Là một cơ quan hành chính nhà nước trực thuộc Tổng cục Hải quan đóng trên địa bàn tỉnh Cao Bằng, Cục Hải quan Cao Bằng được thành lập tháng 6/1952. Trải qua nhiều giai đoạn lịch sử với nhiều tên gọi khác nhau: Chi sở thuế XNK tỉnh Cao Bằng,Chi cục Hải quan Cao Bằng, Phân khu xuất nhập liên tỉnh Cao – Hải – Lạng, Hải quan Cao Bằng, đến tháng 3/1994, đổi tên thành Cục Hải quan Cao Bằng và tên gọi đó được giữ đến nay. Với tổng số cán bộ cơng chức là 192 người, trong đó 154 cơng chức, 30 nhân viên hợp đồng lao động theo Nghị định 68. Cục Hải quan tỉnh Cao Bằng gồm có 01 Cục
trưởng và 03 Phó Cục trưởng. Theo Quyết định số 1919/QĐ-BTC ngày 06/9/2016 của Bộ Tài chính, Cục Hải quan Cao Bằng gồm có 04 phòng chuyên mơn gồm: Phịng Nghiệp vụ; Phịng Chống bn lậu và xử lý vi phạm; Phòng Tổ chức cán bộ - Thanh tra và Văn phịng. Cục có 06 Chi cục hải quan trực thuộc gồm 05 Chi cục Hải quan cửa khẩu là :Chi cục Hải quan cửa khẩu Tà Lùng, Chi cục Hải quan cửa khẩu Trà Lĩnh, Chi cục Hải quan cửa khẩu Sóc Giang, Chi cục Hải quan cửa khẩu Pò Peo, Chi cục Hải quan cửa khẩu Lý Vạn; 01 Chi cục Hải quan ngoài cửa khẩu là: Chi cục Hải quan Bắc Kạn ngoài các chi cục trực thuộc cịn có 01 Đội kiểm sốt hải quan. Cơng tác nghiệp vụ chủ yếu được thực hiện tại các chi cục hải quan và đội kiểm soát hải quan. Các chi cục hải quan cửa khẩu thực hiện các hoạt động nghiệp vụ liên quan đến thủ tục hải quan, kiểm tra, giám sát hàng hoá xuất nhập khẩu, phương tiện vận tải và hành lý của người xuất nhập cảnh. Do yêu cầu phát triển kinh tế của tỉnh và sự giao thương kinh tế với nước bạn Trung Quốc, Cục Hải Quan tỉnh Cao Bằng cịn có các cửa khẩu phụ và lối mở.
Cụci Hảii quani tỉnhi Caoi Bằngi lài đơni vịi trựci thuộci Tổngi cụci Hảii quan,i
cói chứci năngi giúpi Tổngi cụci trưởngi Tổngi cụci Hảii quani quảni lýi nhài nướci vềi
hảii quani vài tổi chứci thựci thii phápi luậti vềi hảii quan,i cáci quyi địnhi kháci củai
phápi luậti cói liên quani i trêni địai bàni 02i tỉnhi Caoi Bằng,i Bắci Kạni theoi quyi địnhi
củai phápi luật.i Cụci Hảii quani i Caoi Bằngi cói tưi cáchi phápi nhân,i coni dấui riêng,i
đượci mởi tàii khoảni tạii Khoi bạci Nhài nướci theoi quyi địnhi củai phápi luật.
