Nghiên cứu xác định các gen nguy cơ ở bệnh nhân alzheimer việt nam bằng kỹ thuật giải trình tự thế hệ mới

ỦY BAN NHÂN DÂN SỞ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ TP.HCM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH VIỆN DI TRUYỀN Y HỌC SỞ KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ CHƯƠNG TRÌNH KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ CẤP THÀNH PHỐ BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ Tên nhiệm vụ : NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH CÁC GEN NGUY CƠ Ở BỆNH NHÂN ALZHEIMER VIỆT NAM BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI Cơ quan chủ trì nhiệm vụ: Viện Di truyền Y học Chủ nhiệm nhiệm vụ: TS Giang Hoa Thành phố Hồ Chí Minh, năm 2020 LỜI CẢM ƠN Nhóm nghiên cứu xin chân thành cảm ơn Sở Khoa học Công nghệ, Quỹ phát triển Khoa học Công nghệ Tp Hồ Chí Minh phê duyệt, tài trợ ln giám sát, động viên thực nhiệm vụ khoa học công nghệ quan trọng Cảm ơn bệnh viện Đại học Y dược Tp Hồ Chí Minh phê duyệt “Đạo đức nghiên cứu” cho phép thực hành khám, chẩn đoán, tuyển chọn bệnh nhân Alzheimer khoa Thần kinh bệnh viện Cảm ơn Viện Di truyền Y học (MGI) Công ty Giải pháp gen (GS) cử người tham gia nghiên cứu cho phép sử dụng miễn phí thiết bị Viện cơng ty vào mục đích nghiên cứu Cảm ơn bệnh nhân bị bệnh Alzheimer gia đình tự nguyện tham gia nghiên cứu, cung cấp thông tin cần thiết q trình nghiên cứu Thay mặt nhóm nghiên cứu TS Giang Hoa ỦY BAN NHÂN DÂN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH SỞ KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ SỞ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆN DI TRUYỀN Y HỌC NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ ĐẦU TƯ TỪ NGÂN SÁCH SỰ NGHIỆP KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ CỦA THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH CÁC GEN NGUY CƠ Ở BỆNH NHÂN ALZHEIMER VIỆT NAM BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI Chủ nhiệm đề tài TS Giang Hoa Cơ quan chủ trì nhiệm vụ Thành phố Hồ Chí Minh, năm 2020 VIỆN DI TRUYỀN Y HỌC CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập – Tự Do – Hạnh Phúc TP Hồ Chí Minh, ngày tháng năm 2020 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KH&CN I THÔNG TIN CHUNG Tên nhiệm vụ: Nghiên cứu xác định gen nguy bệnh nhân Alzheimer Việt Nam kỹ thuật giải trình tự hệ Dạng nhiệm vụ: R&D, lĩnh vực: Y Dược Chủ nhiệm nhiệm vụ: - Họ tên: Giang Hoa - Ngày tháng năm sinh: 05/10/1982 Giới tính: Nam - Học hàm: Học vị: Tiến sỹ Chuyên ngành: Sinh tin học Năm đạt học vị: 2013 - Chức danh khoa học: Năm phong chức danh: - Tên quan công tác: Viện Di Truyền Y Học - Chức vụ: Phó Viện trưởng - Địa quan: 186-188 Nguyễn Duy Dương, Phường 3, Quận 10, TPHCM - Điện thoại quan: 02866608050 Fax: - Địa nhà riêng: 154/63 Phong Phú, Phường 12, Quận 8, TPHCM - Điện thoại nhà riêng: - Điện thoại di động: 0918933242 - E-mail: gianghoa@suckhoeditruyen.vn Tổ chức chủ trì nhiệm vụ - Tên tổ chức chủ trì nhiệm vụ: Viện Di Truyền Y Học - Điện thoại: 02866608050 Fax: - E-mail: mgi@suckhoeditruyen.vn - Website: www.suckhoeditruyen.vn - Địa chỉ: 186-188 Nguyễn Duy Dương, Phường 3, Quận 10, TPHCM - Họ tên thủ trưởng tổ chức: GS Trương Đình Kiệt - Số tài khoản: 0421000485380 - Kho bạc Nhà nước/Ngân hàng: Vietcombank CN Hùng Vương II TÌNH HÌNH THỰC HIỆN Thời gian thực nhiệm vụ:  Theo hợp đồng ký kết: từ 12/2018 đến 05/2020  Thực tế thực hiện: từ 12/2018 đến 11/2020 Kinh phí sử dụng kinh phí: a) Tổng số kinh phí thực hiện: 2368 triệu đồng, đó: + Kinh phí hỗ trợ từ ngân sách khoa học: 2368 triệu đồng + Kinh phí từ nguồn khác: b) Tình hình cấp sử dụng kinh phí từ nguồn ngân sách khoa học: Số TT Ghi (Số đề nghị toán) Thực tế đạt Theo kế hoạch Thời gian (Tháng/năm) Kinh phí (Triệu đồng) Thời gian Kinh phí (Tháng/năm) (Triệu đồng) 11/2018 1.184 11/2018 1.184 1.184 07/2019 947,2 03/2020 947,2 947,2 11/2020 236,8 - - c) Kết sử dụng kinh phí theo khoản chi: Đối với đề tài: Đơn vị tính: Triệu đồng Số Nội dung TT khoản chi Thực tế đạt Theo kế hoạch Tổng NSKH