(LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

177 6 0
(LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

BỘ GIÁO DỤC & ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN SỐT RÉT - KÝ SINH TRÙNG - CÔN TRÙNG TRUNG ƯƠNG TRẦN QUANG PHỤC NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM NHIỄM Orientia tsutsugamushi, ẤU TRÙNG MÒ TẠI KHU VỰC TÂY BẮC VÀ CHẾ TẠO BỘ SINH PHẨM PHÁT HIỆN LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC HÀ NỘI - 2019 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com BỘ GIÁO DỤC & ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN SỐT RÉT - KÝ SINH TRÙNG - CÔN TRÙNG TRUNG ƯƠNG TRẦN QUANG PHỤC NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM NHIỄM Orientia tsutsugamushi, ẤU TRÙNG MÒ TẠI KHU VỰC TÂY BẮC VÀ CHẾ TẠO BỘ SINH PHẨM PHÁT HIỆN Chuyên ngành: Ký sinh trùng y học Mã số: 62 72 01 16 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC CÁN BỘ HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS Nguyễn Văn Ba PGS TS Lê Thành Đồng Hà Nội - 2019 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan số liệu kết nghiên cứu trình bày luận án hồn tồn trung thực, xác chưa công bố công trình nghiên cứu khác Nếu có sai sót tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm Nghiên cứu sinh Trần Quang Phục LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ii LỜI CẢM ƠN Trong trình học tập, nghiên cứu hồn thành luận án tơi Thầy, Cô, nhà khoa học, bạn bè đồng nghiệp gia đình nhiệt tình giúp đỡ, ủng hộ Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới PGS TS Nguyễn Văn Ba, PGS TS Lê Thành Đồng người Thầy tâm huyết tận tình hướng dẫn, động viên khích lệ, dành nhiều thời gian giúp đỡ tơi q trình thực hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc PGS TS Trần Thanh Dương, Viện trưởng đồng chí Phó viện trưởng Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương động viên, tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ tơi q trình học tập hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn Chủ nhiệm đề tài, thành viên nhóm nghiên cứu đề tài Nhà nước “Nghiên cứu ứng dụng kỹ thuật tiên tiến chẩn đốn, dự phịng số bệnh truyền nhiễm địa bàn trọng điểm” Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc GS TSKH Thiếu tướng Lê Bách Quang, PGS TS Nguyễn Mạnh Hùng tận tình ủng hộ, giúp đỡ tơi q trình học tập hoàn thành luận án Xin cảm ơn đồng nghiệp Phòng Khoa học - Đào tạo, Phòng Kế hoạch tổng hợp, Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Cơn trùng Trung ương nhiệt tình giúp đỡ, ủng hộ tơi q trình học tập Xin cảm ơn bạn bè người thân gia đình bên tôi, động viên giúp đỡ q trình học tập hồn thành luận án LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com iii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Viết đầy đủ ADN Acid Deoxyribonucleic ARN Acid ribonucleic BamHI Bacillus amyloliquefaciens BLAST Basic local alignment search tool dNTP Deoxy nucleoside triphosphate EDTA Ethylendiamin tetraacetic acid FAM Fluorescein amidite FN False negative - Âm tính giả FP False positive - Dương tính giả IFA Indirect fluorescent antibody IgG Immunoglobulin G IgM Immunoglobulin M IIP Indirect immunoperoxidase kDa Kilo dalton LAMP Loop mediated isothermal amplification LF Lateral flow - Thẩm thấu ngang MgOAc Magnesium acetate NASBA Nucleic acid sequence-based amplification NAT Nucleic acid test PCR Polymer chain reaction RDT Rapid