Khảo sát ảnh hưởng của kiểu gen esr fshb và kết hợp phương pháp blup để chọn lọc giống lợn yorkshire và landrace có khả năng sinh sản cao

ỦY BAN NHÂN DÂN TP HỒ CHÍ MINH SỞ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆN CHĂN NUÔI PHÂN VIỆN CHĂN NUÔI NAM BỘ BÁO CÁO TỔNG KẾT KHẢO SÁT ẢNH HƯỞNG CỦA KIỂU GEN ESR, FSHB VÀ KẾT HỢP PHƯƠNG PHÁP BLUP ĐỂ CHỌN LỌC GIỐNG LỢN YORKSHIRE VÀ LANDRACE CĨ KHẢ NĂNG SINH SẢN CAO CƠ QUAN CHỦ TRÌ: PHÂN VIỆN CHĂN NUÔI NAM BỘ CHỦ NHIỆM ĐỀ TÀI: TS NGUYỄN HỮU TỈNH THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH 2019 ỦY BAN NHÂN DÂN TP HỒ CHÍ MINH VIỆN CHĂN NUÔI SỞ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ PHÂN VIỆN CHĂN NUÔI NAM BỘ - BÁO CÁO TỔNG KẾT KẾT QUẢ NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ “KHẢO SÁT ẢNH HƯỞNG CỦA KIỂU GEN ESR, FSHB VÀ KẾT HỢP PHƯƠNG PHÁP BLUP ĐỂ CHỌN LỌC GIỐNG LỢN YORKSHIRE VÀ LANDRACE CÓ KHẢ NĂNG SINH SẢN CAO” (Đã chỉnh sửa theo kết luận Hội đồng nghiệm thu ngày 15/11/2019) Chủ nhiệm nhiệm vụ TS Nguyễn Hữu Tỉnh Cơ quan chủ trì nhiệm vụ (ký tên đóng dầu) LỜI CẢM ƠN Nhóm tác giả xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Sở Khoa học Công nghệ Tp Hồ Chí Minh phê duyệt cấp kinh phí cho thực thành công nghiên cứu Đồng thời, nhóm tác giả xin gửi lời cám ơn đến quan đơn vị, cá nhân, bao gồm: - Ban giám đốc, Phòng chức - Phân Viện Chăn Nuôi Nam Bộ - Bộ môn Di Truyền Giống vật nuôi – Phân Viện Chăn Nuôi Nam Bộ - Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn nuôi Heo Bình Thắng - Cùng đồng nghiệp Phân Viện Chăn Nuôi Nam Bộ Đã tạo điều kiện thuận lợi phịng thí nghiệm CNSH, chuồng trại, giống nhân lực hỗ trợ, giúp đỡ hồn thành đề tài khoa học Tp Hồ Chí Minh, tháng năm 2019 Chủ trì đề tài TS Nguyễn Hữu Tỉnh MỤC LỤC Nội dung Trang PHẦN I: BÁO CÁO THỐNG KÊ PHẦN II: BÁO CÁO TỔNG HỢP 14 DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT 14 DANH SÁCH CÁC BẢNG, HÌNH VÀ BIỂU ĐỒ 15 MỞ ĐẦU 18 1.Tính cấp thiết 18 Tính mới, tính khoa học 18 Mục tiêu nghiên cứu 20 CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 21 1.1 Ứng dụng di truyền phân tử cải thiện suất sinh sản lợn 21 1.2 Ứng dụng đánh giá di truyền BLUP chọn giống lợn 26 CHƯƠNG 2: NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 35 2.1 Địa điểm triển khai nghiên cứu 35 2.2 Phương pháp nghiên cứu 35 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 45 3.1 Tần số kiểu gen tần số alen 45 3.2 Mối liên quan kiểu gen với số tính trạng sinh sản 49 3.3 Ảnh hưởng kết hợp kiểu gen ESR FSHB