,10 6,9.3 9,10 7,7 7,7 9,9 6,9 D13 S317 8,11 8,8 8,11 8,8 8,10 8,12 8,12 8,11 11,12 11,13 8,10 11,12 8,12 11,12 8,10 8,12 10,11 8,12 8,12 12,12 12,12 11,12 8,11 9,11 8,9 8,12 9,9 8,11 10,12 8,8 8,11 8,10 D16 S539 9,11 11,12 10,12 10,12 11,11 12,13 9,13 9,9 9,9 9,13 9,11 11,11 11,12 11,13 12,12 12,12 9,12 12,12 12,12 9,12 9,12 10,11 10,11 11,12 11,12 12,12 9,12 9,11 9,9 9,11 9,9 11,12 84 D2 S1338 19,19 21,26 18,23 17,19 18,24 19,24 18,24 19,24 18,19 19,20 18,20 20,24 16,20 23,25 16,20 20,25 24,24 20,20 20,20 20,22 20,22 19,23 19,23 20,20 17,20 20,20 17,20 19,24 17,23 20,24 19,23 21,24 D19 S433 13,13.2 13,15.2 14,15 13,14 12,16.2 14,16 13,15.2 14,14 13,14 13,14.2 14,15.2 13,15.2 13,14 13,14 13,14 13,15.2 13,14.2 15,15.2 15,15.2 13,13 13,13 14.2,15 14,14.2 13,14.2 13,14.2 15,15.2 14.2,15.2 13,14 14,15 14.2,15.2 14,15 13,15 vWA TPOX 14,18 17,18 14,19 18,20 16,19 14,20 16,17 17,17 16,17 14,17 14,17 14,14 16,17 18,19 17,18 14,17 14,18 17,17 17,17 17,18 17,18 14,15 15,17 14,14 14,14 17,17 14,14 14,14 14,18 19,19 17,19 14,15 8,9 8,11 8,11 8,11 8,9 8,11 9,11 8,8 8,11 8,10 8,8 8,8 8,11 8,8 8,10 8,10 8,8 8,11 8,11 11,12 11,12 8,9 9,11 8,8 8,11 8,11 8,11 8,8 11,11 8,9 8,11 8,9 D18 S51 13,14 12,15 15,16 14,19 15,17 15,15 13,13 14,16 13,14 14,15 16,19 12,14 13,14 14,15 14,18 14,15 13,18 13,16 13,16 13,16 13,16 13,13 13,15 16,16 13,16 13,16 14,21 15,17 13,14 16,16 13,14 15,16 D5 S818 11,13 11,12 10,13 11,13 11,13 11,12 11,12 13,13 11,13 10,12 10,13 11,13 11,11 11,12 11,12 12,12 10,11 12,12 12,12 9,12 9,12 11,12 7,11 11,12 10,12 12,12 9,13 7,13 10,13 10,11 9,10 11,12 FGA 23,25 19,20 21,21.2 19,22 22,24 22,25 21,26 23,24 24,26 20,26 19,22 20,26 21,21.2 21.2,22 19,21 19,24 20,23 19,21 19,21 19,23 19,23 19,23 19,24 18,26 18,23 19,21 21,23 23,24 19,20 20,24 22,23 20,23 Ký AMEL hiệu M155 X,Y M156 X,Y M157 X,Y M158 X,Y M159 X,Y M160 X,Y M161 X,Y M162 X,Y M163 X,Y M164 X,Y M165 X,X M166 X,Y M167 X,Y M168 X,Y M169 X,Y M170 X,Y M171 X,Y M172 X,Y M173 X,Y M174 X,Y M175 X,Y M176 X,Y M177 X,Y M178 X,Y M179 X,Y M180 X,Y M181 X,Y M182 X,Y M183 X,Y M184 X,Y M185 X,Y M186 X,Y D8 S1179 10,11 11,13 10,13 14,15 12,15 10,15 13,14 10,11 10,13 11,15 10,14 14,15 11,15 10,10 10,14 15,16 13,15 13,16 10,13 10,10 11,13 11,14 13,14 10,11 15,16 10,11 13,13 11,15 10,12 15,17 13,15 11,14 D21 S11 29,32.2 29,30 30,30.3 30,30.3 32.2,32.2 29,31 28,30 30,32 28,30 28,30 29,32.2 32.2,32.2 29,32.2 30,32.2 29,32.2 29,32.2 29,30.3 30,32.2 31.2,32.2 30,31.2 32.2,32.2 29,31.2 29,32.2 32.2,32.2 30,30 30,33.2 31,32.2 29,32.2 29,30 28,31 28,30 29,31.2 D7 S820 10,10 11,12 8,11 11,12 12,13 8,9 10,13 10,11 8,13 11,12 11,11 10,11 8,11 11,12 8,11 10,12 12,12 10,10 11,12 12,13 8,9 10,12 10,10 11,12 11,12 10,11 10,12 12,12 11,12 11,13 11,11 10,11 CSF 1PO 10,11 12,12 10,12 11,12 10,12 10,14 11,12 11,11 11,11 11,12 10,11 10,11 10,12 11,12 10,12 10,10 9,12 10,10 11,12 12,12 10,12 10,13 12,12 10,12 10,11 10,12 11,13 12,12 10,12 9,10 10,10 10,12 D3 S1358 17,17 16,17 15,15 15,18 16,17 17,17 16,16 15,16 16,16 15,17 15,17 15,16 15,16 14,15 15,16 16,17 16,16 15,16 16,17 15,17 17,18 15,16 15,16 15,17 15,17 14,16 16,16 15,17 14,16 16,17 14,14 14,15 TH01 9.3,9.3 9,9 7,7 7,9 7,7 6,9 6,9 6,8 9,10 9,9.3 9,9 7,9.3 7,7 9,9 7,9 9,9 7,9 7,9 6,7 6,7 6,7 7,9 7,9 7,10 9,9 7,9 7,10 7,9 7,9 6,10 6,9 6,7 D13 S317 8,9 11,13 11,12 9,11 8,12 9,11 9,10 8,11 9,11 7,11 9,11 8,11 8,10 11,12 8,11 9,10 9,10 8,12 12,13 10,14 8,10 8,11 11,14 10,11 8,11 11,12 8,8 12,12 10,12 8,12 11,12 10,10 D16 S539 12,12 8,13 10,11 9,10 9,12 9,10 10,12 9,12 12,14 11,11 9,9 10,12 9,11 12,13 11,12 12,14 9,11 11,12 9,10 10,13 9,11 13,13 11,12 11,11 9,12 10,12 10,11 10,12 11,12 10,12 10,12 11,14 85 D2 S1338 19,23 19,24 16,23 18,24 23,24 19,24 