0356Khảo sát tính đề kháng kháng sinh của các chủng Staphylococcus anureus phân lập được từ các mẫu bệnh phẩm máu và mủ tại Bệnh viện Nhi Đồng

B GIÁO D C ÀO T O TR NG I H C M TP HCM  BÁO CÁO KHÓA LU N T T NGHI P Tên chuyên đ : Kh o sát tính đ kháng kháng sinh c a ch ng Staphylococcus aureus phân l p đ c t m u b nh ph m máu m t i B nh vi n Nhi ng II t tháng 11/2013 đ n tháng 04/2014 KHOA: CÔNG NGH SINH H C CHUYÊN NGÀNH: VI SINH-SHPT GVHD: ThS.BS Tr n Th Ng c Anh SVTH: Nguy n Th Hu nh Nh MSSV: 1053012551 L p: SH10A4 Khóa h c: 2010-2014 Tp H Chí Minh, ngày tháng n m Xác nh n c a GVHD TP.HCM, ngày …… tháng …… n m …… Ch ký c a Gi ng viên (Ký ghi rõ h tên) Ths.Bs TR N TH NG C ANH L IC M N L i đ u tiên, em xin g i l i c m n chân thành đ n Ths.BS Tr n Th Ng c Anh, tr ng khoa Vi sinh B nh vi n Nhi ng II, ng i t n tình h ng d n, ch b o, giúp đ em su t trình h c, th c hi n hồn thành khóa lu n t t nghi p Xin g i l i c m n đ n Ban Giám đ c b nh vi n Nhi t o u ki n cho em th c t p t i khoa Vi sinh c a b nh vi n ng II đ ng ý M c dù l n đ u tiên em đ c ti p xúc v i môi tr ng làm vi c th c t , b n thân nhi u h n ch , thi u sót ki n th c chun mơn k n ng m m, nh ng nh có s giúp đ h ng d n nhi t tình c a cô Tr n Th Ng c Anh, tr ng khoa Vi sinh B nh vi n Nhi ng II, anh ch làm vi c khoa, đ c bi t anh ch làm vi c t i nhóm ni c y Vi Khu n nên em hồn thành khóa lu n t t nghi p Trong trình th c t p t i Khoa, có u thi u xót, mong cô anh ch thông c m b qua cho em Em xin chân thành c m n Ban giám hi u nhà tr ng th y cô khoa Công ngh sinh h c truy n đ t cho em nh ng ki n th c quý báu t o u ki n cho em su t th i gian h c rèn luy n t i tr ng Cu i cùng, em xin g i l i chân thành c m n đ n gia đình, th y cơ, anh ch , b n bè giúp đ t o u ki n cho em trình th c t p t t nghi p t i b nh vi n Nhi đ ng II Em xin chân thành c m n! DANH SÁCH CH VI T T T BA: .Blood Agar Bactrim, SXT: Trimethoprime-sulfamethoxazole BCP: Bromocresol Purble Agar BP: Baird Parker C: Chloramphenicol CA: Chocolate Agar CD: Clindamycin CIP : Ciprofloxacine CLSI: Clinical and Laboratory Standards Institute CN: Gentamycine E: Erythromycin HIV: Human immunodeficiency virus MHA: Mueller Hinton Agar MRSA: Methicillin resistant Staphylococcus Areus MSA: Manitol sait agar ODC: Ornithine de hydrolase Ox: Oxacilline P: Penicilline PBPs: Penicillin binding protein RD: Rifampicin S.aureus: Staphylococcus aureus SCN: .Staphylococcus coagulase negative TCYTTG: T ch c Y t th gi i TSA: Tryptic soy agar TSST: Toxic shock syndrome toxin VA: Vancomycin VRSA: Vancomycin Resistant Staphylococcus aureus WHO: The World Health Organisation DANH M C HÌNH NH Hình 1: Hình thái Staphylococcus Trang Hình 2: T c u Staphylococcus aureus gram d ng du i kính hi n vi Trang Hình 3: Mơi tr ng BP Trang 11 Hình 4: Mơi tr ng Chapman Trang 11 Hình 5: Các y u t đ c l c c a Staphylococcus aureus Trang 14 Hình 6: T l S.aureus kháng Methicillin n m 2007 M La tinh vùng Caribe Trang 21 Hình 7: Vi khu n thách th c đ i v i kháng sinh Trang 29 Hình 8: Hình d ng khu n l c c a S.aureus m c BA, CA, BCP Trang 46 Hình 9: Thí nghi m sinh hóa đ nh danh S.aureus Trang 48 Hình 10: D-test d ng tính Trang 52 DANH M C B NG B ng 1: So sánh nh ng đ c tính c a S.aureus, S.epidermidis micrococci (Reginald W.B cs, 2001) Trang 11 B ng 2: M t s môi tr ng ch n l c cho S.aureus Trang 13 B ng 3: Các enzyme vi khu n ti t phá h y kháng sinh Trang 28 B ng 4: Các đ a kháng sinh đ t cho S.aureus Trang 36 B ng 5: K t qu nuôi c y phân l p loài vi khu n t b nh ph m máu Trang 55 B ng 6: K t qu nuôi c y phân l p loài vi khu n t b nh ph m m Trang 56 B ng 7: T l lo i vi khu n phân l p đ c t b nh ph m máu Trang 57 B ng 8: T l lo i vi khu n phân l p đ c t b nh ph m m Trang 58 B ng 9: K t qu phân l p S.aureus b nh ph m máu m Trang 59 B ng 10: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo gi i tính Trang 60 B ng 11: T l phân l p S.aureus theo đ tu i Trang 61 B ng 12: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo khoa b nh ph m máu Trang 62 B ng 13: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo khoa b nh ph m m …Trang 63 B ng 14: M c đ nh y c m kháng sinh c a S.aureus phân l p b nh ph m máu Trang 64 B ng 15: M c đ nh y c m kháng sinh c a S.aureus phân l p b nh ph m m Trang 65 B ng 16: Th nghi m D-test Trang 66 DANH M C BI U Bi u đ 1: S phân b vi khu n theo m u b nh ph m Trang 24 Bi u đ 2: M c đ kháng kháng sinh c a S.aureus Trang 31 Bi u đ 3: T l loài vi khu n t b nh ph m máu Trang 55 Bi u đ 4: T l loài vi khu n t b nh ph m m Trang 56 Bi u đ 5: T l lo i vi khu n phân l p đ c t b nh ph m máu Trang 57 Bi u đ 6: T l lo i vi khu n phân l p đ c t b nh ph m m Trang 58 Bi u đ 7: T l phân l p S.aureus b nh ph m máu m Trang 59 Bi u đ 8: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo gi i tính b nh ph m máu Trang 60 Bi u đ 9: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo gi i tính b nh ph m m Trang 60 Bi u đ 10: T l phân l p S.aureus theo đ tu i b nh ph m máu Trang 61 Bi u đ 11: T l phân l p S.aureus theo đ tu i b nh ph m m Trang 62 Bi u đ 12: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo khoa b nh ph m máu Trang 63 Bi u đ 13: T l b nh nhân b nhi m S.aureus theo khoa b nh ph m m Trang 64 Bi u đ 14: M c đ nh y c m kháng sinh c a S.aureus phân l p b nh ph m máu Trang 65 Bi u đ 15: M c đ nh y c m kháng sinh c a S.aureus phân l p b nh ph m m Trang 66 Bi u đ 16: Th ngi m D-test Trang 66 Bi u đ 17: So sánh t l đ kháng kháng sinh c a S.aureus m u b nh ph m máu m t 11/2013 đ n 04/2014 v i t l th ng kê t i B nh vi n Nhi ng II n m 2012 2013 Trang 69 Bi u đ 18: So sánh t l đ kháng kháng sinh c a S.aureus m u b nh ph m máu m t 11/2013 đ n 04/2014 v i t l th ng kê t i khoa H i s c tích c c Ch ng đ c B nh vi n c p c u Tr ng V ng n m 2010 Trang 70 DANH M C S S đ 1: Quy trình c y máu Trang 42 S đ 2: Quy trình c y m Trang 43 S đ 3: Quy trình đ nh danh S.aureus Trang 47 KHÓA LU N T T NGHI P GVHD: ThS.BS Tr n Th Ng c Anh II.2 Bàn lu n v m c đ nh y c a kháng sinh v i S.aureus II.2.1 i v i b nh ph m máu: Nh y 100 % v i kháng sinh:  Bactrim (SXT): Bactrim s k t h p c a sulfamethoxazol trimethoprim, đ u thu c kháng sinh đ u tr lo i khác c a nhi m trùng vi khu n gây  Rifampycin (RD): kháng sinh bán t ng h p t kháng sinh t nhiên  Vancomycin (VA): kháng sinh lo i glycopeptid nhân vịng ph h p Có t l kháng cao đ i v i kháng sinh thu c h -lactams S.aureus có kh n ng s n xu t -lactamase:  Penicilline (P): Các penam (vịng A có c nh bão hịa) t l kháng 96.55%  Oxacilline (OX): Có t l kháng 89.66% i v i kháng sinh nhóm Aminoglycosides thu c h -lactams nh Gentamycin (CN) có t l kháng 55.17% i v i kháng sinh thu c h Quinolones: t l kháng Ciprofloxacine (CIP) 48.28 % ây kháng sinh có ph kháng khu n r t r ng v i l nh y cao m t nh ng l a ch n cho bác s u tr nhi m khu n S.aureus, nhiên kháng sinh th ng gây tác d ng ph trình u tr i v i kháng sinh đ (C).