Cân 8 g SKK (đã được nghiền khô mịn bằng máy xay sinh tố) cho vào chai pyrex 500mL. Bổ sung 120mL hỗn hợp dung dịch hóa chất methanol: chloroform tỉ lệ 2:1 (v/v), ngâm chiết trên máy khuấy từ qua đêm (máy khuấy từ đặt trong phòng box, bật điều hòa 270C, đặt tốc độ khuấy ở mức 3, khoảng 13h khuấy liên tục). Lấy mẫu ra khỏi máy khuấy từ, để phân lớp tự nhiên 30-45 phút. Hút phần dịch trong phía trên cho riêng vào 2 ống fancol, phần bã sinh khối phía dưới cho vào 2 ống fancol. Cả 4 ống li tâm 4000 vòng/phút, trong 10 phút. Sau li tâm, hút phần dịch trong phía trên của 2 ống dịch phần trên cho vào bình cầu 250mL, hút phần dịch trong phía trên của 2 ống chứa bã sinh khối lọc qua giấy lọc Ө 11 trên phễu thủy tinh. Rửa sinh khối 3 lần, mỗi lần bổ sung 20mL hỗn hợp dung dịch hóa chất methanol: chloroform tỉ lệ 2:1 (v/v) để rửa bã sinh khối. Li tâm 4000 vòng/phút trong 15 phút. Hỗn hợp phân thành 2 lớp, hút lớp trên lọc qua giấy lọc Ө 11. Toàn bộ phần dịch trên tiến hành cất quay (nhiệt độ 700C, trong 15-20 phút) để loại bỏ hết dung môi và thu lipid tổng số.
Toàn bộ lipit tổng số thu được, bổ sung 40mL hỗn hợp dung dịch hóa chất methanol: acetone tỉ lệ 7:3 (v/v), vontex hỗn hợp trong 5 phút thấy có phân lớp chưa rõ ràng. Để hỗn hợp trong tủ - 200C, trong 40h, thấy phân thành 2 lớp. Lấy phần trên lọc qua giấy lọc GF/C, phần dưới tiến hành li tâm 6000 vòng/ phút trong 5 phút, thấy phân thành 2 lớp, lấy lớp trên. Rửa lớp dưới 3 lần, mỗi lần bổ sung 10mL hỗn hợp dung dịch hóa chất methanol:acetone tỉ lệ 7:3 (v/v) lạnh -200C, để rửa phần dưới, lắc đều, li tâm 6000 vòng/ phút trong 5 phút. Hỗn hợp phân thành 2 lớp, thu lớp trên. Toàn bộ phần dịch trên tiến hành cất quay (nhiệt độ 700
C, trong 15-20 phút) để loại bỏ hết dung môi và thu squalene thô.