19,24 23,23 20,24 18,23 19,25 17,19 17,21 20,24 21,24 18,24 17,18 17,23 23,24 20,23 20,25 19,24 20,23 24,24 18,23 21,24 22,25 17,25 20,24 19,20 18,20 19,19 D19 S433 14,15 13,15.2 15.2,15.2 15,15.2 13,14 13,13 13,15.2 12,15.2 12,15 13,14.2 13,14 13.2,14.2 13,15.2 14,14 12,14 12,15.2 12,13.2 15,15.2 13,15.2 14,15.2 13,14 15,16 13,14 13,15 14,14 13,15.2 13,13 14.2,16 13,16 14,14.2 13.2,14 13,14.2 vWA TPOX 14,17 14,15 14,14 14,18 18,18 14,16 16,18 16,18 14,18 14,17 19,19 14,18 18,19 14,16 18,18 15,19 14,14 14,19 14,17 18,18 14,19 14,17 14,14 16,19 14,14 14,14 17,19 14,17 14,18 14,18 14,15 19,19 10,11 8,8 8,9 8,11 8,8 8,11 11,12 9,11 8,11 8,11 8,11 11,11 8,11 8,11 9,11 11,11 8,8 8,8 8,10 8,11 9,9 8,11 8,10 8,11 8,11 8,8 10,11 11,11 11,11 8,11 8,8 9,11 D18 S51 11,19 15,16 13,17 12,15 12,14 17,22 13,15 15,15 13,16 14,18 14,18 14,19 13,15 15,16 13,15 16,17 16,18 15,18 15,16 13,13 14,15 13,14 15,16 15,15 15,18 15,16 13,25 14,14 14,17 13,16 15,15 12,13 D5 S818 9,10 9,10 11,11 11,11 7,11 10,13 10,12 10,10 10,12 11,12 11,11 12,12 10,12 11,12 10,15 9,12 11,12 10,11 12,13 13,13 12,13 10,11 10,13 11,12 10,13 13,13 10,11 11,12 11,12 11,13 10,11 9,10 FGA 21,25 24,28 21,26 20,26 22,23 21,23 23,24 23,26 19,24 21,22 19,25 21,21 24,26 20,26 21,22 18,20 22,24 21,24 21,24 23,27 19,23 22,23 23,25 22,26 23,26 18,24 22,24 22,23 21,22 19,24 22,23 21,24 Ký AMEL hiệu M187 X,Y M188 X,Y M189 X,Y M190 X,Y M191 X,Y M192 X,Y M193 X,Y M194 X,Y M195 X,Y M196 X,Y M197 X,Y M198 X,Y M199 X,Y M200 X,Y D8 S1179 14,14 14,15 12,15 10,11 11,14 11,12 11,13 12,13 9,12 11,13 13,15 13,15 14,15 14,15 D21 S11 29,30 30,32 29,31.2 31.2,31.2 28,31.2 29,31.2 31,32.2 31,32.2 30,30 28,32.2 31.2,31.2 28,29 29,31.2 29,31.2 D7 S820 12,12 8,11 11,11 8,11 12,12 9,11 8,12 10,11 11,12 8,11 13,13 8,11 8,11 8,11 CSF 1PO 11,13 7,11 12,13 10,12 10,12 12,12 10,11 10,12 11,11 12,13 11,11 12,12 12,12 12,12 D3 S1358 16,17 15,17 15,17 16,17 15,16 16,17 15,15 15,17 16,16 16,16 15,16 15,17 17,18 17,18 TH01 7,9.3 6,9 7,7 9,10 7,9 6,7 7,8 9,9 6,7 8,8 7,9 7,7 6,9.3 6,9.3 D13 S317 8,9 9,9 11,11 9,10 8,13 10,11 12,13 8,12 8,11 8,10 9,11 9,12 9,11 9,11 D16 S539 9,15 10,14 10,11 9,10 11,12 9,13 9,9 9,10 9,11 9,9 11,11 11,11 9,13 9,13 D2 S1338 18,23 17,23 17,19 19,22 18,23 17,24 20,22 19,25 17,25 16,19 19,20 19,25 22,25 22,25 D19 S433 13,13 12,14.2 13.2,14 13,13 14,15 14,14 13,14 13,13.2 12,15.2 14,15.2 13,15.2 14,14.2 13,14 13,14 vWA TPOX 14,18 14,18 15,18 17,19 18,18 17,17 14,17 14,14 18,18 14,15 14,17 14,16 16,19 16,19 8,11 11,11 8,11 8,9 8,11 8,8 8,8 8,8 8,11 8,11 8,8 8,9 11,11 11,11 D18 S51 14,18 16,16 14,15 14,15 13,16 13,15 12,15 14,16 13,16 14,15 17,19 14,17 16,18 16,18 D5 S818 12,13 10,11 12,13 9,10 9,12 10,10 10,11 11,13 11,12 10,13 11,12 12,13 12,12 12,12 Phần 2: Các locus khơng có hệ Identifiler Ký hiệu M001 M002 M003 M004 M005 M006 M007 M008 M009 M010 M011 D1 S1656 15,15 15,15 13,14 15,16 13,16 13,16 15,15 16,18 16,18 15,16 14,15 D2 S441 11,11.3 11,14 10,11.3 10,15 10,14 10,10 9.1,11.3 11,12 11,12 10,10 10,11 D4 S2408 10,10 8,11 10,10 9,10 8,10 10,10 9,9 10,11 10,11 8,10 8,11 D6 S1043 13,14 13,18 11,18 15,19 18,20 12,18 18,20 12,18 12,18 11,17 11,11 D9 S1122 11,13 12,12 11,12 11,12 15,15 13,15 12,13 12,13 12,13 12,13 11,13 D10 S1248 14,17 13,14 13,15 14,15 15,15 13,15 14,16 13,16 13,16 15,17 13,16 86 D12 S391 17,18 21,23 18,25 19,21 20,22 17,20 18,18 18,20 18,20 19,20 18,18 PentaE 11,14 19,19 12,21 10,11 16,18 14,18 15,18 11,12 11,12 11,11 12,12 D17 S1301 11,12 12,12 11,13 12,13 12,12 12,12 10,13 12,14 12,14 12,12 11,12 D20 S482 13,14 10,14 13,14 14,14 13,13 13,15 13,14 13,14 13,14 14,14 14,15 PentaD 9,9 11,12 9,13 10,11 10,12 7,12 10,12 9,13 9,13 9,11 9,12 D22 S1045 11,11 11,16 16,17 