(ban đ u đ c s n xu t b ng ph ng pháp t ng h p nh Chloramphenicol c phân l p t Streptomyces venezuelae), t l kháng 6.9% Tuy nhiên vi c s d ng b a bãi d n đ n tình tr ng kháng thu c c a S.aureus theo m t th nghi m in vitro Vi t Nam n m 1998 t l kháng Cloramphenicol c a Staphylococcus aureus 64% II.2.2 i v i b nh ph m m : Nh y 100 % v i kháng sinh:  Bactrim (SXT), Rifampycin (RD), Vancomycin (VA) Có t l kháng cao đ i v i kháng sinh thu c h SVTH: Nguy n Th Hu nh Nh -lactams: Trang 68 KHÓA LU N T T NGHI P GVHD: ThS.BS Tr n Th Ng c Anh  Penicilline (P): t l kháng 96.61%  Oxacilline (OX): có t l kháng 62.71% i v i kháng sinh nhóm Aminoglycosides thu c h -lactams nh Gentamycin (CN) có t l kháng th p 18.64% i v i kháng sinh thu c h Quinolones nh Ciprofloxacine (CIP) t l kháng 84.75 % i v i kháng sinh đ c s n xu t b ng ph ng pháp t ng h p nh Chloramphenicol (C), t l kháng 30.51% i v i kháng sinh thu c Nhóm Macrolid: ph n l n đ u l y t Streptomyces, công th c r t c ng k nh, đ i di n Erythromycin Các Lincosamid c ng l y t Streptomyces, công th c đ n gi n h n nhi u, đ i di n Clindamycin T l kháng Erythromycin Clindamycin là: 69.49% .Hai nhóm có đ c tính tác d ng ch ng kháng Penicilin Tetracyclin, đ c bi t Staphylococus Bi u đ 17: So sánh t l đ kháng kháng sinh c a S.aureus m u b nh ph m máu m t 11/2013 đ n 04/2014 v i t l th ng kê t i B nh vi n Nhi ng II n m 2012 2013[22],[23] SVTH: Nguy n Th Hu nh Nh Trang 69 KHÓA LU N T T NGHI P GVHD: ThS.BS Tr n Th Ng c Anh Theo bi u đ ta th y đ c có s chênh l ch l n v t l S.aureus đ kháng kháng sinh G n nh có d u hi u t ng qua n m đ c bi t Genatmycin Ciprofloxacine kháng sinh thu c Nhóm Trimethoprime nh Bactrim t l kháng th p, nh ng n m qua t i b nh vi n Nhi ng II t l S.aureus kháng Vancomycin 0% T t l có th l a ch n kháng sinh phù h p cho vi c u tr S.aureus đ giúp h n ch tình tr ng đ kháng kháng sinh Bi u đ 18: So sánh t l đ kháng kháng sinh c a S.aureus m u b nh ph m máu m t 11/2013 đ n 04/2014 v i t l th ng kê t i khoa H i s c tích c c Ch ng đ c B nh vi n c p c u Tr ng V ng n m 2010[24] Theo bi u đ ta th y t l đ kháng kháng sinh c a S.aureus v i Oxacillin máu m cao h n nhi u so v i Erythromycin Bv Tr ng V ng Trong t l kháng v i Vancomycin máu m l i th p h n Ch có t l kháng v i Penicillin g n nh b ng SVTH: Nguy n Th Hu nh Nh Trang 70 KHÓA LU N T T NGHI P GVHD: ThS.BS Tr n Th Ng c Anh III K t lu n: III.1 Trên b nh ph m máu: Trong s 7942 m u b nh ph m máu: + Có 554 m u d +S m ud ng tính, chi m t l 6.98 % ng tính v i S.aureus th p ch chi m 5.23% + S chênh l ch gi a nam n không đáng k , c th : nam (48.28 %), n (51.72 %) + T l nhi m tr em >5 tu i cao nh t chi m 48.28% III.2 Trên b nh ph m m : Trong s 292 m u b nh ph m m : + Có 146 m u d +S m ud ng tính, chi m 50% ng tính v i S.aureus chi m 40.41% + Có s chênh l ch gi a nam n , c th : nam (54.24 %), n (45.76 %) + T l nhi m  tr em t >=1 đ n