- Chính sách thuế là một vấn đề hết sức phức tạp trong nền kinh tế thị trường, cần khắc phục những nhược điểm của hệ thống thuế hiện hành, đảm bảo sự thích ứng của nó trong cơ chế thị trường tạo mọi điều kiện hạn chế thất thu.
Giả sử Luật thuế GTGT áp dụng 2 mức thuế suất: một mức thuế suất thấp áp dụng cho hàng hóa, dịch vụ thiết yếu, nhằm thực hiện chính sách xã hội vừa giảm gánh nặng về thuế cho các đối tượng tiêu dùng có thu nhập thấp; một mức thuế suất cao áp dụng cho những mặt hàng đặc biệt, góp phần tiết kiệm một phần thu nhập của người có thu nhập cao đảm bảo tính công bằng trong xã hội .
Nếu áp dụng chung một mức thuế suất cho tất cả các đối tượng tiêu dùng, sẽ khắc phục những nhược điểm của việc áp dụng hai hay nhiều mức thuế suất như:
+ Áp dụng 1 mức thuế suât sẽ giảm tính phức tạp, dễ hiểu, dễ áp dụng cho đối tượng nộp thuế và đối tượng trả tiền thuế.
+ Các cơ sở kinh doanh không lợi dụng được việc kinh doanh hàng hóa, dịch vụ nhằm chuyển doanh thu của những hàng hóa, dịch vụ có mức thuế suất cao sang mức thuế suất thấp; cũng như không lợi dụng được chênh lệch về mức thuế suất giữa những hàng hóa, dịch vụ có tính chất gần giống nhau để kê khai sai mức thuế suất, ví dụ: sản phẩm hóa chất mức thuế suất 10% sẽ dễ bị kê khai thành thuốc trừ sâu hoặc các chất kích thích vật nuôi cây trồng để hưởng mức thuế suất 5%.
+ Áp dụng 1 mức thuế suất sẽ khắc phục được việc khấu trừ thuế GTGT đầu vào lớn hơn thuế GTGT đầu ra. Ví dụ : đối với ngành gia công xay xát thuế suất thuế GTGT đầu ra là 5%, thuế suất thuế GTGT đầu vào của điện, dầu là 10%, như vậy thuế GTGT phải nộp có thể bị âm.
+ Để đảm bảo giảm chi phí, công sức của đối tượng nộp thuế và cơ quan thuế, đảm bảo đối xử bình đẳng giữa các loại hình kinh doanh, tăng thu cho NSNN, vừa thực hiện được các chính sách xã hội. Thì ban đầu Luật thuế GTGT sẽ áp dụng 2 mức thuế suất (một mức thuế suất thấp đối với những hàng hóa, dịch vụ thiết yếu; một mức thuế suất cao cho những hàng hóa, dịch vụ đặc biệt), dần dần đời sống nhân dân được ổn định và nâng cao, Luật thuế GTGT sẽ chuyển sang áp dụng thống nhất một mức thuế suất, góp phần hoàn thiện việc áp dụng thuế suất thuế GTGT.
+ Phương pháp tính thuế GTGT sẽ áp dụng phương pháp khấu trừ thuế cho những cơ sở kinh doanh có qui mô tương đối lớn, ấn định thuế đối với những hộ có qui mô khá nhỏ, loại bỏ phương pháp tính thuế GTGT theo phương pháp trực tiếp. Để làm được việc này thì cơ quan thuế hướng dẫn và bắt buộc những cơ sở có qui mô tương đối lớn đều phải thực hiện chế độ sổ sách kế toán, sử dụng hóa đơn, chứng từ theo qui định hiện hành.
- Cần phát huy rõ ràng về xử lý vi phạm trốn thuế, ẩn lậu thuế phạt hành chính, cưỡng chế thi hành….Trong từng trường hợp cụ thể có thể tăng mức phạt nhằm giúp người thực hiện luôn ý thức trách nhiệm và làm theo đúng qui định.
- Thực hiện quản lý thuế theo cơ chế tổ chức, cá nhân nộp thuế tự khai, tự nộp thuế đối với tổ chức cá nhân đủ điều kiện, nhận tờ khai thuế có mã vạch và đăng ký mã số thuế hộ cá nhân mô hình phân tán. Còn đối với các tổ chức, cá nhân nộp thuế không đủ điều kiện hoặc đối với các loại thuế không đủ điều kiện thực hiện cơ chế tự khai, tự nộp (như thuế tài sản; phí, lệ phí...) áp dụng cơ chế giám sát, quản lý chặt chẽ đầu ra, thực hiện ấn định thuế, khấu trừ tại nguồn, uỷ nhiệm thu nhằm đáp ứng được yêu cầu thuận lợi, giảm chi phí quản lý và thực hiện cho cả cơ quan thuế và tổ chức, cá nhân nộp thuế.
- Cần phải có một ứng dụng hỗ trợ kê khai thuế và in ra tờ khai có mã vạch mà ngành thuế đã triển khai qua hình thức phát miễn phí phần mềm ứng dụng cho doanh nghiệp