11,11 16,18 14,16 11,15 11,14 11,14 11,15 15,15 FGA 24,25 20,22 16,22 16,23 20,22 23,23 19,25 21,21 21,22 22,22 19,24 22,22 20,23 20,23 Ký hiệu M012 M013 M014 M015 M016 M017 M018 M019 M020 M021 M022 M023 M024 M025 M026 M027 M028 M029 M030 M031 M032 M033 M034 M035 M036 M037 M038 M039 M040 M041 M042 M043 D1 S1656 15,15 14,17 15,16 15,16 16,17.3 13,15 14,17.3 12,15 14,15 17.3,17.3 15,17.3 15,18.3 13,15 14,15 15,16 16,17 14,16 13,15 12,16 16,17 14,16 16,17 13,15 15,15 15,17 14,15 12,15 16,16 12,13 12,18.3 11,13 14,15 D2 S441 10,10 10,11 10,10 10,12 11.3,12 14,14 10,12 10,15 10,14 10,11 11,12 11,11.3 11,14 10,10 11,13 11,12 10,11 10,11 12,14 11.3,12 12,14 11,12 10,12 10.1,11 11,14 11,11 11,12 11,12 10,14 10,14 11.3,15 11,11.3 D4 S2408 9,9 10,11 9,9 9,10 9,11 9,11 10,11 10,10 10,10 9,10 8,9 9,10 8,10 10,11 9,11 10,11 9,11 9,9 8,10 10,11 8,11 10,11 8,10 8,9 9,12 8,12 9,10 10,11 9,9 9,11 9,12 10,11 D6 S1043 11,19 11,12 11,19 11,18 12,19 18,18 18,18 13,18 11,18 13,18 17,18 14,19 10,14 12,19 12,13 11,11 12,18 12,18 12,18 14,17 11,18 11,11 12,13 11,14 10,11 14,18 13,14 11,11 12,20 19,19 11,18 18,19 D9 S1122 12,12 11,11 12,12 13,13 10,12 12,12 10,13 11,13 13,14 13,14 11,12 12,13 12,12 11,12 12,12 12,13 11,13 11,13 11,12 12,13 9,12 12,13 12,12 13,13 10,12 12,13 13,13 11,13 12,12 12,13 12,14 12,13 D10 S1248 12,16 13,16 13,16 12,13 13,15 13,15 15,15 13,15 15,15 13,14 13,13 13,15 13,14 13,16 13,14 14,14 13,16 14,17 13,14 13,14 14,15 14,14 13,14 13,13 13,15 13,13 13,13 14,14 13,15 13,15 15,15 14,14 87 D12 S391 21,21 18,22 18,21 18,21 18,22 18,21 18,18 19,20 19,22 19,22 16,19 19,19 22,24 19,21 18,19 19,20 17,19 19,21 18,23 20,24 23,23 19,20 18,21 18,19 18,20 18,23 18,20 19,20 18,23 19,20 19,23 19,20 PentaE 11,12 13,13 11,15 12,13 10,12 10,11 11,13 12,18 10,11 15,19 10,11 5,16 11,16 11,17 10,13 11,18 13,17 11,15 10,15 13,13 10,17 11,18 11,14 11,13 16,16 11,14 12,14 11,18 7,14 10,10 14,14 11,11 D17 S1301 11,13 11,11 11,14 12,12 10,11 12,12 10,12 12,13 12,13 11,12 11,13 12,13 12,13 12,13 11,13 11,12 12,15 12,13 9,12 11,13 12,12 11,12 12,13 9,12 11,12 9,12 12,12 11,12 11,12 12,13 12,13 11,12 D20 S482 13,13 13,15 13,14 13,13 13,14 12,14 13,14 13,16 14,15 14,15 13,14 14,14 14,14 13,15 15,15 13,15 13,14 13,14 14,14 11,13 13,14 13,16 13,14 10,14 10,14 14,14 13,14 13,16 14,15 13,13 13,13 12,13 PentaD 8,12 9,9 11,12 7,13 9,10 9,9 9,10 9,9 11,12 9,10 9,10 10,10 9,11 9,12 7,11 9,9 10,12 8,9 11,11 9,11 9,9 9,9 10,12 8,8 9,10 8,9 8,9 9,9 12,13 9,13 12,13 10,10 D22 S1045 11,11 15,15 11,16 11,11 15,17 11,15 15,15 16,16 15,15 11,15 16,17 15,17 15,17 16,16 11,17 15,15 15,16 15,15 15,16 11,15 15,16 15,15 11,15 14,15 11,16 14,17 11,15 15,15 16,16 16,17 17,17 15,16 Ký hiệu M044 M045 M046 M047 M048 M049 M050 M051 M052 M053 M054 M055 M056 M057 M058 M059 M060 M061 M062 M063 M064 M065 M066 M067 M068 M069 M070 M071 M072 M073 M074 M075 D1 S1656 15,17 13,17.3 13,16 14,15 13,15 16,16 17,18.3 13,15 13,15 14,15 16,17 16,18.3 14,17.3 13,17 11,17 12,15 12,15 13,16 15,16 15,16 15,16 15,17 15,16 17.3,18.3 13,15 16,17.3 15,16 12,13 15,15 15,16 15,17.3 11,11 D2 S441 13,14 11,11 12,14 10,14 11,14 11,12 10,14 12,14 11,14 10,11 11,12 11.3,12 12,12 11,14 11,11.3 11,12 10,12 11,14 10,11 10,11 10,11 10,11 10,11 11,15 12,12 11,12 11,11 11,11.3 11,11.3 10,11 11,14 10,12 D4 S2408 9,11 9,11 8,10 10,10 8,10 9,10 9,10 8,8 8,9 10,11 10,11 9,11 8,10 10,10 9,11 9,10 9,10 8,10 9,11 9,11 9,11 9,10 9,11 9,10 9,9 10,11 10,11 9,10 8,11 9,11 10,11 8,11 D6 S1043 18,18 13,14 10,12 11,19 10,14 11,20 12,14 19,19 12,19 10,11 11,11 12,18 14,15 15,18 12,14 13,14 18.2,20 12,18 12,13 12,13 12,13 11,12 12,13 14,20 11,11 11,13 10,13 12,18 14,17 12,13 14,18 12,12 D9 S1122 12,13 12,13 12,12 11,12 12,12 11,13 