Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng và xác định gen kháng thuốc của phế cầu, hemophilus influenzae và moracella catarrhalis gây viêm phổi ở trẻ 6 tuổi tại bệnh viện nhi đồng cần thơ

MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ TỔNG QUAN 1.1 .Thuật ngữ bệnh 1.1.1 Theo hình thái tổn thương 1.1.2 Theo nguyên gây bệnh 1.1.3 Theo hoàn cảnh mắc bệnh 1.2 .Dịch tễ học 1.2.1 Dịch tễ học chung viêm phổi 1.2.2 Dịch tễ học viêm phổi phế cầu 11 1.2.3 Dịch tễ học viêm phổi Haemophilus influenzae 14 1.2.4 Dịch tễ học viêm phổi Moraxella catarrhalis 17 1.2.5Tình hình kháng kháng sinh vi khuẩn phế cầu, Haemophilus influenza Moracella catarrhalis .18 1.3 .Đặc điểm lâm sàng viêm phổi 25 1.4 Đặc điểm cận lâm sàng 26 1.4.1 Các xét nghiệm chẩn đốn hình ảnh 26 1.4.2 .Xét nghiệm dịch thể 28 1.4.3 Các xét nghiệm dịch thể khác 30 1.5 Chẩn đoán 31 1.5.1 Chẩn đoán lâm sàng 31 1.5.2 Chẩn đoán tác nhân gây bệnh 32 1.5.3 .Chẩn đoán mức độ 33 1.6 Cơ chế kháng kháng sinh vi khuẩn 33 1.6.1 Thay đổi phân tử kháng sinh 34 1.6.2 Thay đổi hóa học kháng sinh 34 1.6.3 Phá hủy phân tử kháng sinh 34 1.6.4 Giảm tính thấm 35 1.6.5 Bơm đẩy 36 1.6.6 Thay đổi mục tiêu đích 37 1.6.7 Sự kháng kháng sinh xuất đề kháng 38 1.7 Một số nghiên cứu gene kháng thuốc chủng vi khuẩn phế cầu, Haemophilus influenza Moracella catarrhalis 39 TÀI LIỆU THAM KHẢO DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1: Ước tính tỷ lệ mắc số trường mắc năm viêm phổi lâm sàng trẻ em tuổi, theo khu vực WHO* .6 Bảng 2: 15 quốc gia có tỉ lệ viêm phổi mắc ước tính cao Bảng 3: 15 quốc gia có tỉ lệ tử vong cao Thế giới viêm phổi Bảng 4: Các yếu tố nguy gây viêm phổi cộng đồng nước phát triển 10 Bảng 5: Các yếu tố làm tăng nguy nhiễm phế cầu 13 Bảng 6: Độ nhạy H.influenzae với nhóm thuốc kháng sinh qua năm từ 2000 đến 2012 20 Bảng 7: Kháng sinh đồ Morraxella catarrhalis Mỹ 2008-2010 22 Bảng 8: Kháng sinh đồ phế cầu 23 Bảng 9: Kết kháng sinh đồ H.influenzae 24 Bảng 10: Các mẫu kháng thuốc typ huyết 138 chủng phế cầu từ mũi họng trẻ khỏe mạnh 40 DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1: Tỉ lệ viêm phổi trẻ em Thế giới .5 Hình 2: Tỉ lệ tử vong phế cầu Thế giới trẻ từ – 59 tháng tuổi 11 Hình 3: 10 quốc gia có tỉ lệ tử vong trẻ < tuổi phế cầu cao Thế giới 12 Hình 4: Tỉ lệ tử vong Thế giới trẻ μg / ml), 268 (94,7%) dương tính với gene TEM-1, (3,2%) gene ROB-1, ( 1,4%) cho hai gien (0,7%) hai gene Các ampicillin MICs cho chủng thể β-lactamase mã hoá ROB-1 16 đến 256 μg / ml Trong nghiên cứu này, việc sản xuất β-lactamase mã hoá TEM-1 chế kháng ampicillin phổ biến H influenza Các trình tự nucleotide gen ftsI xác định cho 33 dòng BLNAR 28 chủng BLPACR xác định cách sử dụng sàng lọc kiểu hình trình tự nucleotide chúng so sánh với chuỗi nhạy cảm với ampicillin Sự thay axit amin PBP3 suy dòng BLNAR Trong số 33 mẫu phân lập BLNAR, thay đổi Asp350Asn, Met377Ile, Ala502Val / Thr, Asn526Lys tìm thấy nhiều xác định 13 mơ hình đột biến khác Hầu hết chủng BLNAR (26 chủng, 