1. Trang chủ
  2. » Thể loại khác

Kết quả ngoại kiểm chuẩn xét nghiệm đột biến gen EGFR năm 2014 và 2015 tại Bệnh viện Bạch Mai

11 105 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 11
Dung lượng 295,78 KB

Nội dung

Mục tiêu nghiên cứu của bài viết nhằm chuẩn hóa kỹ thuật và xác định tính chính xác của xét nghiệm đột biến gen EGFR bằng kỹ thuật Strip Assay đang thực hiện tại Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai. Phương pháp: 29 mẫu bệnh phẩm do Mạng lưới Kiểm soát Chất lượng Di truyền học Phân tử châu Âu.

Tạp chí y - dợc học quân số 1-2017 KẾT QUẢ NGOẠI KIỂM CHUẨN XÉT NGHIỆM ĐỘT BIẾN GEN EGFR NĂM 2014 VÀ 2015 TẠI BỆNH VIỆN BẠCH MAI Ph m C m Ph ơng*; Mai Tr ng Khoa*; Nguy n Ti n Lung* TÓM TẮT Mục tiêu: chuẩn hóa kỹ thuật xác định tính xác xét nghiệm đột biến gen EGFR kỹ thuật Strip Assay thực Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai Phương pháp: 29 mẫu bệnh phẩm Mạng lưới Kiểm soát Chất lượng Di truyền học Phân tử châu Âu (The European Molecular Genetics Quality Network - EMQN) Hệ thống Ngoại kiểm Chất lượng Vương quốc Anh (UK National External Quality Assessment Schemes - UK NEQAS) cung cấp năm 2014, 2015 để xác định đột biến gen EGFR kít EGFR StripAssay® (ViennaLab) Các kết gửi trả trực tuyến tổ chức đánh giá, công bố kết Kết quả: 29 mẫu kiểm chuẩn thực cho kết xác với cơng bố EMQN UK NEQAS (đạt 100%) Kết luận: kỹ thuật xét nghiệm sử dụng kít EGFR StripAssay® thiết bị có Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai đảm bảo tiêu chuẩn để phát đột biến gen EGFR Các xét nghiệm có độ xác cao, ổn định, từ cung cấp thơng tin xác cho bác sỹ lâm sàng chẩn đoán lập điều trị cho bệnh nhân (BN) ung thư phổi (UTP) không tế bào nhỏ * Từ khóa: Ung thư phổi khơng tế bào nhỏ; Đột biến gen EGFR; Ngoại kiểm kiểm tra chất lượng xét nghiệm The Results of External Quality Assessment of EGFR Mutations Testing at Bachmai Hospital Summary Objectives: To standardize the technique and assess the realibility of EGFR mutations tests by Strip Assay technique at the Gene Therapy Unit, Bachmai Hospital Methods: 29 samples for external quality assessment which obtained from the European Molecular Genetics Quality Network (EMQN) and UK National External Quality Assessment Schemes (UK NEQAS) from 2014 to 2015 were detected EGFR mutations by EGFR StripAssay® (ViennaLab), these results were submited online and compared with validated results Results: All of samples had same results with publication of EMQN and UK NEQAS (100% efficiency) Conclusion: EGFR mutations tests with EGFR StripAssay® kit and equipment available at the Gene Therapy Unit, Bachmai Hospital ensure the quality to detect EGFR mutations These tests have high accuracy, providing more details for clinicians in diagnosis and treatment of non-small lung cancer management * Key words: Non-small cell lung cancer; EGFR mutation; External quality assessment * Bệnh viện Bạch Mai Ng i ph n h i (Corresponding): Ph m C m Ph ơng (camphuongmd@yahoo.com) Ngày nh n bài: 04/07/2016; Ngày ph n bi n