12,13 11,12 13,13 13,13 12,13 13,13 12,13 11,12 11,13 11,12 11,13 13,13 12,13 12,13 12,13 12,13 12,13 11,13 12,13 10,14 11,12 11,12 13,14 12,13 12,13 12,13 D10 S1248 14,15 13,14 15,16 15,16 13,14 16,17 13,15 13,14 14,15 10,14 14,14 13,14 12,12 14,16 13,15 13,15 12,13 14,16 13,15 13,15 13,15 13,13 13,15 14,15 15,15 14,15 14,15 14,15 12,15 13,15 13,14 13,14 88 D12 S391 18,20 18,19 23,23 18,19 22,24 18,19 20,20 22,23 15,17 18,22 19,20 20,21 18,20 19,21 19,25 18,22 19,20 18,18 18,20 18,20 18,20 23,24 18,20 19,21 18,22 18,20 18,19 18,18 21,22 18,20 18,21 20,22 PentaE 11,11 11,13 12,18 11,16 11,16 17,17 5,19 11,13 11,11 11,18.4 11,18 12,18 5,20 11,11 11,11 14,16 11,12 5,12 11,11 11,11 11,11 9,10 11,11 11,12 17,23 16,16 11,12 11,12 16,19 11,11 18,19 11,17 D17 S1301 9,13 12,12 12,14 13,13 12,13 11,12 11,13 9,12 11,12 11,12 11,12 12,12 12,13 12,13 11,13 11,11 12,12 12,13 12,13 12,13 12,13 12,14 12,13 9,12 11,14 11,12 10,12 13,13 12,12 12,13 12,13 12,14 D20 S482 14,14 12,15 13,14 13,14 14,14 12,14 14,14 14,14 13,14 13,14 13,15 13,14 13,13 12,13 12,14 13,13 14,14 13,14 13,14 13,14 13,14 14,14 13,14 14,15 12,13 13,13 13,15 15,16 14,15 13,14 15,16 10,13 PentaD 9,12 9,11 9,12 8,11 9,11 9,12 9,10 10,12 14,19 9,11 9,9 8,9 9,11 10,11 9,14 9,12 8,12 10,11 9,14 9,14 9,14 12,15 9,14 7,10 9,9 11,11 8,15 9,10 9,9 9,14 9,10 9,13 D22 S1045 11,16 15,17 16,17 11,17 15,15 11,15 11,17 17,17 14,17 15,16 15,15 15,15 15,16 11,16 15,15 11,16 15,17 11,17 15,16 15,16 15,16 11,15 15,16 11,16 11,15 15,16 15,15 15,15 11,11 15,16 16,17 14,15 Ký hiệu M076 M077 M078 M079 M080 M081 M082 M083 M084 M085 M086 M087 M088 M089 M090 M091 M092 M093 M094 M095 M096 M097 M098 M099 M100 M101 M102 M103 M104 M105 M106 M107 D1 D2 S1656 S441 11,11 10,12 11,11 10,12 15,17.3 11.3,14 11,11 10,12 16,16.3 11,12 12,12 10,14 16,19 12,12 11,11 10,12 12,16 11,14 11,15 11,14 13,14 11.3,12 18,18 10,10 11,11 10,14 11,15 10,11 17.3,17.3 10,10 14,17 11.3,11.3 16,16 11,11 11,15 10,11 16,17 11.3,14 11,15 9.1,14 13,16 10,11 11,15 9.1,14 15,17.3 10,14 16,18 11.3,14 11,15 9.1,14 15,16 10,12 15,18.3 10,14 15,17.3 11,11.3 15,17.3 10,10 11,11 10,10 11,16 11,13 13,17 10,11 D4 S2408 8,11 8,11 9,10 8,11 9,10 9,12 10,10 8,11 9,12 9,9 10,10 9,10 10,10 10,11 10,10 10,11 9,10 9,9 10,10 9,12 7,10 10,12 9,9 9,10 10,12 9,10 8,10 10,11 9,10 10,12 10,11 10,10 D6 S1043 12,12 12,12 13,18 12,12 10,17 11,13 12,19 12,12 12,14 13,14 11,19 13,14 17,19 13,14 12,13 12,12 13,18 11,13 11,11 11,18 11,11 11,18 14,18 11,18 11,18 11,13 14,18 18,19 13,19 14,17 12,13 12,21 D9 S1122 12,13 12,13 10,13 12,13 11,11 11,13 12,13 12,13 12,13 13,13 12,13 12,12 12,12.3 11,12 12,12 11,13 12,12 12,13 10,12 12,14 11,13 12,14 11,13 11,12 12,14 11,12 12,13 13,13 12,12 11,12 11,13 12,15 D10 S1248 13,14 13,14 14,16 13,14 14,14 14,16 13,15 13,14 13,16 14,16 14,15 13,16 13,14 14,16 12,15 15,15 13,15 14,15 13,15 13,14 13,15 13,14 13,15 13,13 13,14 13,14 15,18 12,14 12,13 12,16 14,15 13,13 89 D12 S391 20,22 20,22 18,20 20,22 18,21 18,19 18,19 20,22 15,21 23,23 18,20 19,19 19,20 18,19 19,23 18,18 23,24 17,18 18,19 17,21 19,20 17,17 19,20 20,21 17,21 18,23 20,20 17,20 20,21 19,22 19,19 17,18 PentaE 11,17 11,17 14,15 11,17 11,13 5,5 12,16 11,17 15,16 5,11 15,15 17,18 12,14 17,18 5,11 11,12 12,12 15,16 12,18 11,11 10,11 10,11 10,11 12,15 11,20 12,12 9,19 11,14 12,16 15,15 12,16 11,21 D17 S1301 12,14 12,14 12,12 12,14 12,12 10,13 12,13 12,14 12,12 11,12 11,12 10,12 11,12 10,12 12,12 12,14 12,12 9,11 10,13 9,11 7,12 10,11 10,12 12,12 10,11 11,13 13,13 10,11 12,13 9,13 12,13 12,12 D20 S482 10,13 10,13 14,14 10,13 13,13 10,15 14,14 10,13 12,12 13,14 15,16 14,14 13,14 13,14 12,14 13,14 14,15 14,14 14,15 11,12 13,13 12,14 12,15 13,14 12,14 13,14 14,16 14,15 