diagnostic test - Tét chẩn đoán nhanh RPA Recombinase polymerase amplification SDS Sodium dedocyl sunfate TP True positive - Dương tính thật TN True negative - Âm tính thật LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com iv MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT iii MỤC LỤC iv DANH MỤC BẢNG vii DANH MỤC HÌNH ix ĐẶT VẤN ĐỀ Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Đặc điểm bệnh sốt mò 1.1.1 Triệu chứng bệnh sốt mò 1.1.2 Chẩn đoán bệnh sốt mò 1.1.3 Điều trị bệnh sốt mò 1.1.4 Phòng bệnh sốt mò 1.2 Đặc điểm dịch tễ bệnh sốt mò 1.2.1 Phân bố bệnh sốt mò 1.2.2 Nguồn bệnh chế lây truyền bệnh sốt mò 12 1.3 Tác nhân gây bệnh phương pháp xét nghiệm chẩn đốn bệnh sốt mị 19 1.3.1 Tác nhân gây bệnh 19 1.3.2 Các nghiên cứu xét nghiệm chẩn đoán huyết học 26 1.3.3 Các kỹ thuật sinh học phân tử chẩn đoán bệnh sốt mò 28 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 38 2.1 Đối tượng phương pháp nghiên cứu số đặc điểm nhiễm Orientia tsutsugamushi, ấu trùng sốt mò khu vực Tây Bắc 38 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com v 2.1.1 Đối tượng, địa điểm, thời gian nghiên cứu 38 2.1.2 Phương pháp nghiên cứu 39 2.1.3 Nội dung nghiên cứu 42 2.1.4 Các biến số nghiên cứu 43 2.1.5 Các số nghiên cứu 44 2.1.6 Các kỹ thuật sử dụng nghiên cứu 45 2.2 Đối tượng phương pháp nghiên cứu chế tạo sinh phẩm (kit) phát Orientia tsutsugamushi quy mơ phịng thí nghiệm 49 2.2.1 Đối tượng, địa điểm, thời gian nghiên cứu 49 2.2.2 Phương pháp nghiên cứu 49 2.2.3 Nội dung nghiên cứu 51 2.2.4 Các kỹ thuật áp dụng chế tạo kit 52 2.3 Phương pháp xử lý số liệu 58 2.4 Sai số khống chế sai số 59 2.5 Đạo đức nghiên cứu 59 Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 61 3.1 Một số đặc điểm nhiễm Orientia tsutsugamushi, ấu trùng sốt mò khu vực Tây Bắc 61 3.1.1 Kết điều tra huyết phát kháng thể Orientia tsutsugamushi lưu hành cộng đồng dân cư 61 3.1.2 Một số đặc điểm phân bố bệnh sốt mò điều trị bệnh viện 64 3.1.3 Kết điều tra vật chủ vector truyền bệnh sốt mò 67 3.2 Kết nghiên cứu chế tạo sinh phẩm phát Orientia tsutsugamushi quy mơ phịng thí nghiệm 72 3.2.1 Thiết kế phản ứng khuếch đại acid nucleic công nghệ khác để phát Orientia tsutsugamushi 72 3.2.2 Tối ưu hóa phản ứng khuếch đại acid nucleic công nghệ khác sử dụng ADN khuôn tổng hợp từ plasmid 75 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com vi 3.2.3 Xây dựng quy trình chế tạo kit chẩn đoán O tsutsugamushi 83 Chương 4: BÀN LUẬN 95 4.1 Một số đặc điểm nhiễm Orientia tsutsugamushi, ấu trùng sốt mò khu vực Tây Bắc 95 4.1.1 Điều tra huyết phát kháng thể Orientia tsutsugamushi lưu hành cộng đồng dân cư 95 4.1.2 Một số đặc điểm phân bố bệnh sốt mò 97 4.1.3 Đặc điểm vật chủ vector truyền bệnh sốt mò 101 4.2 Chế tạo sinh phẩm phát Orientia tsutsugamushi công nghệ đẳng nhiệt RPA quy mơ phịng thí nghiệm 104 4.2.1 Điều kiện phản ứng kit khuếch đại đẳng nhiệt RPA phát Orientia tsutsugamushi quy mơ phịng thí nghiệm 105 4.2.2 Các thơng số kỹ thuật kit khuếch đại đẳng nhiệt RPA phát Orientia tsutsugamushi quy mơ phịng thí nghiệm 111 4.2.3 Đánh giá ngưỡng phát độ đặc hiệu phản ứng RPA so với công nghệ realtime PCR phát Orientia tsutsugamushi 115 4.2.4 Khả ứng dụng kit khuếch đại đẳng nhiệt RPA phát Orientia tsutsugamushi 117 KẾT LUẬN 119 KIẾN NGHỊ 121 HẠN CHẾ CỦA NGHIÊN CỨU TÍNH MỚI VÀ TÍNH THỰC TIỄN CỦA LUẬN ÁN TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com vii DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1 Dịch sốt mò số quốc gia từ năm 2007 - 2016 Bảng 1.2 Các tác nhân rickettsia gây bệnh chủ yếu 20 Bảng 2.1 Danh sách, định nghĩa biến số nghiên cứu 43 Bảng 3.1 Tỷ lệ người có kháng thể kháng O tsutsugamushi theo tỉnh 61 Bảng 3.2 Tỷ lệ người có kháng thể kháng O tsutsugamushi theo giới 62 Bảng 3.3 Tỷ lệ người có kháng thể kháng O tsutsugamushi theo tuổi 62 Bảng 3.4 Tỷ lệ người có kháng thể kháng Orientia tsutsugamushi theo dân tộc 63 Bảng 3.5 Tỷ lệ người có kháng thể kháng Orientia tsutsugamushi theo nghề nghiệp 63 Bảng 3.6 Tỷ lệ người có kháng thể kháng Orientia tsutsugamushi theo đặc điểm sinh cảnh khu vực sinh sống 64 Bảng 3.7 Phân bố bệnh nhân sốt mò theo tỉnh 65 Bảng 3.8 Phân bố bệnh nhân sốt mò theo tuổi 66 Bảng 3.9 Số lượng loài chuột điều tra điểm nghiên cứu 67 Bảng 3.10 Mật độ chuột điểm nghiên cứu 68 Bảng 3.11 Tỷ lệ chuột nhiễm ấu trùng mò 69 Bảng 3.12 Định loại mò chuột điểm nghiên cứu 70 Bảng 3.13 Thành phần lồi mị điểm nghiên cứu 70 Bảng 3.14 Kết xét nghiệm huyết phát kháng thể kháng Orientia tsutsugamushi chuột 71 Bảng 3.15 Trình tự primer probe khuếch đại acid nucleic sử dụng công nghệ khác 74 Bảng 3.16 Trình tự primer/probe cho phản ứng khuếch đại chứng nội 74 Bảng 3.17 Bảng điều kiện tối ưu phản ứng Realtime PCR 75 Bảng 3.18 Bảng điều kiện tối ưu phản ứng RPA 75 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com viii Bảng 3.19 Bảng kết tối ưu thành phần phản ứng realtime PCR 76 Bảng 3.20 Tổng hợp kết tối ưu thành phần phản ứng RPA 77 Bảng 3.21 So sánh thông số chu kỳ ngưỡng tương ứng 83 Bảng 3.22 So sánh độ đặc hiệu công nghệ 84 Bảng 3.23 Thành phần kit 86 Bảng 3.24 Kết đánh giá độ ổn định kit dựa kết phát Orientia tsutsugamushi mẫu bệnh phẩm 88 Bảng 3.25 Kết đánh giá độ ổn định kit dựa thời gian thu nhận tín hiệu khuếch đại 89 Bảng 3.26 So sánh độ nhạy kit đẳng nhiệt RPA phát 90 Bảng 3.27 So sánh độ đặc hiệu kit đẳng nhiệt RPA phát 90 Bảng 3.28 Kết đánh giá độ tương hợp loại kit 91 Bảng 3.29 Thành phần hỗn hợp phản ứng 93 Bảng 3.30 Chu trình nhiệt 94 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Sau ngày bảo quản Sau 14 ngày bảo quản Sau 30 ngày bảo quản Sau 60 ngày bảo quản Sau 90 ngày bảo quản Hình Kết kiểm tra đánh giá độ ổn định kit phát Orientia tsutsugamushi sau 7, 14, 30, 60 90 ngày bảo quản LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC 2: TIÊU CHUẨN CƠ SỞ BỘ KIT MỤC ĐÍCH CỦA BỘ KIT Phát chẩn đốn Orientia tsutsugamusi công nghệ khuếch đại đẳng nhiệt Recombinase polymerase amplification (RPA) nhằm phục vụ cơng tác chẩn đốn, dự phòng bệnh sốt mò địa bàn trọng điểm NỘI DUNG TIÊU CHUẨN CƠ SỞ 2.1 Nguyên lý kit Orientia tsutsugamusi phát kit nhờ công nghệ khuếch đại acid nucleic đẳng nhiệt Recombinase polymerase amplification RPA công nghệ sử dụng hỗn hợp recombinase sinh vật tiền nhân để giúp primer gắn đặc hiệu vào gen đích Enzyme ADN polymerase thay sợi (tiểu phần lớn Bacillus subtilis PolI, Bsu) xúc tác phản ứng kéo dài primer để tổng hợp sợi ADN bổ sung Bộ kít phát O tsutsugamushi sử dụng công nghệ RPA với cặp mồi (primer) thiết kế đặc hiệu nhằm khuếch đại vùng trình tự gen 47 kDa Để có độ đặc hiệu cao nhất, mẫu dò đánh dấu huỳnh quang (probe) đặc hiệu với vùng trình tự khuếch đại chứa vị trí THF giúp enzyme Exo nuclease III nhận biết cắt đặc hiệu lai với sản phẩm khuếch đại Mỗi trình tự mục tiêu nhân tương ứng với tín hiệu huỳnh quang, đầu