Nguồn khác 167,310 167,310 Tổng NSKH Trả công lao động (khoa học, phổ thông) Nguyên vật liệu Thiết bị, máy móc 0 0 Xây dựng, sửa chửa 0 0 Dịch vụ thuê phục vụ nghiên cứu 420,000 420,000 420,000 420,000 Điều tra khảo sát, thu thập số liệu 67,575 67,575 0 1.581,307 1.581,307 61,701 Nguồn khác 61,701 1.581,307 1.581,307 Số Nội dung TT khoản chi Thực tế đạt Theo kế hoạch Tổng NSKH Nguồn khác Tổng NSKH VPP, thông tin liên lạc, in ấn 8,958 8,958 8,692 8,692 Chi hội đồng tự đánh giá kết thực 10,850 10,850 3,5 3,5 Chi quản lý nhiệm vụ KH&CN 112 112 56 56 Nguồn khác 2.368 2.368 2.131,200 2.131,200 Tổng cộng  Lý thay đổi (nếu có): Các văn hành q trình thực đề tài/dự án: (Liệt kê định ) Số TT Số, thời gian ban hành Tên văn Ghi văn 1122/QĐ-SKHCN, 19/10/2018 Quyết định việc phê duyệt nhiệm vụ nghiên cứu khoa học công nghệ 16/2018/HĐHợp đồng thực nhiệm vụ QKHCN, 26/11/2018 khoa học công nghệ 485/QĐ-SKHCN, 20/05/2020 Quyết định việc điều chỉnh Thời gian thực QĐ 1122/QĐ-SKHCN: thời đề tài 24 tháng gian thực đề tài 24 tháng kể từ ngày ký hợp đồng (các nội dung khác giữ nguyên) 12/VDTYH, 25/12/2018 Tờ trình phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu gói thầu phục vụ nhiệm vụ khoa học công nghệ Giám định kỳ 17/09/2019 Thẩm tra toán Quyết toán kinh phí nhiệm vụ đợt 1, 31/12/2019 khoa học cơng nghệ năm 2019 16/QĐ-SKHCN, 14/01/2019 Quyết định việc phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu gói thầu phục vụ nhiệm vụ khoa học công nghệ 26/QĐ-VDTYH, 19/09/2020 Quyết định thay đổi nhà thầu IDNA chuyển giao cho nhà thầu IHOPE 25/QĐ-MGI, 13/10/2020 Quyết định thành lập Tổ chuyên gia thẩm định quy trình 10 27/QĐ-MGI, 20/10/2020 Quyết định thành lập Hội đồng nghiệm thu sở Thẩm tra tốn Quyết tốn kinh phí nhiệm vụ đợt 2, 21/12/2020 khoa học công nghệ năm 2019 Tổ chức phối hợp thực nhiệm vụ: 11 Số Tên tổ chức đăng ký Tên tổ chức tham TT theo thuyết minh gia thực BV Đại học Y dược BV Đại học Y dược TPHCM (Khoa nội thần TPHCM (Khoa nội thần kinh) kinh) Hội đồng giám định đồng ý tiếp tục nghiên cứu đề nghị cấp kinh phí đợt Cá nhân tham gia thực nhiệm vụ: Số TT Tên cá nhân đăng ký theo Thuyết minh Tên cá nhân tham gia thực Nội dung tham gia Sản phẩm chủ yếu đạt - Hoàn thành xây dựng quy trình giải trình tự NGS 15 gen liên quan đột biến gây bệnh TS Giang Hoa TS Giang Hoa - Hồn thành áp dụng quy trình 151 người tham gia Thực nghiên cứu gồm 101 bệnh nội dung 3, 50 chứng - Hồn thành phân tích liệu 101 mẫu với 51 bệnh nhân thuộc nhóm EOAD, 50 bệnh nhân thuộc nhóm LOAD - Hồn thành quy trình tư vấn di truyền trước sau xét nghiệm Gen cho bệnh nhân Alzheimer TS Nguyễn Thị Quỳnh Thơ TS Nguyễn Thị Quỳnh Thơ Thực - Hoàn thành thu thập thông nội dung 2, tin gia sử sức khỏe bệnh sử 101 bệnh nhân Alzheimer - Hoàn thành việc tư vấn, vẽ gia hệ gia đình bệnh nhân TS Trần Cơng Thắng - Hồn thành quy trình tuyển chọn người tham gia nghiên Thực cứu TS Trần nội dung 1, 2, - Hoàn thiện tiêu chí để Cơng Thắng chẩn đốn lâm sàng cho 101 đôi tượng tham gia nghiên cứu Ghi Số TT Tên cá nhân đăng ký theo Thuyết minh Tên cá nhân tham gia thực Nội dung tham gia Sản phẩm chủ yếu đạt - Hoàn thiện tuyển chọn 101 đối tượng nghiên cứu TS Nguyễn Hoài Nghĩa TS Nguyễn Hoài Nghĩa - Hồn thành xây dựng quy trình giải trình tự NGS 15 gen Thực liên quan đột biến gây bệnh nội dung - Hoàn thành áp dụng quy trình 151 người tham gia nghiên cứu gồm 101 bệnh 50 chứng - Hoàn thành quy trình tuyển chọn người tham gia nghiên cứu BSCK1 Tống Mai Trang BSCK2 Tống Mai Trang Thực - Hồn thiện tiêu chí để nội dung 1, 2, chẩn đoán lâm sàng cho 101 đơi tượng tham gia nghiên cứu - Hồn thiện tuyển chọn 101 đối tượng nghiên cứu ThS Nguyễn Thị Tuyết Lan ThS Nguyễn Thị Tuyết Lan - Hoàn thành nhiệm vụ quản lý đề tài, giấy tờ cần thiết, Thực tốn kinh phí nội dung - Hoàn thành việc thực bước quy trình giải trình tự gen cho 151 đối tượng tham gia nghiên cứu PGS.TS Đỗ Thị Thanh Thủy - Hoàn thành thiết kế mồi cho biến thể cần ngoại kiểm PGS.TS Đỗ Thực nội Thị Thanh - Hoàn thành đánh giá ngoại dung Thủy kiểm 101 phản ứng