đến tính trạng sinh 55 sản 59 3.4 Phân bố kiểu gen ESR FSHB đàn giống khảo sát 59 3.5 Kết đánh giá giá trị giống 61 3.6 Kết đánh giá chọn lọc kết hợp số giá trị giống kiểu gen 67 3.7 Tiến khuynh hướng di truyền đàn giống chọn lọc 71 CHƯƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 75 4.1 Kết luận 75 4.2 Đề nghị 75 TÀI LIỆU THAM KHẢO 76 PHỤ LỤC 82 Phụ lục 1: Danh sách đàn đực Landrace Yorkshire khảo sát 83 Phụ lục 2: Danh sách đàn nái Landrace khảo sát 84 Phụ lục 3: Danh sách đàn nái Yorkshire khảo sát 91 Phụ lục 4: Danh sách đàn hạt nhân Landrace 97 Phụ lục 5: Danh sách đàn hạt nhân Yorkshire 100 Phụ lục 6: Quy trình chọn lọc nhân giống (kèm QĐ 359 ngày 101 04/9/2019 Biên HĐ) + Giấy xác nhận Trung tâm NC &PT CN Heo Bình Thắng đàn giống hạt nhân chọn việc áp dụng quy trình chọn lọc đề tài, + Giấy xác nhận Công ty TNHH Nhật Minh Phụ lục 7: Báo cáo phân tích gen ESR gen FSHB 117 Phụ lục 8: Các báo công bố 126 Phụ lục 9: Kết đào tạo 141 Phụ lục 10: Một số hồ sơ liên quan 144 Hợp đồng 169 Sơ lược thuyết minh Quyết định thành lập HĐ nghiệm thu sở biên đánh giá Bản giải trình chủ nhiệm đề tài sau HĐ nghiệm thu sở VIỆN CHĂN NUÔI PHÂN VIỆN CHĂN NUÔI NĂM BỘ CỘNG HOÀ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc Bình Dương, ngày 20 tháng năm 20019 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN NHIỆM VỤ NGHIÊN CỨU KH&CN I THÔNG TIN CHUNG Tên nhiệm vụ: Khảo sát ảnh hưởng kiểu gen ESR, FSHB kết hợp phương pháp BLUP để chọn lọc giống lợn Yorkshire Landrace có khả sinh sản cao Thuộc: Chương trình/lĩnh vực (tên chương trình/lĩnh vực): Chủ nhiệm nhiệm vụ: Họ tên: Nguyễn Hữu Tỉnh Ngày, tháng, năm sinh: 14/12/1967 Nam/ Nữ: Nam Học hàm, học vị: Tiến sỹ Chức danh khoa học: Nghiên cứu viên Chức vụ: Phó giám đốc Điện thoại: Tổ chức: Nhà riêng: Mobile: 0903 315 059 Fax: E-mail: tinh.iasvn@gmail.com Tên tổ chức công tác: Phân viện Chăn nuôi Nam Bộ - Viện Chăn Nuôi Địa tổ chức: KP Hiệp Thắng, Bình Thắng, Dĩ An, Bình Dương Địa nhà riêng: MA-16.06, Đảo Kim Cương, Quận 2, Tp Hồ Chí Minh Tổ chức chủ trì nhiệm vụ: Tên tổ chức chủ trì nhiệm vụ: Phân viện Chăn nuôi Nam Bộ - Viện Chăn Nuôi Điện thoại: 0274 3751615 Fax: 0274 3750622 E-mail: Website: www iasvn.vn Địa chỉ: KP Hiệp Thắng, Bình Thắng, Dĩ An, Bình Dương Họ tên thủ trưởng tổ chức: Nguyễn Hữu Tỉnh Số tài khoản: 3713.0.1052501.00000 Kho bạc nhà nước, Dĩ An, Bình Dương Mã QHNS: 1052501 Tên quan chủ quản đề tài: Viện Chăn Nuôi II TÌNH HÌNH THỰC HIỆN Thời gian thực nhiệm vụ: - Theo Hợp đồng ký kết: từ tháng 10 năm 2016 đến tháng 10 năm 2019 - Thực tế thực hiện: từ tháng 10 năm 2016 đến tháng 10 năm 2019 - Được gia hạn (nếu có): Kinh phí sử dụng kinh phí: a) Tổng số kinh phí thực hiện: 1.684,99 tr.