78,8% tổng số chủng BLNAR) 54 thuộc nhóm II, định nghĩa thay Asn526Lys Hơn nữa, 26 phân lập nhóm II chia thành bốn phân nhóm: IIa (n = 3), IIb (n = 10), IIc (n = 10), IId (n = 3) Đặc điểm thay Arg517His nhóm I quan sát thấy ba mẫu phân lập BLNAR (9,1%) Đặc biệt, phân lập BLNAR nhóm III, có bốn thay đồng thời (Met377Ile, Ser385Thr, Leu389Phe Asn526Lys) [ CITATION Son09 \l 1033 ] Moraxella catarrhalis nguyên nhân gây viêm phổi phổ biến, cư trú đường hô hấp Máy bơm đẩy nhiều lần có vai trò chế kháng kháng sinh độc lực nhiều sinh vật Vai trò máy bơm dòng chảy AcrAB-OprM kháng thuốc kháng sinh nghiên cứu cách tạo đột biến thiếu gen acrA, acrB oprM M catarrhalis, chủng O35E Kết cho thấy giảm MICs amoxicillin cefotaxime trung bình (1,5 lần) giảm clarithromycin (4.7 lần) đột biến acrA, acrB oprM so với chủng O35E hoang dã Sự tiếp xúc chủng M catarrhalis O35E 300 amoxicillin làm tăng phiên mã tất gen bơm AcrAB-OprM, phơi nhiễm chủng O35E, 300, 415 clarithromycin làm tăng biểu mRNA acrA oprM Việc ngưng hoạt động gen bơm thải AcrABOprM cho thấy khả xâm lấn tế bào biểu mô giảm xuống Kết luận rằng, bơm AcrAB-OprM đóng vai trò kháng kháng sinh độc lực M catarrhalis [ CITATION Vio15 \l 1033 ] 55 Hầu tất chủng Moraxella catarrhalis kháng thuốc kháng sinh β-lactam Các enzim chịu trách nhiệm kháng khuẩn này, BRO-1 BRO-2, lipoprotein chế mà chúng tiết với periplasm tế bào M.catarrhalis Các phân tích gen so sánh xác định sản phẩm gen M catarrhalis tương tự protein TatA, TatB, TatC Twin Arginine Translocation (TAT) Các đột biến gen M catarrhalis tatA, tatB tatC cho thấy protein cần thiết cho phát triển tối ưu kháng lại β-lactam Sự đột biến chỗ sử dụng để thay dư lượng arginine kép bảo tồn cao chuỗi tín hiệu dự đốn chủng M.35 cracrhalis O35E BRO-2, loại bỏ kháng kháng sinh carbamaillin β-lactam [ CITATION Rac13 \l 1033 ] TÀI LIỆU THAM KHẢO Igor Rudan, Cynthia Boschi-Pinto, Zrinka Biloglav, Kim Mulholland, Harry Campbell, "Epidemiology and etiology of childhood pneumonia," Bulletin of the World Health Organization, no 86, pp 408-416, 2008 T A Tuấn, "Bệnh Viêm Phổi Trẻ Em," Hội Hơ Hấp Thành Phố Hồ Chí Minh, 2015 Gamal Agmy,1 Sherif Farghally, Hamdy Mohamed,1 Mohammedin Yaser and Gad, Hebba Esam Rashed, "Bacterial Profile, Antibiotic Sensitivity and Resistance of Lower Respiratory Tract Infections Mediterr J Hematol Infect Dis, 2013 in Upper Egypt," 56 Le TM, Baker S, Le TP, Le TP, Cao TT, Tran TT, Nguyen VM, Campbell JI, Lam MY, Nguyen TH, Nguyen VV, Farrar J, Schultsz C, ", High prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance determinants incommensal members of the Enterobacteriaceae in Ho Chi Minh City, Vietnam.," J Med Microbiol, no 58, pp 1585-92, 2009 T Quỵ, "Đặc điểm giải phẫu sinh lý phận hô hấp trẻ em, Viêm phế quản phổi," Bài giảng Nhi khoa, Nhà xuất y học, vol 1, pp 274-279, 302-307, 2009 B Y Tế, Hướng dẫn chẩn đoán điều trị số bệnh thường gặp trẻ em, Hà Nội, 2015 Murphy SL, Kochanek KD, Jiaquan X et al., "Deaths: Final Data for 2012.," Natl