Nhiễm khuẩn phế cầu ở trẻ em tại bệnh viện nhi đồng 2 đặc điểm lâm sàng, tuýp huyết thanh, gen độc lực và gen đề kháng kháng sinh

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH oOo VÕ THỊ MINH TUYỀN NHIỄM KHUẨN PHẾ CẦU Ở TRẺ EM TẠI BỆNH VIỆN NHI ĐỒNG 2: ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, TUÝP HUYẾT THANH, GEN ĐỘC LỰC VÀ GEN ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH LUẬN VĂN BÁC SĨ NỘI TRÚ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH oOo VÕ THỊ MINH TUYỀN NHIỄM KHUẨN PHẾ CẦU Ở TRẺ EM TẠI BỆNH VIỆN NHI ĐỒNG 2: ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, TUÝP HUYẾT THANH, GEN ĐỘC LỰC VÀ GEN ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CHUYÊN NGÀNH: NHI KHOA MÃ SỐ: NT 62 72 16 55 LUẬN VĂN BÁC SĨ NỘI TRÚ NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS TS PHẠM THỊ MINH HỒNG THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu kết nêu luận văn hồn tồn trung thực chưa cơng bố cơng trình nghiên cứu khác Tác giả luận văn Võ Thị Minh Tuyền LỜI CÁM ƠN Nghiên cứu nhánh nghiên cứu hợp tác Bệnh viện Nhi Đồng Đơn Vị Nghiên Cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford (OUCRU) Dữ liệu nghiên cứu khoa học chia sẻ từ Dự Án Nghiên Cứu “Khảo sát lưu hành chủng Streptococcus pneumoniae trẻ em khoẻ mạnh cộng đồng trẻ viêm phổi cộng đồng: tỉ lệ diện phổ kháng sinh nhạy cảm Việt Nam” Tơi xin trân trọng cám ơn nhóm nghiên cứu OUCRU bao gồm cô PGS TS Ngô Thị Hoa, nghiên cứu viên Huỳnh Xuân Yến phân tích gen cung cấp kết hỗ trợ cho nghiên cứu Đồng thời xin trân trọng cám ơn quý thành viên nhóm nghiên cứu 26ZN Dự Án Nghiên Cứu tài trợ Pfizer hỗ trợ việc thực nghiên cứu MỤC LỤC Trang phụ bìa Lời cam đoan Lời cám ơn Mục lục Danh mục đối chiếu Anh Việt i Danh mục từ viết tắt tiếng Việt iii Danh mục bảng iv Danh mục biểu đồ - hình - sơ đồ vi MỞ ĐẦU CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Đặc điểm vi sinh 1.2 Đặc điểm lâm sàng 18 1.3 Tình hình nghiên cứu nước 38 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 41 2.1 Thiết kế nghiên cứu 41 2.2 Đối tượng nghiên cứu 41 2.3 Cỡ mẫu 41 2.4 Tiêu chuẩn chọn mẫu 41 2.5 Các bước tiến hành 44 2.6 Sơ đồ nghiên cứu 46 2.7 Biến số 47 2.8 Vấn đề y đức 56 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ 57 3.1 Đặc điểm dịch tễ nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 58 3.2 Đặc điểm lâm sàng chung nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 59 3.3 Đặc điểm lâm sàng viêm phổi phế cầu trẻ em 62 3.4 Đặc điểm lâm sàng nhiễm khuẩn huyết phế cầu trẻ em 66 3.5 Đặc điểm lâm sàng chung viêm màng não phế cầu trẻ em 70 3.6 Đặc điểm vi sinh nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 75 3.7 Kết điều trị nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 85 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 88 4.1 Đặc điểm dịch tễ nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 88 4.2 Đặc điểm lâm sàng nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 89 4.3 Đặc điểm vi sinh nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 95 4.4 Kết điều trị nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em 104 KẾT LUẬN 106 KIẾN NGHỊ 108 CƠNG TRÌNH NGHIÊN CỨU ĐÃ ĐƯỢC CÔNG BỐ TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC i DANH MỤC ĐỐI CHIẾU ANH VIỆT Từ viết tắt Nghĩa tiếng Anh Nghĩa tiếng Việt ADH Antidiuretic Hormone Hóc mơn chống niệu ALT Alanine Aminotransferase ANSRP The Asian Network for Mạng lưới giám sát Tác nhân Surveillance of Resistant Pathogens Kháng thuốc châu Á AST Aspartate Aminotransferase BMI Body Mass Index Chỉ số khối thể CDC Centers for Disease Control and Prevention Trung tâm Phòng ngừa Kiểm soát Bệnh tật CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute Viện tiêu chuẩn lâm sàng cận lâm sàng CRP C-Reactive Protein Protein phản ứng viêm C CRT Capillary Refill Time Thời gian phục hồi mao mạch CT-scan Computed Tomography scan Chụp cắt lớp điện toán EEG Electroencephalography Điện não đồ Hib Haemophilus influenzae tuýp b IDSA The Infectious Diseases Society of America Hiệp hội Các bệnh Truyền nhiễm Hoa Kỳ IHME Institute for Health Metrics and Evaluation Viện Đo lường Đánh giá Sức khỏe INR International Normalized Ratio LDH Lactate dehydrogenase MDR Multidrug Resistant Đa kháng thuốc MIC Minimum Inhibitory concentration Nồng độ ức chế tối thiểu MRI Magnetic resonance imaging Chụp cộng hưởng từ NCPAP Nasal Continous Positive Airway Pressure Thở áp lực dương liên tục qua mũi PBP Penicillin-binding proteins Protein liên kết với penicillin PC Streptococcus pneumoniae Phế cầu PCR Polymerase chain reaction Phản ứng khuếch đại gen PCV Pneumococcal Conjugated Vaccines Vắc xin phế cầu cộng hợp ii Áp lực dương cuối thở PEEP Positive End Expiratory Pressure PNC Penicillin PPSV Pneumococcal Polysaccharide Vaccin Vắc xin polysaccharide phế cầu PSCC The Pediatric Sepsis Consensus Conference Hội Nghị Đồng Thuận Nhiễm Khuẩn Huyết Trẻ Em SGOT Glutamic Oxaloacetic Transaminase SGPT Glutamic Pyruvic Transaminase SIRS Systemic Inflammatory Response Syndrome Hội chứng đáp ứng viêm toàn thân SSC 2020 Surviving Sepsis Campaign International Guidelines for the Management of Septic Shock and Sepsis Associated Organ Dysfunction in Children 2020 Hướng dẫn Quốc tế Điều trị Sốc nhiễm khuẩn Rối loạn chức quan liên quan đến Nhiễm khuẩn huyết Trẻ em năm 2020 WHO The World Health Organization Tổ chức Y tế Thế giới iii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT TIẾNG VIỆT Từ viết tắt Nghĩa BPCKXL Bệnh phế cầu không xâm lấn BPCXL Bệnh phế cầu xâm lấn CDTS Chọc dò tủy sống CNLS Cân nặng lúc sinh DMP Dịch màng phổi DNT Dịch não tủy TALNS Tăng áp lực nội sọ TDMP Tràn dịch màng phổi PC Phế cầu VMMP Viêm mủ màng phổi VMNM Viêm màng não mủ iv DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1.Yếu tố nguy nhiễm PC xâm lấn Bảng 1.2 Các yếu tố độc lực PC 12 Bảng 1.3 Triệu chứng dấu hiệu thường gặp viêm phổi PC .19 Bảng 1.4 Tần suất biến chứng phổi viêm phổi phế cầu 21 Bảng 1.5 Đặc điểm khác biệt TDMP dịch tiết TDMP dịch thấm 25 Bảng 2.1 Bảng biến số thu thập .47 Bảng 2.2: Độ nặng viêm phổi .54 Bảng 3.1 Đặc điểm dịch tễ nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em .58 Bảng 3.2 Tiền sản khoa nhiễm khuẩn phế cầu trẻ em .59 Bảng 3.3 Tình trạng dinh dưỡng 59 Bảng 3.4 Tình trạng chủng ngừa 59 Bảng 3.5 Bệnh trẻ nhiễm khuẩn phế cầu 60 Bảng 3.6 So sánh đặc điểm nhóm bệnh phế cầu khơng xâm lấn xâm lấn 61 Bảng 3.7 Triệu chứng lâm sàng viêm phổi PC 62 Bảng 3.8 Đặc điểm xét nghiệm máu viêm