đ, đó: + Kính phí hỗ trợ từ ngân sách khoa học: 1.420,00 tr.đ + Kinh phí từ nguồn khác: 264,99 tr.đ b) Tình hình cấp sử dụng kinh phí từ nguồn ngân sách khoa học: Số TT Theo kế hoạch Thời gian Kinh phí (Tháng, năm) (Tr.đ) 10/2016 710,00 06/2018 568,00 12/2019 142,00 Thực tế đạt Thời gian Kinh phí (Tháng, năm) (Tr.đ) 12/2016 710,00 08/2018 568,00 Ghi (Số đề nghị toán) 710,00 568,00 c) Kết sử dụng kinh phí theo khoản chi: Đơn vị tính: Triệu đồng Số TT Nội dung khoản chi Theo kế hoạch Tổng NSKH Trả công lao động (khoa học, phổ thơng) Ngun, vật liệu, lượng Thiết bị, máy móc Xây dựng, sửa chữa nhỏ Chi khác 950,92 Tổng cộng Thực tế đạt Tổng NSKH 685,93 Nguồn khác 264,99 950,92 685,93 Nguồn khác 264,99 599,37 599,37 - 599,37 599,37 - - - - - - - - - - - - - 134,70 134,70 - 134,70 134,70 - 1.684,99 1.420,00 264,99 1.684,99 1.420,00 264,99 Các văn hành q trình thực đề tài/dự án: (Liệt kê định, văn quan quản lý từ công đoạn xét duyệt, phê duyệt kinh phí, hợp đồng, điều chỉnh (thời gian, nội dung, kinh phí thực có); văn tổ chức chủ trì nhiệm vụ (đơn, kiến nghị điều chỉnh có) Số Số, thời gian ban TT hành văn 749- 21/09/2015 887- 30/12/2016 169 - 01/12/2016 609 - 14/07/2017 865 - 22/09/2017 548 - 11/06/2018 38 - 18/7/2018 Tên văn Ghi QĐ thành lập HĐ xét duyệt ĐT QĐ phê duyệt đề tài Hợp đồng NCKH QĐ phê duyệt KH tổng thể QĐ phê duyệt lựa chọn nhà thầu QĐ thành lập HĐ giám định Phụ lục Hợp đồng 749/QĐ-SKHCN 887/QĐ-SKHCN 169/2016/HĐ-SKHCN 609/2017/QĐ-SKHCN 865/2017/QĐ-SKHCN 548/2018/QĐ-SKHCN 38/2018/PLHĐ-SKHCN Tổ chức phối hợp thực nhiệm vụ: Số TT Tên tổ chức Tên tổ chức đăng ký theo tham gia Thuyết minh thực Trung tâm NC PTCN heo Bình Thắng Trung tâm NC PTCN heo Bình Thắng Nội dung Sản phẩm chủ yếu đạt tham gia chủ yếu - Thu thập mẫu máu đàn nái, đực Yorkshire, Landrace trại Bình Minh - Đánh giá chọn lọc cá thể có kiểu gen ESR, FSHB ảnh hưởng tích cực đến suất sinh sản đàn giống Yorkshire Landrace - Thu thập 527 mẫu máu thu thập từ 491 nái 36 đực Yorkshire, Landrace - Nhân giống phát triển hai đàn Yorkshire Landrace có suất sinh sản cao mang kiểu gen ESR FSHB ảnh hưởng tích cực đến khả sinh sản - Từ kết phân tích gen ESR, FSHB đàn giống chọn 21 nái + đực Landrace; 21 nái + đực Yorkshire để nhân giống hệ từ chọn hệ 56 nái đực giống Landrace; 54 nái đực giống Yorkshire - Kết sinh sản đàn Landrace hạt nhân là: Số đẻ ra/ổ ≥14,12 con; Số sống/ổ ≥12,35 con; Số cai sữa/ổ ≥12,01 con; đàn Yorkshire hạt nhân là: số đẻ ra/ổ ≥13,67 con; số sống/ổ ≥12,45 con; số cai sữa/ổ ≥11,82 Ghi * Cá nhân tham gia thực nhiệm vụ: (Người tham gia thực đề tài thuộc tổ chức chủ trì quan phối hợp, khơng q 10 người kể chủ nhiệm) Số TT Tên cá nhân Tên cá nhân đăng ký theo tham gia Thuyết minh thực TS Nguyễn TS Nguyễn Hữu Tỉnh Hữu Tỉnh ThS Nguyễn Văn Hợp ThS Nguyễn Văn Hợp ThS Trần Văn Hào ThS Trần Văn Hào ThS Nguyễn Ngọc Thanh Yên ThS Nguyễn Ngọc Thanh Yên Nội dung tham gia Sản phẩm chủ yếu đạt - Chủ trì đề tài - Phân tích thống kê di truyền - Xây dựng số chọn lọc - Hồn thiện quy trình đánh giá di truyền - Viết báo cáo nghiệm thu - Thư ký đề tài - Thu thập mẫu máu, - Phân tích thống kê xác định liên quan kiểu gen với tính trạng - Tham gia hồn thiện quy trình đánh giá di truyền - Tham gia viết báo cáo - Triển khai nội dung - Thu thập liệu suất - Đánh giá chọn lọc, loại thải - Xây dựng kế hoạch ghép phối - Xây dựng đàn giống hạt nhân - Thu thập liệu suất sinh sản - Thu thập mẫu máu - Tham gia xây dựng - Kết phân tích thống kê di truyền - Chỉ số chọn lọc - Quy trình đánh giá di truyền - Các báo cáo nghiệm thu - Các mẫu máu, - Báo cáo phân tích thống kê xác định liên quan kiểu gen với tính trạng - Quy trình đánh giá di truyền - Các báo cáo - Báo cáo kết nội dung - Dữ liệu suất - Đàn giống chọn lọc, loại thải - Đàn giống hạt nhân - Dữ liệu suất sinh sản - Các mẫu máu - BC đàn giống Ghi chú* ThS Nguyễn Thị Lan Anh ThS Nguyễn Thị Lan Anh KS Hoàng Trung Hiếu KS Hoàng Trung Hiếu CN Trịnh Thị Thu Thảo CN Trịnh Thị Thu Thảo ThS Nguyễn Thị Hiệp ThS Nguyễn Thị Hiệp 10 BSTY Nguyễn Văn Phong BSTY Nguyễn Văn Phong đàn giống hạt nhân - Tham gia hồn thiện quy trình đánh giá di truyền - Thu thập liệu suất sinh sản - Thu thập mẫu máu - Tham gia phân tích thống kê - Tham gia viết báo cáo khoa học - Thu thập mẫu máu - Phân tích kiểu gen ESR FSHB - Đánh giá kiểu gen ESR gen FSHB - Thu thập mẫu máu - Phân tích kiểu gen ESR FSHB - Đánh giá kiểu gen ESR gen FSHB - Thu thập liệu suất sinh sản - Thu thập mẫu máu - Tham gia phân tích thống kê - Thu thập liệu suất sinh sản - Thu thập mẫu máu - Tham gia xây dựng đàn giống hạt nhân hạt nhân - Quy trình đánh giá di truyền - Dữ liệu suất sinh sản - Các mẫu máu - Báo cáo phân tích thống kê - Báo cáo khoa học - Các mẫu máu - Kết phân tích đánh giá kiểu gen ESR FSHB - Các mẫu máu - Kết phân tích đánh giá kiểu gen ESR FSHB - Dữ liệu suất sinh sản - Các mẫu máu - Báo cáo phân tích thống kê - Dữ liệu suất sinh sản - Các mẫu máu - BC đàn giống hạt nhân Tình hình hợp tác quốc tế: Không Số TT Theo kế hoạch (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đoàn, số lượng người tham gia ) Thực tế đạt (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số đồn, số lượng người tham gia ) 10 Ghi chú* - Phân tích kiểu gen ESR: Sử dụng CCTGTTTTTACAGTGACTTTTACAGAG cặp mồi xuôi ngược mồi ESR-F: ESR-R: CACTTCGAGGGTCAGTCCAATTAG để nhận diện đa hình ESR vị trí A65B nằm intron enzyme phân cắt giới hạn PvuII (CAGCTG) Phản ứng PCR thực tube Eppendorf 0,5 ml gồm thành phần gồm 12.5 µL mastermix (MyTaq™ Mix, Bioline), µL mồi xi (10 mM), µL mồi ngược (10 mM) (IDT), 10 µL dH2O (Bioline) 0.5 µL DNA với 35 chu kỳ thiết bị PCR Mastercycler proS (Eppendorf, Đức) Sản phẩm PCR sau kiểm tra gel agarose 1% nhuộm với 6X GelRedTM Loading Buffer with TriColor (TBR, Việt Nam) thiết bị MultiSUB midi (Cleaver, Anh) hiệu điện 150V 20 phút Thành phần phản ứng PCR-RFLP gồm 18µL dH2O, 2µL Buffer R, 1µL PvuII enzyme 10µL sản phẩm PCR ủ nhiệt độ 37oC 16 tiếng thiết bị Biosan (EU) Sản phẩm PCR-RFLP/PvuII sau điện di gel agarose 3% nhuộm với TBR hiệu điện 150V 45 phút MultiSUB midi, kiểm tra đèn cực tím máy ghi hình ảnh gel điện di GelDoc-It2 (UVP, Mỹ) để nhận diện alen A B locus T1227C Kết cho kiểu gen ESR AA (120 bp), kiểu gen BB (65+55bp) kiểu gen AB (120+65+55bp) - Phân tích kiểu gen FSHB: Sử AGTTCTGAAATGATTTTTCGGG dụng cặp mồi mồi xuôi ngược FSHB-F: FSHB-R: TTTGCCATTGACTGTCTTAAAGG để nhận diện đa hình FSHB nằm intron enzyme phân cắt giới hạn HaeIII để nhận diện đa hình gen FSHB Phản ứng PCR thực tube Eppendorf 0,5 ml gồm thành phần gồm 12.5 µL mastermix (MyTaq™ Mix, Bioline), µL mồi xi (10 mM), µL mồi ngược (10 mM) (IDT), 10 µL dH2O (Bioline) 0.5 µL DNA với 35 chu kỳ thiết bị PCR Mastercycler proS (Eppendorf, Đức) Sản phẩm PCR sau kiểm tra gel agarose 1% nhuộm với 6X GelRedTM Loading Buffer with TriColor (TBR, Việt Nam) thiết bị MultiSUB midi (Cleaver, Anh) hiệu điện 150V 20 phút Sau cắt sản phẩm 109 PCR enzyme HaeIII, kết cho kiểu gen DD (332, 208, 84 bp), kiểu gen CD (332, 208, 173, 159, 84 bp), kiểu gen CC (208, 173, 159, 84 bp) 2.2 Đánh giá giá trị giống thiết lập số SPI - Xuất liệu cho đánh giá di truyền từ mục khai thác liệu phần mềm HEOMAN HEOPRO-C HEOPRO+ đặt tên, lưu trữ tập tin liệu (DAT) tập tin hệ phả (PED) vào ổ đĩa máy tính - Xây dựng tập tin tham số điều khiển (pfile) có cú pháp cấu trúc