dò máy ghi nhận Cơng nghệ cho phép khuếch đại gen đích cách tổng hợp liên tục ADN mà không cần biến tính sợi kép ADN nhiệt độ cao Xét nghiệm tiến hành khoảng nhiệt độ từ 24°C đến 45°C với hiệu suất cao nhờ phát tín hiệu từ đơn phân tử đích sau 20 phút LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 2.2 Đích phát Trình tự gen đích dùng để thiết kế primer probe cho phát O tsutsugamushi sử dụng kit gen 47 kDa 2.3 Thành phần kit Bảng 1: Thành phần kit TT Thành phần Ký hiệu Reaction Buffer A1, A2 dNTPs B1, B2 Nuclease-freewater D1, D2 Probe E-mix C1, C2 Orientia tsutsugamushi I1, I2 oligo-mix Core Reaction Mix F1, F2 Exo E1, E2 MgOAc H1, H2 Positive Control G1, G2 2.4 Vật liệu, hóa chất thiết bị cung cấp người sử dụng 2.4.1 Hóa chất - Cồn (Ethanol) 90% 70% - Kít chiết tách ADN: E.Z.N.A.® Blood DNA Mini Kit (Omega Biotek); E.Z.N.A.® SQ Blood DNA Kit (Omega Bio-tek); QIAamp DNA Blood Mini Kit (QIAGEN ); QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN ) kít tương đương LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 2.4.2 Thiết bị, dụng cụ - Máy trộn mẫu (Vortex) - Máy ly tâm nhỏ (Centrifuge Spin) - Máy lắc ủ nhiệt - Máy ly tâm lạnh cho ống eppendorf 1,5 ml - Micropipettes đầu típ có lọc tương ứng lấy thể tích: 0,5 – 10 µl; 10 -100 µl 100 - 1000µl - Ống PCR 200 µl - Ống eppendorf thể tích 0,5 ml ,5 ml - Ống ly tâm nhựa thể tích ml, 10 ml 50 ml 2.5 Cách tiến hành 2.5.1 Sơ đồ thực Mẫu bệnh phẩm Tách chiết DNA RPA khuếch đại acid nucleic đẳng nhiệt Đọc kết Hình 1: Sơ đồ thực xét nghiệm LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 2.5.2 Chuẩn bị mẫu Tất loại mẫu phù hợp cho phản ứng khuếch đại RPA sử dụng Hãy đảm bảo mẫu ADN có độ tinh sạch, nồng độ tính tồn vẹn cao Ln ln chạy mẫu đối chứng dương kèm với mẫu Để chuẩn bị mẫu đối chứng âm, thay mẫu ADN nước khơng có RNase / Dnase 2.5.3 Tách chiết ADN Mẫu bệnh phẩm tách chiết ADN cách sử dụng kit sau: E.Z.N.A.® Blood DNA Mini Kit (Omega Bio-tek); E.Z.N.A.® MicroElute Viral RNA/DNA (Omega Bio-tek); E.Z.N.A.® SQ Blood DNA Kit (Omega Bio-tek); QIAamp DNA Blood Mini Kit (QIAGEN ); QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN ) kít tương đương Quy trình tách chiết ADN thực theo hướng dẫn của nhà sản xuất kit tách chiết E.Z.N.A.® MicroElute Viral RNA/DNA (Omega Bio-tek) Mẫu ADN sau tách chiết nên bảo quản tủ -80°C tiến hành thử nghiệm 2.5.4 Thực phản ứng RPA khuếch đại acid nucleic đẳng nhiệt - Rã đông hoàn toàn thành phần phản ứng mẫu ADN tách chiết (nếu đông) giữ chúng đá - Trộn ly tâm thành phần phản ứng để hỗn hợp đồng nhất, sau giữ chúng đá để có hiệu xét nghiệm cao - Chuẩn bị Master Mix theo Bảng 2: LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Bảng 2: Chuẩn bị Master Mix STT Thành phần Nồng độ gốc Thể tích cho phản ứng (µl) Reaction Buffer 2X 10 dNTPs 25 mM 1.44 Nuclease-freewater Probe E-mix Oligo-mix Core Reaction Mix 20 X Exo 50 X 0.4 0.52 10 X 1.64 Tổng thể tích dung dịch đểm thực phản ứng MgOAc Mẫu ADN 280 mM Tổng thể tích dung dịch thực phản ứng 17 20 - Đối với thành phần Core Reaction Mix Exo: bổ sung thành phần lên nắp tube sau đảo trộn lên xuống 10 lần ly tâm - Đảo trộn pipet thành phần dung dich đệm trước chia 17 µl ống phản ứng 0,2 ml - Bổ sung MgOAc mẫu ADN với thể tích tương ứng lên nắp tube phản ứng - Ly tâm để MgOAc mẫu ADN rơi xuống đáy ống phản ứng bắt đầu ủ LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Lưu ý: MgOAc giúp