Sanger, tính tốn độ nhạy độ đặc hiệu quy trình NGS Ghi Số TT 10 Tên cá nhân đăng ký theo Thuyết minh Tên cá nhân tham gia thực Nội dung tham gia Sản phẩm chủ yếu đạt - Hoàn thành thiết kế mồi cho biến thể cần ngoại kiểm TS Đường Thị Hồng Diệp TS Đường Thị Hồng Diệp CN Nguyễn Thành Luân Hoàn thành bước Thực CN Nguyễn quy trình giải trình tự gen cho nội dung Thành Luân 151 đối tượng tham gia nghiên cứu CN Võ Thanh Bình Ghi Thực nội - Hoàn thành đánh giá ngoại dung kiểm 101 phản ứng Sanger, tính tốn độ nhạy độ đặc hiệu quy trình NGS CN Võ Thanh Bình Hồn thành bước Thực quy trình giải trình tự gen cho nội dung 151 đối tượng tham gia nghiên cứu Tình hình hợp tác quốc tế: Số Theo kế hoạch () TT Thực tế đạt () Ghi  Lý thay đổi (nếu có): Tình hình tổ chức hội thảo, hội nghị: Số TT Theo kế hoạch () Không Thực tế đạt () Ghi Hội thảo “Bệnh Alzheimer: giải Không sử dụng mã chiến lược điều trị” kinh phí đề tài Mã số mẫu Nhóm mẫu Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT - - Đồng hợp - - Dị hợp - Dị hợp downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant AZ086 LOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C AZ087 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C AZ090 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C EOAD_genes chr21_26000 163_G/A NM_001 136129.3 :c.69817686C> T NM_002 087.3:c.1 460C>T NP_002078.1: p.Thr487Ile Dị hợp Đồng hợp AZ091 EOAD APP - AZ091 EOAD GRN FTD_genes chr17_44352 387_C/T AZ091 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - NM_001 271821.2 :c.242G> A NP_00125875 0.1:p.Ser81As n LOAD_genes chr6_411614 12_C/T Hệ chức AZ092 LOAD TREM AZ092 LOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - AZ093 Đối chứng TREM LOAD_genes chr6_411614 12_C/T NM_001 271821.2 NP_00125875 0.1:p.Ser81As n missense _variant downstre am_gene _variant Dự đoán SIFT Chức Clinvar Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - BA1 Benign 0.595 0.4444 PM6 uncertain significan ce 0.0004 0.001 uncertain significan ce - - 0.595 0.4444 - - 0.595 0.4444 - - - deleteri ous(0.0 4) - tolerate d(0.07) Đồng hợp missense _variant downstre am_gene _variant Dị hợp missense _variant tolerate d(0.07) Dị hợp Dự đoán Poly Phen - possi bly_d amagi ng(0 511) proba bly_d amagi ng(0 994) proba bly_d amagi drug_respo nse Conflicting _interpreta tions_of_p athogenicit y drug_respo nse BA1 uncertain significan ce drug_respo nse - Benign BA1 Benign uncertain significan ce Mã số mẫu Nhóm mẫu Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT Hệ chức Dự đoán SIFT :c.242G> A NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys Dị hợp AZ093 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 822_C/T AZ093 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp AZ093 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp AZ094 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp AZ095 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ097 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp AZ097 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ098 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp AZ098 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp Dự đoán Poly Phen Chức Clinvar Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) 0.0751 0.1002 missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant deleteri ous(0) ng(0 994) proba bly_d amagi ng(1) - - - BA1 Benign 0.112 0.1101 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - 0.595 0.4444 tolerate d(1) benig n(0.0 01) BA1 PS1, PM6, PP5, BA1 Benign missense _variant downstre am_gene _variant drug_respo nse Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor 0.1506 0.0863 - - 0.595 0.4444 tolerate d(1) benig n(0.0 01) BA1 PS1, PM6, PP5, BA1 Benign missense _variant downstre am_gene _variant drug_respo nse Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor 0.1506 0.0863 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 drug_respo nse PS3, PM6, PP3, BA1 Likely pathogeni c Likely pathogeni c Likely pathogeni c Mã số mẫu AZ099 AZ099 