theo yêu cầu phần mềm PEST, đây: COMMENT EBV of Sinh san heo, Multi_trait model everything solved by IOC in memory system_size non_zero = 1000000 total = 10000000 DATA INFILE = 'D:\BLUP\PEST\data\SS-dat.txt' OUTFILE = 'D:\blup\vce\data\SS.cod' [text INPUT [ VAR_NAME MAXLEVEL START_COLUMN VAR_LENGTH DECIMAL ] animal 20000 11 sire 5000 13 11 dam 8000 25 11 mc 5000 11 litter 5000 46 15 hys 5000 62 KC 71 tuoide 15 76 NBA 79 NW 82 KL21 85 DISK TRANSFORMATION TREATED_AS_MISSING NBA none, 00 ,none NW none, 00 ,none KL21 none, 000.0 ,none RELATIONSHIP rel_for animal INFILE = 'D:\BLUP\PEST\data\SS-ped.txt' unknown = ' 00000000000 ' OUTFILE = 'D:\blup\vce\data\SS.ped' [text INPUT animal 11 m_p 13 11 f_p 25 11 birthdate 37 DISK HYPOTHESIS PEV MODEL NBA NW KL21 = hys kc tuoide litter animal VE 8.327 2.239 11.967 2.239 3.268 19.996 110 11.967 19.996 192.716 VG vg_for animal 2.2969 0.5793 2.7059 0.5793 0.2179 1.4051 2.7059 1.4051 21.3617 vg_for litter 0.00352 -0.01136 -0.06164 -0.01136 0.07866 0.81072 -0.06164 0.81072 9.99347 SOLVER /IOC IOD IOCD SMP ioc [stop = 001 printout outfile 'D:\blup\pest\temp\KQ_HOANG\EBV-LandBMKM' page_len=99999999 - Thiết lập số chọn lọc: Dựa việc kết hợp giá trị kinh tế tính trạng chọn lọc với giá trị giống tính trạng số sơ sinh sống/ổ số cai sữa/ổ khối lượng 21 ngày tuổi/ổ, theo khuyến cáo từ Hiệp hội cải tiến giống lợn Hoa Kỳ (NSIF, 2002) sau: SPI = 100 + 25/SD (v1.EBVSCS + v2.EBVP21 + v3.EBVCS) Trong đó, EBVSCS giá trị giống tính trạng số sơ sinh sống/ổ, EBVP21 giá trị giống tính trạng khối lượng 21 ngày tuổi/ổ, EBVCS giá trị giống tính trạng số cai sữa/ổ SD độ lệch chuẩn giá trị giống v1, v2 , v3 hệ số kinh tế tính trạng (v1 = 3,09 ; v2 = 0,17 v3 = 1,72 theo kết nghiên cứu Nguyễn Hữu Tỉnh ctv (2014) - Từ công thức số chọn lọc trên, đàn giống chọn lọc có số giá trị giống trung bình 100 độ lêch chuẩn 25 Bước Đánh giá chọn lọc kết hợp số SPI với kiểu gen ESR FSHB - Đánh giá mối liên kết kiểu gen AA, BB AB (gen ESR) CC, DD CD (gen FSHB) với tính trạng số sơ sinh sống/ổ, số cai sữa/ổ khối lượng 21 ngày tuổi/ổ để xác định kiểu gen kiểu gen có ảnh hưởng tích cực đến tiêu sau tiến hành phân loại đàn giống Landrace Yorkshire theo kiểu gen 111 - Từ đàn giống Landrace Yorkshire diện (gồm hậu bị) có kết phân tích kiểu gen kết đánh giá giá trị giống, chọn tất cá thể có số nái sinh sản SPI lớn 100 điểm - Từ nhóm cá thể chọn có số SPI lớn 100 điểm, tiếp tục chọn lọc cá thể có kiểu gen BB AB với gen ESR kiểu gen CC CD với gen FSHB - Công thức