Vai trò của phòng xét nghiệm trong giám sát và điều tra vụ dịch

BỘ Y TẾ VIỆN PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH Vai trò phòng xét nghiệm giám sát điều tra vụ dịch PGS.TS.BS Vũ Thị Quế Hương Viện Pasteur TP.HCM Lớp Sinh viên Y học Dự phòng – ĐHYD TP.HCM, TP.HCM – 10/2014 E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Mục tiêu giảng • Hiểu đƣợc vai trò PXN giám sát dịch bệnh truyền nhiễm, • Nắm đƣợc nhóm hội chứng bệnh dịch, tác nhân vi sinh gây bệnh, bệnh phẩm tƣơng ứng, • Biết đƣợc nguyên tắc phƣơng pháp chẩn đoán PXN bệnh truyền nhiễm • Biết đƣợc yếu tố ảnh hƣởng đến kết XN E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Bài tập Trong giám sát điều tra dịch bệnh truyền nhiễm (BTN), theo bạn cần đến hoạt động phòng xét nghiệm (PXN)? E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Vai trò giám sát bệnh PXN - Trƣớc dịch xảy - Trong vụ dịch - Sau vụ dịch E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Vai trò giám sát bệnh PXN Trước dịch xảy • Cảnh báo sớm • Phát dịch Trong vụ dịch • Đáp ứng – xử lý dịch E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E QUY TRÌNH CẢNH BÁO SỚM DỊCH BỆNH TRUYỀN NHIỄM ĐN ca bệnh ngƣỡng cảnh báo dịch Thu thập, xử lý thông tin E P I D E M I C A L E R T Báo cáo A N D R E S P O N S E Điều tra dịch (dịch tễ XN) PXN cảnh báo sớm - Phát tác nhân có nguy lan rộng (ca H5N1) - Tình đặc biệt: • Phân lập đƣợc chủng có nguy gây dịch (Chủng Salmonella non-typhi từ trẻ sơ sinh phòng hồi sức, chủng Vibrio cholerae Noncoaggulase gây nhiễm trùng huyết) • Bùng phát chủng đa kháng thuốc Bệnh viện/cộng đồng (Vi khuẩn Lao đa kháng) E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E PXN phát vụ dịch - Xác định hàng loạt ca: • Nhiễm trùng với tác nhân bất thƣờng • Một loại tác nhân đặc hiệu – Chủng kháng thuốc – Subtypes tác nhân (DEN 2) - Các PXN chuẩn thức khu vực phát dịch lan truyền khu vực E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E PXN xác định tác nhân gây dịch - Dịch tễ: phát gia tăng tỉ lệ mắc ca bệnh - PXN: • Xác định chẩn đoán • Giúp định nghĩa ca bệnh xác • Phát tác nhân • Cung cấp thêm thông tin tác nhân gây bệnh E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Vai trò giám sát bệnh PXN Trước dịch xảy • Các dấu hiệu cảnh báo sớm • Phát dịch Trong vụ dịch • Đáp ứng – xử lý dịch E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E PHẢN ỨNG NNKHC PHẢN ỨNG ELISA Antigen cọnjugate Add substrate PHẢN ỨNG MDHQ E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E PHẢN ỨNG PRNT PHẢN ỨNG rRT-PCR E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) • Phân tích mối liên hệ di truyền chủng vi khuản E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E CHIẾN LƯỢC XÉT NGHIỆM THEO DỊCH BTN Bài tập 3: Xét nghiệm sàng lọc gì? Cho ví dụ? Xét nghiệm khẳng định gì? Cho ví dụ? E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E 1- DỊCH TIÊU CHẢY CẤP (ví dụ: tả, ETEC, Rotavirus) a XÉT NGHIỆM SÀNG LỌC 1) ELISA (IgG) b XÉT NGHIỆM XÁC ĐỊNH 1) ELISA (IgM, kháng nguyên) 2) Nuôi cấy định danh 3) PCR E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E DỊCH VIÊM GAN/VÀNG DA CẤP a XÉT NGHIỆM SÀNG LỌC 1) ELISA (IgG): VG A/E 2) Vi ngƣng kết (IgG): Leptospira b XÉT NGHIỆM XÁC ĐỊNH 1) ELISA (IgM): VG A/E 2) Vi ngƣng kết (IgM): Leptospira 3) Cấy máu/PCR: Leptospira 4) Soi kính trực tiếp: Leptospira E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E 3- DỊCH VIÊM NÃO – MÀNG NÃO CẤP (Ví dụ: vi-rút VNNB, VRĐR, não mô cầu…) a XÉT NGHIỆM SÀNG LỌC IFA (IgG) ELISA (IgG) HI (IgG) b XÉT NGHIỆM XÁC ĐỊNH ELISA (IgM) Nuôi cấy vi sinh/RT-PCR Phản ứng trung hòa E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E 4- DỊCH SỐT/SỐT XUẤT HUYẾT CẤP (ví dụ: dengue, hantaan, Rickettsia) A XÉT NGHIỆM SÀNG LỌC 1) Phản ứng ngăn ngƣng kết hồng cầu (IgG) 2) ELISA/IFA (IgG) B XÉT NGHIỆM XÁC ĐỊNH 1) ELISA (IgM, kháng nguyên) 2) Nuôi cấy phân lập định danh 3) RT-PCR/rRT-PCR 4) Phản ứng trung hòa E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E DỊCH HÔ HẤP CẤP (Ví dụ: Cúm) a XÉT NGHIỆM SÀNG LỌC 1) ELISA (IgG) b XÉT NGHIỆM XÁC ĐỊNH 1) RT-PCR/PCR/rRT-PCR 2) Nuôi cấy định danh 3) ELISA (IgM) E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E LƢU ĐÔ XN CHẨN ĐOÁN BỆNH TCM DO ENTEROVIRUS BỆNH PHẨM (DNT, PHÂN, PHẾT HỌNG, BÓNG NƢỚC) EV71 RT–PCR /Real-Time RT-PCR (Độ 4, tử vong) DƢƠNG TÍNH ÂM TÍNH PHÂN LẬP VIRUS EV RT–PCR/Sn-PCR ( Độ 3, 4, tử vong) DƢƠNG TÍNH Giải trình tự gien VP1 Xác định EV71 subgenogroup ÂM TÍNH Kết quả: Xá định EV71 RT-PCR E P I D E M I C DƢƠNG TÍNH ÂM TÍNH Kết quả: EV âm tính A L E R T A N D Phân lập virus R E S P O N S E Giải trình tự gien , Xác định týp huyết EV LƯU ĐỒ XÉT NGHIỆM CHẨN ĐOÁN BỆNH SXHD HT cấp (Ngày 1-5) RT-PCR /NS1 − + Ca dengue xác định MAC ELISA + 2° IgG ELISA IgG ELISA − Không xác định + 1°/2°? PRNT E P I D E M I C MAC ELISA + − % PLVR Không xác định +− HT hồi phục (Ngày 10-21) A L E R T A N D − 1° Dengue âm tính R E S P O N S E IgG ELISA − + Ca Dengue xác định BỆNH PHẨM rRT PCR cho Type A VÀ rRT PCR cho Subtype H1 (mới + cũ) (mới + cũ) Type A Subtype H1 Dương Âm CÚM A/H1 (-) CÚM A/H1 (+) CÚM A (+) H1 (-) RT PCR cho cúm Type B RT PCR cho N1 vi-rút hô hấp khác E P I D E M I C A L E R T A N D Dương Âm R E S P O N S E RTPCR cho H5, H3… 51 MẪU BỆNH PHẨM/KẾT QUẢ XÉT NGHIỆM BẢNG CÂU HỎI stt Tên Giới Tuổi Smith Nam 14 Kho Nữ 28 Toni Nam 39 Sinaga Nữ 29 Amin Nam 48 Mali Nữ 29 Sutomo Nam 10 Karna Nam 63 NHÃN: Số…… Tên:… Ngày:… Nối với Mã số BN & HỌ TÊN 27-Oct-14 E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E 52 Các yếu tố ảnh hƣởng • Sự chuẩn bị: chuyên môn, nguồn lực • Am hiểu, thành thạo • Năng lực PXN • Lấy vận chuyển mẫu quy định • PXN tham gia hiệu công tác PCD: Cần có phối hợp chặt chẽ dịch tễ PXN E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Chân thành cảm ơn E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E ... dịch xảy - Trong vụ dịch - Sau vụ dịch E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Vai trò giám sát bệnh PXN Trước dịch xảy • Cảnh báo sớm • Phát dịch Trong vụ dịch • Đáp ứng – xử lý dịch E P... tập Trong giám sát điều tra dịch bệnh truyền nhiễm (BTN), theo bạn cần đến hoạt động phòng xét nghiệm (PXN)? E P I D E M I C A L E R T A N D R E S P O N S E Vai trò giám sát bệnh PXN - Trƣớc dịch. .. PXN sau dịch - Công bố hết dịch: Xác định ca cuối dịch - Giám sát sau dịch: Xu hƣớng/các can thiệp • Giám sát môi trƣờng/ngƣời mang mầm bệnh • Giám sát tiêm VX/hiệu sử dụng thuốc • Giám sát việc