kích hoạt phản ứng diễn Phản ứng RPA xảy MgOAc thêm vào nhiệt độ phòng Do đó, hạn chế cho MgOAc tiếp xúc với master mix chưa tiến hành ủ - Cài đặt điều kiện phản ứng theo Bảng 3: Bảng 3: Chu trình nhiệt Nhiệt độ Thời gian Ghi 37°C 20 phút Khuếch đại (20s thu nhận tín hiệu lần) 4°C ∞ Lưu mẫu máy - Chuyển ống phản ứng vào máy đẳng nhiệt bắt đầu phản ứng theo điều kiện phản ứng cài đặt 2.5.5 Đọc kết - Kết phát O tsutsugamushi sử dụng kit phát O tsutsugamushi xác định dựa vào tín hiệu khuếch đại nhờ tín hiệu huỳnh quang thu từ hệ thống thu nhận tín hiệu huỳnh quang - Kiểm tra mẫu phải kết âm tính giả dương tính giả + Mẫu đối chứng dương phải cho kết dương tính có thời gian thu nhận tín hiệu khuếch đại trùng khớp với thời gian thu nhận tín hiệu khuếch đại mẫu chuẩn độ trước (mẫu chứng dương cung cấp kèm kít có thời gian thu nhận tín hiệu khuếch đại - 10 phút) + Mẫu chứng âm phải cho kết âm tính - Nếu hệ thống mẫu đối chứng dương đối chứng âm khơng phải thực lại xét nghiệm LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 2.6 Đóng gói, ghi nhãn 2.6.1 Mơ tả sản phẩm - Tên sản phẩm: Orientia tsutsugamushi RPA minikit - Mục đích sử dụng: Phát Orientia tsutsugamushi mẫu bệnh phẩm công nghệ khuếch đại acid nucleic đẳng nhiệt RPA 2.6.2 Đóng gói Bộ sinh phẩm Orientia tsutsugamushi RPA mini kit đóng gói hộp carton (50 test/hộp) Trên hộp có nhãn ghi Tên sản phẩm, Số lô, Hạn sử dụng, Điều kiện bảo quản; Tên, địa chỉ, số điện thoại nơi sản xuất Bảng thành phần kit Trong hộp có tờ hướng dẫn sử dụng kit Thành phần kit gồm: TT Thành phần Số lượng Ký hiệu Reaction Buffer x 300 µl A1, A2 dNTPs x 50 µl B1, B2 Probe E-mix x 60 µl C1, C2 Nuclease-freewwater x 100 µl D1, D2 Orientia tsutsugamushi x 50 µl I1, I2 oligo-mix Exo x 11 µl E1, E2 Core Reaction Mix x 30 µl F1, F2 Positive Control x 50 µl G1, G2 MgOAc x 50 µl H1, H2 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC 3: BẢN ĐỐ CÁC TỈNH NGHIÊN CỨU Bản đồ hành tỉnh Điện Biên LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Bản đồ hành tỉnh Lai Châu LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Bản đồ hành tỉnh Hịa Bình LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Bản đồ hành tỉnh Sơn La LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Bản đồ huyện Mường Ảng - tỉnh Điện Biên Bản đồ huyện Phong Thổ - tỉnh Lai Châu LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Bản đồ huyện Mai Châu - tỉnh Hịa Bình Bản đồ huyện Yên Châu - tỉnh Sơn La LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC 4: MỘT SỐ THIẾT BỊ DÙNG TRONG NGHIÊN CỨU Máy trộn mẫu Voltex Máy ly tâm mini Máy khuếch đại đẳng nhiệt Máy RT-PCR Máy ly tâm ly tâm lạnh LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ... ấu trùng mò khu vực Tây Bắc chế tạo sinh phẩm phát hiện? ?? triển khai nhằm mục tiêu: 1) Mô tả số đặc điểm nhiễm Orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò đặc điểm phân bố bệnh sốt mò khu vực Tây Bắc. ..BỘ GIÁO DỤC & ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN SỐT RÉT - KÝ SINH TRÙNG - CÔN TRÙNG TRUNG ƯƠNG TRẦN QUANG PHỤC NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM NHIỄM Orientia tsutsugamushi, ẤU TRÙNG MÒ TẠI KHU VỰC TÂY BẮC VÀ CHẾ... TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Đối tượng phương pháp nghiên cứu số đặc điểm nhiễm Orientia tsutsugamushi, ấu trùng sốt mò khu vực Tây Bắc 2.1.1 Đối tượng, địa điểm, thời gian nghiên cứu 2.1.1.1