AZ100 AZ100 Nhóm mẫu Đối chứng Đối chứng Tên gen APP PSEN1 LOAD PSEN2 LOAD DCTN Nhóm gene EOAD_genes Biến thể xác định Biến thể DNA chr21_25905 102_AGAA/- NM_000 484.4:c.1 91028_191025del EOAD_genes chr14_73198 052_C/T EOAD_genes chr1_226888 181_G/C NM_000 021.4:c.7 91C>T NM_000 447.3:c.5 66+23G> C FTD_genes chr2_743668 76_G/A NR_033 935.1:n.2 574C>T Dị hợp Đồng hợp LOAD_genes AZ100 LOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - AZ101 Đối chứng DCTN FTD_genes chr2_743668 76_G/A NR_033 935.1:n.2 574C>T LOAD_genes - Dị hợp - APOE APOE - Dị hợp Đồng hợp LOAD AZ101 NP_000012.1: p.Pro264Leu Dị hợp intron_va riant NP_000032.1: p.Cys130Arg AZ100 chr19_44908 684_T/C - GT NM_000 041.4:c.3 88T>C chr19_44908 684_T/C Đối chứng Biến thể protein Hệ chức NM_000 041.4:c.3 88T>C - NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp Dị hợp missense _variant intron_va riant non_codi ng_transc ript_exon _variant missense _variant downstre am_gene _variant non_codi ng_transc ript_exon _variant missense _variant Dự đoán SIFT - deleteri ous(0) - - Dự đoán Poly Phen proba bly_d amagi ng(1) - Pathogenic /Likely_pa thogenic benig n(0.0 01) - - drug_respo nse tolerate d(1) benig n(0.0 01) PS3, PM2, PM6, PP3, PP5 - tolerate d(1) - Tiêu chuẩn ACM G - Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - Chức Clinvar Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) uncertain significan ce - 0.006 Pathogeni c - - uncertain significan ce - - uncertain significan ce - - 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 Phân loại theo ACMG PS1, PM6, PP5, BA1 Likely pathogeni c BA1 Benign PS1, PM6, PP5, BA1 Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ101 Đối chứng APOE AZ102 Đối chứng C9orf7 AZ103 EOAD Tên gen GRN Nhóm gene Biến thể xác định LOAD_genes chr19_44911 194_T/C FTD_genes chr9_275624 67_T/C FTD_genes chr17_44349 767_GG/- Biến thể DNA NM_001 256054.2 :c.514A> G NM_002 087.3:c.3 49+17_3 49+18del Biến thể protein NP_00124298 3.1:p.Ile172Va l - GT Hệ chức Dự đoán SIFT Dự đoán Poly Phen Dị hợp downstre am_gene _variant - - Dị hợp missense _variant tolerate d(0.47) benig n(0.0 01) Dị hợp intron_va riant NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys Dị hợp AZ103 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44908 822_C/T AZ103 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp AZ103 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ104 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 822_C/T NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys Dị hợp AZ104 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp AZ104 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp - Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) 0.595 0.4444 - uncertain significan ce - - - uncertain significan ce - - drug_respo nse PS3, PM6, PP3, BA1 Likely pathogeni c 0.0751 0.1002 - BA1 Benign 0.112 0.1101 Benign 0.595 0.4444 drug_respo nse BA1 PS3, PM6, PP3, BA1 0.0751 0.1002 Chức Clinvar drug_respo nse Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG BA1 Benign missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant deleteri ous(0) proba bly_d amagi ng(1) - - - missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant deleteri ous(0) proba bly_d amagi ng(1) - - - BA1 Benign 0.112 0.1101 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 drug_respo nse Likely pathogeni c Mã số mẫu Nhóm mẫu Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp GT AZ105 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C AZ105 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ106 Đối chứng APOE LOAD_genes Dị hợp AZ107 C9orf7 NM_001 256054.2 :c.44542_44520del - Đối chứng chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant FTD_genes - Dự đoán Poly Phen - deleteri ous(0) drug_respo nse PS3, PM6, PP3, BA1 - - - BA1 Benign 0.112 0.1101 - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 Pathogenic PS1, PS3, PM2, PM6 - - - - - Đồng hợp NP_000475.1: p.Val717Ile Dị hợp missense _variant tolerate d(0.05) proba bly_d amagi ng(0 997) - Dị hợp intron_va riant - - EOAD FUS FTD_genes chr16_31188 290_-/T NM_001 170634.1 0.1002 - - AZ108 0.0751 Phân loại theo ACMG proba bly_d amagi ng(1) chr19_44911 194_T/C chr21_25891 784_C/T Likely pathogeni c BA1 LOAD_genes EOAD_genes - drug_respo nse APOE APP - - Dị hợp EOAD uncertain significan ce - - AZ108 0.4444 BA1 - NM_000 484.4:c.2 149G>A 0.595 drug_respo nse chr19_44911 142_C/A Đối chứng Benign - LOAD_genes AZ107 0.4444 - APOE Đối chứng 0.595 Likely pathogeni c Dị hợp AZ107 Benign PS1, PM6, PP5, BA1 LOAD_genes APOE 0.0863 Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor NP_000032.1: p.Arg176Cys AZ107 0.1506 tolerate d(1) benig n(0.0 01) NM_000 041.4:c.5 26C>T missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant Tần suất biến thể (quần thể Đơng Á) Tiêu chuẩn ACM G Dự đốn SIFT chr19_44908 822_C/T Đối chứng Tần suất biến thể (1000 genome project) Chức Clinvar Hệ chức - Pathogeni c uncertain significan ce Mã số mẫu Nhóm mẫu Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT Hệ chức Đồng hợp downstre am_gene _variant Dự đoán SIFT Dự đoán Poly Phen Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) 0.595 0.4444 Pathogeni c - - Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 - - Benign 0.595 0.4444 BA1 Benign 0.595 0.4444 PS1, PS3, PM2, PM6 Pathogeni c - - Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG drug_respo nse BA1 Benign Pathogenic Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor PS1, PS3, PM2, PM6 PS1, PM6, PP5, BA1 drug_respo nse BA1 Benign Pathogenic PS1, PS3, PM2, PM6 Pathogeni c drug_respo nse BA1 drug_respo nse Pathogenic Chức Clinvar :c.79726dup AZ108 EOAD APOE chr19_44911 194_T/C - EOAD_genes chr21_25891 784_C/T NM_000 484.4:c.2 149G>A NP_000475.1: p.Val717Ile NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp - Đồng hợp LOAD_genes - AZ109 Đối chứng AZ109 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C AZ109 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - NP_000475.1: p.Val717Ile Dị hợp APP Dị hợp AZ110 Đối chứng APP EOAD_genes chr21_25891 784_C/T NM_000 484.4:c.2 149G>A AZ110 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp AZ111 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp chr21_25891 784_C/T NM_000 484.4:c.2 149G>A AZ112 Đối chứng APP EOAD_genes NP_000475.1: p.Val717Ile Dị hợp missense _variant tolerate d(0.05) proba bly_d amagi ng(0 997) missense _variant downstre am_gene _variant tolerate d(1) benig n(0.0 01) missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant missense _variant - - tolerate d(0.05) proba bly_d amagi ng(0 997) - - - proba bly_d amagi ng(0 997) tolerate d(0.05) Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ112 Đối chứng Tên gen APOE Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT chr19_44911 194_T/C - EOAD_genes chr21_25891 784_C/T NM_000 484.4:c.2 149G>A NP_000475.1: p.Val717Ile NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp - Đồng hợp LOAD_genes - Dị hợp AZ113 Đối chứng AZ113 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C AZ113 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - EOAD_genes chr21_25891 784_C/T NM_000 484.4:c.2 149G>A NP_000475.1: p.Val717Ile NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp APP AZ114 Đối chứng AZ114 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C AZ114 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - AZ115 Đối chứng LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg APP APOE Dị hợp Hệ chức downstre am_gene _variant Dự đoán SIFT - Dự đoán Poly Phen missense _variant tolerate d(0.05) proba bly_d amagi ng(0 997) missense _variant downstre am_gene _variant tolerate d(1) benig n(0.0 01) missense _variant tolerate d(0.05) proba bly_d amagi ng(0 997) tolerate d(1) benig n(0.0 01) Dị hợp missense _variant downstre am_gene _variant - - Dị hợp missense _variant tolerate d(1) benig n(0.0 01) Dị hợp - Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) 0.595 0.4444 Pathogeni c - - Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 Pathogeni c - - Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 0.1506 0.0863 Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG drug_respo nse BA1 Benign Pathogenic Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor PS1, PS3, PM2, PM6 PS1, PM6, PP5, BA1 drug_respo nse BA1 Pathogenic Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor PS1, PS3, PM2, PM6 PS1, PM6, PP5, BA1 drug_respo nse Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor BA1 PS1, PM6, PP5, BA1 Chức Clinvar Benign Benign Likely pathogeni c Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ115 Đối chứng APOE EOAD C9orf7 AZ116 Tên gen Nhóm gene LOAD_genes FTD_genes AZ116 EOAD APOE LOAD_genes AZ116 EOAD APOE LOAD_genes AZ117 Đối chứng C9orf7 FTD_genes AZ117 Đối chứng APOE LOAD_genes AZ117 Đối chứng APOE LOAD_genes AZ118 Đối chứng C9orf7 FTD_genes Biến thể xác định chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- Biến thể DNA NM_001 256054.2 :c.44542_44520del chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- NM_001 256054.2 :c.44542_44520del chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- NM_001 256054.2 :c.44542_44520del Biến thể protein - - GT Hệ chức Dị hợp downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant NP_000032.1: p.Cys130Arg Đồng hợp - Đồng hợp missense _variant downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant - NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp - Đồng hợp missense _variant downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant - Dự đoán SIFT - - Dự đoán Poly Phen - drug_respo nse tolerate d(1) benig n(0.0 01) Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - drug_respo nse - - Chức Clinvar tolerate d(1) benig n(0.0 01) Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - drug_respo nse - - - - Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 - - Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG BA1 Benign PS1, PM6, PP5, BA1 Likely pathogeni c BA1 Benign PS1, PM6, PP5, BA1 Likely pathogeni c BA1 Benign uncertain significan ce Mã số mẫu AZ118 Nhóm mẫu Đối chứng Tên gen APP Nhóm gene EOAD_genes AZ118 Đối chứng APOE LOAD_genes AZ118 Đối chứng APOE LOAD_genes AZ119 Đối chứng C9orf7 AZ119 Đối chứng APOE AZ119 Đối chứng APOE FTD_genes Biến thể xác định Biến thể DNA chr21_25905 102_AGAA/- NM_000 484.4:c.1 91028_191025del chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- NM_001 256054.2 :c.44542_44520del Biến thể protein - GT Hệ chức Dị hợp intron_va riant NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp - Dị hợp missense _variant downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant - LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp NM_000 021.4:c.7 91C>T NP_000012.1: p.Pro264Leu Dị hợp - - Đồng hợp AZ124 EOAD PSEN1 EOAD_genes chr14_73198 052_C/T AZ124 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C missense _variant downstre am_gene _variant missense _variant downstre am_gene _variant Dự đoán SIFT - Dự đoán Poly Phen tolerate d(1) benig n(0.0 01) Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - drug_respo nse - - Chức Clinvar - tolerate d(1) benig n(0.0 01) Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - drug_respo nse deleteri ous(0) proba bly_d amagi ng(1) - - Tiêu chuẩn ACM G Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) uncertain significan ce - 0.006 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 0.595 0.4444 - - 0.595 0.4444 Phân loại theo ACMG PS1, PM6, PP5, BA1 Likely pathogeni c BA1 Benign PS1, PM6, PP5, BA1 Benign Pathogenic /Likely_pa thogenic BA1 PS3, PM2, PM6, PP3, PP5 drug_respo nse BA1 Benign Pathogeni c Mã số mẫu AZ125 Nhóm mẫu EOAD Tên gen APP Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT Hệ chức proba bly_d amagi ng(0 979) possi bly_d amagi ng(0 511) EOAD_genes chr21_25982 420_C/T NP_000475.1: p.Gly383Glu NM_002 087.3:c.1 460C>T NP_002078.1: p.Thr487Ile Dị hợp Dị hợp missense _variant downstre am_gene _variant Dị hợp missense _variant deleteri ous(0) proba bly_d amagi ng(1) tolerate