Khách hàng tham gia TTQT tại chi nhánh hầu hết là doanh nghiệp vừa và nhỏ và khách hàng cá nhân, trình độ hiểu biết về thanh tốn quốc tế của họ còn hạn chế. Khách hàng cịn nhiều sai sót trong q tình lập chứng từ, ảnh hưởng tới thời gian thực hiện thanh toán, họ chủ yếu sử dụng các phương thức thanh tốn truyền thống, ít khi yêu cầu các phương thức mới. Quy mô doanh nghiệp nhỏ và chưa tạo dựng được uy tín nên khi thanh tốn hàng nhập, bên phía nước ngồi thường xuyên yêu cầu thanh toán bằng L/C để đảm bảo an toàn, khi hoạt động thương mại quốc tế càng phát triển thì càng xảy ra nhiều tranh chấp, lừa đảo, gian lận,...
Thời gian qua, MHB gặp rất nhiều khó khăn trong việc giải quyết các vướng mắc phát sinh trong tài trợ thương mại, phần lớn là vướng mắc liên quan đến thanh tốn thư tín dụng như: người xuất khẩu phía nước ngồi xuất trình bộ chứng từ L/C địi thanh tốn nhưng thực tế không giao hàng, xuất trình bộ chứng từ giả mạo đến ngân hàng thương lượng, hoặc cùng một bộ chứng từ xuất trình tại năm ngân hàng thương lượng để yêu cầu gửi chứng từ đến MHB yều cầu giải quyết thanh toán. Hay doanh nghiệp Việt Nam đã
nhận được giấy báo hàng đến từ đại lý giao nhận hàng tại Việt Nam nhưng khi mang chứng từ xuống cảng nhận hàng mới biết là hàng chưa về đến cảng do tàu bị thủy thủ đồn đưa đi mất tích, hoặc tàu bị giữ lại cảng nước ngoài,…
Ngoài ra, nguyên nhân khác xuất phát từ phía khách hàng là khi khách hàng thấy có bất lợi do hàng hóa xuống giá làm ảnh hưởng đến hiệu quả kinh doanh, họ lại nhờ ngân hàng tìm kiếm sai sót để bắt lỗi với mục đích từ chối thanh tốn. Kể cả trong trường hợp sai sót khơng đáng kể, việc từ chối là trái với thông lệ quốc tế làm ảnh hưởng đến uy tín và vị thế của ngân hàng, đẩy ngân hàng vào tình trạng khó khăn khi phải thực hiện cam kết với ngân hàng nước ngoài.