phổi phế cầu 63 Bảng 3.9 Đặc điểm hình ảnh học viêm phổi PC 64 Bảng 3.10 Đặc điểm điều trị viêm phổi PC .64 Bảng 3.11 Triệu chứng lâm sàng nhiễm khuẩn huyết PC 67 Bảng 3.12 Đặc điểm cận lâm sàng nhiễm khuẩn huyết PC trẻ em 68 Bảng 3.13 Đặc điểm điều trị nhiễm khuẩn huyết PC trẻ em 69 Bảng 3.14 Triệu chứng lâm sàng viêm màng não PC .71 Bảng 3.15 Đặc điểm cận lâm sàng viêm màng não PC trẻ em 71 Bảng 3.16 Đặc điểm điều trị viêm màng não PC trẻ em 73 Bảng 3.17 Mối liên quan yếu tố dịch tễ học lâm sàng với tỉ lệ kháng kháng sinh 76 Bảng 3.18 Mối liên quan tuýp huyết phế cầu với bệnh cảnh lâm sàng tỉ lệ tử vong .79 Bảng 3.19 Tỉ lệ kháng kháng sinh tuýp huyết phế cầu .80 Bảng 3.20 Liên quan nhóm gen độc lực bệnh cảnh lâm sàng .82 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 23 Phế âm giảm  Có  Không  Không ghi nhận 24 Tiếng ran phổi Nếu có:  Có  Khơng  Khơng ghi nhận  Ran ẩm  Ran nổ  Ran ngáy  Ran rít  Có  Khơng  Khơng ghi 25 Gan sờ hạ sườn phải nhận Nếu có, ghi rõ ……… cm 26 Ban xuất huyết  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 27 Thóp phồng  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 28 Cổ gượng  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 29 Dấu Brudzinski  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 30 Dấu Kernig  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 31 Gồng vỏ  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 32 Duỗi não  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 33 Phù gai thị  Có  Không  Không ghi nhận 34 Dấu thần kinh khu trú  Có  Khơng  Khơng ghi nhận 35 Chẩn đoán lúc nhập viện 36 Bệnh kèm (điền “Khơng có” khơng có) IV CẬN LÂM SÀNG Huyết học  Thực  Không thực Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Hemoglobin (HGB) ……… g/dL Hematocrit ……… % MCV ……… fL MCH ……… pg MCHC ……… g/dL RDW ……… % Bạch cầu (WBC) ……… K/µL Bạch cầu trung tính (NEU) ……… % ……… K/µL Bạch cầu đơn nhân (MONO) ……… % ……… K/µL Bạch cầu lympho (LYM) ……… % ……… K/µL Bạch cầu toan (EOS) ……… % ……… K/µL Bạch cầu kiềm (BASO) ……… % ……… K/µL Tiểu cầu (PLT) ……… K/µL Sinh hóa CRP ……… mg/L  Không thực Procalcitonin ……… ng/dL  Không thực SGOT/AST ……… U/L  Không thực SGPT/ALT ……… U/L  Khơng thực Creatinin/máu ……… µmol/L  Khơng thực Natri/máu ……… mmol/L  Không thực Kali/máu ……… mmol/L  Khơng thực Bilirubin tồn phần/máu ……… mmol/L  Không thực Lactate/máu ……… mmol/L  Không thực Glucose/máu ……… mmol/L  Khơng thực Khí máu động mạch  Thực  Không thực pH ……… pO2 ……… mmHg pCO2 ……… mmHg Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh HCO3- ……… mmol/L Base excess (BE) ……… mmol/L FiO2 ……… % SaO2 ……… % AaDO2 ……… mmHg Dịch não tủy  Thực  Không thực ……… ……… Màu sắc Số lượng bạch cầu ……… tế bào/mm3 Đạm (protein) ……… g/L Đường (glucose) ……… mmol/L Đường DNT/glucose máu ……… Lactate ……… mmol/L Dịch màng phổi Màu sắc  Thực  Không thực ……… ……… Số lượng bạch cầu ……… tế bào/mm3 Neutrophil ……… % Đạm (protein) ……… g/L Đường (glucose) ……… mmol/L Đạm DMP / Đạm máu ……… LDH ……… mmol/L LDH DMP / LDH máu ……… Kết hình ảnh học X quang ngực:  Thực  Không thực Kết quả: Siêu âm ngực:  Thực  Khơng thực Tn thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Kết quả: Siêu âm thóp:  Thực  Khơng thực Kết quả: CT-scan não:  Thực  Không thực Kết quả: CT-scan ngực:  