Vital Stat Rep, p 63, 2015 Nicola Principi and Susanna Esposito, "Biomarkers in Pediatric Community-Acquired Pneumonia," International Journal of Molecular Sciences, vol 18, p 447, 2017 UNICEF/WHO, "Pneumoniae - The forgotten killer of the children," 2006 10 B Y tế, "Sử dụng kháng sinh điều trị viêm phổi công đồng trẻ em," Bác sĩ nội trú, 2015 11 Ian C Michelow, Kurt Olsen, Juanita Lozano, Nancy K Rollins, Lynn B Duffy,Thedi Ziegler, Jaana Kauppila, Maija Leinonen and George H McCracken, Jr , "Epidemiology and Clinical Characteristics of Community-Acquired Pneumoniain Hospitalized Children," Pediatrics, no 113, pp 701-707, 2009 12 Phạm Thu Hiền, Đào Minh Tuấn, Đỗ Thị Hậu, Nguyễn Phong Lan, Trần Quang Bình, Phan Lê Thanh Hương, "Căn nguyên gây viêm phổi trẻ em tuổi điều trị bệnh viện 57 Nhi Trung ương," Tạp chí y học dự phòng, vol 8, no 157, p 65, 2014 13 Katherine L O’Brien, Lara J Wolfson, James P Watt, Emily Henkle, Maria Deloria-Knoll, Natalie McCall, Ellen Lee, Kim Mulholland, Orin S Levine, "Burden of disease caused by Streptococcus pneumoniae inchildren younger than years: global estimates," The lancet, vol 374, pp 893-902, 2009 14 Elain I Tuomanen MD, Sheldon L Kaplan MD, "Pneumococcal pneumonia in children," Up to date, 2011 15 Đặng Đức Anh, Trần Văn Nam cs, "Tỉ lệ mắc bệnh phế cầu trẻ tuổi nhập viện Thành phố Hải Phòng," Đề tài nghiên cứu cấp Bộ - Viện Vệ Sinh Dịch Tế Trung Ương, pp 30-41, 2008 16 N V Bàng, "Đánh giá kháng kháng sinh chủng vi khuẩn phân lập từ trẻ viêm phổi điều trị khoa Nhi bệnh viện Bạch Mai," Tạp chí Nhi khoa, vol II, no 3, pp 55-60, 2009 17 Đào Minh Tuấn, Đặng Thị Thu Hằng, Nguyễn Thị Ngọc Trân cộng sự, "Nghiên cứu nguyên gây viêm phổi trẻ em tính kháng kháng sinh vi khuẩn gây viêm phổi trẻ em từ tháng đến 15 tuổi," Tạp chí Y học Việt Nam, pp 14-20, 2013 18 WHO, "Haemophilus influenzae type B (HiB).," WHO fact sheet no 294, 2005 December 19 Lê Thị Hồng Hanh, Lê Thị Minh Hương, Nguyễn Duy Bộ, "Đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng viêm phổi Haemophilus influenzae tính kháng kháng sinh," Tạp chí y học dự phòng, 2017 58 20 R Daum, "Haemophilus influenzae," in Nelson Textbook of Pediatrics,19 th Edition., 2011 21 ames P Watt, Lara J Wolfson, Katherine L O’Brien, Emily Henkle, Maria Deloria-Knoll, Natalie McCall, Ellen Lee, Orin S Levine, Rana Hajjeh,Kim Mulholland, Thomas Cherian, "Burden of disease caused by Haemophilus influenzae type b in children younger than years: global estimates," The Lancet, vol 374, pp 903-911, 2009 22 Batmunkh Nyambat, Duc Anh Dang, Hien Anh Nguyen, Trinh Quynh Mai, Manju Rani, Mary PE Slack and Paul E Kilgore, "Rapid assessment of Hib disease burden in Vietnam," BMC Public Health, no 11, p 260, 2011 23 WANG, YA-JUAN MD; VUORI-HOLOPAINEN, ELINA MD; YANG, YONGHONG MD; WANG, YATING MD; HU, YUNWEN MD; LEBOULLEUX, DIDIER MD; HEDMAN, KLAUS MD; LEINONEN, MAIJA PhD; PELTOLA, HEIKKI MD, "Relative frequency of Haemophilus influenzae type b pneumonia in Chinese