tổng quát sau: Chọn lọc cá thể = Chỉ số SPI (>100 điểm) + + Kiểu gen ESR (BB AB) + Kiểu gen FSHB (CC CD) - Tỷ lệ chọn lọc để thiết lập đàn hạt nhân tiếp tục nhân giống đực hậu bị từ 2-5% hậu bị từ 20-25% đàn kiểm tra suất; nái sinh sản chọn 10-15% số cá thể đàn nái sinh sản, ưu tiên chọn tất cá thể có số SPI lớn 100 điểm, đồng thời mang kiểu gen BB với gen ESR kiểu gen CC với gen FSHB, sau đến cá thể mang kiểu gen AB với gen ESR kiểu gen CD với gen FSHB Bước 4: Nhân giống tiếp tục chọn lọc - Tiếp tục thu thập liệu sinh sản đàn nái hạt nhân đàn sản xuất khác có quan hệ huyết thống để tiếp tục gia tăng mức độ xác đánh giá giá trị giống đàn nái hạt nhân - Từ đàn hạt nhân này, tiến hành ghép phối tiếp tục nhân đàn nguyên tắc tăng dần tần số gen B (gen ESR) gen C (gen FSHB) có ảnh hưởng tốt đến tính trạng chọn lọc qua hệ nhân giống - Nguyên tắc ghép phối: Luôn ưu tiên chọn đực giống để ghép phối với có kiểu gen đồng hợp tử BB (gen ESR) CC (gen FSHB), đồng thời có giá trị số SPI cao Có thể xem xét khống chế mức độ cận huyết ghép phối có đủ đực giống mang kiểu gen mong muốn quan hệ huyết thống không trực hệ với - Tiếp tục đánh số cá thể đời sinh hệ tiếp theo, cập nhật thơng tin hệ phả thường xun, xác cá thể đàn giống 112 - Tiếp tục kiểm tra suất đàn hậu bị thu thập liệu suất cá thể hệ sinh ra, kết hợp đánh giá ngoại hình kết thúc kiểm tra suất với đánh giá giá trị giống tính trạng sinh trưởng, dày mỡ lưng số dòng mẹ đàn giống hậu bị - Tiếp tục thu thập mẫu DNA cá thể chưa biết kiểu gen chúng đàn giống hậu bị này, để tiếp tục phân tích xác định kiểu gen ESR gen FSHB 113 Phụ lục 7: HƯỚNG DẪN THỰC HIỆN QUY TÌNH CHỌN LỌC VÀ NHÂN GIỐNG DỰA TRÊN KIỂU GEN KẾT HỢP VỚI GIÁ TRỊ GIỐNG Đánh số cá thể Có thể sử dụng hệ thống đánh số tai nào, song số ký tự số tai phải đảm bảo không ký tự Có thể tham khảo hệ thống đánh số tai áp dụng số quốc gia Mỹ, Canada hay Đài Loan hình vẽ Trong hình vẽ này, số hiệu lứa đẻ năm (từ 1/1 – 31/12) cắt tai bên phải , số hiệu cá thể (14) cắt tai bên trái (L) số tai cá thể đọc 121-14 Mã hóa số hiệu cá thể Để tránh trùng lặp số hiệu cá thể đàn/trại đàn/trại với trại khác, lựa chọn hệ thống mã số cá thể kết hợp số tai với nguồn gốc (nơi sinh), năm sinh số tai cá thể Lưu ý, để tích hợp liệu với yêu cầu phần mềm đánh giá giá trị giống PEST, tổng số ký tự mã số cá thể khơng vượt q 11, ví dụ sau đây: Ví dụ: cá thể có mã số BM 19 0121-14 Trong (từ trái sang phải): - số “BM” mã số nguồn gốc (nơi sinh) cá thể - số “19” mã số năm sinh cá thể (năm 2019) - số “0121-14” số tai cá thể 114 Thu thập liệu kiểm tra suất cá thể - Nếu lợn hậu bị đưa vào kiểm tra có nguồn gốc từ trại, khu trại khác, cần có thời gian ngày để chúng làm quen với điều kiện tiểu khí hậu khu trại kiểm tra suất - Ni tách riêng theo nhóm giới tính ô cách xa - Số lượng lợn hậu bị kiểm tra theo nhóm từ 12 – 15 con/ơ chuồng với mật độ 1,3 – 1,5m2/con suốt giai đoạn kiểm tra suất - Cho ăn phần lượng cao hàm lượng protein tối thiểu 18% 35 ngày giai đoạn kiểm tra suất, sau giảm bớt hàm lượng protein phần xuống 17,5% kết thúc kiểm tra - Thu thập liệu tiêu thụ thức ăn cá thể sử dụng trạm kiểm tra suất tự động với hệ thống “chíp” điện tử gắn cho cá thể, chuồng khơng có hệ thống “chíp” - Cập nhật liệu kiểm tra suất vào biểu 1.1 biểu 1.2 Biểu mẫu 1: Biểu thu thập quản lý hệ phả lợn hậu bị KTNS cá thể Mã số cá thể Mã số bố Mã số mẹ Ngày sinh Tính biệt Nhóm giống Nguồn gốc (nơi sinh) Đàn/trại (ni giữ) Kiểu chuồng ni (kín/hở) Biểu mẫu 2: Biểu thu thập tiêu kiểm tra suất cá thể chủ yếu Mã số cá thể Ngày sinh Tính biệt Ngày vào kiểm tra KL vào kiểm tra Ngày kết thúc kiểm tra KL kết thúc kiểm tra Mỡ lưng Thức ăn tiêu thụ (*) (*): Tổng thức ăn giai đoạn KTNSCT theo dõi theo cá thể theo nhóm 115 Thu thập liệu suất sinh sản - Biểu mẫu sử dụng để cập nhật hệ phả đàn đực giống Biểu 3: Biểu thu thập quản lý hệ phả đực giống Mã đực giống - Mã số bố Mã số mẹ Giống Ngày sinh Nguồn gốc (nơi sinh) Đàn/trại (nuôi giữ) Các biểu mẫu 4, 5, 6, biểu mẫu 8) sử dụng để cập nhật số liệu đàn nái sinh sản Biểu 4: Biểu thu thập quản lý hệ phả đàn nái sinh sản Mã số nái Mã số bố Mã số mẹ Giống Ngày sinh Nguồn gốc (nơi sinh) Đàn/trại (nuôi giữ) Biểu 5: Biểu thu thập quản lý hệ phả lợn Mã số cá thể Mã số bố Mã số mẹ Ngày sinh Giống Nguồn gốc (nơi sinh) Tính biệt Đàn/trại (ni giữ) Biểu 6: Biểu thu thập liệu phối giống Mã số nái Ngày sinh Giống Lứa đẻ Ngày phối 116 Mã đực phối Phương thức phối Nhân viên phối giống Biểu 7: Biểu thu thập quản lý liệu nái đẻ Mã số nái Ngày sinh Giống Lứa đẻ Ngày đẻ Số đẻ Số sống Số chết Số thực nuôi KL sơ sinh/ ổ Biểu 8: Biểu thu thập quản lý liệu nái cai sữa Mã số nái Ngày sinh Giống Lứa đẻ Ngày đẻ Ngày cai sữa Số cai sữa KL cai sữa/ổ Các tiêu chuẩn đánh giá ngoại hình - Sau kết thúc kiểm tra suất, tiến hành đánh giá ngoại hình theo tiêu chí trình bày biểu mẫu 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 18 - Tổng hợp đánh giá tiêu ngoại hình số chọn lọc tổng quát biểu mẫu Ở cột kết luận không chọn tiêu ngoại hình có thang điểm