Ngày đăng: 10/10/2022, 14:41

Hình ảnh liên quan

Hình 1.3: Hình ảnh Leptotrombidium (Lep.) deliense - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 1.3.

Hình ảnh Leptotrombidium (Lep.) deliense Xem tại trang 26 của tài liệu.
Hình 1.4. Hình ảnh Orientia tsutsugamushi xâm nhập và ký sinh trong tế bào nội mô mạch máu   - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 1.4..

Hình ảnh Orientia tsutsugamushi xâm nhập và ký sinh trong tế bào nội mô mạch máu Xem tại trang 32 của tài liệu.
Hình 1.5. Các bước của chu trình khuếch đại đẳng nhiệt RPA - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 1.5..

Các bước của chu trình khuếch đại đẳng nhiệt RPA Xem tại trang 46 của tài liệu.
Hình 2.1. Sơ đồ thiết kế nghiên cứu mục tiêu 1 - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 2.1..

Sơ đồ thiết kế nghiên cứu mục tiêu 1 Xem tại trang 51 của tài liệu.
Đặc điểm hình thái ấu trùng mị: - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

c.

điểm hình thái ấu trùng mị: Xem tại trang 59 của tài liệu.
Hình 2.3. Quy trình chế tạo kit phát hiện Orientia tsutsugamushi - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 2.3..

Quy trình chế tạo kit phát hiện Orientia tsutsugamushi Xem tại trang 61 của tài liệu.
Kết quả bảng 3.2 cho thấy: Sự khác biệt về tỷ lệ mang kháng thể kháng - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

t.

quả bảng 3.2 cho thấy: Sự khác biệt về tỷ lệ mang kháng thể kháng Xem tại trang 73 của tài liệu.
Kết quả bảng 3.4 cho thấy: Tỷ lệ người có kháng thể kháng Orientia - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

t.

quả bảng 3.4 cho thấy: Tỷ lệ người có kháng thể kháng Orientia Xem tại trang 74 của tài liệu.
Bảng 3.7. Phân bố của bệnh nhân sốt mò theo tỉnh - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 3.7..

Phân bố của bệnh nhân sốt mò theo tỉnh Xem tại trang 76 của tài liệu.
Hình 3.1: Phân bố của bệnh nhân sốt mị theo tháng - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.1.

Phân bố của bệnh nhân sốt mị theo tháng Xem tại trang 77 của tài liệu.
Bảng 3.11. Tỷ lệ chuột nhiễm ấu trùng mò - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 3.11..

Tỷ lệ chuột nhiễm ấu trùng mò Xem tại trang 80 của tài liệu.
Hình 3.2. Hình ảnh đọc trình tự gen kiểm tra đoạn chèn - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.2..