children as evidenced by serology," Pediatric Infectious Disease Journal, vol 21, no 4, pp 271-277, 2002 24 Zhu, H., et al, " Nasopharyngeal carriage and antimicrobial susceptibility of Haemophilus influenzae among children younger than years of age in Beijing, China.," BMC Micribiol, p 6, 2015 25 Trần Thanh Tú and Ngô Thị Phương Nga, "Mức độ nhạy cảm kháng sinh đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng viêm phổi vi khuẩn Haemophilus influenzae trẻ em.," Nghiên cứu lâm sàng, no 80, pp 153-158, 2012 26 Hồ Sỹ Công, "Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng 59 viêm phổi vi khuẩn trẻ em tuổi khoa Nhi bệnh viên Bạch Mai," Luận văn tốt nghiệp thạc sỹ y học, pp 51-59, 2011 27 Raheleh Sheikhi, Mansour Amin, Soodabeh Rostami, Saeed Shoja and Nasim Ebrahimi, "Oropharyngeal Colonization With Neisseria lactamica, Other Nonpathogenic Neisseria Species and Moraxella catarrhalis Among Young Healthy Children in Ahvaz, Iran," Jundishapur J Microbio, 2015 28 Dabin Ren, PhD MD, Research Scientist and Michael E Pichichero, MD, Director, "Vaccine targets against Moraxella catarrhalis," Expert Opin Ther Targets, pp 1933, 2016 29 HEISKANEN-KOSMA, TARJA MD; KORPPI, MATTI MD; JOKINEN, CAMILLA MD; KURKI, SEIJA MD; HEISKANEN, LEENA MD; JUVONEN, HELVI MD; KALLINEN, SAKARI MD; STÉN, MARJA MD; TARKIAINEN, AIRI MD; RÖNNBERG, PIRJORIITTA RN; KLEEMOLA, MARJAANA MD; MÄKELÄ et al, "Etiology of childhood pneumonia: serologic results of a prospective, population-based study," Pediatric Infectious Disease Journal, vol 17, no 11, pp 986-991, 1998 30 Carolyn M Kercsmar , "Pneumonia," Nelson Essentials of Pediatrics, Elsevier, pp 356-458, 2005 31 Gotoh, K et al, "Prevalance of Hemophilus Influenzae with resistant genes isolated from young children with acute lower respiratory tract infections in Nha Trang, Vietnam," J Infect Chemother, vol 3, no 14, pp 349-53, 2008 32 M e a Pfaller, " AWARE Ceftaroline Surveillance Program 60 (2008-2010): trends in resistance patterns among Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, and Moraxella catarrhalis in the United States.," Clin Infect Dis, no 3, pp 187-93, 2012 33 H e a Zhu, "Nasopharyngeal carriage and antimicrobial susceptibility of Haemophilus influenzae among children younger than years of age in Beijing, China.," BMC Microbiol, no 15, p 6, 2015 34 Safia Bader Uddin Shaikh, Zafar Ahmed, Syed Ali Arsalan, and Sana Shafiq, "Prevalence and resistance pattern of Moraxella catarrhalis in community-acquired lower respiratory tract infections," Infect Drug Resist, no 8, pp 263-267, 2015 35 Đ M T v c sự, "Nghiên cứu nguyên nhân gây viêm phổi trẻ em tính kháng kháng sinh vi khuẩn gây viêm phổi trẻ em từ tháng đến 15 tuổi," Tạp chí y học Việt Nam, pp 14-20, 2013 36 Lê Thị Hồng Hanh, Lê Thị Minh Hương, Nguyễn Duy Bộ, "Đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng viêm phổi Haemophilus influenzae, xác định tính kháng kháng sinh haemophilus influenzae," Tạp chí y học thực hành, 2016 37 N V Thành, "Viêm phổi cộng đồng: Tình hình kháng thuốc vi khuẩn gây bệnh phổ biến điều trị kháng sinh," Hội nghi hô hấp Thành phố Hồ Chí Minh, 2015 38 Grant CC., Pati A., Tan D., Volgel, "Ethnic comparisons of disease severity in chidren hospitalized with pneumonia in 61 New Zealand," J Pediatr Child Health, pp - 24, 2001 39 Phạm Văn Thắng, Nguyễn Chấn, "Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng nguyên nhân gây viêm phế quản phổi trẻ suy dinh dưỡng nặng qua cấy dịch họng - phế quản," Kỷ yếu cơng trình NCKH, 1995 40 Đào Minh Tuấn, "Viêm phế quản phổi tái diễn trẻ em: Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng số nguyên nhân qua nội soi phế quản," Luận án Tiến sĩ y học, Trường Đại học Y Hà Nội, pp 49, 60, 71, 99, 127, 131, 2002 41 Palafox M, "Diagnostic value of tarchypnoea in pneumoniae defined radiologically," Arch Dis Child, pp 41 - 45, 2000 42 N T H Nga, "Đặc điểm lâm sàng, nguyên tính kháng kháng sinh vi khuẩn gây viêm phổi trẻ em bệnh viện Nhi Trung Ương năm 2013," Luận văn bác sĩ chuyên khoa cấp II, 2013 43 V R, "Differentiation of bacterial and viral pneumonia in children," Thorax, no 57, pp 151 -169, 2002 44 Sandora TJ, Harper MB, "Pnemonia in hospitalized children," Pediatr Clin North Am, vol 52, p 1059, 2005 45 Shah SS, Dugan MH, Bell LM, et al, "Blood cultrures in the emergency department evaluation of chidlhood pneumonia," Pediatr Infect Dis J, vol 30, p 475, 2011 46 Flood RG, Badik J, Aronoff SC, "The Utility of Serum C reactive Protein in Differentiating Bacterial from Nonbacteria Pneumonia in Children: a Meta-analysis of 1230 Children," Pediatr Infect Dis J, vol 27, p 95, 2008 47 Schutzle H, Forste J, Superti-Furga A, et al, "Is Serum Proclcitonin a Reliable Dignostic Marker in Children with 62 Acute Respiratory tract Infection?," Eur J Pediatr, vol 168, p 1117, 2009 48 W J B MD, "Clinical features and diagnosis of community- acquired pneumonia in children," Up to date, 2011 49 M D Tarzi, S Grigoriadou, S B Carr,L M Kuitert, H J Longhurst, "Clinical Immunology Review Series: An approach to the management of pulmonary disease in primary antibody deficiency," Clinical and Experimental Immunology, vol 155, pp 147-155, 2008 50 Silvia Montella, Adele Corcione and Francesca Santamaria, "Recurrent Pneumonia in Children: A Reasoned Diagnostic Approach and a Single Centre Experience," Int J Mol Sci, vol 18, p 296, 2017 51 WHO, "Acute Rerpiratory Infection in Children," 2007 52 WHO, "Cough or dificult breathing," Pocketbook of Hospital care for children, pp 73 - 78, 2005 53 B Y tế, "Dược thư quốc gia," 2002 54 Jose M Munita and Cesar A Arias, "Mechanisms of Antibiotic Resistance," Microbiol Spectr, PMC, 2016 55 Izabela Korona-Glowniak, Radoslaw Siwiec, and Anna Malm, "Resistance Determinants and Their Association with Different Transposons in the Antibiotic-Resistant Streptococcus pneumoniae," BioMed Research Internationa, 2015 56 Sedigheh Rafiei Tabatabaei,1 Mohammad Rahbar, Ali Nazari Alam, Fatemeh