Thực  Không thực Kết quả: Cấy vi sinh chẩn đoán Lần Loại mẫu (Đàm, DMP, DNT, máu,…) Tác nhân Lần Lần  Dương tính  Dương tính  Dương tính  Âm tính  Âm tính  Âm tính …………………… …………………… …………………… Tên tác nhân …………………… …………………… …………………… Đối với mẫu bệnh phẩm đường hơ hấp (ví dụ NTA, đàm, …), kết nhuộm đếm tế bào 10x theo thang điểm Bartlett: ……… ……… ……… Điểm  < 10  < 10  < 10 Số tế bào bạch  10 – 25  10 – 25  10 – 25 cầu  > 25  > 25  > 25  < 10  < 10  < 10 Số tế bào biểu  10 – 25  10 – 25  10 – 25 mô Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Đại thể  > 25 …………………… ……………………  > 25 …………………… ……………………  > 25 …………………… …………………… Kháng sinh đồ phế cầu Kháng sinh Ciprofloxacin Daptomycin Doxycycline Gentamycin Linezolid Minocycline Oxacillin Penicillin G Trimethprim/Sulfamethoxazol e Tetracycline Vancomycin Nhạy Trung gian Kháng Không nhạy Xét nghiệm khác 9.1 Xét nghiệm miễn dịch xác định tác nhân gây bệnh khơng điển hình  Thực Tác nhân  Không thực Kết  Dương tính  Âm tính  Khơng thực  Dương tính Mycoplasma  Âm tính pneumoniae  Khơng thực Legionella pneumophila  Dương tính  Âm tính  Khơng thực  Dương tính Khác, ghi rõ …………………………  Âm tính …………………………  Khơng thực Chlamydia pneumoniae Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn IgM dương tính  IgG dương tính        Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 9.2.Xét nghiệm sinh học phân tử để xác định tác nhân gây bệnh  Thực  Không thực Tên tác nhân ……………………………….……………………………… ……………………………… ……………………………… ……………………………….……………………………… V ĐIỀU TRỊ Điều trị kháng sinh Thuốc điều trị STT Tên kháng sinh ………………… ………………… ………………… ………………… ………………… ………………… Liều dùng (Tổng liều/ngày) ……… ……… ……… ……… ……… ……… Đổi kháng sinh trình điều trị Đường dùng Số ngày sử dụng (ngày) ……… ……… ……… ……… ……… ……… ……… ……… ……… ……… ……… ………  Có  Khơng Nếu Có, điền thơng tin vào bảng sau: Tên Kháng sinh cũ …………………… …………………… …………………… …………………… …………………… …………………… Số ngày điều trị (ngày) …… …… …… …… …… …… Kháng sinh Lý đổi …………………… …………………… …………………… …………………… …………………… …………………… … … … … … … Điều trị khác Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Thời điểm thở oxy Nếu có, thở oxy  Có  Khơng  lúc nhập viện  vòng 24 sau nhập viện ……… % / ……… lít/phút FiO2/oxy qua canula cao Thở NCPAP  Có  Khơng Thời gian thở oxy trước thở NCPAP ………ngày Thời gian thở NCPAP ……… ngày PEEP cao ……… cmH2O FiO2/NCPAP cao ……… % Thời gian thở oxy sau ngưng NCPAP ……… ngày Đặt nội khí quản Nếu có, đặt  Có  Khơng  lúc nhập viện  vòng 24 sau nhập viện Truyền dịch Điện giải  Có  Khơng Cao phân tử  Có  Khơng Albumin  Có  Khơng Adrenaline  Có  Khơng Noradrenaline  Có  Khơng Dopamin  Có  Khơng Dobutamin  Có  Khơng Thuốc vận mạch Thủ thuật thực trẻ thời gian điều trị bệnh viện (ví dụ dẫn lưu màng phổi, đặt catheter tĩnh mạch/động mạch, chọc dịch não tủy ) ……………………………….……………………………… ……………………………… ……………………………… ……………………………….……………………………… Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh VI KẾT QUẢ ĐIỀU TRỊ Chẩn đoán xuất viện Tình trạng xuất viện  Xuất viện  Chuyển viện  Tử vong/nặng xin  Khác:……………………………………………………… Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Phụ lục Đặc điểm dịch não tủy điển hình số trường hợp (Nelson 2020) Đặc điểm Áp lực (cmH2O) Bình thường 15,5 hay 18 >13,5 hay 14 >11 hay