Chính sách tài khóa và chính sách tiền tệ hợp thành hệ thống chính sách quan trọng trong việc điều tiết vĩ mô nền kinh tế, phải đƣợc thực hiện song song với nhau, không mâu thuẫn nhau. Sự phối hợp không nhịp nhàng, không gắn kết sẽ làm giảm hiệu quả điều hành chính sách và có thể làm trầm trọng, làm cho kinh tế vĩ mô bất ổn, sẽ ảnh hƣởng đến thanh khoản của thị trƣờng. Do đó để nâng cao hiệu quả hoạt động quản trị rủi ro thanh khoản của các NHTM, Chính phủ cần tiếp tục đảm bảo tính ổn định của nền kinh tế, cụ thể: kiểm soát, khắc phục nhanh chóng những yếu tố tiềm ẩn có thể dẫn tới mất ổn định kinh tế vĩ mô; theo dõi và điều hành chặt chẽ cán cân thanh toán, thu chi ngân sách.
Ngoài ra, việc điều hành chính sách tiền tệ thông qua các công cụ mang tính chất hành chính nhƣ trần lãi suất, hạn mức tăng trƣởng tín dụng, tỷ lệ dự trữ bắt buộc sẽ làm tình trạng thanh khoản thị trƣờng bị bóp méo. Nhƣ ở thời điểm cuối
năm 2007 và đầu năm 2008, các biện pháp kiềm chế lạm phát của chính phủ chỉ tập trung vào lĩnh vực tiền tệ. Để chống lạm phát NHNN đã thực hiện hàng loạt giải pháp mạnh, trong đó việc phát hành tín phiếu bắt buộc với tổng giá trị 20.300 tỷ đồng đƣợc xem là một biện pháp hành chính khá mạnh. Kết quả, thị trƣờng tiền tệ bị xáo trộn, các ngân hàng chạy đua lãi suất nhằm thu hút tiền gửi đáp ứng nhu cầu thanh khoản, thị trƣờng chứng khoán, bất động sản sụt giảm...Trong tình huống kiềm chế lạm phát, việc thực thi chính sách tiền tệ thắt chặt là cần thiết, nhƣng việc sử dụng liên tiếp nhiều biện pháp mạnh nhƣ thế trong một khoảng thời gian chƣa đủ để thị trƣờng thích ứng, nên đƣợc xem xét cẩn trọng hơn. Việc thay đổi đột ngột các chính sách sẽ ảnh hƣởng đến tình hình thanh khoản của các ngân hàng do không có đủ thời gian, đủ nguồn vốn bù đắp để đáp ứng các yêu cầu quản lý mới của NHNN dẫn đến thiếu hụt, căng thẳng về thanh khoản. Ngƣợc lại nếu các chính sách đƣợc lập kế hoạch và thực thi sẽ tạo nên sự an tâm cho hệ thống NHTM cổ phần từ đó giúp các ngân hàng có điều kiện ổn định để duy trì, hoạch định chiến lƣợc kinh doanh của mình.