d(1) deleteri ous(0) Dị hợp missense _variant AZ125 EOAD GRN FTD_genes AZ125 EOAD APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - AZ126 Đối chứng LOAD_genes chr19_44908 822_C/T NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys AZ126 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp AZ126 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp AZ126 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant AZ127 Đối chứng LOAD_genes chr19_44908 822_C/T NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys Dị hợp missense _variant APOE Dự đoán Poly Phen NM_000 484.4:c.1 148G>A chr17_44352 387_C/T APOE Dự đoán SIFT deleteri ous(0) deleteri ous(0.0 4) - Chức Clinvar - Tiêu chuẩn ACM G PM1, PM2, PM6, PP3 drug_respo nse Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) Likely pathogeni c - - uncertain significan ce - - 0.595 0.4444 Likely pathogeni c 0.0751 0.1002 Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 Phân loại theo ACMG Benign benig n(0.0 01) drug_respo nse Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor BA1 PS3, PM6, PP3, BA1 PS1, PM6, PP5, BA1 - - - BA1 Benign 0.112 0.1101 - proba bly_d amagi ng(1) BA1 PS3, PM6, PP3, BA1 Benign 0.595 0.4444 0.0751 0.1002 drug_respo nse drug_respo nse Likely pathogeni c Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ127 Đối chứng APOE AZ127 Đối chứng APOE AZ128 Đối chứng AZ128 Đối chứng AZ129 Đối chứng AZ129 Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp APOE LOAD_genes chr19_44907 908_G/C NM_000 041.4:c.1 92G>C NP_000032.1: p.Gln64His Dị hợp APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp AZ131 Đối chứng APOE LOAD_genes Dị hợp AZ132 C9orf7 NM_001 256054.2 :c.44542_44520del - Đối chứng chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant AZ133 Đối chứng APOE FTD_genes LOAD_genes chr19_44908 822_C/T NM_000 041.4:c.5 26C>T - NP_000032.1: p.Arg176Cys Dị hợp Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) Benign 0.112 0.1101 BA1 Benign 0.595 0.4444 - PS3, PM6 Likely pathogeni c 0.0004 0.001 BA1 PS1, PM6, PP5, BA1 Benign 0.595 0.4444 benig n(0.0 01) drug_respo nse Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor 0.1506 0.0863 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - Likely pathogeni c 0.0751 0.1002 Dự đoán Poly Phen Chức Clinvar Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG - - - BA1 - drug_respo nse deleteri ous(0.0 1) possi bly_d amagi ng(0 629) - - tolerate d(1) Hệ chức missense _variant downstre am_gene _variant missense _variant Dự đoán SIFT - deleteri ous(0) proba bly_d amagi ng(1) - drug_respo nse PS3, PM6, PP3, BA1 Likely pathogeni c Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ133 Đối chứng APOE AZ133 Đối chứng APOE AZ134 Đối chứng AZ134 Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp APOE LOAD_genes chr19_44908 822_C/T NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys Dị hợp Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp AZ134 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ135 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp AZ135 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - AZ136 Đối chứng TARD BP FTD_genes chr1_110272 19_G/A NM_006 610.4:c.1 727C>T NP_006601.2: p.Thr576Ile AZ136 Đối chứng LOAD_genes chr19_44908 822_C/T NM_000 041.4:c.5 26C>T NP_000032.1: p.Arg176Cys APOE downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) Benign 0.112 0.1101 Benign 0.595 0.4444 drug_respo nse BA1 PS3, PM6, PP3, BA1 0.0751 0.1002 - BA1 Benign 0.112 0.1101 drug_respo nse Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor BA1 PS1, PM6, PP5, BA1 Benign 0.595 0.4444 0.1506 0.0863 drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 PM6, PP3, BP6 PS3, PM6, PP3, BA1 uncertain significan ce 0.0006 0.003 Likely pathogeni c 0.0751 0.1002 Dự đoán Poly Phen Chức Clinvar Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG - - - BA1 - Hệ chức Dự đoán SIFT missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant deleteri ous(0) proba bly_d amagi ng(1) - - - - tolerate