Căn cứ thực trạng hoạt động của Trung tâm Công nghệ sinh học và Công nghệ thực phẩm hiện nay, để chuyển đổi hoạt động theo cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm, cần theo lộ trình sau:
- Xác định Trung tâm cần đƣợc chuyển đổi theo hình thức nào. Trung tâm Công nghệ sinh học và Công nghệ thực phẩm loại thứ nhất (Nghiên cứu cơ bản,…, phục vụ quản lý nhà nƣớc). Điều này đƣợc ghi bổ sung vào Nghị định 96 sửa đổi, bổ sung Nghị định 115;
- Phân tích, đánh giá tiềm năng, thực lực của Trung tâm Công nghệ sinh học và Công nghệ thực phẩm Hà Nội và thời điểm, tiến độ triển khai Dự án Xây dựng Trung tâm để có lộ trình chuyển đổi cho hợp lý. Cần có một thời gian chuẩn bị để tăng cƣờng tiềm lực;
- Phải xây dựng đề án chuyển đổi phù hợp, trình cấp có thẩm quyền phê duyệt.
Trong Đề án chuyển đổi sang cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm, cần: + Xác định rõ thời điểm chuyển đổi và kế hoạch phát triển trong giai đoạn sau chuyển đổi;
+ Lộ trình thực hiện và xác định khả năng tự đảm bảo kinh phí hoạt động thƣờng xuyên;
+ Có kế hoạch để nhà nƣớc đầu tƣ về cơ sở vật chất, nhân lực, kinh phí nhằm đảm bảo khả năng chuyển đổi;
+ Đƣợc Nhà nƣớc chính thức giao tài sản, có thể sử dụng để liên doanh, liên kết, sử dụng cho sản xuất kinh doanh, chủ động thanh lý, chuyển nhƣợng tài sản;
+ Đƣợc cấp thẩm quyền chính thức ủy quyền thực hiện quyền làm chủ mọi mặt: thành lập hoặc giải thể đơn vị trực thuộc, bổ nhiệm, nâng lƣơng cho cán bộ, cử cán bộ đi công tác nƣớc ngoài, tuyển dụng và kỹ hợp đồng làm việc, chi tiêu hành chính…