Fallah, Ali Hashemi, "Detection of pbp2b Gene and Antimicrobial Susceptibility Pattern of Streptococcus Pneumoniae Isolates in Tehran Hospitals, 63 Iran," Arch Pediatr Infect Dis, p 5(1):e38891, 2017 57 Songmee Bae, Jaehoon Lee, Jaehwa Lee, Eunah Kim, Sunhwa Lee, Jaeyon Yu and Yeonho Kang, "Antimicrobial Resistance in Haemophilus influenzae Respiratory Tract Isolates in Korea: Results of a Nationwide Acute Respiratory Infections Surveillance," Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2009 58 Violeta Spaniola, Sara Bernharda and Christoph Aebia., "Moraxella catarrhalis AcrAB-OprM Efflux Pump Contributes to Antimicrobial Resistance and Is Enhanced during Cold Shock Response," Antibmicrobial Agents and Chemotherapy, 2015 59 Rachel Balder, Teresa L Shaffer and Eric R Lafontaine, "Moraxella catarrhalis uses a twin-arginine translocation system to secrete the β-lactamase BRO-2," BMC Microbiology, 2013 60 J Anthony G Scott, W Abdullah Brooks, J.S Malik Peiris, Douglas Holtzman and E Kim Mulhollan, "Pneumonia research to reduce childhood mortality in the developing world," J Clin Invest, pp 1290-1300, 2008 61 M William J Barson, "Epidemiology, pathogenesis, and etiology of pneumonia in children," Up to date, 2011 62 M William J Barson, "Common Causes Pnemonia Child," Up to date, 2011 63 Thomas Bénet1,Mariam Sylla, Mélina Messaoudi, Valentina Sánchez Picot, Jean-Noël Telles, Abdoul-Aziz Diakite, Souleymane Diallo., "Etiology and Factors Associated with Pneumonia in Children under Years of Agein Mali: A Prospective Case-Control Study," PMCID: PMC4687909, 64 2015 64 Pelton SL, Hammerschlag MR, "Overcoming current obstacles in the management of bacteria communityacquired pneumonia in ambulatory children," Clin Pediatr (Phila), no 44, p 1, 2005 65 Hageman JC, Uyeki TM, Hulten KG, Francis JS, et al, "Severe community-acquired pneumonia clue to Staphylococcus aures," Emerg Infect Dis, no 12, p 894, 2006 66 Lê Văn Phủng, Lê Huy Chính, Đinh Hữu Dung, "Vi khuẩn y học," Nhà xuất y học, 2009 67 Kyu Han Lee, Aubree Gordon and Betsy Foxman, "Role of respiratory viruses in the etiology of bacterial pneumonia," Evolution, Medicine, and Public Health, p 95–109, 2016 68 Nguyễn Văn Kính cộng sự, "Báo cáo sử dụng kháng sinh kháng kháng sinh 15 bệnh viện Việt Nam năm," Hợp tác toàn cầu kháng kháng sinh – GARP-Việt Nam, 2009 ... Hemophilus influenzae Moracella catarrhalis gây viêm phổi trẻ < tuổi Bệnh viện nhi đồng Cần Thơ với mục tiêu: Mô tả đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng trẻ bị viêm phổi tháng đến 60 tháng tuổi Xác định. .. xác định gen kháng thuốc giúp cải thiện tình trạng kháng kháng sinh vơ cần thiết Vì vậy, chúng tơi thực đề tài: Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng xác định gen kháng thuốc phế cầu, Hemophilus. .. thùy phổi Viêm phổi định nghĩa chung trình viêm tác nhân nhi m trùng gây tổn thương nhu mô phổi 1.1.2Theo nguyên gây bệnh Viêm phổi chia thành  Viêm phổi vi khuẩn  Viêm phổi virus  Viêm phổi