Cụci Hảii quani tỉnhi Caoi Bằngi thựci hiệni nhiệmi vụ,i quyềni hạni theoi quyi
địnhi củai Luậti Hảii quan,i cáci quyi địnhi kháci củai phápi luậti cói liêni quani cói nhữngi nhiệmi vụi quyềni hạni cụi thểi saui đây:i (1)i Tổi chức,i chỉi đạo,i hướngi dẫni vài triểni khaii thựci hiệni cáci quyi địnhi củai Nhài nướci vềi hảii quani trêni địai bàni
hoạti độngi củai Cục Hảii i quan.i (2)i Hướngi dẫn,i chỉi đạoi vài kiểmi trai cáci Chii cụci
Hảii quan,i Độii kiểmi soáti hảii quani vài tươngi đươngi thuộci vài trựci thuộci Cụci trongi việci tổi chức,i triểni khaii nhiệmi vụ đượci i giao.i (3)i Thanhi tra,i kiểmi trai việci
thựci hiệni chínhi sách,i phápi luậti vềi hải quani i theoi quyi địnhi củai phápi luật.i (4)i
Xửi lýi vii phạmi hànhi chínhi hoặci khởii tối đốii vớii cáci vụi bni lậu,i vậni chuyểni
tráii phépi hàngi hóai quai biêni giớii theo quyi i địnhi củai phápi luật;i giảii quyếti khiếui
nạii đốii vớii các quyếti i địnhi hànhi chínhi củai cáci đơni vịi trựci thuộci vài giảii quyếti
khiếui nại,i tối cáoi thuộci thẩmi quyềni theo quyi i địnhi củai phápi luật.i (5)i Kiếni nghịi nhữngi vấni đềi cầni sửai đổi,i bổi sungi các quyi i địnhi củai nhài nướci vềi hảii quani đốii
vớii hoạti độngi xuấti khẩu,i nhậpi khẩu,i xuấti cảnh,i nhậpi cảnh,i qi cảnhi vài chínhi
sáchi thuếi đốii vớii hàngi hóa.i (6)i Tổi chứci nghiêni cứu,i tiếpi nhậni vài triểni khaii
ứngi dụngi tiếni bội khoai học,i côngi nghệ,i phươngi phápi quảni lýi hảii quani hiệni
đạii vàoi cáci họati độngi củai Cục.i (7)i Phốii hợpi chặti chẽi vớii cáci cơi quani nhài nước,i tổi chứci hữui quan,i đơni vịi trêni địai bàni đểi thựci hiệni nhiệmi vụi đượci giao.i
(8)i Tổi chứci tuyêni truyềni vài hướngi dẫn thựci i hiệni chínhi sách,i phápi luậti vềi hảii
quani trêni địai bàn.i (9)i Thựci hiệni nhiệmi vụi hợpi táci quốci tếi hảii quani theoi quyi
địnhi củai phápi luậti vài theoi phâni côngi hoặci ủyi quyềni củai Tổngi Cụci trưởngi
Tổngi cụci Hảii quan.i (10)i Tổngi kết,i đánhi giái tìnhi hìnhi vài kếti quải hoạti độngi
củai Cụci Hảii quan;i thựci hiệni báoi cáoi theoi quyi định.i (11)i Quảni lý,i sửi dụng,i đàoi tạo,i bồii dưỡngi côngi chức,i ngườii laoi độngi củai Cụci Hảii quani theoi quyi
địnhi củai Nhài nướci vài theoi phâni cấpi quảni lýi cáni bội củai Bội Tàii chính.i (12)i
Quảni lý,i sửi dụngi cói hiệui quải cơi sở vậti i chất,i phươngi tiện,i trangi bịi kỹi thuậti vài
kinhi phíi họati độngi củai Cụci Hảii quani theoi đúngi quyi địnhi củai phápi luật.i (13)i
Thựci hiệni cáci nhiệmi vụi kháci đượci giao. [2]
Trải qua quá trình xây dựng và trưởng thành, Cục Hải quan Cao Bằng đã không ngừng kiện tồn tổ chức bộ máy để hoạt động có hiệu quả, nâng cao về chất lượng đáp ứng với yêu cầu nhiệm vụ theo từng giai đoạn phát triển đất nước. Đảng ủy và Lãnh đạo Cục thường xuyên chú trọng công tác xây dựng đội ngũ cán bộ hải quan vững vàng về tư tưởng chính trị, có trình độ năng lực chun mơn, có phẩm chất đạo đức tốt để đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ. Công tác thu ngân sách liên tục tăng cao, số thu năm sau cao hơn năm trước; công
tác chống buôn lậu gian lận thương mại luôn được tăng cường; công tác cải cách hành chính, hiện đại hóa hải quan được đẩy mạnh, công tác chỉ đạo điều hành luôn bám sát các chương trình, mục tiêu của cấp trên; vai trị lãnh đạo của các cấp ủy Đảng trong Đảng bộ được tăng cường và phát huy; sức chiến đấu của các tổ chức cơ sở Đảng được nâng lên. Đơn vị luôn ổn định và phát triển, Đảng bộ luôn liên tục giữ vững Đảng bộ trong sạch vững mạnh, tạo sức mạnh tổng hợp để thực hiện xuất sắc nhiệm vụ chính trị được giao, đã góp phần tích cực vào sự nghiệp phát triển kinh tế - xã hội và giữ vững chủ quyền an ninh quốc gia tại địa phương.