15,15 13,15 13,14 13,14 PentaD 9,13 9,13 9,11 9,13 7,9 10,13 8,9 9,13 7,12 8,8 9,12 9,9 9,10 11,11 9,10 8,12 11,12 9,10 11,13 9,10 10,12 9,10 8,10 10,11 9,10 8,10 11,12 9,11 9,10 8,10 8,10 9,9 D22 S1045 15,16 14,15 16,19 14,15 15,16 15,16 11,14 15,16 11,17 15,15 11,15 17,17 15,15 17,17 15,16 17,18 16,17 15,16 11,15 15,16 16,17 15,16 11,15 11,16 15,16 11,16 14,16 11,17 14,15 15,15 11,16 11,16 Ký hiệu M108 M109 M110 M111 M112 M113 M114 M115 M116 M117 M118 M119 M120 M121 M122 M123 M124 M125 M126 M127 M128 M129 M130 M131 M132 M133 M134 M135 M136 M137 M138 M139 D1 S1656 15,17.3 15,15 14,17 11,12 14,15 16,17 17.3,17.3 15,17.3 13,15 11,17.3 13,16 15,16 13,15 15,16 13,13 16,16.3 13,17 15,16 11,14 11,16 15,16 12,15 12,17 12,15 12,15 15,16 13,15 17.3,17.3 15,17.3 15,15 15,16 13,15 D2 S441 10,11.3 10,12 11,12 10,13 9.1,11 11.3,12 12,15 11,11 12,12 11.3,12 11,11.3 11,12 12,15 11.3,12 12,14 11,12 10,10 11,12 10,12 11,14 10,11 10,11 10,12 10,12 10,15 11,13 14,14 10,11 11,12 10,10 10,10 10,11 D4 S2408 9,10 8,10 10,10 8,10 8,11 9,10 9,10 9,10 9,11 9,10 10,10 9,9 8,10 10,10 9,11 10,10 9,12 10,10 10,13 10,10 8,10 10,12 9,10 9,10 10,10 9,11 9,11 9,10 8,9 9,9 9,9 9,9 D6 S1043 18,19 18,19 11,19 12,18 12,20 13,18 13,14 13,18 11,11 12,12 11,12 14,18 13,14 12,18 12,18 14,14 13,18 14,15 11,19 10,17 11,12 15,18 13,17 17,18 13,18 12,13 18,18 13,18 17,18 11,19 11,19 12,18 D9 S1122 12,13 11,13 12,14 13,13 11,13 11,13 13,14 11,13 12,14 11,13 13,13 12,13 10,11 12,12 13,13 11,13 12,13 12,12 12,13 13,13 11,13 10,10 12,13 11,12 11,13 12,12 12,12 13,14 11,12 12,12 12,12 11,13 D10 S1248 13,13 13,15 15,16 13,15 13,15 14,14 13,14 14,16 14,14 16,16 12,13 13,15 13,14 12,17 12,13 13,16 13,13 13,14 14,14 14,15 14,16 13,14 13,13 13,14 13,15 13,14 13,15 13,14 13,13 12,16 13,16 14,17 90 D12 S391 18,22 18,22 18,19 22,23 22,23 23,25 22,22 18,22 15,18 18,23 21,22 15,19 18,19 21,22 19,22 21,24 17,20 17,21 19,20 18,19 23,25 18,19 19,20 18,20 19,20 18,19 18,21 19,22 16,19 21,21 18,21 19,21 PentaE 11,11 10,16 12,17 11,17 11,19 15,15 5,16 11,11 14,14 18,20 10,11 11,11 11,14 12,14 13,17 14,14 18,19 10,16 12,15 11,15 11,14 11,19 11,12 11,11 12,18 10,13 10,11 15,19 10,11 11,12 11,15 11,15 D17 S1301 12,12 12,13 12,13 12,12 12,14 11,11 13,13 12,12 12,12 12,13 12,12 11,12 12,13 12,13 12,13 12,13 12,12 12,13 14,14 12,12 10,12 12,12 10,11 10,12 12,13 11,13 12,12 11,12 11,13 11,13 11,14 12,13 D20 S482 14,14 13,15 12,14 14,15 14,14 13,13 13,14 14,15 15,15 14,15 13,14 13,14 13,14 14,14 13,13 13,14 13,16 13,14 10,13 10,14 13,14 13,13 13,13 13,13 13,16 15,15 12,14 14,15 13,14 13,13 13,14 13,14 PentaD 9,14 9,13 10,11 8,12 9,9 9,12 9,10 9,11 9,12 9,11 11,12 10,11 11,13 9,11 9,15 9,11 10,12 6,12 9,11 9,11 9,11 12,13 9,11 11,13 9,9 7,11 9,9 9,10 9,10 8,12 11,12 8,9 D22 S1045 11,15 15,15 11,11 16,17 11,15 16,17 16,16 15,15 16,17 11,11 16,17 15,16 16,17 15,16 16,16 15,15 15,16 16,16 14,14 15,17 15,16 16,16 14,15 15,16 16,16 11,11 11,15 11,15 16,17 11,11 11,11 15,15 Ký hiệu M140 M141 M142 M143 M144 M145 M146 M147 M148 M149 M150 M151 M152 M153 M154 M155 M156 M157 M158 M159 M160 M161 M162 M163 M164 M165 M166 M167 M168 M169 M170 M171 D1 S1656 15,16 15,16 15,15 15,15 12,16 14,16 15,15 14,15 15,16 13,15 15.3,17 15,16 11,13 14,16 15,17 16,16.3 11,13 15,17 15,16 11,15 15,16 15,15 15,16 15,15 11,16 17,18.3 13,15 13,17 15,15 15,16 11,15.3 14,15 D2 S441 10,11 10,11 11,11.3 11,11.3 12,14 12,14 10.1,11 11,11 10,11 11,14 10,11 11.3,13 11.3,12 11,14 10,11 10,12 11.3,14 11,11 11,12 11.3,12 11.3,12 11,14 10,12 10,11 11,12 10,11.3 12,12 10,14 14,14 11,11.3 10,12 11,11.3 D4 S2408 10,10 10,10 10,10 10,10 8,10 8,11 8,9 8,12 10,10 8,10 9,12 8,9 9,10 8,10 9,10 9,10 10,11 10,10 9,10 8,10 9,10 9,10 9,10 9,10 9,10 10,10 9,9 9,10 9,9 9,10 10,10 9,10 D6 S1043 12,17 12,17 13,14 13,14 12,18 11,18 11,14 14,18 12,17 10,14 17,19 18,18 11,11 18,18 11,20 19,19 18,19 12,19 17,17 10,18 18,18.2 14,18 11,18 14,19 12,18 11,18 13,14 18,20 11,14 17,18 13,14 18,18 D9 S1122 13,15 13,15 11,13 11,13 11,12 9,12 13,13 12,13 13,15 12,12 12,14 12,13 13,13 13,13 10,12 11,13 14,14 12,13 12,13 12,13 12,13 10,12 13,13 12,14 12,14 12,13 12,14 12,13 10,12 11,11 12,13 13,13 D10 S1248 15,17 15,17 14,17 14,17 13,14 14,15 13,13 13,13 15,17 13,14 13,14 12,13 12,13 13,14 12,14 13,13 13,13 13,14 12,13 15,15 13,16 13,14 12,13 13,13 13,13 14,15 13,13 13,16 15,15 13,15 13,14 16,16 91 D12 S391 17,19 17,19 17,18 17,18 18,23 23,23 18,19 18,23 17,19 22,24 20,25 19,21 20,21 19,21 21,23 22,26 21,21 19,19 19,21 19,23 21,22 20,22 18,21 22,22 18,18 18,19 17,18 17,22 18,25 20,21 21,23 18,19 PentaE 14,21 14,21 11,14 11,14 10,15 10,17 11,13 11,14 14,21 11,16 12,20 12,14 15,17 12,12 5,12 11,18 11,16 11,12 17,20 12,19 14,15 11,13 12,13 11,16 11,14 12,16 14,14 16,18 13,21 14,20 10,19 11,11 D17 S1301 12,12 12,12 11,12 11,12 9,12 12,12 9,12 9,12 12,12 12,13 11,12 11,11 12,12 8,13 12,13 12,12 12,12 11,12 11,13 13,13 13,13 11,12 12,12 12,12 12,13 12,12 9,13 11,13 12,12 11,13 12,12 12,12 D20 S482 12,14 12,14 13,14 13,14 14,14 13,14 10,14 14,14 12,14 14,14 13,14 13,14 12,13 13,15 12,13 11,13 14,15 14,16 13,14 10,14 13,14 13,14 13,13 13,14 14,14 10,14 13,14 13,14 13,13 14,14 10,13 14,14 PentaD 9,9 9,9 9,9 9,9 11,11 9,9 8,8 8,9 9,9 9,11 8,9 10,13 11,13 12,15 9,13 11,12 11,12 10,15 9,15 9,13 11,11 10,12 7,13 8,10 7,10 9,9 12,13 8,9 9,9 9,10 11.2,13 13,13 D22 S1045 11,14 11,14 11,11 11,11 15,16 16,16 14,15 14,17 11,14 15,15 11,15 11,11 11,15 15,16 11,11 15,15 16,17 11,17 11,16 11,11 15,17 15,16 11,11 15,16 15,15 15,16 15,16 14,15 15,15 11,11 14,14 15,15 Ký hiệu M172 M173 M174 M175 M176 M177 M178 M179 M180 M181 M182 M183 M184 M185 M186 M187 M188 M189 M190 M191 M192 M193 M194 M195 M196 M197 M198 M199 M200 D1 S1656 13,15 15,16 16,17.3 15,17 16,17.3 11,16 14,16 15,16 13,15 15,18.3 13,17 17,17 15,16 15,15 15,15 15,17 11,15 16,16 15,15 14,17.3 15,15 16,17 14,15 11,16 15,16 11,17 15,18 12,13 12,13 D2 S441 10,14 11,12 10,12 14,14 11,11.3 12,12 10,11.3 11.3,12 11.3,12 11,14 10,11 10,12 12,14 12,14 10,11 12,14 10,11 12,12 11,11.3 12,14 12,12 10,11.3 12,14 10,11 10,11 11,12 11,12 10,14 10,14 D4 S2408 9,10 9,10 10,12 9,11 9,9 8,10 8,9 9,10 9,10 10,11 9,9 8,9 11,11 8,9 8,9 10,12 9,11 10,11 10,10 8,10 9,10 9,11 9,10 9,10 9,9 10,10 10,10 9,9 9,9 D6 S1043 11,19 11,13 13,18 14,18 14,19 11,11 14,18 12,13 19,20 14,17 11,18 13,20 13,19 11,13 14,14 12,13 13,14 11,18 14,18 12,19 13,18 17,18 13,14 12,18 11,14 14,18 18,19 12,20 12,20 D9 S1122 11,13 12,13 11,12 11,13 11,12 12,14 11,16 9,11 11,12 13,13 12,13 11,13 13,14 10,12 12,12 12,12 12,14 12,13 12,13 12,13 12,13 12,13 12,13 10,11 12,13 11,13 12,13 12,12 12,12 D10 S1248 14,15 13,16 14,15 14,16 14,14 13,14 14,14 12,14 13,14 13,15 13,14 12,15 13,14 13,15 14,16 14,16 12,13 13,14 14,14 13,14 13,15 13,15 13,13 13,13 13,14 15,16 15,16 13,15 13,15 92 D12 S391 18,25 20,24 18,19 21,23 21,21 21,23 20,21 18,21 19,23 18,19 20,21 18,18 19,23 18,20 18,23 19,21 19,22 20,24 22,22 19,20 17,19 20,24 20,20 18,18 17,19 20,21 19,21 18,23 18,23 PentaE 13,17 12,12 11,11 11,16 11,16 11,18 11,14 11,15 8,8 11,13 5,20 10,14 11,13 14,19 11,18 5,12 11,20 11,11 12,12 15,17.4 11,11 11,18 11,12 11,16 18,18 13,16 10,11 7,14 7,14 D17 S1301 12,12 12,12 12,12 11,12 12,12 12,12 11,12 12,12 11,11 11,12 12,12 11,12 10,13 12,13 11,12 10,11 11,12 12,13 11,13 10,12 12,13 10,14 12,13 11,12 12,14 11,12 11,12 11,12 11,12 D20 S482 13,15 13,13 13,14 14,15 13,14 13,14 14,14 15,15 14,15 10,14 10,14 13,14 14,15 14,14 12,14 14,16 13,14 14,14 13,13 13,15 13,13 12,14 14,15 12,13 14,14 15,15 13,15 14,15 14,15 PentaD 8,14 10,13 7,8 10,12 12,14 10,13 9,11 9,9 9,9 8,10 8,11 9,12 10,11 7,9 9,9 10,13 9,11 8,9 9,13 9,9 8,12 9,9 11,13 9,9 10,11 8,10 10,11 12,13 12,13 D22 S1045 17,17 11,11 16,16 15,17 15,15 16,16 11,11 15,15 14,14 15,15 11,11 15,15 11,11 11,11 15,15 11,11 15,15 15,15 15,15 15,15 14,14 11,11 15,15 15,15 11,11 15,15 16,16 16,16 16,16 PHỤ LỤC 2: BẢNG TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 27 LOCUS STR TRÊN NHIỄM SẮC THỂ THƯỜNG TỪ QUẦN THỂ NGƯỜI DÂN TỘC KINH TẠI VIỆT NAM (N = 200) Phần 1: Các locus trùng với hệ Identifiler Locus/ Alen D8 S1179 D21 S11 D7 S820 CSF 1P0 D3 S1358 TH01 D13 S317 D16 S539 D2 S1338 D19 S433 vWA TPOX D18 S51 D5 S818 FGA 6.0 7.0 8.0 9.0 9.3 10.0 10.1 11.0 12.0 12.2 13.0 13.2 14.0 14.2 15.0 15.2 16.0 16.2 17.0 18.0 19.0 20.0 20.2 21.0 21.2 22.0 0.0025 0.0075 0.1625 0.1475 0.1200 0.1550 0.1500 0.1675 0.0700 0.0075 0.0100 - - 0.0050 0.1350 0.0525 0.2075 0.0025 0.3800 0.1725 0.0425 0.0025 - 0.0100 0.0025 0.0175 0.1975 0.2425 0.4475 0.0625 0.0200 - 0.0025 0.0525 0.2950 0.3450 0.2225 0.0775 0.0050 - 0.1400 0.3750 0.0425 0.3175 0.0650 0.0600 - 0.0050 0.2825 0.1325 0.1075 0.2350 0.1825 0.0500 0.0050 - 0.0050 0.2250 0.1525 0.2425 0.2900 0.0625 0.0200 0.0025 - 0.0250 0.0975 0.0850 0.1650 0.1750 0.0325 0.0400 0.0425 0.0025 0.3125 0.0200 0.2725 0.0975 0.0700 0.1475 0.0100 0.0250 - 0.3050 0.0525 0.0900 0.2300 0.200 0.0975 0.0200 0.0050 - 0.5800 0.0775 0.0325 0.2900 0.0200 - 0.0050 0.0400 0.1675 0.1850 0.2050 0.1925 0.0775 0.0675 0.0250 0.0150 0.0125 0.0025 0.0450 0.0550 0.2325 0.2700 0.2275 0.1675 0.0025 0.0050 - 0.0050 0.0275 0.0950 0.0575 0.0025 0.1400 0.0125 0.2150 93 Locus/ Alen D8 S1179 D21 S11 D7 S820 CSF 1P0 D3 S1358 TH01 D13 S317 D16 S539 22.2 23.0 23.2 24.0 24.2 25.0 25.2 26.0 27.0 28.0 28.2 29.0 30.0 30.2 30.3 31.0 31.2 32.0 32.2 33.2 34.0 34.2 H(0b) H(exp) HWE PD PE PIC PI 0.8195 0.8800 0.6855 0.9555 0.7548 0.84 4.17 0.0050 0.0575 0.0050 0.2400 0.1875 0.0075 0.0075 0.0800 0.1125 0.0250 0.1650 0.0925 0.0025 0.0125 0.8132 0.8737 0.4729 0.9498 0.7421 0.83 3.96 0.7522 0.7400 0.2935 0.9006 0.4928 0.73 1.92 0.6960 0.7250 0.0992 0.8546 0.4680 0.65 1.82 0.7357 0.6750 0.1489 0.8890 0.3907 0.69 1.54 0.7293 0.7300 0.1145 0.8803 0.4762 0.69 1.85 0.7997 0.7900 0.1300 0.9273 0.5806 0.77 2.38 0.7788 0.7700 0.2208 0.9132 0.5446 0.74 2.17 94 D2 S1338 D19 S433 vWA TPOX 0.1575 0.1575 0.0600 0.0050 0.8537 0.8750 0.5166 0.9626 0.7447 0.85 4.00 0.7762 0.8250 0.6918 0.9151 0.6462 0.76 2.86 0.7932 0.9650 0.1302 0.9267 0.5358 0.76 2.13 0.5720 0.5750 0.0233 0.7572 0.2619 0.51 1.18 D18 S51 D5 S818 FGA 0.0025 0.0025 0.8387 0.8485 0.7707 0.9492 0.6919 0.82 3.30 0.7907 0.7700 0.1806 0.9211 0.5446 0.76 2.17 0.0050 0.1525 0.0100 0.1125 0.0150 0.0575 0.0050 0.0675 0.0175 0.0025 0.8682 0.9000 0.5919 0.9692 0.7954 0.86 5.00 Phần 2: Các locus khơng có hệ Identifiler Locus/ Alen D1 S1656 D2 S441 D4 S2408 D6 S1043 D9 S1122 D10 S1248 D12 S391 PentaE D17 S1301 D20 S482 PentaD D22 S1045 5.0 6.0 6.3 7.0 8.0 8.1 9.0 9.1 10.0 11.0 11.2 11.3 12.0 13.0 14.0 15.0 15.3 16.0 16.3 17.0 17.3 17.4 18.0 18.2 18.3 18.4 19.0 20.0 0.0900 0.0475 0.0975 0.0625 0.3225 0.0025 0.1900 0.0075 0.0750 0.0675 0.0150 0.0200 0.0025 - 0.0075 0.0050 0.2500 0.3025 0.0525 0.2075 0.0150 0.1425 0.0175 - 0.0025 0.1125 0.3100 0.3950 0.1400 0.0375 0.0025 - 0.0250 0.1600 0.1600 0.1250 0.1250 0.0125 0.0500 0.2125 0.0500 0.0900 0.0325 0.0075 0.0350 0.1550 0.3800 0.3475 0.0525 0.0175 0.0025 - 0.0025 0.0550 0.3550 0.2600 0.200 0.0975 0.0275 0.0025 - 0.0100 0.0050 0.0550 0.2300 0.1900 0.1525 0.0300 0.0075 0.0050 0.0050 0.0625 0.3025 0.1225 0.0550 0.0900 0.0625 0.0700 0.0500 0.0025 0.0600 0.0025 0.0350 0.0200 0.0025 0.0025 0.0325 0.0475 0.1775 0.5025 0.1875 0.0450 0.0025 - 0.0425 0.0075 0.0600 0.3325 0.4050 0.1250 0.0275 - 0.0025 0.0275 0.0850 0.3575 0.1400 0.1425 0.0025 0.1150 0.0850 0.0250 0.0150 0.0025 - 0.2350 0.0675 0.3575 0.2250 0.1075 0.0050 0.0025 - 95 Locus/ Alen D1 S1656 D2 S441 D4 S2408 D6 S1043 D9 S1122 D10 S1248 D12 S391 PentaE D17 S1301 D20 S482 PentaD D22 S1045 21.0 22.0 23.0 24.0 25.0 26.0 H(0b) H(exp) HWE PD PE PIC PI 0.7896 0.8150 0.7327 0.9445 0.6272 0.81 2.7 0.7769 0.8450 0.2663 0.9039 0.6850 0.75 3.3200 0.7142 0.7350 0.0783 0.8721 0.4845 0.67 1.89 0.0025 0.8422 0.8442 0.4266 0.9576 0.6835 0.84 3.21 0.7054 0.7500 0.2270 0.8494 0.5098 0.66 2.00 0.7530 0.7850 0.1171 0.8880 0.5715 0.71 2.33 0.1275 0.0975 0.0875 0.0250 0.0175 0.0025 0.8209 0.8600 0.3415 0.9547 0.7147 0.83 3.57 0.0150 0.0025 0.8270 0.7778 1.8389 0.9626 0.5585 0.84 2.25 0.6666 0.7000 0.0770 0.8559 0.4283 0.64 1.67 0.7036 0.7150 0.1032 0.8567 0.4518 0.66 1.75 0.8024 0.7950 0.5178 0.9357 0.5898 0.78 2.44 0.7502 0.5700 0.3342 0.8935 0.2564 0.71 1.16 96 PHỤ LỤC 3: CÁC CHỈ SỐ THỐNG KÊ CỦA 27 LOCUS STR TRÊN NHIỄM SẮC THỂ THƯỜNG TỪ QUẦN THỂ NGƯỜI DÂN TỘC KINH TẠI VIỆT NAM (N = 200) STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 Locus D8S1179 D21S11 D7S820 CSF1P0 D3S1358 TH01 D13S317 D16S539 D2S1338 D19S433 vWA TPOX D18S51 D5S818 FGA D1S1656 D2S441 D4S2408 D6S1043 D9S1122 D10S1248 D12S391 PentaE D17S1301 D20S482 PentaD D22S1045 Số cá thể đồng hợp tử Số cá thể dị hợp tử H(ob) H(exp) 24 25 52 55 65 54 42 46 25 65 47 85 30 46 20 37 31 65 31 50 43 28 42 60 57 41 86 176 175 148 145 135 146 158 154 175 135 153 115 170 154 180 163 169 135 169 150 157 172 158 140 143 159 114 0.8195 0.8132 0.7522 0.6960 0.7357 0.7293 0.7997 0.7788 0.8537 0.7762 0.7932 0.5720 0.8387 0.7907 0.8682 0.7896 0.7769 0.7142 0.8422 0.7054 0.7530 0.8209 0.8270 0.6666 0.7036 0.8024 0.7502 0.8800 0.8737 0.7400 0.7250 0.6750 0.7300 0.7900 0.7700 0.8750 0.8250 0.9650 0.5750 0.8485 0.7700 0.9000 0.8150 0.8450 0.7350 0.8442 0.7500 0.7850 0.8600 0.7778 0.7000 0.7150 0.7950 0.5700 97 HWE 2TT 2LT 0.6855 0.4729 0.2935 0.0992 0.1489 0.1145 0.1300 0.2208 0.5166 0.6918 0.1302 0.0233 0.7707 0.1806 0.5919 0.7327 0.2663 0.0783 0.4266 0.2270 0.1171 0.3415 1.8389 0.0770 0.1032 0.5178 0.3342 2.167 2.733 1.145 1.145 0.711 1.145 1.145 1.635 3.325 2.167 1.635 0.711 3.325 1.145 4.575 3.325 2.167 1.145 3.325 1.145 1.145 3.325 5.226 3.325 1.145 2.733 0.711 PD PE PIC PI 0.9555 0.9498 0.9006 0.8546 0.8890 0.8803 0.9273 0.9132 0.9626 0.9151 0.9267 0.7572 0.9492 0.9211 0.9692 0.9445 0.9039 0.8721 0.9576 0.8494 0.8880 0.9547 0.9626 0.8559 0.8567 0.9357 0.8935 0.7548 0.7421 0.4928 0.4680 0.3907 0.4762 0.5806 0.5446 0.7447 0.6462 0.5358 0.2619 0.6919 0.5446 0.7954 0.6272 0.685 0.4845 0.6835 0.5098 0.5715 0.7147 0.5585 0.4283 0.4518 0.5898 0.2564 0.84 0.83 0.73 0.65 0.69 0.69 0.77 0.74 0.85 0.76 0.76 0.51 0.82 0.76 0.86 0.81 0.75 0.67 0.84 0.66 0.71 0.83 0.84 0.64 0.66 0.78 0.71 4.17 3.96 1.92 1.82 1.54 1.85 2.38 2.17 4.00 2.86 2.13 1.18 3.30 2.17 5.00 2.70 3.32 1.89 3.21 2.00 2.33 3.57 2.25 1.67 1.75 2.44 1.16 ... đáp ứng nhu cầu cấp bách trên, chúng tơi thực đề tài "Nghiên cứu tính đa hình tần suất alen 27 locus STR nhiễm sắc thể thường kit ForenSeq ứng dụng giám định ADN hình Việt Nam" Mục tiêu nghiên cứu. ..BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ Phạm Ngọc Sơn NGHIÊN CỨU TÍNH ĐA HÌNH VÀ TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 27 LOCUS STR TRÊN NHIỄM... liệu tần suất alen 27 locus STR nhiễm sắc thể thường kít ForenSeqTM DNA Signature Prep - Mix A quần thể người dân tộc Kinh Việt Nam để ứng dụng giám định ADN hình - Mục tiêu cụ thể đề tài xác định