Hình ảnh đọc trình tự gen kiểm tra đoạn chèn Xem tại trang 84 của tài liệu.
Bảng 3.20. Tổng hợp kết quả tối ưu thành phần phản ứng RPA - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 3.20..

Tổng hợp kết quả tối ưu thành phần phản ứng RPA Xem tại trang 88 của tài liệu.
Hình 3.3. Sơ đồ các bước xây dựng panel mẫu chuẩn - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.3..

Sơ đồ các bước xây dựng panel mẫu chuẩn Xem tại trang 89 của tài liệu.
Hình 3.4. Xây dựng panel sử dụng kỹ thuật realtime PCR - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.4..

Xây dựng panel sử dụng kỹ thuật realtime PCR Xem tại trang 90 của tài liệu.
Hình 3.5. Đường chuẩn của bộ mẫu chuẩn - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.5..

Đường chuẩn của bộ mẫu chuẩn Xem tại trang 91 của tài liệu.
Hình 3.8. Kết quả RPA kiểm tra độ đặc hiệu khuếch đại ADN Orientia - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.8..

Kết quả RPA kiểm tra độ đặc hiệu khuếch đại ADN Orientia Xem tại trang 93 của tài liệu.
Hình 3.7. Kết quả realtime PCR kiểm tra độ đặc hiệu khuếch đại ADN - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.7..

Kết quả realtime PCR kiểm tra độ đặc hiệu khuếch đại ADN Xem tại trang 93 của tài liệu.
Hình 3.9. Hình ảnh bộ sinh phẩm chẩn đoán Orientia tsutsugamushi - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3.9..

Hình ảnh bộ sinh phẩm chẩn đoán Orientia tsutsugamushi Xem tại trang 97 của tài liệu.
Bảng 3.25. Kết quả đánh giá độ ổn định bộ kit dựa trên thời gian thu nhận được tín hiệu khuếch đại  - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 3.25..

Kết quả đánh giá độ ổn định bộ kit dựa trên thời gian thu nhận được tín hiệu khuếch đại Xem tại trang 100 của tài liệu.
Bảng 3.29. Thành phần hỗn hợp phản ứng - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 3.29..

Thành phần hỗn hợp phản ứng Xem tại trang 104 của tài liệu.
Bảng 3. Kết quả phát hiện Orientia tsutsugamushi trên 10 mẫu bệnh phẩm giả định của 2 loại kit   Mã bệnh  - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 3..

Kết quả phát hiện Orientia tsutsugamushi trên 10 mẫu bệnh phẩm giả định của 2 loại kit Mã bệnh Xem tại trang 156 của tài liệu.
Bảng 5. Kết quả đánh giá độ lặp lại của 2 loại kit được thực hiện bởi kỹ thuật viên 1  - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 5..

Kết quả đánh giá độ lặp lại của 2 loại kit được thực hiện bởi kỹ thuật viên 1 Xem tại trang 157 của tài liệu.
Hình 1. Kết quả chạy phản ứng RPA khuếch đại DNA - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 1..

Kết quả chạy phản ứng RPA khuếch đại DNA Xem tại trang 160 của tài liệu.
Hình 2. Kết quả chạy phản ứng RPA khuếch đại DNA - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 2..

Kết quả chạy phản ứng RPA khuếch đại DNA Xem tại trang 161 của tài liệu.
Hình 3. Kết quả tối ưu nồng độ MgOAc phản ứng RPA khuếch đại DNA Orientia tsutsugamushi  - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 3..

Kết quả tối ưu nồng độ MgOAc phản ứng RPA khuếch đại DNA Orientia tsutsugamushi Xem tại trang 162 của tài liệu.
Hình 4. Kết quả kiểm tra đánh giá độ ổn định của bộ kit phát hiện - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Hình 4..

Kết quả kiểm tra đánh giá độ ổn định của bộ kit phát hiện Xem tại trang 163 của tài liệu.
Bảng 1: Thành phần bộ kit - (LUẬN án TIẾN sĩ) nghiên cứu đặc điểm nhiễm orientia tsutsugamushi, ấu trùng mò tại khu vực tây bắc và chế tao bộ sinh phẩm phát hiện

Bảng 1.

Thành phần bộ kit Xem tại trang 165 của tài liệu.

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan