Nguyên nhân khách quan:
Nguyên nhân mà ta phải kể đến đầu tiên là sự biến động không ngừng của môi trường kinh doanh, trong thời kỳ nước ta mở rộng hội nhập và đặc biệt khi gia nhập WTO làm nền kinh tế biến động càng rõ
Hệ thống pháp luật và chính sách kinh tế của nhà nước đang trong giai đoạn vừa xây dựng, vừa hoàn thiện và có sự thay đổi nhiều đã gây không ít khó khăn cho hoạt động kinh doanh của doanh nghiệp.
Thị trường nguyên nhiên liệu biến đổi khó có thể lường trước như giá dầu lên xuống thất thường trong một vài năm gần đây ảnh hưởng đến công tác hoạch định. Nguyên nhân chủ quan từ công ty.
- Khi xây dựng công tác hoạch định, công ty TNHH vận tải biển Nam Việt chưa xây dựng được nhiều phương án hoạch định để từ đó phân tích và lựa chọn mà chỉ xây dựng một phương án hoạch định và tìm mọi cách để áp dụng luôn công tác hoạch định này vào thực tiễn hoạt động sản xuất kinh doanh của công ty. Đồng thời, công ty đưa ra những kế hoạch chính nhưng không có kế hoạch hỗ trợ nên khi có biến cố xảy ra thì không thể ứng phó kịp thời, trở nên bị động và ảnh hưởng đến các mục tiêu đặt ra.
- Công ty không đi sâu vào nghiên cứu môi trường vĩ mô trước tiên là do trình độ nhận thức, lý luận và thực tiễn của cán bộ công nhân viên trong công ty còn hạn chế, kiến thức về hoạch định không được bổ sung thường xuyên và một cách hệ thống nên tư duy của các nhà hoạch định không thay đổi.
- Không hoàn toàn chủ động trong việc lựa chọn phương án là do còn hạn chế về nguồn lực tài chính và cơ sở vật chất kỹ thuật. Hiện nay, đội tàu biển của công ty TNHH vận tải biển Nam Việt còn nhỏ về số lượng và chưa cân đối về chủng loại. Tàu chủ yếu là tàu chở hàng rời, hàng bách hóa, không có tàu container. Công ty còn thiếu hụt phương tiện vận tải, phương tiện bốc dỡ, sự lạc hậu về kho bãi và đặc biệt là sự hạn chế trong việc kết nối giữa cảng biển với hệ thống vận tải nội địa.