đánh giá báo: 13/12/2016 Ngày báo c ng: 23/12/2016 47 Tạp chí y - dợc häc qu©n sù sè 1-2017 ĐẶT VẤN ĐỀ Ung thư phổi bệnh ung thư phổ biến giới Việt Nam Hiện nay, có nhiều tiến chẩn đoán (sinh học phân tử, tế bào…) điều trị bệnh UTP (phẫu thuật, xạ trị, hóa trị, điều trị đích…), nâng cao hiệu điều trị cải thiện chất lượng sống cho người bệnh Một tiến chẩn đoán xét nghiệm đột biến gen EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor: thụ thể yếu tố phát triển biểu mô) Gen EGFR đóng vai trò quan trọng hoạt động chức phát triển biệt hóa tế bào Đột biến EGFR dẫn đến tăng biểu tăng cường hoạt động EGFR phát nhiều loại bệnh ung thư có UTP Hiện nay, có nhiều bước tiến quan trọng điều trị, đời thuốc điều trị đích (kháng thể đơn dòng, thuốc phân tử nhỏ, ức chế vùng tyrosine kinase [tyrosine kinase inhibitor - TKI] thụ thể yếu tố tăng trưởng biểu mô) sử dụng để điều trị cho BN UTP không tế bào nhỏ Các nghiên cứu giới Việt Nam cho thấy BN có đột biến EGFR có thời gian sống thêm không bệnh tiến triển (progression-free survival - PFS) thời gian sống thêm toàn (overall survival - OS) cao BN khơng có đột biến EGFR điều trị thuốc TKI [1, 2] Vì vậy, xét nghiệm đột biến gen EGFR cho BN UTP không tế bào nhỏ thực cần thiết để bác sỹ lâm sàng lựa chọn phương án điều trị tối ưu cho người bệnh 48 Hiện nay, có nhiều phương pháp khác để xét nghiệm đột biến gen EGFR giải trình tự gen (giải trình tự Sanger pyrosequencing), real time PCR (ví dụ kít therascreen - Qiagen), lai đầu dò (Strip Assay - ViennaLab)… Mỗi phương pháp có ưu nhược điểm riêng: kít therascreen, Strip Assay có độ nhạy cao, phát số lượng đột biến giới hạn theo thiết kế kít; phương pháp giải trình tự có khả phát đột biến mới, gặp, đòi hỏi số lượng tế bào mang đột biến mẫu phân tích lớn [3] Do vậy, phương pháp xét nghiệm cho kết khác mẫu phân tích Vì vậy, việc ngoại kiểm tra chất lượng xét nghiệm có vai trò đặc biệt quan trọng đánh giá khả phát đột biến gen EGFR Nhằm chuẩn hóa kỹ thuật, đồng thời xác định tính xác tính ổn định xét nghiệm đột biến gen EGFR, Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai tham gia đợt ngoại kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm Mạng lưới EMQN Hệ thống UK NEQAS, có trụ sở Thành phố Manchester, Anh ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Đối tượng nghiên cứu 29 mẫu bệnh phẩm UTP không tế bào nhỏ nhận từ EMQN (10 mẫu năm 2014, 10 mẫu năm 2015) UK NEQAS (9 mẫu năm 2015) Các mẫu cố định formalin đúc paraffin (formalin-fixed, paraffin-embedded - FFPE) Tạp chí y - dợc häc qu©n sù sè 1-2017 để làm tiêu HE phân tích đột biến gen EGFR Đây mẫu mù, gửi cho tất phòng thí nghiệm đăng ký tham gia ngoại kiểm, tình trạng đột biến gen EGFR xác định trước từ phòng thí nghiệm chuẩn Phương pháp nghiên cứu * Địa điểm nghiên cứu: Đơn vị Gen Trị liệu, Trung tâm Y học Hạt nhân Ung bướu - Bệnh viện Bạch Mai * Thời gian nghiên cứu: năm 2014 2015 * Phương pháp nghiên cứu: đối chiếu kết phân tích đột biến EGFR Bệnh viện Bạch Mai với kết tổ chức ngoại kiểm * Thiết bị, vật tư, hóa chất: - Thiết bị: thiết bị phòng thí nghiệm sinh học phân tử pipet kèm giá đỡ (Eppendorf Research Plus), máy ly tâm lạnh (Eppendorf 5424R), máy ủ nhiệt kèm lắc rung (Eppendorf Thermomixer comfort), máy định lượng ADN theo nguyên tắc huỳnh quang (Qubit® 2.0 Fluorometer), máy PCR (Eppendorf Mastercycler pro S)… - Hóa chất: kít tách ADN từ mơ FFPE (PureLink® Genomic DNA Mini Kit, Invitrogen), kít định lượng ADN theo nguyên tắc huỳnh quang (Qubit™ dsDNA HS, Molecular Probes), kít xác định đột biến gen EGFR (EGFR StripAssay®, ViennaLab)… - Vật tư tiêu hao: vật tư cần thiết hãng uy tín cung cấp: ống PCR; ống ly tâm 1,7 ml; đầu tip 10, 20, 200, 1.000 µl (Corning); ống Qubit assay (Invitrogen)… * Các bước tiến hành: 29 mẫu bệnh phẩm thực xét nghiệm đột biến EGFR theo quy trình sau: tách ADN từ mơ FFPE (sử dụng kít PureLink® Genomic DNA Mini Kit, Hãng Invitrogen), định lượng ADN (Qubit™ dsDNA HS, Molecular Probes), khuếch đại đoạn gen quan tâm phản ứng PCR lai sản phẩm khuếch đại với đầu dò đặc hiệu (EGFR StripAssay®, ViennaLab), phân tích kết (sử dụng phần mềm StripAssay® Evaluator, ViennaLab) * Đối chiếu kết quả: kết phân tích gửi trực tuyến cho EMQN UK NEQAS Sau đó, tổ chức so sánh kết Bệnh viện Bạch Mai với kết xét nghiệm biết trước, từ phân tích, đánh giá chất lượng xét nghiệm EGFR Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN Kết ngoại kiểm EMQN năm 2014 Việc ngoại kiểm tra chất lượng xét nghiệm có vai trò đặc biệt quan trọng đánh giá khả phát đột biến gen EGFR Nhằm chuẩn hóa kỹ thuật, đồng thời xác định tính xác tính ổn định xét nghiệm đột biến gen EGFR, Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai tham gia đợt ngoại kiểm hai tổ chức kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm uy tin giới: EMQN (từ năm 2014) UK NEQAS (từ năm 2015) 49 T¹p chí y - dợc học quân số 1-2017 Bng 1: Kết phân tích đột biến gen EGFR mẫu kiểm chuẩn EMQN 2014 Mã bệnh phẩm Chẩn đốn Vị trí/phương pháp lấy mẫu Kết EMQN Kết phân tích Đơn vị Gen Trị liệu 01.6127774 UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến 02.6130768 UTP (biểu mô tuyến) Phế quản (sinh thiết) Đột biến L858R (exon 21) Đột biến L858R (exon 21) 03.6153218 UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Đột biến G719S (exon 18) Đột biến G719S (exon 18) 04.6126965 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Không phát đột biến Không phát đột biến 05.6127265 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Không phát đột biến Không phát đột biến 06.6130038 EMQN không cung cấp EMQN khôngcung cấp Không phát đột biến Không phát đột biến 07.6130241 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến E746_A750del (exon 19) Đột biến E746_A750del (exon 19) 08.6126384 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến L861Q (exon 21) Đột biến L861Q (exon 21) 09.6161625 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến L858R (exon 21) Đột biến L858R (exon 21) 10.6161844 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến E746_A750del (exon 19) Đột biến E746_A750del (exon 19) Gen EGFR nằm nhiễm sắc thể 7p11.2, dài khoảng 200 kb, chứa 28 exon Các đột biến liên quan đến đáp ứng với TKI nằm exon từ 18 - 21, đột biến thay exon 18 21, đoạn exon 19 (chiếm chủ yếu) làm tăng độ nhạy với thuốc, đột biến thay T790M số đột biến thêm đoạn exon 20 (chiếm tỷ lệ nhỏ) liên quan đến kháng thuốc Tỷ lệ đột biến EGFR phụ thuộc vào chủng tộc, tình trạng hút thuốc lá, giới…, tỷ lệ đột biến EGFR người chủng tộc châu Á cao chủng tộc châu Âu, châu Mỹ [2, 4] 50 Chúng sử dụng kít EGFR StripAssay® (ViennaLab) để phân tích đột biến gen EGFR Đây kít thiết kế theo nguyên tắc PCR kết hợp lai đầu dò đặc hiệu: giai đoạn PCR sử dụng mồi (primer) đặc hiệu giúp khuếch đại xác với trình tự gen quan tâm Phân tử biotin gắn mồi nhờ đưa vào sản phẩm khuếch đại Ở giai đoạn lai, đoạn ADN khuếch đại kết hợp xác với đầu dò (probe) tương ứng teststrip, phân tử biotin gắn đoạn hoạt hoá streptavidin thnh dng phỏt mu Tạp chí y - dợc học qu©n sù sè 1-2017 Nhờ đó, dễ dàng phát kết cách so màu teststrip, đối chiếu với thang chuẩn mắt thường phần mềm StripAssay® Evaluator Bộ kít có độ nhạy cao, có khả phát số lượng tế bào mang đột biến < 1%, đồng thời cấp chứng tiêu chuẩn xét nghiệm châu Âu áp dụng cho chẩn đoán bệnh (European Conformity In Vitro Diagnostics, CE-IVD) Kít EGFR StripAssay® có khả phát 16 đột biến, chiếm tỷ lệ cao exon 18 - 21 có vai trò đáp ứng điều trị với TKI Hiện nay, chúng tơi chuyển sang sử dụng kít EGFR XL StripAssay® cải tiến từ kít EGFR StripAssay®, số lượng đột biến phát cao (30 đột biến exon 18 - 21) để nâng cao chất lượng xét nghiệm Kết phân tích đột biến gen EGFR 10 mẫu kiểm chuẩn Đơn vị Gen Trị liệu cho kết xác theo công bố EMQN 2014, đạt tỷ lệ 100% Hình 1: Phân tích kết teststrip (Trên teststrip có sẵn vạch control cho phản ứng lai, PCR negative control cho exon [vạch 17 - 20] PCR positive control (vạch 21) làm đối chứng Các vạch - 16 tương ứng với 16 đột biến exon 18 - 21 Mẫu 01.6127774 [trái] không phát đột biến, mẫu 02.6130768 [giữa] phát đột biến L858R exon 21, mẫu 03.6153218 [phải] phát đột biến G719S exon 18) 51 T¹p chÝ y - dợc học quân số 1-2017 Kt ngoại kiểm EMQN năm 2015 Bảng 2: So sánh kết phân tích đột biến gen EGFR mẫu kiểm chuẩn EMQN 2015 Mã bệnh phẩm Chẩn đốn Vị trí/phương pháp lấy mẫu Kết EMQN Kết phân tích Đơn vị Gen Trị liệu 01.6270600 UTP (biểu mô tuyến) Phế quản (sinh thiết) Không phát đột biến Không phát đột biến 02.6266929 UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Đột biến L861Q (exon 21) Đột biến L861Q (exon 21) 03.6270088 UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Đột biến T790M (exon 20) Đột biến T790M (exon 20) 04.6271000 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Không phát đột biến Không phát đột biến 05.6267553 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến L858R (exon 21) Đột biến L858R (exon 21) 06.6271489 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Không phát đột biến Không phát đột biến 07.6266391 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến L858R (exon 21) T790M (exon 20) Đột biến L858R (exon 21) T790M (exon 20) 08.6271739 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Không phát đột biến Không phát đột biến 09.6290622 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến E746_S752delinsV (exon 19) Đột biến E746_S752del-insV (exon 19) 10.6291042 EMQN không cung cấp EMQN không cung cấp Đột biến E746_A750del (exon 19) Đột biến E746_A750del (exon 19) Tương tự EMQN 2014, kết phân tích đột biến gen EGFR 10 mẫu kiểm chuẩn EMQN 2015 Đơn vị Gen Trị liệu cho kết xác theo cơng bố, đạt tỷ l 100% 52 Tạp chí y - dợc học quân sù sè 1-2017 Kết ngoại kiểm UK NEQAS năm 2015 Bảng 3: Kết phân tích đột biến gen EGFR mẫu kiểm chuẩn UK NEQAS 2015 Mã bệnh phẩm Chẩn đốn Vị trí/phương pháp lấy mẫu Kết UK NEQAS Kết phân tích Đơn vị Gen Trị liệu 172L14A UTP (biểu mô tuyến) U phổi (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến 182L14E UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Đột biến L747_P753delinsS (exon 19) Đột biến L747_P753delinsS (exon 19) 192L15D UTP (biểu mô tuyến) Khối di buồng trứng (phẫu thuật) Đột biến G746_P753delinsVS (exon 19) T790M (exon 20) Đột biến T790M (exon 20) 210L15C UTP (biểu mô tuyến) U phổi (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến 211L15C UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến 233L15C UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi trái (phẫu thuật) Đột biến (S768_D770 dup) (;) (P772A) (exon 20) Không phát đột biến 220L15C UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi phải (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến 219L15C UTP (biểu mô tuyến) U phổi (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến 245L15C UTP (biểu mô tuyến) U thùy phổi trái (phẫu thuật) Không phát đột biến Không phát đột biến Kết phân tích đột biến gen EGFR mẫu kiểm chuẩn UK NEQAS 2015 Đơn vị Gen Trị liệu cho kết xác 7/9 mẫu Đối với trường hợp mẫu 192L15D 233L15C, UK NEQAS xác nhận kết phân tích Đơn vị Gen Trị liệu không phát đột biến gặp hạn chế kít xét nghiệm, đánh giá độ xác 100% chất lượng labo Kết ngoại kiểm theo EMQN năm 2014 2015 cho thấy Đơn vị Gen Trị liệu cho kết xác 100% theo cơng bố EMQN Đây kết đáng khích lệ so sánh với kết tổng hợp EMQN, tỷ lệ xét nghiệm lỗi phòng thí nghiệm tham gia ngoại kiểm năm 2014 3,8%, năm 2015 4,2%, tỷ lệ Đơn vị Gen Trị liệu 0% năm Những vấn đề sai sót xảy labo trường hợp đột biến gặp G719S exon 18, E746_S752delinsV exon 19 hay L861Q exon 21 (được khuyến cáo khơng phát kít cobas); hoc mu 53 Tạp chí y - dợc học quân sù sè 1-2017 có tỷ lệ tế bào mang đột biến thấp (như mẫu 2, EMQN 2014 có tỷ lệ < 15%), gây nên âm tính giả sử dụng phương pháp kít xét nghiệm có độ nhạy khơng cao, đặc biệt phương pháp giải trình tự gen [5, 6] Bảng 4: Tổng hợp xét nghiệm lỗi labo tham gia kiểm chuẩn EMQN năm 2014 2015 EMQN 2014 EMQN 2015 Mẫu Số labo gửi kết Số labo xét nghiệm lỗi Tỷ lệ lỗi (%) Mẫu Số labo gửi kết Số labo xét nghiệm lỗi Tỷ lệ lỗi (%) 254 1,1 279 3,2 254 4,3 279 21 11,1 256 11 5,4 279 16 7,5 252 3,2 282 2,9 253 2,4 282 13 4,6 256 3,5 282 2,8 249 2,3 282 11 3,9 256 22 8,5 282 2,8 249 10 4,0 282 10 3,6 10 256 3,5 10 282 22 7,8 Tổng 2543 93 3,8 Tổng 2.811 117 4,2 (Năm 2014 có 277 labo 39 quốc gia ký tham gia, 258 labo hồn thành báo cáo kết Năm 2015 có 290 labo báo cáo kết tổng số 321 labo [ở 47 quốc gia] đăng ký tham gia) Đối với kết ngoại kiểm theo UK NEQAS 2015, Đơn vị Gen Trị liệu thực mẫu bệnh phẩm, cho kết xác 7/9 mẫu Đối với mẫu 192, sử dụng kít EGFR StripAssay®, chúng tơi phát đột biến T790M exon 20, thực tế mẫu có thêm đột biến G746_P753delinsVS exon 19 (đây đột biến gặp, theo sở liệu COSMIC phân tích 141.465 bệnh nhân, đột biến chiếm 0,02% tổng số đột biến) Đột biến phát 54 kít EGFR XL StripAssay® mà sử dụng Trong đó, mẫu 233 mang đồng thời đột biến gặp exon 20: đột biến thêm đoạn S768_D770 (0,02%) đột biến thay P772A (< 0,01%), dạng khơng phát kít EGFR StripAssay® Trong trường hợp này, UK NEQAS xác nhận hạn chế kít xét nghiệm đánh giá độ xác 100% chất lượng labo [7, 8] Tạp chí y - dợc học quân sè 1-2017 Bảng 5: Tổng hợp xét nghiệm lỗi labo tham gia kiểm chuẩn UK NEQAS năm 2015 STT Mẫu Số labo gửi kết Số labo xét nghiệm lỗi Tỷ lệ lỗi (%) 172 100 7,0 182 100 5,0 192 100 11 11,0 210 100 2,0 211 100 1,0 233 100 20 20,0 220 100 2,0 219 100 5,0 245 100 2,0 900 55 6,1 Tổng số (Có 100 labo báo cáo kết tổng số 105 labo đăng ký tham gia) Hiện nay, có nhiều phương pháp khác để xét nghiệm đột biến gen EGFR giải trình tự gen (giải trình tự Sanger pyrosequencing), real time PCR (ví dụ kít therascreen - Qiagen, cobas Roche), lai đầu dò (Strip Assay ViennaLab)… Mỗi phương pháp có ưu nhược điểm riêng: kít therascreen, cobas, Strip Assay có độ nhạy cao, có chứng IVD, phát số lượng đột biến giới hạn theo thiết kế kít (thường dạng đột biến phổ biến, với tổng tỷ lệ xuất chiếm > 95%); phương pháp giải trình tự có khả phát đột biến mới, gặp, đòi hỏi số lượng tế bào mang đột biến mẫu phân tích lớn, đồng thời kết xét nghiệm phụ thuộc nhiều vào kỹ thuật viên (thiết kế mồi, thao tác thực hiện, nhận định kết quả) [3] Thực tế qua kết tổng kết đợt ngoại kiểm cho thấy: số dạng đột biến gặp khơng phát kít thương mại L861Q exon 21 (không phát kít cobas - Roche), thêm đoạn exon 20 (đối với kít therascreen - Qiagen, Strip Assay ViennaLab); phương pháp giải trình tự gen cho kết âm tính giả mẫu có tỷ lệ tế bào mang đột biến thấp, ngồi chất lượng xét nghiệm khơng ổn định [5, 6, 7, 8] 55 T¹p chÝ y - dợc học quân số 1-2017 Bng 6: u, nhc điểm số phương pháp phát đột biến gen EGFR [3] Giải trình tự Sanger Giải trình tự pyrosequencing Therascreen Strip Assay Khơng Khơng Có Có Giới hạn phát 25 - 30% - 10% 1% < 1% Thời gian trả kết - 1/2 Thời gian thực giờ giờ Số xét nghiệm tối thiểu lần chạy phản ứng phản ứng phản ứng phản ứng Khả phát đột biến gặp Có Có Khơng Khơng Hệ thống giải trình tự Sanger Hệ thống pyrosequencing Hệ thống real time PCR Hệ thống PCR Phương pháp Chứng CE - IVD Thiết bị chuyên dụng cần thiết KẾT LUẬN Qua nghiên cứu 29 mẫu bệnh phẩm UTP không tế bào nhỏ thực ngoại kiểm xét nghiệm EGFR Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai năm 2014 2015 cho thấy: L i c m ơn: Nhóm nghiên cứu xin chân thành cảm ơn Cơng ty Roche AstraZeneca hỗ trợ đăng ký tham gia kiểm chuẩn xét nghiệm đột biến gen EGFR TÀI LIỆU THAM KHẢO - Kỹ thuật xét nghiệm sử dụng kít EGFR StripAssay® thiết bị có Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai đảm bảo tiêu chuẩn để phát đột biến gen EGFR Tạ Thành Văn Nghiên cứu xác định đột biến gen định tính đáp ứng thuốc điều trị ung thư đại trực tràng UTP Đề tài Khoa học cấp Nhà nước KC.04.06/11-15 Bộ Khoa học Công nghệ 2014 - 27/29 mẫu ngoại kiểm cho kết xác, mẫu lại mang đột biến gặp khơng có thiết kế kít, tổ chức ngoại kiểm đánh giá labo Đơn vị Gen Trị liệu cho kết xác 100% Shi Y, Au J.S, Thongprasert S, Srinivasan S, Tsai CM, Khoa M T et al A prospective, molecular epidemiology study of EGFR mutations in Asian patients with advanced non-small-cell lung cancer of adenocarcinoma histology (PIONEER) J Thorac Oncol 2014, (2), pp.154-162 Như vậy, xét nghiệm đột biến gen EGFR thực Bệnh viện Bạch Mai có độ xác ổn định cao Từ đó, cung cấp thêm thơng tin đáng tin cậy cho bác sỹ lâm sàng điều trị UTP không tế bào nhỏ Jancik S, Drabek J et al A comparison of direct sequencing, pyrosequencing, high resolution melting analysis, TheraScreen DxS, and the K-ras Strip Assay for detecting KRAS mutations in non small cell lung carcinomas Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 2012, 31, pp.79-91 56 T¹p chí y - dợc học quân số 1-2017 Cheng L, Alexander R.E et al Molecular pathology of lung cancer: key to personalized medicine Modern Pathology 2012, 25 (3), pp.347-369 The European Molecular Genetics Quality Network EMQN External Quality Assessment Scheme for Lung Cancer, 2014 EMQN Online Manchester, UK 2014 The European Molecular Genetics Quality Network EMQN External Quality Assessment Scheme for Lung Cancer, 2015 EMQN Online Manchester, UK 2015 UK National External Quality Assessment Schemes External Quality Assessment Scheme 2015 - 2016, Molecular genetic analysis of non-small cell lung cancer Scheme Report - Run UK NEQAS Online Manchester, UK 2015 UK National External Quality Assessment Schemes External Quality Assessment Scheme 2015 - 2016, Molecular genetic analysis of non-small cell lung cancer Scheme Report - Run UK NEQAS Online Manchester, UK 2016 57 ... sánh kết Bệnh viện Bạch Mai với kết xét nghiệm biết trước, từ phân tích, đánh giá chất lượng xét nghiệm EGFR Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN Kết ngoại kiểm. .. xét nghiệm đột biến gen EGFR, Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai tham gia đợt ngoại kiểm hai tổ chức kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm uy tin giới: EMQN (từ năm 2014) UK NEQAS (t nm 2015) 49... gia kiểm chuẩn xét nghiệm đột biến gen EGFR TÀI LIỆU THAM KHẢO - Kỹ thuật xét nghiệm sử dụng kít EGFR StripAssay® thiết bị có Đơn vị Gen Trị liệu, Bệnh viện Bạch Mai đảm bảo tiêu chuẩn để phát đột

Ngày đăng: 23/01/2020, 18:32

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w