d(1) benig n(0.0 01) Dị hợp missense _variant downstre am_gene _variant Dị hợp missense _variant deleteri ous(0) Dị hợp missense _variant deleteri ous(0) - possi bly_d amagi ng(0 614) proba bly_d amagi ng(1) drug_respo nse Uncertain_ significanc e drug_respo nse Likely pathogeni c Likely pathogeni c Mã số mẫu Nhóm mẫu Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp GT drug_respo nse tolerate d(0.15) benig n(0.0 26) Pathogenic Dị hợp missense _variant downstre am_gene _variant BA1 PS3, PM6, PP3, PP5 - - drug_respo nse BA1 Dị hợp intron_va riant LOAD_genes chr19_44911 142_C/A - - Dị hợp AZ136 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp AZ137 Đối chứng UBQL N2 FTD_genes chrX_565653 62_C/T NM_013 444.3:c.1 489C>T NP_038472.2: p.Pro497Ser Dị hợp AZ137 Đối chứng APOE LOAD_genes AZ138 C9orf7 NM_001 256054.2 :c.44542_44520del - Đối chứng chr19_44911 194_T/C chr9_275656 10_TTTAAA AAAACAAC CCACAACA T/- LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ139 APOE AZ139 Đối chứng AZ140 Đối chứng missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant - - 0.112 0.1101 Benign 0.595 0.4444 - - Benign 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - 0.1506 0.0863 BA1 - APOE Benign Likely pathogeni c - Đối chứng 0.0863 PS1, PM6, PP5, BA1 - AZ136 0.1506 Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - LOAD_genes Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) Tiêu chuẩn ACM G - APOE Tần suất biến thể (1000 genome project) Chức Clinvar tolerate d(1) AZ136 Đối chứng Dự đoán Poly Phen missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant chr19_44908 684_T/C - Dự đoán SIFT benig n(0.0 01) Đối chứng FTD_genes Hệ chức Phân loại theo ACMG Likely pathogeni c tolerate d(1) benig n(0.0 01) Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 PS1, PM6, PP5, BA1 Likely pathogeni c Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ141 Đối chứng AZ142 Đối chứng AZ142 Đối chứng AZ142 Đối chứng AZ142 Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT Hệ chức Đồng hợp downstre am_gene _variant Dị hợp intron_va riant Dị hợp intron_va riant LOAD_genes chr19_44911 194_T/C FTD_genes chr16_31188 290_-/T EOAD_genes chr21_25975 061_G/A NM_001 170634.1 :c.79726dup NM_000 484.4:c.1 458+9C> T APOE LOAD_genes chr19_44908 684_T/C NM_000 041.4:c.3 88T>C NP_000032.1: p.Cys130Arg Dị hợp Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp AZ143 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ144 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - Dị hợp AZ145 Đối chứng GRN FTD_genes chr17_44349 767_GG/- NM_002 087.3:c.3 49+17_3 49+18del - Dị hợp AZ145 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Đồng hợp APOE FUS APP - - - missense _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant intron_va riant downstre am_gene _variant Dự đoán SIFT - - Dự đoán Poly Phen - - Chức Clinvar drug_respo nse Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) 0.595 0.4444 uncertain significan ce - - uncertain significan ce - - Likely pathogeni c 0.1506 0.0863 Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG BA1 Benign - - - tolerate d(1) benig n(0.0 01) Uncertain_ significanc e Likely_pat hogenic,_o ther,_risk_ factor - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - 0.595 0.4444 - - - - - drug_respo nse PM6 PS1, PM6, PP5, BA1 uncertain significan ce BA1 Benign Mã số mẫu Nhóm mẫu AZ146 Đối chứng APOE AZ147 Đối chứng AZ148 Tên gen Nhóm gene Biến thể xác định Biến thể DNA Biến thể protein GT LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ150 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp AZ151 Đối chứng APOE LOAD_genes chr19_44911 194_T/C - - Dị hợp Hệ chức downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant downstre am_gene _variant Dự đoán SIFT Dự đoán Poly Phen Chức Clinvar Tiêu chuẩn ACM G Phân loại theo ACMG Tần suất biến thể (1000 genome project) Tần suất biến thể (quần thể Đông Á) - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444 - - drug_respo nse BA1 Benign 0.595 0.4444